<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/REC-html40/loose.dtd">
<html lang="en" style='--code-editor-font: var(--default-mono-font, "GitLab Mono"), JetBrains Mono, Menlo, DejaVu Sans Mono, Liberation Mono, Consolas, Ubuntu Mono, Courier New, andale mono, lucida console, monospace;'>
<head>
<meta content="text/html; charset=utf-8" http-equiv="Content-Type">
<title>
GitLab
</title>

<style data-premailer="ignore" type="text/css">
a { color: #1068bf; }
</style>


<style>img {
max-width: 100%; height: auto;
}
body {
font-size: .875rem;
}
body {
-webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px;
}
body {
font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji"; font-size: inherit;
}
</style>
</head>
<body style='font-size: inherit; -webkit-text-shadow: rgba(255,255,255,.01) 0 0 1px; font-family: "GitLab Sans",-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Roboto,"Noto Sans",Ubuntu,Cantarell,"Helvetica Neue",sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji","Segoe UI Symbol","Noto Color Emoji";'>
<div class="content">

<h3 style="margin-top: 20px; margin-bottom: 10px;">
Karsten Schöke pushed to branch master at <a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython">Debian Med / python-biopython</a>
</h3>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
Commits:
</h4>
<ul>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/b2480d7b683f6292c072a1e4c528f0fff43ba0c8">b2480d7b</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T06:43:30+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/b51fc0d69e6e9fb798d020b7bcb9f25329861cdd">b51fc0d6</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T06:43:31+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>New upstream version 1.87+dfsg</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/7f85f611b1d404d4a29d7375adc875dd7afe792e">7f85f611</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T06:43:43+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Update upstream source from tag 'upstream/1.87+dfsg'

Update to upstream version '1.87+dfsg'
with Debian dir df313f34fd78f352ff53f94860d6894fe55f408b</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/8f54155a3f4761ebad9b8a319ca45c612c61ac68">8f54155a</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T06:43:44+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>Standards-Version: 4.7.4 (routine-update)
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/22fb417d84973ed962ef55004b0d0793c388a862">22fb417d</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T09:35:59+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>d/rules: Sphinx no longer aborts the build on warnings.
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/8e8fadf4a7b853016abe6056dcc8d92c2792f14d">8e8fadf4</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T10:51:30+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>d/t/control: Remove obsolete skip-not-installable option
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/701ded83897eeaf47f6ef15151f10d86d478c1ef">701ded83</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T11:23:57+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>d/rules: Updated the link to the Debian mathjax jslib after upstream change.
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/a56ba172968c5db9717f95b36abe5fd7931c5806">a56ba172</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T12:03:11+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>d/control: wrap-and-sort and change B-D
</pre>
</li>
<li>
<strong style="font-weight: 600;"><a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/commit/d25b139064d72c269c70bb8f34dda06fa6a3e642">d25b1390</a></strong>
<div>
<span> by Karsten Schöke </span> <i> at 2026-05-13T12:04:50+02:00 </i>
</div>
<pre class="commit-message" style='white-space: pre-wrap; display: block; font-size: 14px; color: #3a383f; position: relative; font-family: "GitLab Mono", "JetBrains Mono", "Menlo", "DejaVu Sans Mono", "Liberation Mono", "Consolas", "Ubuntu Mono", "Courier New", "andale mono", "lucida console", monospace; font-variant-ligatures: none; word-break: break-all; word-wrap: break-word; background-color: #fbfafd; border-radius: 2px; margin: 0; padding: 8px 12px; border: 1px solid #dcdcde;'>prepare release.
