<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">

<html lang="en">

<head>

<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">

<title>

GitLab

</title>

<style>img {

max-width: 100%; height: auto;

}

</style>

</head>

<body>

<div class="content">

<h3>

Nilesh Patra pushed to branch upstream

at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap">Debian Med / gmap</a>

</h3>

<h4>

Commits:

</h4>

<ul>

<li>

<strong><a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/c3f4687612927c90ed501ebdb85b6c8fd77cdff4">c3f46876</a></strong>

<div>

<span>by Nilesh Patra</span>

<i>at 2020-12-19T18:13:46+05:30</i>

</div>

<pre class="commit-message" style="white-space: pre-wrap; margin: 0;">New upstream version 2020-12-17+ds</pre>

</li>

</ul>

<h4>30 changed files:</h4>

<ul>

<li class="file-stats">

<a href="#00fe7828d56d7a3ee4030d6cea057cf13f50e70c">

ChangeLog

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#b33892fbddeffc3368077b4904ad0b3d562a7312">

VERSION

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#e898dcb4575afbe2011dd3239a76d23e692b995d">

src/distant-rna.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#d0c1ff4b9ba36725b9f9d14830dfab75cc757147">

src/distant-rna.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#fec4337d2f52dc984866d8246d6d46e7228ff60d">

src/dynprog_genome.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#b5f590f1abf7ebb3af70d5c7a09638c046710c9d">

src/extension-search.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#72d527140f4bbafea5b13cde7c73befc48b92e63">

src/extension-search.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#39f73f3fcab5e56bf327190a099c346bb4c38598">

src/filestring.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#948f3b1f3ff776f2b77c9acdbee7addb91f05216">

src/filestring.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#82ecd9beadcbe9383d59d8b04c2d232d0f7d98f5">

src/genome.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#1398e09aee4b5fd67820a5247d65e6dc13b9bbe7">

src/genome.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#21fa3a3235386f70fbec47c2f55d39928abcbcca">

src/get-genome.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#d747f527041a6e797f86fcd6f1fcd1562bab24a2">

src/gmap.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#d1a71d80a50c38c9cb493f24be3edf3b17c8f562">

src/gsnap.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#990f20eac678a097cbaeb62045b28774977979ac">

src/indel.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#ac493283b61ab0f008dd2aafc8b3f8f01d4e900a">

src/indel.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#c98399a907bb515fa302e9111b148f9f0da3c8ba">

src/kmer-search.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#533dac6a70f6f1a9e019d374052128e93650f659">

src/outbuffer.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#7a310969bb2a67aa607a7a970dcf62e22eabb80b">

src/outbuffer.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#c672fce9c671440792e33117e131e53e07e9ddc6">

src/output.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#667933d29731aaedc5d4c17a05fe5bbc8d9cc3ef">

src/pair.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#0dd5d12033c1a01e9fd376edac71138d395f15a1">

src/path-solve.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#692595da326487888f0a5a64ebfc54a54759a36f">

src/path-solve.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#ff13941301b234908dc77aa781ec1472d3cf8ca9">

src/sam_sort.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#eafbe065c235e0716c2c14f9f4034a51b9645dd6">

src/samflags.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#519c54768148085908e97e30f9b0cb63742e846d">

src/samheader.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#5a7c9b19c5fd22fe0b9b19b6ba39e269fdec574e">

src/samheader.h

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#959dc4d7bc7cbf46f686ae1a0069076131926bcc">

src/samprint.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#df046f7a7f2467c0dad9e090aa5d02739c3c138a">

src/sequence.c

</a>

</li>

<li class="file-stats">

<a href="#6e262354aa74f2ac927c6278ee23289d7d8b9438">

src/splice.c

</a>

</li>

</ul>

<h5>The diff was not included because it is too large.</h5>

</div>

<div class="footer" style="margin-top: 10px;">

<p style="font-size: small; color: #666;">

—

<br>

<a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/c3f4687612927c90ed501ebdb85b6c8fd77cdff4">View it on GitLab</a>.

<br>

You're receiving this email because of your account on salsa.debian.org.

If you'd like to receive fewer emails, you can

adjust your notification settings.

<script type="application/ld+json">{"@context":"http://schema.org","@type":"EmailMessage","action":{"@type":"ViewAction","name":"View Commit","url":"https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/c3f4687612927c90ed501ebdb85b6c8fd77cdff4"}}</script>

</p>

</div>

</body>

</html>