<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style="--code-editor-font: GitLab Mono, JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Ananthu C V pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime">Debian Med / python-treetime</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime/-/commit/bc7ed4dea2a0360e7cb30762ccbfaa42a2cc1c46">bc7ed4de</a></strong>
<div>
<span> by Ananthu C V </span> <i> at 2023-11-01T01:09:00+05:30 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 0.11.1</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime/-/commit/8b15affbbb7cdb6b295a8c530a44361a4409b42f">8b15affb</a></strong>
<div>
<span> by Ananthu C V </span> <i> at 2023-11-01T01:09:15+05:30 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/0.11.1'

Update to upstream version '0.11.1'
with Debian dir a3dc43bf0fab912644a03a17b8ed011b4b9453bd</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime/-/commit/c881c097a1afe4b7468e3bef71b1caaf784bfbfe">c881c097</a></strong>
<div>
<span> by Ananthu C V </span> <i> at 2023-11-01T01:18:56+05:30 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Bump Standards-Version to 4.6.2 (no changes needed)
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime/-/commit/7a02acec3d7686baef5f9376eda2ec6424e0c1b5">7a02acec</a></strong>
<div>
<span> by Ananthu C V </span> <i> at 2023-11-01T01:52:47+05:30 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Create a patch to remove warning on shell script by adding shebang
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime/-/commit/292ddef8e709232ea118c10cc72c3fc74dd43fa3">292ddef8</a></strong>
<div>
<span> by Ananthu C V </span> <i> at 2023-11-01T01:54:54+05:30 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update changelog
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
30 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec9a00bfd09b3190ac6b22251dbb1aa95a0579d">
README.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4c23f3e77a0ef00cf8da63e8e50eef5197724f75">
changelog.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bc34014ab4b9a49dd7a27bdd8d352912607c3a96">
<span class="new-file">
+
debian/patches/series
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#21f07864a3929c097dd38d0ed1d1b912b1f34a64">
<span class="new-file">
+
debian/patches/shebang.patch
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9e4b18dd4973209585cacb447ee505ec303baf36">
docs/source/tutorials/timetree.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8e2edce0d507e1297474f25c00cae94258db38d8">
setup.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2acc65acdda9ae987dbf8da8251ed25fe5a18110">
test.sh
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2b6156e204dfd7dc3d5a6585293b24731c61729b">
test/command_line_tests.sh
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f70b5fe5f14f2090bfda8bfc76a25a07a2184ae5">
<span class="new-file">
+
test/test_sequence_evolution_model.txt
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7a513663688f4096eb663d34c667233688ef8265">
test/test_treetime.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#69dc641dc8a4f2ceee2025d190e2e761dcae3c84">
<span class="new-file">
+
treetime/CLI_io.py
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#716e6f6c16580800d13452615e2c01668aacc288">
treetime/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f3968ef54a1ec991f68a8e3b407e656684ddc39e">
treetime/__main__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#595202a65707f2c13afa5a4958366d4eb8a9353e">
treetime/argument_parser.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#15c2d91bed02b64945cc0f1947f5a93a4c2c7c2c">
<span class="new-file">
+
treetime/clock_filter_methods.py
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d83958daf140c08b7ec128fe971dc4438e4ebc30">
treetime/clock_tree.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9197866d72ee7afc1de2097e1da379c23f68c559">
treetime/distribution.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b990c4f689cacd4a1e8800b187c4078a5c5ed01f">
treetime/gtr.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2079a85c231a4f534ebaf29fa31ed62071d9eb24">
treetime/gtr_site_specific.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ea6325c04095908d06ab422a724a6b1ff8dbdd51">
treetime/merger_models.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3aeeb413c53c6b3ee346e05c6bb707f4cfe6aeb3">
treetime/node_interpolator.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#82a08428349f48dbbab4c8ccac6320f52b4c7a7b">
treetime/seq_utils.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0571519df7f8cf585d85cbbbf8be96d68c6d676c">
treetime/seqgen.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a2e471fd9fc09543e8fd92727442680e1b76576b">
treetime/treeanc.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#20e5b42fc56612eb476c510ffba58152379c4609">
treetime/treeregression.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0994bbb65b28bed19201420b96136d5e9f676859">
treetime/treetime.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b73718dcdf4bacd94dd536b6bb62ded9789d6bc5">
treetime/utils.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#86f02b8df99e58795d36ed9e703173e372da3411">
treetime/vcf_utils.py
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #737278;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-treetime/-/compare/ecd6e26872f9bb5bf1b5f657e40f7940d3d6a78f...292ddef8e709232ea118c10cc72c3fc74dd43fa3">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>



</p>
</div>
</body>
</html>