</pre>
</li>
</ul>
<h4 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px;">
151 changed files:
</h4>
<ul>
<li class="file-stats">
<a href="#fd5da61396a8376845bee5cdf71aaf3c98a888ae">
.circleci/config.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3ac517dad11a750eb4733a0cf5eb375d247f3116">
.flake8
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#899ce9c202bf7bb5480e72836c3edc773c9c4244">
.github/workflows/ci.yml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5cc2925ca8258af241be7e5b0381edf30266302">
.gitignore
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e7d14d429f898757a423156de0e8c49d75240694">
.pre-commit-config.yaml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d7754918e6821db6ffea065687599ec4f11a8e2d">
Bio/Align/AlignInfo.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b828f25c57e9442dfc9c7738d1dcb83de7e17c19">
Bio/Align/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#0fb32e0023e61bcec50942241d8631e1a6b94cca">
Bio/Align/chain.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f084f699e8c526cc55e5529bd26f24986aa6862f">
Bio/AlignIO/MauveIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ac06a3c92b052e6befbd20c79b184bb1a7523641">
Bio/AlignIO/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dcda2f0cf29b26c97ce2a457ad1dae9330d56b1e">
Bio/Blast/NCBIXML.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c756bff6c484fd6df6e574384ee51f2dfbc60ce9">
Bio/Blast/_parser.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#795fee8b6983596fd1013024b69254c84c6b7334">
Bio/Blast/_writers.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2875fbe76126d77b0916a89fd4ca571f965c1e68">
Bio/Cluster/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#289f18eae0268e423ca2e28114fda1eef9292e9d">
Bio/Entrez/DTDs/einfo.dtd
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#22b32875c85022682ee93ac78c6471976c6b7483">
<span class="new-file">
+
Bio/Entrez/DTDs/pubmed_230101.dtd
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2a1150623c4defdfca2999fa8c66cff59e4d24e8">
<span class="new-file">
+
Bio/Entrez/DTDs/pubmed_240101.dtd
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6ee9321c2d8f4f4f1094fe06520cb05dfc0eb6c1">
<span class="new-file">
+
Bio/Entrez/DTDs/pubmed_250101.dtd
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#92697284e6445c90f2367315b3a37f511dc35e4c">
Bio/Entrez/Parser.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#11e6a4a4f7d94f0f3b4aeefcc98432a8859e2bf7">
Bio/Entrez/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#eab940f13a78b4dd6d2c6b7b5ea8597eafa7eb0a">
Bio/ExPASy/ScanProsite.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#844a6e4bd54e458578804be1668e767a77614708">
Bio/Nexus/Trees.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7c60b27999f1cd66f9763678013fca08f4a73f9f">
Bio/PDB/MMCIFParser.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1beec66c2ff258255e69dbb2677d904240c3f230">
Bio/PDB/PDBIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#89ac6cc0570f4d56a894f16d3bb723b4cbdbcc10">
Bio/PDB/PDBList.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b9595167c9416d4dd20ec36c49e9a8c263dbe9d9">
Bio/PDB/PSEA.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7664c429f7eeb62a78d067b864dd7a0cbeaa7b9e">
Bio/PDB/StructureAlignment.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#32d22b0ac258839964f6fd82f648ab30e8e8eedd">
Bio/PDB/internal_coords.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f6baca80bb6ee331aaf9808989785d061cf4e7d7">
Bio/PDB/vectors.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bb683f78c7fc0556e1bca1db0102b040e7ce8194">
Bio/Phylo/BaseTree.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5fd0b1b3be21c3e950b393f711f253fda0514dc8">
Bio/Phylo/NeXMLIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a6ff258e9bf1f305f2752b673c5e0e1f5592faf3">
Bio/SCOP/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#be1d31723ed174fee4812e16f9ea9f05e1df89cf">
Bio/SearchIO/HmmerIO/hmmer3_text.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#6fba811be6f80b3d5d71825f1c1546bc69159da1">
Bio/SearchIO/InfernalIO/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cc60fd506cd906613fcc58708c6e43f0f9a32590">
Bio/SearchIO/InfernalIO/_base.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9344103bdc11c0d0962f58f6ed271d4b93f389f3">
Bio/SearchIO/_utils.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#227277e4cebf405199d290196749a879f64405b3">
Bio/Seq.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f708e5b7921ac59888f471c69ae3525a3c2ea629">
Bio/SeqIO/FastaIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dfd9464756a3ba7326f68904c94be49a934932fa">
Bio/SeqIO/InsdcIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a5c6f021591079b7e3f26acbc8d520fccf33ebfc">
Bio/SeqIO/Interfaces.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#323f655c7b662b1063ad518decdfa3563aadff22">
