<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style='--code-editor-font: var(--default-mono-font, "GitLab Mono"), JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;'>
<head>
<meta content="text/html; charset=US-ASCII" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: .875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Étienne Mollier pushed to branch upstream at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap">Debian Med / gmap</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/9b84fa74070e7cdf7b2290492d16eaf8f0708832">9b84fa74</a></strong>
<div>
<span> by Étienne Mollier </span> <i> at 2024-11-03T17:25:18+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #28272d; position: relative; font-family: "GitLab Mono","JetBrains Mono","Menlo","DejaVu Sans Mono","Liberation Mono","Consolas","Ubuntu Mono","Courier New","andale mono","lucida console",monospace; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 2024-10-20+ds</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
30 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#00fe7828d56d7a3ee4030d6cea057cf13f50e70c">
ChangeLog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b33892fbddeffc3368077b4904ad0b3d562a7312">
VERSION
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#67e794015a01b8816bd16290e5f8538236da8245">
src/Makefile.am
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ae2eb5ba5468a4edbf1e88199842c9e7877dea42">
src/altsplice.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#43da1f85cfb3d0e20c26e193392588a0aa654c0a">
src/concordance.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b5f590f1abf7ebb3af70d5c7a09638c046710c9d">
src/extension-search.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#72d527140f4bbafea5b13cde7c73befc48b92e63">
src/extension-search.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#526b2679ae6af7b9ad1ad61cc7192ed05c6d79de">
src/genomebits_count.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d747f527041a6e797f86fcd6f1fcd1562bab24a2">
src/gmap.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d1a71d80a50c38c9cb493f24be3edf3b17c8f562">
src/gsnap.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#990f20eac678a097cbaeb62045b28774977979ac">
src/indel.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cee7d6dbb037053f4ba9e6248fc93d10fb321b64">
src/intersect-small.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c98399a907bb515fa302e9111b148f9f0da3c8ba">
src/kmer-search.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#077f0a49b34f1904ced8f7ca4ad1a38e6d13ef6f">
src/localdb-read.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#010f4e3d40d78f7d8696a6e9c9898312319fae36">
src/localdb-read.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cf5daa53b07dfad4e4a4fad1c4dd1cd6702f464b">
src/mem.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2e60d4194dabea20e1d4863a86c592a23c5c7b87">
src/mem.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a42ff894dff322ea5fe3575dca37fb0fb84e028d">
<span class="new-file">
+
src/merge-diagonals-heap-uint4.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#66fe231ad5ea3ec39cf44c759759dc20c22e7b1b">
<span class="new-file">
+
src/merge-diagonals-heap-uint4.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d0db2c51336dfe5e141d847a676e1cb09c05c8c5">
src/merge-diagonals-heap.c

src/merge-diagonals-heap-uint8.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c789de47cf2b4d8d7b433a2893dd8c1bc228b5d4">
src/merge-diagonals-heap.h

src/merge-diagonals-heap-uint8.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#19d5fa4e5e2c56efcaf9bb22654ecc2c476bee4b">
src/merge-diagonals-simd-uint4.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d45b640ed30392faaaafa0953a17b7ce51d446d0">
src/merge-diagonals-simd-uint4.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#703a1da46d22363c35814ecca9e14c2c8d6bca54">
src/merge-diagonals-simd-uint8.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#df518fb19362f57adda799962764b9aca752868d">
src/merge-diagonals-simd-uint8.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ab070c4eb4e1154dfe8ea83580610fea12744d14">
<span class="new-file">
+
src/merge-method.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#02491cb0a616645f2401753b0e2fe2176b4ec610">
src/merge-uint4.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b212e11af9760fe421bdd4c1e91fc5734fa8a853">
src/merge-uint8.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cf99ff93587f849f1eb9c3067bf8a4e234572f86">
src/path-eval.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#76b8fdadb58aa7b91c72379e63e49d368c882056">
src/path-fusion.c
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: .875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #737278;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/9b84fa74070e7cdf7b2290492d16eaf8f0708832">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<script type="application/ld+json">{"@context":"http://schema.org","@type":"EmailMessage","action":{"@type":"ViewAction","name":"View Commit","url":"https://salsa.debian.org/med-team/gmap/-/commit/9b84fa74070e7cdf7b2290492d16eaf8f0708832"}}</script>


</p>
</div>
</body>
</html>