<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style='--code-editor-font: var(--default-mono-font, "GitLab Mono"), JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;'>
<head>
<meta content="text/html; charset=utf-8" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: .875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml">Debian Med / phyml</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/62211745151a29d5ab766cc9f89fad7b9f706826">62211745</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T21:12:39+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Restrict to 64 bit architectures only by Build-Depending architecture-is-64-bit Closes: #1106652
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/7e5cf91a5d27cb05e0e482e211f2214e6895067d">7e5cf91a</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T21:15:01+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>d/watch: version=5
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/a841b84fc6615b84ca82c85eaab9a7fd150decc1">a841b84f</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T21:15:25+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 3.3.20250515</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/8ff80e156cf65c600786f7d87a06c99ef46e2b43">8ff80e15</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T21:15:25+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/f089d8975fe342e96450c002deab24eb39204d25">f089d897</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T21:15:30+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/3.3.20250515'

Update to upstream version '3.3.20250515'
with Debian dir e4989ce0aad48d13ffce2ef86db9741d3f270936</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/887f13251b5abb054eb011ee38357226c5c34d6d">887f1325</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T21:15:31+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Standards-Version: 4.7.2 (routine-update)
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/commit/f91228c858d63e3f7d6979c92f9dea61d0a8432e">f91228c8</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2025-12-06T22:30:14+01:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Refresh patches
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
130 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#4123588cdef112aa874bf52a300e9ed01db3ccd2">
<span class="new-file">
+
.github/FUNDING.yml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a91b1970808e533a5de67f93824231e12770a765">
<span class="new-file">
+
.github/workflows/ci.yaml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#836efb6e25a091dcb4ff8e1dbb2f0be6a5cbf14c">
<span class="new-file">
+
Makefile
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d5b4de16d947214ec306bd57bed1bd23a939b5f9">
Makefile.am
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#152c3993c79ed609cfec1b4276c2eb31f4d518b3">
autogen.sh
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#03461db87a24c8a99f7e61a96ba5df4ef9e79d47">
<span class="new-file">
+
config.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0a382cdcbcea7fc88d5b1dc00bbdad14a0624e14">
<span class="new-file">
+
config.log
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#22f0bd3cd09f15570dde844a74eb9361c7a77e6a">
<span class="new-file">
+
config.status
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#87db583be5c13c1f7b3c958b10e03d67b6a2ca06">
configure.ac
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ab0df1e4f4eac054b3fb98c728a2d1baa734a597">
debian/patches/apply-cflags.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4149afba33d9c67a830ca0e4115181a0271f4fc3">
debian/patches/apply-ldflags.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f440d121a1e50460d9dd2fa5b3022d8246cca3ee">
debian/patches/filter-sse3-intrinsics.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6f3a0e7c3e302714921e20148750add5ef227469">
debian/patches/fix_declaration_of_temp.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0ad239590caf1f32229185c32cf814afd342d082">
debian/patches/fix_wrong_initialisation_of_array.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e3a9dc24be73b1344c7407143138db68421c2439">
debian/patches/no-configure-ac-date.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0377f9dac78f4d5990bc676c9acc7f531d3c209c">
debian/patches/no-march-native.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#acecfa794df004cba7e8002f550ed635606108ad">
debian/patches/sse_only_if_supported.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e0ece4a919b15a75c23178e379a8ca9c0870bb37">
debian/patches/typos.patch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#68ef9f98c01c7eecd4c605cc26048a06f3304b79">
debian/watch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c86c7a6d9a7bc77f1c375315f47ff6952729ba5b">
<span class="new-file">
+
doc/Makefile
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8b52818d0f696d740be57cc15128a73ac43f3777">
doc/Makefile.am
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5635b094c65ea9bb242f5671695ffc69c540acaa">
doc/fig/phyrexlog.pdf
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0ea64d9e3671f9c31a01590161ab439d5b58e8e6">
doc/naturemag.bst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#68cfb233186cef6ccf088ebba92ea31af3fd2e66">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.aux
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#44f6bee6c4176da903da70e9bb9847b5cfa5dd72">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.bbl
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5d0926c66747a2a3a5f5aeb2a367854f8a2acb00">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.blg
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ff3929f17e0722ab424e75b1f375f3629db851a3">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.fls
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4ea3ed9d1bbba1a1204d036f58af13a8c493a7da">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.idx
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2766a541bd74117b781aa5a4ce57ba8ce45fc255">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.ilg
