<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style="--code-editor-font: GitLab Mono, JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Michael R. Crusoe pushed to branch upstream at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap">Debian Med / gmap</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/31fefcddae2c3a07bfef608be27bc9f764ee8dde">31fefcdd</a></strong>
<div>
<span> by Michael R. Crusoe </span> <i> at 2023-10-05T15:25:07+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 2023-10-01+ds</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
23 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#00fe7828d56d7a3ee4030d6cea057cf13f50e70c">
ChangeLog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b33892fbddeffc3368077b4904ad0b3d562a7312">
VERSION
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#87db583be5c13c1f7b3c958b10e03d67b6a2ca06">
configure.ac
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#67e794015a01b8816bd16290e5f8538236da8245">
src/Makefile.am
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9b29769010656b0ce4d21dfdf23241939db051d4">
src/compress.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c52e3c41defedd3b757b433adc35c1fc77f04540">
src/compress.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#43da1f85cfb3d0e20c26e193392588a0aa654c0a">
src/concordance.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#28eee06d961fa0695cda20c1b8ee46196f259ff0">
src/concordance.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#405ca9175e0ed8d68aa2c3cef7af73fb8af31b5a">
src/exon.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b5f590f1abf7ebb3af70d5c7a09638c046710c9d">
src/extension-search.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#72d527140f4bbafea5b13cde7c73befc48b92e63">
src/extension-search.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7a893ba25a0b18be3aa4e3295ec13e042427d28b">
src/genomebits.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#abb17fce74ad17b700a3ff057542ad0069be1296">
src/genomebits_consec.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#526b2679ae6af7b9ad1ad61cc7192ed05c6d79de">
src/genomebits_count.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d1a71d80a50c38c9cb493f24be3edf3b17c8f562">
src/gsnap.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2b92075ef190eb89fe56503551bb3b955cd9ad68">
src/hitlistpool.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5480605cd6b3407afd953acfaa327543ba45455d">
src/hitlistpool.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#990f20eac678a097cbaeb62045b28774977979ac">
src/indel.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ac493283b61ab0f008dd2aafc8b3f8f01d4e900a">
src/indel.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#042321fa4e5d086008cb4565fc75bb86d6dde089">
<span class="new-file">
+
src/intersect-approx-simd.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7161f56d2651c7a0f9f7e66fb9ca84bb3e684383">
<span class="new-file">
+
src/intersect-approx-simd.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c250904e9d5939959b643a45144415dc5de425ff">
src/intersect-simd.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e226e465f22208eba437115eccb59a7973d1decb">
src/intersect-simd.h
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #737278;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/31fefcddae2c3a07bfef608be27bc9f764ee8dde">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<script type="application/ld+json">{"@context":"http://schema.org","@type":"EmailMessage","action":{"@type":"ViewAction","name":"View Commit","url":"https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/31fefcddae2c3a07bfef608be27bc9f764ee8dde"}}</script>


</p>
</div>
</body>
</html>