<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch upstream at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/snap-aligner">Debian Med / snap-aligner</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/snap-aligner/-/commit/a56f9bbaaa986b004d4f5c769e6f8b4322589273">a56f9bba</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-02-01T19:26:09+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 0.8125rem; color: #303030; position: relative; font-family: "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fafafa; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dbdbdb;'>New upstream version 2.0.2+dfsg</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
13 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec9a00bfd09b3190ac6b22251dbb1aa95a0579d">
README.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a21d09451061c96791124a9bc81371fe83e43559">
SNAPLib/AffineGapVectorized.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dc201fac0bbd34776ec4fabea6d736a3eb8e26e8">
SNAPLib/AffineGapVectorized.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#66a42352e8acb461590c39ff797ea59cc42451f9">
SNAPLib/AlignerContext.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#aa56031008802c2b265498e6eef1b0f5e6fe0790">
SNAPLib/AlignerContext.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9bb9aff30d7c007202b16f3986195f3ed2e82c3e">
SNAPLib/AlignerOptions.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#440590fee9dabb413f903741acac331b91ca7314">
SNAPLib/AlignerOptions.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#97043dbb4bd3919503e7dcf756ad42a055d73e08">
SNAPLib/AlignerStats.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f05d00969b3fd7ed7133373b907bdaa9607bc2da">
SNAPLib/AlignerStats.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4d3d052f1ccc6c148a030deb92acb6a59002a8b0">
SNAPLib/AlignmentResult.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#23b1be5ba07cacc7a3ccdaec604b4fd46f234ec6">
SNAPLib/Bam.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9a7a577f2262f2296c4f5c94f93d367733f06055">
SNAPLib/Bam.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5b5dd25807fa4057b49a4db0dd5b08218d120beb">
SNAPLib/BaseAligner.cpp
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #666;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/snap-aligner/-/commit/a56f9bbaaa986b004d4f5c769e6f8b4322589273">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<script type="application/ld+json">{"@context":"http://schema.org","@type":"EmailMessage","action":{"@type":"ViewAction","name":"View Commit","url":"https://salsa.debian.org/med-team/snap-aligner/-/commit/a56f9bbaaa986b004d4f5c769e6f8b4322589273"}}</script>


</p>
</div>
</body>
</html>