<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style="--code-editor-font: GitLab Mono, JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Mohammed  Bilal pushed to branch upstream at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/delly">Debian Med / delly</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/delly/-/commit/fc85d841d84b07d0474c943b61de26ad969dd508">fc85d841</a></strong>
<div>
<span> by Mohammed Bilal </span> <i> at 2023-10-12T14:37:23+00:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 1.1.8</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
21 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dad57a4c245a8007c90257aef0514c8b6a0f600c">
<span class="deleted-file">

AUTHORS
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3f454a98e586d1aa0d322e19afd5e67e08f2d3c8">
CONTRIBUTING.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6651ddff6eb82c840ced7c1dddee15c6e1913dd4">
Dockerfile
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#836efb6e25a091dcb4ff8e1dbb2f0be6a5cbf14c">
Makefile
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5f978958190b293037054bd9d5e795d0b92d1ca8">
R/rd.R
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec9a00bfd09b3190ac6b22251dbb1aa95a0579d">
README.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6dc5636d753033d870847a5cc00737a93ef170a2">
parallel/Dockerfile
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8986e012fa75a6b6747b11cabec6e3cc6cd45561">
src/align.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#44e2ce9634eb475699cabef7bdb1017aff3883df">
src/asmode.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9dc82939741eb76d609db1ac16b1398c80eb0e27">
src/assemble.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#09127824dfd1dcb511663f94ed3fb9ad5e9d7d5e">
src/bed.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9552d96e6b96b9a150af98898379b82ac7542c26">
<span class="new-file">
+
src/chimera.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d0a709faa909252ae246c0d6c1212099d4cc6343">
src/cluster.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7c96bdec9445854c498667ea809c1dc1cadf6cdb">
<span class="new-file">
+
src/compvcf.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e19d274a46472d34d39a42180498e5c30d7e7424">
src/coverage.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5d775c4d26336d72c9aaeefa6f42a658ef123ac9">
src/delly.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#959a235a0b48a27af0667cc50c53360de917157d">
src/delly.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6cf66911c6f33458585d79abb14f14851f9fcb3f">
src/filter.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a3b372df33a38eea1588ae4ab57d9b6eea4de5b5">
<span class="new-file">
+
src/gaf.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#836bf99511b7d355c156c4bd68f24fd0b7ce69c9">
src/genotype.h
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #737278;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/delly/-/commit/fc85d841d84b07d0474c943b61de26ad969dd508">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<script type="application/ld+json">{"@context":"http://schema.org","@type":"EmailMessage","action":{"@type":"ViewAction","name":"View Commit","url":"https://salsa.debian.org/med-team/delly/-/commit/fc85d841d84b07d0474c943b61de26ad969dd508"}}</script>


</p>
</div>
</body>
</html>