<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">FYI, in building +dfsg-9 we are seeing new bus errors on armhf (which previously passed the tests)<br><a href="https://buildd.debian.org/status/logs.php?arch=armhf&pkg=seqan2">https://buildd.debian.org/status/logs.php?arch=armhf&pkg=seqan2</a><br></div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr"><a href="https://buildd.debian.org/status/fetch.php?pkg=seqan2&arch=armhf&ver=2.4.0%2Bdfsg-9&stamp=1544194851&raw=0">https://buildd.debian.org/status/fetch.php?pkg=seqan2&arch=armhf&ver=2.4.0%2Bdfsg-9&stamp=1544194851&raw=0</a><br></div><div dir="ltr"><br></div><div>And on mips there is a new test failure (tests previously passed here):</div><div><br></div><div><a href="https://buildd.debian.org/status/fetch.php?pkg=seqan2&arch=mips&ver=2.4.0%2Bdfsg-9&stamp=1544151238&raw=0">https://buildd.debian.org/status/fetch.php?pkg=seqan2&arch=mips&ver=2.4.0%2Bdfsg-9&stamp=1544151238&raw=0</a><br></div><div><br></div><div>Given that these architectures (and sparc64) previously built fine for Debian, I suggest we revert this patch for now.</div><div><br></div><div dir="ltr"><div dir="ltr">===</div><div>armel bus errors:</div><div>===</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr"><div dir="ltr"> 39/400 Test  #46: test_test_index_crosscompare_dna ..................................................Bus error***Exception:   0.01 sec</div><div dir="ltr">TEST SUITE test_index</div><div dir="ltr">SEQAN_ENABLE_DEBUG == 1</div><div dir="ltr">SEQAN_ENABLE_TESTING == 1</div><div dir="ltr">SEQAN_CXX_FLAGS == "SEQAN_CXX_FLAGS_NOT_SET"</div><div dir="ltr">SEQAN_ASYNC_IO == 1<br>testIndexCrossCompareDna OK<br><br> 46/400 Test  #52: test_test_index_fm_rank_dictionary ................................................Bus error***Exception:   0.01 sec<br>TEST SUITE tests<br>SEQAN_ENABLE_DEBUG == 1<br>SEQAN_ENABLE_TESTING == 1<br>SEQAN_CXX_FLAGS == "SEQAN_CXX_FLAGS_NOT_SET"<br>SEQAN_ASYNC_IO == 1<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<bool, seqan::Naive<void, seqan::RDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<bool, seqan::Levels<void, seqan::LevelsRDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<seqan::SimpleType<unsigned char, seqan::Dna_>, seqan::Levels<void, seqan::LevelsRDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<seqan::SimpleType<unsigned char, seqan::Dna5_>, seqan::Levels<void, seqan::LevelsRDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<seqan::SimpleType<unsigned char, seqan::Dna5Q_>, seqan::Levels<void, seqan::LevelsRDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<seqan::SimpleType<unsigned char, seqan::ReducedAminoAcid_<seqan::Tag<seqan::Murphy10_> > >, seqan::Levels<void, seqan::LevelsRDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK<br>RankDictionaryTest_Constructor type parameter seqan::RankDictionary<seqan::SimpleType<unsigned char, seqan::AminoAcid_>, seqan::Levels<void, seqan::LevelsRDConfig<unsigned int, seqan::Alloc<void>, 1u, 1u> > > OK</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr">===</div><div>mips test failure</div><div>===</div><div><br></div><div><div>  5/397 Test   #7: test_align_parallel_data_structures ...............................................Child aborted***Exception:   0.10 sec</div><div>TEST SUITE test_align_parallel_data_structures</div><div>SEQAN_ENABLE_DEBUG == 1</div><div>SEQAN_ENABLE_TESTING == 1</div><div>SEQAN_CXX_FLAGS == "SEQAN_CXX_FLAGS_NOT_SET"</div><div>SEQAN_ASYNC_IO == 1</div><div>test_align_parallel_wavefront_task_scheduler_construct OK</div><div>test_align_parallel_wavefront_task_scheduler_async OK</div><div>test_align_parallel_wavefront_alignment_scheduler_construct OK</div><div>test_align_parallel_wavefront_alignment_scheduler_async OK</div><div>double free or corruption (out)</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>