<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra" style="color: #1068bf;">Debian Med / python-cobra</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/1fad568f3764761f223cde35bf132933d55bdce1" style="color: #1068bf;">1fad568f</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:33:40+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Fix watch file
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/59ec4bf8e8d47c68705476f82feee9ba225eabcd" style="color: #1068bf;">59ec4bf8</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:39:29+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>routine-update: New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/59436148c07849027e40829dbc9e1bb8989f8be9" style="color: #1068bf;">59436148</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:39:30+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>New upstream version 0.26.0</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/fc59c0cd2d44bcc5c13ff59cfef93b18a3049c67" style="color: #1068bf;">fc59c0cd</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:39:40+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Update upstream source from tag 'upstream/0.26.0'

Update to upstream version '0.26.0'
with Debian dir 86faca35c26c9ff49b0582c0662c3271b2c04290</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/12abcd71bba71543714cae94cc4422cee2f2b18c" style="color: #1068bf;">12abcd71</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:39:55+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Add missing build-dependency on python3-setuptools:any.

This is necessary for build-backend setuptools.build_meta in pyproject.toml

Changes-By: lintian-brush
Fixes: lintian: missing-prerequisite-for-pyproject-backend
See-also: https://lintian.debian.org/tags/missing-prerequisite-for-pyproject-backend.html
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/b4c9d10244e026e0f0597037d1689ce7732bcefc" style="color: #1068bf;">b4c9d102</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:44:42+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Refresh patches
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/commit/18d06e55a83360d9a5c0bb91ca23dc28237e7a07" style="color: #1068bf;">18d06e55</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-23T20:46:53+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Revert "Add missing build-dependency on python3-setuptools:any."
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
30 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#730337a19a5aa856e9a50d6596dfed88aab93f03" style="color: #1068bf;">
.github/workflows/lint.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c778226b6c4c0fb51cf7942c8ee1f3d9fc1249d0" style="color: #1068bf;">
.github/workflows/main.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c35bc83d626f67e197849c9795030a02efe21488" style="color: #1068bf;">
.github/workflows/safety.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302" style="color: #1068bf;">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3374c1c18de688d968548dc001e40ee700f04f6f" style="color: #1068bf;">
INSTALL.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1" style="color: #1068bf;">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#18fe8d0d88ba467a67af89a673f8a34181e05e98" style="color: #1068bf;">
debian/patches/ignore_tests.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#68ef9f98c01c7eecd4c605cc26048a06f3304b79" style="color: #1068bf;">
debian/watch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0d09aef0198de41ddcdd1dedfb1cad795da28a1e" style="color: #1068bf;">
documentation_builder/io.ipynb
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3dcb9dae3cb7825e9585dec9d2c050fd6c83f46b" style="color: #1068bf;">
<span class="new-file">
+
release-notes/0.26.0.md
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8c91c0296909b5ea3c496fde69e9dc44a6c6ae5f" style="color: #1068bf;">
setup.cfg
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8e2edce0d507e1297474f25c00cae94258db38d8" style="color: #1068bf;">
setup.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1de6b4f3a254357ed4adcffc483949c14961379d" style="color: #1068bf;">
src/cobra/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#950f0d4cd6e2e65938f65c0f65feacafda8e0093" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a9f465ed644141b460901c7d78c7d114497f675a" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/configuration.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1a83bb5fa417ddb7e799b7504ecdf5d363382fd1" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/dictlist.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#63bbb4955f80b45d39ea3203f573a66409b1430d" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/formula.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f0e79d24023abfd5dcafb0b13978ae10f44f1f8d" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/gene.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#08688167920e33b099e43f7245f11a75403d1380" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/group.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d7e1aee9380ea447e4ffdfa59bb2fef1043e0908" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/model.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#47fe15ff8f4f2a4270d636a18428ed512655c8ae" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/reaction.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2b33a1132844ee6fc5e778a96d69f6c9fe882ced" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/singleton.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9048b0fa7d68968e10c52da54fc884f551a45a96" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/solution.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1fd52229f68e8c4e384b60fc64cf95b2bb2c6d8f" style="color: #1068bf;">
src/cobra/core/species.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c3b1ff49973e429593bd797b2dfa2a706da1518f" style="color: #1068bf;">
src/cobra/data/init.py

src/cobra/data/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#36ca5543c261030671b7c4c61fcaadf7f10ee92f" style="color: #1068bf;">
src/cobra/data/mini.json
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ea7a96cf295ab6a5dccbffee089d61779eee3011" style="color: #1068bf;">
src/cobra/data/mini.mat
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#256053aaae00aab90d789204b011252ca7f1df09" style="color: #1068bf;">
<span class="deleted-file">

src/cobra/data/mini.pickle
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a502c5e05500c4bc063d5e63b0438d8f446d8c8a" style="color: #1068bf;">
src/cobra/data/mini.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a8902d1f4f2b2ad82daf3f44567a3108608f8355" style="color: #1068bf;">
src/cobra/data/mini_cobra.xml
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #666;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-cobra/-/compare/65b2eb532af527399b3ff00c914ef7443ed3a5aa...18d06e55a83360d9a5c0bb91ca23dc28237e7a07" style="color: #1068bf;">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org" style="color: #1068bf;">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link" style="color: #1068bf;">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link" style="color: #1068bf;">Help</a>



</p>
</div>
</body>
</html>