Bio/SeqIO/PhdIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5c8da40447e69fac34b67e907990d60df9b72749">
Bio/SeqIO/SnapGeneIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1c077e3cd37dd57cd20805e258296382254f8dbf">
Bio/SeqIO/UniprotIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ffe78ce7356484edd343ab60d3741220b155b737">
Bio/SeqIO/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4ccb7ae3d13234140cbcfc045563496addfea865">
Bio/SeqRecord.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b1b2a20edf9f48e52c4dba4ae8626fb1a99fd990">
Bio/SeqUtils/ProtParam.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3dc8691ad40b3f5fd2aab8e94d71f517d46486da">
Bio/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ce8db1ff92b24d75e8e18e8db3524e555da3ebfc">
Bio/codonalign/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#689d307ac1174187963b6ef5df0fe8a9db9a49bd">
Bio/codonalign/codonalignment.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a0c5abbf5570d1d8d40e4e79e17b9d71a9f1bedb">
Bio/motifs/__init__.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#fe56bf00e6929d48ea996ece1396c66554529af2">
Bio/motifs/meme.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2d808b0edbfb251940649b210529a920f99a7931">
BioSQL/BioSeq.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e50fbb964004cc434789ab89cd188c26a3ca0037">
CONTRIB.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#1039f2f1a2551c10ddf7b67dba18b445346c0057">
CONTRIBUTING.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2b4cb0f620900ebd537d44dfc7e190ec08246db4">
DEPRECATED.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c9cb011f37a33e1717a1f835424b4cb292a0fa39">
Doc/Tutorial/chapter_contributing.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bd8e525579ede85099a19dff14cec19d315d32a4">
Doc/Tutorial/chapter_entrez.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7cf78dc7f1f67b5253afae55a3b1f1548339b3d6">
Doc/Tutorial/chapter_introduction.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dcb398aa8961686f0a3f966e20fa5606efc842cd">
Doc/Tutorial/chapter_testing.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#fc82ba45cff138e92d8aa53ff623e016ea0e72c4">
Doc/biopdb_faq.tex
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#78e7f1507da598e9f6a02810c1f846cfc24fb8ad">
LICENSE.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8875df48c18030126ef5ef5a6f5c93b23451fb9f">
MANIFEST.in
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8e9983d68bc118797b12e3c989281a14e4ae4a62">
NEWS.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#561b88e19de321ca62c7590bbb350765fb110905">
README.rst
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7fc3d07ca9d1369f16b3d12c53f4ea395580e0c1">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/egquery1.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#01fc8d42257d26911c7cc57cbfb5e52e7e2a204a">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/egquery2.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a8092eafae975493504a7eaa75e7ae47ad285866">
Tests/Entrez/einfo1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#851c649a9cb0226e4887f062d5e33f2fbf480e27">
Tests/Entrez/einfo2.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ebba1c664873f32692411a40f70d0ee2e91ac415">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/einfo3.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5dd7ef46db4314b7526e6ac17b4c94e66316b6bd">
Tests/Entrez/einfo4.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e755c43577228baddcc7b97192037c707d74d9a4">
Tests/Entrez/elink1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e42159bdf1dcf8f0c223aa323492feb1e0193244">
Tests/Entrez/elink2.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c60f66eac2ad5de011674624f35244f293d733ea">
Tests/Entrez/elink3.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d939ad86d60af0b5aa84033270be77c4b314b94f">
Tests/Entrez/elink4.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#092d464ba41112b735d53d83b31627d6d5257971">
Tests/Entrez/elink5.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f7dacce621ab4a57ebd06dae48e3e0f792369d5a">
Tests/Entrez/elink6.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3913d1ae9038ecfbcbeff88ddbf351a2348a78f2">
Tests/Entrez/elink7.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#78d451203677401655a3df858127bdbbc1b506f1">
Tests/Entrez/elink8.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d0daac864a88006cf34aa8dab3362d0d4fc98105">
Tests/Entrez/epost1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b8f6d8b769dd09dc2d9c4b39e77c481b070a7821">
Tests/Entrez/epost2.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4e437f07fff48b837e8aa446aaa3290d3b44e44e">
Tests/Entrez/epost3.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#226883c0646bbf80418b7dc4811ce1a8d78b32ef">
Tests/Entrez/esearch1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#fbe7d48570442910e724c7234cbeaf1a6513dad1">