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#57af0863a3e636f463cab3d6f1e5bcc5c3bc8ee7">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.ind
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c569afa9e9467454caddb6b69c28f7f902b7b1da">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.log
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c043ea502a833cf5cddc83929dacade3d9189d39">
doc/phyml-manual.pdf
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7cd9138a88d69d2b408dde7d192d6e9970e49b20">
doc/phyml-manual.tex
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d30f8182468ef31e06b5de4a2d2cc2b7548972ff">
<span class="new-file">
+
doc/phyml-manual.toc
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d8da03107937c739846fa12b23604cf9cc68d683">
doc/ref.bib
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9d8a7ea030e21513a1cb6a9e6a07652b4de92eed">
examples/lg4x/X1.mat
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#32bb39469ed913b097e65ca82c11152e73678d44">
examples/lg4x/X2.mat
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c243873d13e8b2406cb12f6336566b551e5b1249">
examples/lg4x/X3.mat
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ce6ec6401d463702ed0e4b8157fd3893288bf541">
examples/lg4x/X4.mat
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b10a23509f5f891343a5b4ee3b6b0ccfd44596bc">
examples/lg4x/lg4x.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#313d63214f981b033a0985aa1d28cf11d158a2fa">
examples/nexus_example.nxs
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2de6eca86a86a5a1eeeac316d65937cd0d57d866">
examples/nucleic
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dd2204d9612f202476f79a63e6eeed676b65ccc9">
examples/phyrex/h1n1.nxs
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e6f58edd8ae7867804f0083d13bc62ed68968250">
examples/phyrex/usa_coord.txt
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f1076ce3ed833b91e03432416c583ffea9ac31ec">
examples/proteic
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#09a8e11089bd7b184c2ba7778565c1350e1c7e3a">
<span class="new-file">
+
src/Makefile
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#67e794015a01b8816bd16290e5f8538236da8245">
src/Makefile.am
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a1c5815275ebac4b0675d9b8e7587b107b6c0ff1">
<span class="deleted-file">
โˆ’
src/Makefile_mc.am
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#10d215d4cebff144a6d1f08c747467ce8808a024">
<span class="deleted-file">
โˆ’
src/Makefile_r.am
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#29589b9dde4fef76aac8e8d8b076784d3244d944">
src/alrt.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7c48062a75a2673af37995350917bc8968b18715">
src/ancestral.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#72e97b72ec97537874d872c205d08a87d9dbcc8d">
src/avx.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#014fd133125c1893bf077d47020188217ef591e1">
src/beagle_utils.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4fb38a1336439670432d1f1b82f98d12848e2a16">
src/cl.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d3508582dd71de36a8ed53b252796a3859df635c">
<span class="new-file">
+
src/cv.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6d96bc1a4cc79b011d5647f0b845f5b76f5625e0">
<span class="new-file">
+
src/cv.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cb22014a290932608bec34e7eae1dd29aac5a846">
src/date.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bc02e6ea245ed292d327563e435cd13d3f9c4878">
src/draw.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4cc39b1f2b53ecc66c4170d883a1c9b487f6e676">
src/draw.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#937fc661dfa359d455ce19812f9c119cb8239607">
<span class="new-file">
+
src/evolve.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#25b91294877de523932154450d3504cccaf34271">
<span class="new-file">
+
src/evolve.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#da4264899259740f7254bb9f5b5e8426d5ed79cb">
src/free.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bdb9151cbb30f67e0d165e523d19db30e3146ada">
src/free.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3aa24e0aa5dbdbd5a6a03457add0a95527b87feb">
src/geo.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#66d9613e548af8a380fe8cc3e5e202e3d39715ae">
src/help.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5d3696592e1be7c0180457558b6619596fae37b8">
src/help.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5debc5cb075d737d524faaee1d82d088dbde4860">
<span class="new-file">
+
src/ibm.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a837f61dcfa277dec62df55827efe8b416afa208">
<span class="new-file">
+
src/ibm.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#433f644a73d0422079a0a1decf6a89581132b081">
src/init.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#65d32292059ae66c5d6f7fc3c2a1f8af9ab5788c">
src/init.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8415695980280a04294c9d52160ed22b4e5e1542">
src/interface.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a9577683e3f436053ba54666ca26769f1cf6913e">
src/interface.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c16415fdc2f19b576cbfe9fd335cfbc04e8ce26f">
src/invitee.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0f3044ba93433ecc1c927c85984cb8dc55b76b9f">
src/io.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#04a209ef5eac81bee2cc97e7eb52740ee6ee6ad4">
src/io.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0b6f3e1f66d3317f2eec848848963c75e1dd64a4">
<span class="new-file">
+
src/iou.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a855284d53426fbcbce7a296c164508780664afc">
<span class="new-file">
+
src/iou.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5b4c1004e045ec9556b0d046a1e1adfda8146a2a">
<span class="new-file">
+
src/iwn.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9eb33e7955db6d535d889245aad7f5c3ccafc530">
<span class="new-file">
