<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc" style="color: #1068bf;">Debian Med / multiqc</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/80144f7ba65e574b4c030d1847148b1e6c7e9cd3" style="color: #1068bf;">80144f7b</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T06:38:39+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Fix watch file
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/0a8098df38de52f5dbc8c613bf1e7235244fd364" style="color: #1068bf;">0a8098df</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T06:39:08+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>routine-update: New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/0d16872645aaf53752a1953c01943deba679df6b" style="color: #1068bf;">0d168726</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T06:43:23+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>New upstream version 1.13+dfsg</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/75e8c45d0f8eac14de5be7d667869f3e271dd96d" style="color: #1068bf;">75e8c45d</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T06:43:31+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Update upstream source from tag 'upstream/1.13+dfsg'

Update to upstream version '1.13+dfsg'
with Debian dir f1f816d93d8975ea864b26c7bfea24aabe97b580</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/78a2d998a45014266ee3da6257e5f5b7e27c5579" style="color: #1068bf;">78a2d998</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T06:44:28+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>routine-update: Standards-Version: 4.6.1
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/5d13f78948e9799dadf6a0f7565e5afb821d0a82" style="color: #1068bf;">5d13f789</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T06:45:16+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Update lintian override info format in d/source/lintian-overrides on line 5.

Changes-By: lintian-brush
Fixes: lintian: mismatched-override
See-also: https://lintian.debian.org/tags/mismatched-override.html
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/ef7f6ee065482be994ebd50055f503e4045ef40f" style="color: #1068bf;">ef7f6ee0</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T07:26:03+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>New Dependency: rich-click
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/commit/2fa197bb550f99c3c38a442ed579f9d41c23bf73" style="color: #1068bf;">2fa197bb</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2022-11-26T07:27:36+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>Fix lintian-overrides
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
30 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#ab09011fa121d0a2bb9fa4ca76094f2482b902b7" style="color: #1068bf;">
CHANGELOG.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2f473ef69010f24d2546e13263bcc2c49befd2f3" style="color: #1068bf;">
<span class="new-file">
+
CITATION.cff
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec9a00bfd09b3190ac6b22251dbb1aa95a0579d" style="color: #1068bf;">
README.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1" style="color: #1068bf;">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2" style="color: #1068bf;">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#85ccdeeb03055211183e48520592d9a93592b330" style="color: #1068bf;">
debian/source/lintian-overrides
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#68ef9f98c01c7eecd4c605cc26048a06f3304b79" style="color: #1068bf;">
debian/watch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8b74e856f0cea75412b372bd39ea593ce2ebe888" style="color: #1068bf;">
docs/config.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a4448811a81071df7040ccfdd80279ec79d306e9" style="color: #1068bf;">
docs/customisation.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#041b7bb05e8cec3f54be9458d4f053e70ef30ad9" style="color: #1068bf;">
<span class="new-file">
+
docs/images/screenshots/fastqc-run.svg
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#55199a4dc06a52cf6712fdb7406566e3a77fd28f" style="color: #1068bf;">
docs/installation.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#17e47e330b563a57a9d325090ee90de2ff7e33aa" style="color: #1068bf;">
docs/plots.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5d35e1d6949bb37d2bd7b9ab7e1bec820608bd3f" style="color: #1068bf;">
docs/usage.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#70cb1899c3b75c56c8f833c2b42e5b47d222dc8b" style="color: #1068bf;">
<span class="new-file">
+
flake.lock
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58cb4f58166586c1ed7f076c568d41682df3661c" style="color: #1068bf;">
<span class="new-file">
+
flake.nix
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2574ff421f421986b409645ccc3c69e6cc2a3e4e" style="color: #1068bf;">
multiqc/__main__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8dfa9ee9ef55313ab7e5ec9796332dd95a5656b6" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/adapterRemoval/adapterRemoval.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e6a4142e164213d8848fb30cf9271aba972711ab" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/base_module.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#391c9570c3155e986552f1d83ddb4d4190efee5a" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/bcl2fastq/bcl2fastq.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ce52ff5e831831467d427a4aac6f8b34be01c4bf" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/custom_content/custom_content.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1a20c0c6e99592fa16bebe7352b44958300b9b11" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/fastp/fastp.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7b80ea457802fa51c9fc3d0fa4b359295a2855fb" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/fastqc/fastqc.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5b1664d690e7921755d9022989861fb46278faf7" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/kallisto/kallisto.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5b158c95f165a2bc997c61c7f7e228c4db754483" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/mirtop/mirtop.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1682b8942075c0369a5b3fffb121a4798f50f848" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/nanostat/nanostat.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#464dfada817d6c9ae2c76bc0edba39f6c151224b" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/pangolin/pangolin.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9155a7b627204b3b95059f4e72e625b84bcaa828" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/picard/HsMetrics.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#35996685fa38bb55d2ada068a3bcd4a120053549" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/somalier/somalier.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e288c16f6ae5a53202534f70e6aa28bb49bb1a29" style="color: #1068bf;">
multiqc/modules/vep/vep.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#81d128967aef80056cc28f5d64cbce0f54706df9" style="color: #1068bf;">
multiqc/multiqc.py
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #666;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/multiqc/-/compare/e1f5c690b50f238e386b329d3fabed7aed8cc97f...2fa197bb550f99c3c38a442ed579f9d41c23bf73" style="color: #1068bf;">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org" style="color: #1068bf;">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link" style="color: #1068bf;">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link" style="color: #1068bf;">Help</a>



</p>
</div>
</body>
</html>