Tests/Entrez/esearch2.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3cff1086b12b9a5c28a35bd91e3ca9b87c84870e">
Tests/Entrez/esearch3.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9eb7fe618ce55bb262cbfe0fc2d5630e0d6cc4d2">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/esearch4.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#adbb6e11e7f524506bda2082b95fee3e37e20064">
Tests/Entrez/esearch5.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#984a9d819445193ddfb206bce05d32a9130afc14">
Tests/Entrez/esearch6.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#088146d7a4b1bfe680c8e8a549b8e4673d965fc0">
Tests/Entrez/esearch7.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5f568e00525aec14f4312c98dcdcf010f420d658">
Tests/Entrez/esearch8.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9de4f6e10da0f4515a0e773f804452b9def49694">
Tests/Entrez/espell.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#3f2fd5968b2732b24b1fde9f4e81593163d7ca6d">
Tests/Entrez/esummary1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#109a7a36a5ced211fa7f8ec5f9ccd80f03c03e4d">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/esummary2.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c61c409c80dda07b50305bc6c7e865c08592e077">
Tests/Entrez/esummary3.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4a21995b1859e99ff1ecb28b8f0e171d0dad8faa">
Tests/Entrez/esummary4.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7d133a88b7a6c73749992c4ccce032e1ce8e2aef">
Tests/Entrez/esummary5.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7d2cda5c54bdf3e1e7d49b4f01fa064016e7757f">
Tests/Entrez/esummary6.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f3a191859a2a72e5389a76348eb75ef5dac22eac">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/esummary7.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ab34132673b907a18a8dd692ae52865d14c0092d">
Tests/Entrez/esummary8.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#bc4be3b41a3ed160ebd3a198ad4efcdb3da220b6">
<span class="deleted-file">

Tests/Entrez/ncbi_mim.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#66cb92ac4a2f1afc28f6113ac69b96fc9ae806d8">
Tests/Entrez/nucleotide1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f9af82509a78a1e995e4dff85f9230ea46795306">
Tests/Entrez/nucleotide2.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f9086db6a8e961c92bbf4b024eda4d9a17818a29">
Tests/Entrez/protein.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2704b29d40dac19c55dfa9a19d4f20a4dbfce1fa">
Tests/Entrez/pubmed1.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e2ca5efd36243a8f7782736e3958c74b2f40d685">
Tests/Entrez/pubmed2.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#211eabfb7fe48b6fd2b06fc7293542a1b964938c">
Tests/Entrez/taxonomy.xml
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cae063d6bc543caae2d0cd1dec0f2b595ead5ef7">
<span class="new-file">
+
Tests/ExPASy/scanprosite_response.xml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#57fc54531ad04909f879f4f191f6aa481f79e83c">
<span class="new-file">
+
Tests/SnapGene/linebreak_in_qualifier_text.dna
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b06fdb83d8b052235f6b96ead138eaeb04d66972">
<span class="new-file">
+
Tests/SnapGene/looped_feature.dna
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#346f9e9b3047affb999c55fc69d244ac07dd156e">
<span class="new-file">
+
Tests/SnapGene/looped_feature_origin.dna
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c1e64feeebc7bbbd8a8547261a10aae331d139f">
Tests/pairwise2_testCases.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#934ca55c9ebe7632b5799271042ab377bcaefd5e">
Tests/test_AlignIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#22b19b47f52249b6b78620d2093079da54616985">
Tests/test_AlignIO_ClustalIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b22d97ec30a0e16ee93b4c97698ba4e5cd73003b">
Tests/test_AlignIO_EmbossIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#552b34c81b7f288109ce6618bea481980a8b20fd">
Tests/test_AlignIO_FastaIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5f56f95282bc1e870c412aa22d4b4a1cea095203">
Tests/test_AlignIO_MauveIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#195037b5ab3215401cc7908feffd250336dfcf02">
Tests/test_AlignIO_PhylipIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2033ef629065f51637c0cd1f6235b7563139a02c">
Tests/test_AlignIO_convert.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#531d7e67bd8733a6309436a36c879d08f3b25270">
Tests/test_Align_format_matrix.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#466acd964709cddc4e1f014cd52f43eec38d7f59">
Tests/test_Align_msf.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#189a29ab3eef15b23cd3230329f50a4a4a77287a">
Tests/test_Entrez.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#4d84bdf88c02a0ec16a63b6a55d56b97934c0fd8">