+
src/iwn.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b400ea2912a521c894001fbd576bba94eb793438">
src/lk.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0987edde9684c7f37e2d596746e158579508502d">
src/lk.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1808f655b869abcf8a1371c8ed1d35ef9b8a6a35">
src/location.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1dd73f48aea822978292a4fb74ab9ca79e0f2a64">
src/location.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bc2c266660808393dc3ab342fc31cefa8d44ad0a">
src/m4.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#700774cc7aefa8b25603f226f8edb3cae943f912">
src/m4.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3a576e09615c0e19842e5f3ac31e858c9ae7fe41">
src/main.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#970ce0cf28ec6b9b27aeb3b6acbed343626e5cf2">
src/make.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7c9e2c4ed4321fc97bb182552517342e961996e8">
src/make.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f572146f3ca0da2730c9b94757227186c006291f">
src/mcmc.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2c7ba104cf910461bf25d7d27c9914368274f303">
src/mcmc.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1536fa120420b7c3d71787173aff9329f3204601">
src/mixt.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ed2280f9a9187abc23d4d7675160149cd56a937f">
src/mixt.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#87589b531f9ad7089d334ec46b4c0fb9a84ca7c2">
src/models.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0a579f8e60b935ce1326c354a78830cd6e010047">
src/models.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#acb73121ed52d4decefb4cf71cc511997f9e012b">
src/mpi_boot.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f559f15b6db39ea9b5b95b1fb6b564a43d609621">
src/nexus.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#63c5be29902aa1e6f225594416af46422989734a">
src/nexus.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c4d14f5364e759f1dd7740647982f8679523f36d">
src/optimiz.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9d708b565bae4a58912e1820ab013bbf6c075a1e">
src/optimiz.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#233175793f46d147b99bcbd00b1ec059715d9116">
<span class="new-file">
+
src/p1.nxs
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1b0c93c332973b9d0aa907cf255b7d2c1030c849">
src/pars.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cf6254bac2e8eec08c5b676bb531f2a9c0220fdb">
src/phyrex.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b75ad214f53661b5de3b7ead059568265f46654b">
src/phyrex.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c6db944874d10613f0589b881511c02bf33e3e2e">
src/rates.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9e6042bf6bad4ddb707b2c00b409939947b5d378">
src/rates.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#305093e54f22bffb269804e5b58c2ceabc659572">
src/rrw.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6eafeec54988aa5949a35c618b801063049fde86">
src/rrw.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a50c440cf2efbeb75699227705c9ae6a52020dbc">
src/rw.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#76f639b9b1bb2b50cb56b896d89b5e378fbe3181">
src/rw.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ae6f3ba9499f613f1534d0ecee289cea10cd6d65">
src/simu.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#533e1e2bed4a6957b9d04097ed91c80fae6b6703">
src/slfv.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4b4566f05271a342bc587408a666561955044706">
src/slfv.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#010aa988caa671a19793ca7c1d923e08be754596">
src/spr.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2730ad3c3018c0e16095d7e4d9178ac3fab73de8">
src/sse.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e35b3bfee47ad17d9522972f28befec3e71a69a0">
src/sse.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ab2abe5e4546f527e000acaff4069d4b5d9979e2">
<span class="new-file">
+
src/sse2neon.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6cd55f2ca9553ef67b341d04bcc40e7d2a24ab3a">
src/stats.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c4d56b3b334a45940206682ed046194b7b8eddd1">
src/stats.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8618222c11d30197f2e514fd443b7dd152530f37">
src/times.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#627fa0c8c73e6ea101e0e70c7374d8a7e1d9b9a8">
src/times.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a84f1a4a432a1a350d78ba2bf1dd646cfd082e28">
src/utilities.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5e6cb2a5bf6dde0a7022ae99c9953e9b36696b5c">
src/utilities.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7c2cf990ef06da93a788cf18045783bb4c6c8249">
<span class="new-file">
+
src/velocity.c
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cf948144edf5231313bd48ad41ac5e10ceeb6c73">
<span class="new-file">
+
src/velocity.h
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3ef9c486d89c31a8aa665db49c30dc4c47519573">
src/xml.c
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1bc07a501d5e374982e15f5b613ba05a065d26ae">
src/xml.h
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#98f7319d526b2610f85f07d910810b0ac7fe293c">
<span class="new-file">
+
stamp-h1
</span>
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: .875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #626168;">
โ€”
<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/compare/cce462bb3bfc7bb72ff92ab4d04b4fc733a76656...f91228c858d63e3f7d6979c92f9dea61d0a8432e">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> ยท <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<span style="color: transparent; font-size: 0; display: none; overflow: hidden; opacity: 0; width: 0; height: 0; max-width: 0; max-height: 0;">
Notification message regarding https://salsa.debian.org/med-team/phyml/-/compare/cce462bb3bfc7bb72ff92ab4d04b4fc733a76656...f91228c858d63e3f7d6979c92f9dea61d0a8432e at 1765056984
</span>



</p>
</div>
</body>
</html>