<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style='--code-editor-font: var(--default-mono-font, "GitLab Mono"), JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;'>
<head>
<meta content="text/html; charset=utf-8" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: .875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Andreas Tille pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta">Debian Med / any2fasta</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/d655eab8623a1c0e7f777a3aad83bb3dcbace93d">d655eab8</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T21:05:03+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>d/watch: version=5
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/a16a3c93628b7b1f55e56ac7610da4f5ffbe5d12">a16a3c93</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T21:06:49+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/d21818287db414628a433651a702ccea172e96f2">d2181828</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T21:06:50+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 0.8.1</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/bdd1b40cecef446ebca48a1728ab5edf14481a67">bdd1b40c</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T21:07:39+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/0.8.1'

Update to upstream version '0.8.1'
with Debian dir cdb7911ac4d05b267d608178a261babaaff38085</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/c9cd2bfd543c38b66dd9645cac1c448e53ee2f93">c9cd2bfd</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T21:07:39+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Standards-Version: 4.7.4 (routine-update)
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/37bd816911f62c27e3aa23fd653671e7c0eaadae">37bd8169</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T21:08:01+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>debputy lint --auto-fix (routine-update)
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/313f25a1416cd19c0380b85461cd01237999c9f2">313f25a1</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T22:19:44+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Adapt autopkgtest to new upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/commit/1ff8283b2cac81a042ed741338a91a3c81e42bd9">1ff8283b</a></strong>
<div>
<span> by Andreas Tille </span> <i> at 2026-04-10T22:21:33+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Upload to unstable
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
32 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#8b6536f69b7b1fa39d8b538b19a1d8f085e9f9ff">
<span class="new-file">
+
.github/workflows/CI.yml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dea01dd89a3b602828e630677fde5d77c06441c8">
<span class="deleted-file">

.travis.yml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0834ae016f8fea5cff771880c0be1d55299732ff">
<span class="new-file">
+
CODE_OF_CONDUCT.md
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8ec9a00bfd09b3190ac6b22251dbb1aa95a0579d">
README.md
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f8557f6d24b7f84a12d6b3b19ad6b86f1413b5ed">
any2fasta
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b763ee16ac1c1987c48aa0af4919f23cf9043f43">
debian/any2fasta-examples.install
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8756c63497c8dc39f7773438edf53b220c773f67">
debian/rules
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#83223a554d33ba7e1888274ff8ac43adb8147ba0">
debian/tests/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8c77cc51b09ef1f7b294222180bcdb53ebb70e2f">
debian/tests/run-unit-test
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#68ef9f98c01c7eecd4c605cc26048a06f3304b79">
debian/watch
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#54c391de2500e0856c23737daf64f9d931569110">
<span class="new-file">
+
environment.yml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f0eca249c61d71d1d8e29cf4012012da7dadbad8">
<span class="new-file">
+
paper/paper.bib
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#30cbbea27bb1efbfe6e3017b073e19e61ebced6f">
<span class="new-file">
+
paper/paper.md
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#111038ed1c0f1fa638614a7b6a727d01ad338e79">
test.clw

test/test.clw
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9d0a5d7346105f021e817a0467547c22e8c10c6c">
test.embl

test/test.embl
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2f8d6babec4653dbf1b2a88c9538d615a2ebd442">
test.fna

test/test.fna
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#678d08e2904295fd96d53080af7a6f9883ffb15f">
<span class="new-file">
+
test/test.fna.bz2
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#701bf9fc001610a4288dcd03ef91b026d8b7e935">
<span class="new-file">
+
test/test.fna.gz
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3fa18c66d1d213ce4dc88860f837d11408129899">
<span class="new-file">
+
test/test.fna.xz
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#100d8cb0dcb7b66beef899a728acbe18b39d6e19">
<span class="new-file">
+
test/test.fna.zip
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2ea4845b6713a99be51f31b1267459912d24d5cb">
<span class="new-file">
+
test/test.fna.zst
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ea1615134a3d2616001cad1f7f70c3de5f04a1eb">
test.fq

test/test.fq
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8073302e71418898a4464dee82af152e0b97f620">
test.gbk

test/test.gbk
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#63148a1aa52a05ebb3503f75e1509ebc657077e6">
test.gfa

test/test.gfa
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e4d22bdb27548f10ad78fa561130afc99fdc537d">
test.gff

test/test.gff
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#13812861526a8e6732839708a9c3a4af4c9b4596">
test.noseq.gff

test/test.noseq.gff
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cc8f7e54cf05d12a7da9125d495e47c1e6793daf">
<span class="new-file">
+
test/test.pdb
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5a7b01a048b02cd9e988eaf93b4d6b3bef40ffdc">
<span class="new-file">
+
test/test.sh
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cd0849b8c9e5c8f8bc11cf5127ab6c3fc369212c">
test.sth

test/test.sth
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: .875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #626168;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/compare/5db33c07f11b26ea4e91768c6cfd8bce088fde8b...1ff8283b2cac81a042ed741338a91a3c81e42bd9">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<span style="color: transparent; font-size: 0; display: none; overflow: hidden; opacity: 0; width: 0; height: 0; max-width: 0; max-height: 0;">
Notification message regarding https://salsa.debian.org/med-team/any2fasta/-/compare/5db33c07f11b26ea4e91768c6cfd8bce088fde8b...1ff8283b2cac81a042ed741338a91a3c81e42bd9 at 1775852694
</span>



</p>
</div>
</body>
</html>