<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 14, 2018 at 9:21 AM, Andreas Tille <span dir="ltr"><<a href="mailto:andreas@an3as.eu" target="_blank">andreas@an3as.eu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Control: tags -1 help<br>
<br>
Hi,<br>
<br>
in the bug log of #906337 the test suite aborts with<br>
<br>
...<br>
------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>--------------<br>
MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD<br>
with errorcode 1.<br>
<br>
NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.<br>
You may or may not see output from other processes, depending on<br>
exactly when Open MPI kills them.<br>
------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>--------------<br>
E: Build killed with signal TERM after 60 minutes of inactivity<br>
------------------------------<wbr>------------------------------<wbr>--------------------<br>
...<br>
<br>
<br>
Since I have no experience with MPI but I know that on Debian Science<br>
are people with experience hanging around, I take the freedom to ask<br>
here for help.  I suspect that the test suite assumes some MPI features<br>
which are not available on any autobuilder machine.  Any idea what to<br>
do in this case?<br></blockquote><div><br></div><div>In debian/rules in dolfin, we use the following to allow test programs to run with OpenMPI:</div><div><br></div><div>  export OMPI_MCA_plm_rsh_agent=/bin/false<br></div><div><br></div><div>Maybe that will fix your problem.</div><div><br></div><div>Johannes</div></div></div></div></div>