<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style="--code-editor-font: GitLab Mono, JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto">Debian Med / kallisto</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto/-/commit/7205d8007d2dd6c8c7d86765e9074c268a7ea169">7205d800</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-08T09:43:17+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>routine-update: New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto/-/commit/9bdff6cf9920d4d420d92f3fc75576b144f51913">9bdff6cf</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-08T09:43:18+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 0.50.1+dfsg</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto/-/commit/1ee4a608c6540abbab77126eec0a99e06597835d">1ee4a608</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-08T09:43:25+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/0.50.1+dfsg'

Update to upstream version '0.50.1+dfsg'
with Debian dir b74632e6b822b1a732fbdfc2d207d73627c6695e</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto/-/commit/a7059c0afec7578c2438da062b4c41012af81d40">a7059c0a</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-08T09:43:25+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>routine-update: Standards-Version: 4.6.2
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto/-/commit/9188c763dacee7e01d5f03291aca106b58cd337d">9188c763</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-08T11:43:12+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update patches
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
18 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#7ceee5d954a74b8640cc2bfd6c27b8fdf07d7045">
.github/workflows/test.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9a2aa4db38d3115ed60da621e012c0efc0172aae">
CMakeLists.txt
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#092e77c62ec2892b4915b2c334f2ed924f45b14e">
debian/patches/disable-failing-bustools-test.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2b96346e015f870ae988a5783c6e77e89d22871a">
debian/patches/htslib1.3
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bc34014ab4b9a49dd7a27bdd8d352912607c3a96">
debian/patches/series
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e4c19aed51618bf0c7ebd03189c67e422f84d4eb">
<span class="deleted-file">

debian/patches/spelling
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e9ffd79035f20df75689c726e3780374ee2ad4f4">
debian/patches/use_debian_packaged_htslib.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7cd8bd078dfe5bff60803f777c125832259ef13d">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/.gitignore
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#211030f896e776f4f264b6e7ef0605db60215284">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/.gitmodules
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#22561252239b449fed426d578e8c58be43a5c219">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/CMakeLists.txt
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1e57b2f31083c85da170a6229b7fa14dbb811b6e">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/Changelog.md
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6b0060ddd263467754f15c850ca9de4fa0d1768a">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/Doxyfile
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ffe975960ad0d37dd003c7cf9642066f34d0d01d">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/LICENSE
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7ad99437a47142618f66a409628042bb0b588fe0">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/README.md
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d15fae1e72e8c0323b66ff24220bee6a3bc5b4cf">
<span class="new-file">
+
ext/bifrost/doc/doxygen/doxygen_sqlite3.db
</span>
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #737278;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/kallisto/-/compare/c507a3e0a1b15eafb8ccb414300945f8d9bd7463...9188c763dacee7e01d5f03291aca106b58cd337d">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>



</p>
</div>
</body>
</html>