Tests/test_Entrez_parser.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#a030bc4932e1cb3d3813533449e1ef45e64f52c3">
Tests/test_ExPASy.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#12273f6cde09107a02a1da88f15363cebae842b2">
<span class="new-file">
+
Tests/test_ExPASy_offline.py
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d48a20eba5f4050f978039bcafb05cb987934ff4">
Tests/test_File.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f6f10955e0652f913347cec62472d55b4e45af8b">
Tests/test_NCBIXML.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#326243830aedbe2408a5c8c6ba19a91d0fc35d67">
Tests/test_PDB_PDBIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#ba2dfbcf1f614b48356a0cd2f9d5f35e1c4651a1">
Tests/test_PDB_PSEA.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#7a7afe8e1c2e74dff93b73089869b6e08df09b08">
Tests/test_PDB_SMCRA.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#fd77336285d54e766230d3b7f9d66a1874316d86">
Tests/test_PDB_StructureAlignment.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9b69d218bb7f2a849c96efb534feed8e1a7b9eea">
Tests/test_PDB_vectors.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#25da01ca9f1daba2c2d72c339b20d5a2144a7336">
Tests/test_Phylo.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#e13dc01ef3f68b92bb59a531fbd3db38f605d844">
Tests/test_PhyloXML.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d898536d9396361fadc8beccafbddbb9b05a8f07">
Tests/test_Phylo_matplotlib.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#68bdcd7d494cd77f13cc2bd1861b5a7e3968b621">
Tests/test_ProtParam.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d212925d5c061b17b553bc90f3b074d869618942">
Tests/test_SearchIO_blast_xml.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#2367364f1e49044fb71ce5e35defd916c67ebdd0">
Tests/test_SearchIO_infernal_text_index.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#f0827a652711e0f05f3991051aa7474661925991">
Tests/test_SeqIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cdcdf23cc5c878e0027c1189c6e4d8644422cd40">
Tests/test_SeqIO_FastaIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#b9154fca8f3ec780747803aac9363699ecbe4934">
Tests/test_SeqIO_QualityIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d308aa409b52db38769c48d83941b946ccb19d44">
Tests/test_SeqIO_SnapGene.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#cdb6fcbfd12bc0c85e62d2af8eebb48c904a670e">
Tests/test_SeqIO_UniprotIO.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#d0ef81d8aaa81891fdc32cfab66bec60a15a2d32">
Tests/test_SeqIO_features.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#c666862f06477c8b8c2d57e2ea4819062e6895fe">
Tests/test_Tutorial.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#357c6933f8ced582b726fb17b8756a9211c47675">
Tests/test_UniGene.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#dc2249a5fc0e8aa85b3d7d621bee51968464eb99">
Tests/test_UniProt_GOA.py
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#9c96da0e9f91d7d8937b69b524702c106258f0d1">
debian/changelog
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#58ef006ab62b83b4bec5d81fe5b32c3b4c2d1cc2">
debian/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8756c63497c8dc39f7773438edf53b220c773f67">
debian/rules
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#83223a554d33ba7e1888274ff8ac43adb8147ba0">
debian/tests/control
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#5d07e7d72637aa0d59c89d381fe6dc4cf46e2491">
<span class="new-file">
+
pyproject.toml
</span>
</a>
</li>
<li class="file-stats">
<a href="#8e2edce0d507e1297474f25c00cae94258db38d8">
setup.py
</a>
</li>
</ul>
<h5 style="margin-top: 10px; margin-bottom: 10px; font-size: .875rem;">
The diff was not included because it is too large.
</h5>

</div>
<div class="footer" style="margin-top: 10px;">
<p style="font-size: small; color: #626168;">

<br>
<a href="https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/compare/dcc31892c0aa54f1092d2201e56bfdd00be69af0...d25b139064d72c269c70bb8f34dda06fa6a3e642">View it on GitLab</a>.
<br>
You're receiving this email because of your account on <a target="_blank" rel="noopener noreferrer" href="https://salsa.debian.org">salsa.debian.org</a>. <a href="https://salsa.debian.org/-/profile/notifications" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="mng-notif-link">Manage all notifications</a> · <a href="https://salsa.debian.org/help" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="help-link">Help</a>
<span style="color: transparent; font-size: 0; display: none; overflow: hidden; opacity: 0; width: 0; height: 0; max-width: 0; max-height: 0;">
Notification message regarding https://salsa.debian.org/med-team/python-biopython/-/compare/dcc31892c0aa54f1092d2201e56bfdd00be69af0...d25b139064d72c269c70bb8f34dda06fa6a3e642 at 1778670552
</span>



</p>
</div>
</body>
</html>