<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style='--code-editor-font: var(--default-mono-font, "GitLab Mono"), JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;'>
<head>
<meta content="text/html; charset=utf-8" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: .875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Maarten L. Hekkelman pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/dssp">Debian Med / dssp</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/dssp/-/commit/a97d1798e6f21e9acce6b3619019c2321aab1ccf">a97d1798</a></strong>
<div>
<span> by Maarten L. Hekkelman </span> <i> at 2025-08-31T12:53:32+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 4.5.5</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/dssp/-/commit/621f6b9a28a3adcb0da5cc0b944bf55cd880f1db">621f6b9a</a></strong>
<div>
<span> by Maarten L. Hekkelman </span> <i> at 2025-08-31T12:54:12+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/4.5.5'

Update to upstream version '4.5.5'
with Debian dir 0b96864d298335cec0fd31b7aa48f1aaf42d5a3a
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/dssp/-/commit/1f5fa98e59a7a41d4e5152cf604a81141cf72b23">1f5fa98e</a></strong>
<div>
<span> by Maarten L. Hekkelman </span> <i> at 2025-08-31T13:19:52+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>temporary fix for building in Debian
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
28 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#bb7147697a51d927fe23423bef7590f5b5a013ef">
<span class="deleted-file">
โˆ’
.github/workflows/build-documentation.yml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#fd049c7ece35e0c50e9f29743b53088309f4402e">
.github/workflows/cmake-multi-platform.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9a2aa4db38d3115ed60da621e012c0efc0172aae">
CMakeLists.txt
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6651ddff6eb82c840ced7c1dddee15c6e1913dd4">
Dockerfile
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec9a00bfd09b3190ac6b22251dbb1aa95a0579d">
README.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#46e2bfdf35ce8caa4b542110e7ed030b6b9fb042">
changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#690cecf43f3adbe2886b4c1db83dfc737d958f7b">
<span class="new-file">
+
cmake/CPM.cmake
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#722ff45382c0b4567fbce61e606c84a36243d82c">
<span class="new-file">
+
debian/patches/cifpp-share-dir.patch
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bc34014ab4b9a49dd7a27bdd8d352912607c3a96">
<span class="new-file">
+
debian/patches/series
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e6c887cc26200426f93d0fe92541a5f91eb2ae59">
doc/mkdssp.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a9974cf95795b494094d95a8caf1b2fdb80131eb">
libdssp/CMakeLists.txt
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#db8ce9974a5828d777df0e9b76f665add87e7cc6">
libdssp/cmake/dsspConfig.cmake.in
โ†’
libdssp/cmake/dssp-config.cmake.in
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a8d2f67fd6748ab583c9cf2d0e019910113fa834">
libdssp/include/dssp.hpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#beb60be8c3c50cca57ffe4b03f253296875e9c74">
libdssp/mmcif_pdbx/dssp-extension.dic
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e5ccf0199cabf48748e43a0bf6dd9fac803ed971">
libdssp/src/dssp-io.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec94b0b08965a4149b2f9f9b63350498b873b35">
libdssp/src/dssp-io.hpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c9b3fc9664f728f9fdf90cff85c7d04f8169ab91">
libdssp/src/dssp.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c64ba48a5848c0ecb97eec033a1713c997184b73">
<span class="new-file">
+
python-module/CMakeLists.txt
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#af0eca951eb81bd89d87d8799e4b79fc5a56c808">
<span class="new-file">
+
python-module/dssp-python-plugin.cpp
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#617362607b3e2690241e10bf2f6c4ac491111b3d">
<span class="new-file">
+
python-module/test-mkdssp.py
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#de2d7725bd6dd68710b101d4f58c19c916bfd29d">
src/mkdssp.cpp
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ff97b80b7caad85247c5e4050112e099cef5e17b">
test/1cbs-dssp.cif
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d9577b84b013e0c4f6dcf8189bbe83b18f2948db">
test/CMakeLists.txt
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#66f144853a637660a3ae7bb7d4bcebb8df8c7a36">
<span class="new-file">
+
test/pdb1cbs.ent.gz
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f53e155c4f8724d7736ca9475e7cab86c6409d95">
<span class="new-file">
+
test/test-python.py
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#800d51156bf7adc4cfc0cdefceb26841c09e3946">
test/unit-test-dssp.cpp
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: .875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #626168;">
โ€”
<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/dssp/-/compare/2d007ff4f9d418f06815bcb30f0de7de2a8d0d3d...1f5fa98e59a7a41d4e5152cf604a81141cf72b23">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> ยท <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<span style="color: transparent; font-size: 0; display: none; overflow: hidden; opacity: 0; width: 0; height: 0; max-width: 0; max-height: 0;">
Notification message regarding https://salsa.debian.org/med-team/dssp/-/compare/2d007ff4f9d418f06815bcb30f0de7de2a8d0d3d...1f5fa98e59a7a41d4e5152cf604a81141cf72b23 at 1756639858
</span>



</p>
</div>
</body>
</html>