<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style="--code-editor-font: GitLab Mono, JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;">
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: 0.875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,0.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans", -apple-system, BlinkMacSystemFont, "Segoe UI", Roboto, "Noto Sans", Ubuntu, Cantarell, "Helvetica Neue", sans-serif, "Apple Color Emoji", "Segoe UI Emoji", "Segoe UI Symbol", "Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx">Debian Med / python-bx</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/68cea644ff3d42e38d14cd31519faae468a116d6">68cea644</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:11:28+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>routine-update: New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/d51f4095f4c4e19ba09c8742a2e299b972fef045">d51f4095</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:11:29+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 0.10.0</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/c096d2874a670ba0f88c80cae93d986414bea823">c096d287</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:11:31+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/0.10.0'

Update to upstream version '0.10.0'
with Debian dir e4f304cb9921b453b25ed108384a2c795dadc273</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/bdc0976988c004c3d55c9a0e6b31f37643d43e71">bdc09769</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:11:31+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>routine-update: Standards-Version: 4.6.2
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/c0809a193072d5ce4ce8d64096a566b7b82858d4">c0809a19</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:11:35+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>routine-update: Build-Depends: s/dh-python/dh-sequence-python3/
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/765f1f2d069494c5d8120862aa2abcfcedc45b50">765f1f2d</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:14:31+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>routine-update: Ready to upload to unstable
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: bold;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/commit/8a01607e7a5669aacae24ddbf0cce83aecbad513">8a01607e</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2023-11-10T15:16:45+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #333238; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Add DEP3
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
30 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#6bf1df73dcb0e35c845e374bc98e9b64aa8192ae">
.github/workflows/deploy.yaml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a60e2382fd0c34cb06177a3d7034264e22531192">
.github/workflows/test.yaml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8875df48c18030126ef5ef5a6f5c93b23451fb9f">
MANIFEST.in
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#21f07864a3929c097dd38d0ed1d1b912b1f34a64">
debian/patches/shebang.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8756c63497c8dc39f7773438edf53b220c773f67">
debian/rules
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#87c1820b3e9b05cd007ea95036b5904546475c20">
lib/bx/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#095f274466d7fe4999922940340ce6a05a67b66a">
lib/bx/_seqmapping.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#31977282111385d524a9614d8f0b4beb9b667fd5">
lib/bx/align/_epo.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e2c14a2dc525a10b97477c8d7f4077fe1a09c966">
lib/bx/align/epo_tests.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#39a1202bddbd23d4dd561e423801ab8b82621f9f">
lib/bx/align/lav.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#824beac453875e2a5b618e47f08a203938053e10">
lib/bx/align/lav_tests.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#40f2703106ddb404171381e20700da394c5760cb">
lib/bx/align/maf_tests.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c47592b848a861fbcd99f9edfe8788bc24db598a">
lib/bx/arrays/array_tree.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7cc3199478f8f5ac0d4dbe252661cd66d7afe843">
lib/bx/bbi/bbi_file.pxd
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1f3d03bf5a3779d95c2d1b6918e2b6953c654dd1">
lib/bx/bbi/bbi_file.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c4d3228adfbb86137d6eeebc6171c737339b3113">
lib/bx/bbi/bigbed_file.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#62905aa149135a3639dcfd6a51e2193f4b890028">
lib/bx/bbi/bigwig_file.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#605cddf4ef4e26d3773404c9febdf11160127deb">
lib/bx/bbi/bpt_file.pxd
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#321f0faa73ee8a81ee2c4e912c24139ff70adbe8">
lib/bx/bbi/cirtree_file.pxd
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bfa9e1a716ecd942a12951cfb1a8668224deb0c8">
lib/bx/bbi/types.pxd
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d3ed378947b81d6469c895f4323dabaa270b4fb4">
lib/bx/cookbook/argparse.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a4e148e603ea2670c3c568a75365d8575872e7c4">
lib/bx/interval_index_file.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d18b60a83ac5c6c79e632e9e89e68cce34abeea0">
lib/bx/interval_index_file_tests.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2a37c25b33b321ce15640fbbbebabbe268963e7e">
lib/bx/intervals/intersection_tests.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e300ef77244f22a4d49e3abe6c5885fd907854c9">
lib/bx/intseq/ngramcount.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#70c77f35ec0dfa6e17a25441244ffdea1be2443e">
lib/bx/misc/_seekbzip2.pyx
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5c343bc56bcb39591192ceecc45eaa88a5bbfd6b">
lib/bx/misc/cdb_tests.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7801e03466671c8ea70edce684dae9c712316eb5">
lib/bx/pwm/bed_score_aligned_pwm.py
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: 0.875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #737278;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-bx/-/compare/5180637647056372c3bc0792459e26bac5e3d0dd...8a01607e7a5669aacae24ddbf0cce83aecbad513">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>



</p>
</div>
</body>
</html>