<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam" style="color: #1068bf;">Debian Med / python-pysam</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam/-/commit/95d45b0b9d397716d8b779eede3b7d690c7d8823" style="color: #1068bf;">95d45b0b</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-09-30T12:00:06+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>New upstream version 0.19.1+ds</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam/-/commit/5ad3a9c926deab124bc85b1dee930e92112c5217" style="color: #1068bf;">5ad3a9c9</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-09-30T12:00:06+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>routine-update: New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam/-/commit/556e56c648163be9c9c826d5268474d38be75c14" style="color: #1068bf;">556e56c6</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-09-30T12:00:13+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Update upstream source from tag 'upstream/0.19.1+ds'

Update to upstream version '0.19.1+ds'
with Debian dir 8d6067cf8e6433e7474d1bfcaaa7dc7205ee6434</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam/-/commit/837c220063bd935b29af90721e6429d09ba5f639" style="color: #1068bf;">837c2200</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-09-30T12:00:13+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>routine-update: Standards-Version: 4.6.1
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam/-/commit/f28c92849632edf1bf39eeb528abdcc99c385ee4" style="color: #1068bf;">f28c9284</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-09-30T12:00:27+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Remove unused license definitions for LGPL-2.1+, BSD-3-clause.

Changes-By: lintian-brush
Fixes: lintian: unused-license-paragraph-in-dep5-copyright
See-also: https://lintian.debian.org/tags/unused-license-paragraph-in-dep5-copyright.html
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
30 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#9f621eb5fd3bcb2fa5c7bd228c9b1ad42edc46c8" style="color: #1068bf;">
NEWS
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#561b88e19de321ca62c7590bbb350765fb110905" style="color: #1068bf;">
README.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bf0a43679ba9de44db63c21cfaaab4c13b046460" style="color: #1068bf;">
bcftools/abuf.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4a681d360c0cdcc37cf928592e704ba449b47a46" style="color: #1068bf;">
bcftools/abuf.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c0013e41536d4afbc270fc669fa8fd42c3ac9935" style="color: #1068bf;">
bcftools/bam_sample.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#450b0e2f272e42321e318d25894a9dfaa2d1b552" style="color: #1068bf;">
bcftools/bam_sample.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#fa57713010929291368e32ac4160670c2e82006d" style="color: #1068bf;">
bcftools/bcftools.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dcbf5d862f73e0b8009ca21756e0653995c68054" style="color: #1068bf;">
bcftools/bcftools.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0dd5d0dba97ac3f2f776b5f876ba12d31d6b9e0a" style="color: #1068bf;">
bcftools/bcftools.pysam.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#03b7c57d03955cd7e83b9324e720e66059724b98" style="color: #1068bf;">
bcftools/bin.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#471373f0a41bf4702def4b896ca11b3dde06baff" style="color: #1068bf;">
bcftools/bin.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5fd37d81f8bd646724bcda881bb183102b6cc741" style="color: #1068bf;">
bcftools/consensus.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5ab08c680272b1f43f9129cb0917e24e6e3f2f72" style="color: #1068bf;">
bcftools/consensus.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d76d906d74b946f3bccb77ffee62e18a8a69d7c3" style="color: #1068bf;">
bcftools/csq.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#11fd9c587c6ace63e6aa709f33371ebce6eecdd3" style="color: #1068bf;">
bcftools/csq.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#41aeb4962dac070a1cb5c5500162192a130b38cf" style="color: #1068bf;">
<span class="new-file">
+
bcftools/dbuf.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#77fe8abc497531a74b93836eaf50db5621498108" style="color: #1068bf;">
bcftools/filter.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5a42f31a30e433ff556f80e9c25a64d47ffabc3" style="color: #1068bf;">
bcftools/filter.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#93a3454dcb1e2aa2b418e6dea380a3e1825b26a3" style="color: #1068bf;">
bcftools/main.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#31f1631ecc8365f1248fe81bb8ef7c48fafe3158" style="color: #1068bf;">
bcftools/main.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1d4d787d58e7fc883fb6f5a7ca0255749b64b4b7" style="color: #1068bf;">
bcftools/mpileup.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2a60e79a2b60faaa20101e392a1b4f0381c2b19e" style="color: #1068bf;">
bcftools/mpileup.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b22dc91ab5d7836148a1382104851d00b5326428" style="color: #1068bf;">
bcftools/regidx.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1b055bee9c7c710f189ac201a1f55ab2e71ec207" style="color: #1068bf;">
bcftools/reheader.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0f606bffcfcbe17b2a50e45b5782555676837d94" style="color: #1068bf;">
bcftools/reheader.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#53a446a59e2841bb71743340904011f4e13ff479" style="color: #1068bf;">
bcftools/smpl_ilist.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c7b949fa221a0b8f292c58cdedd0c442fc0c5695" style="color: #1068bf;">
bcftools/smpl_ilist.c.pysam.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e499b84dd6415ed88e2ea3a7aae3c47bd0cce63b" style="color: #1068bf;">
bcftools/smpl_ilist.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#eeeb665dd386433468bdd1425adaa43d588f1a61" style="color: #1068bf;">
bcftools/tsv2vcf.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c95de18706eb735120a1a119805676cc27d4b657" style="color: #1068bf;">
bcftools/tsv2vcf.c.pysam.c
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #666;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-pysam/-/compare/3c5ce349596c2bedcb66b1850fbf598519e1006c...f28c92849632edf1bf39eeb528abdcc99c385ee4" style="color: #1068bf;">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org" style="color: #1068bf;">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link" style="color: #1068bf;">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link" style="color: #1068bf;">Help</a>



</p>
</div>
</body>
</html>