<div dir="ltr">Dear Andreas,<div><br></div><div>Will give it a look asap.</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Julien.</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Mar 8, 2019 at 9:34 AM Julien Yann Dutheil <<a href="mailto:julien.dutheil@univ-montp2.fr">julien.dutheil@univ-montp2.fr</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear Andreas,<div><br></div><div>Will give it a look asap.</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>Julien.</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, Mar 8, 2019 at 6:30 AM Andreas Tille <<a href="mailto:tille@debian.org" target="_blank">tille@debian.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Julien,<br>
<br>
after fixing bug #923457 I realised that the package does not<br>
build on all architectures[1]. S390x fails with[2]<br>
<br>
 4/14 Test  #5: test_likelihood_nh ...............***Failed    2.44 sec<br>
<br>
/ 1<br>
- 2<br>
\ 3<br>
- 4<br>
/ 5<br>
- 6<br>
\ 7<br>
- 8<br>
/ 9<br>
- 10<br>
\ 11 nodes loaded.<br>
Theta0 set to 0.444785<br>
Theta1 set to 0.137341<br>
Theta2 set to 0.219281<br>
Theta3 set to 0.759382<br>
Theta4 set to 0.549516<br>
Theta5 set to 0.925583<br>
Theta6 set to 0.527333<br>
Theta7 set to 0.891561<br>
Theta8 set to 0.331932<br>
Theta9 set to 0.523327<br>
Initializing data structure............: Done.<br>
Number of distinct sites...............: 363<br>
Initializing data structure............: Done.<br>
Number of distinct sites...............: 363<br>
<br>
Optimizing... / 1<br>
Optimizing... - 2<br>
Optimizing... \ 3<br>
Optimizing... - 4<br>
Optimizing... / 5<br>
Optimizing... - 6<br>
Optimizing... \ 7<br>
Optimizing... - 8<br>
Optimizing... / 9<br>
Optimizing... - 10<br>
Optimizing... \ 11<br>
Optimizing... - 12<br>
Optimizing... / 13<br>
Optimizing... - 14<br>
<br>
<br>
Optimizing... / 1<br>
Optimizing... - 2<br>
Optimizing... \ 3<br>
Optimizing... - 4<br>
Optimizing... / 5<br>
Optimizing... - 6<br>
Optimizing... \ 7<br>
Optimizing... - 8<br>
Optimizing... / 9<br>
Optimizing... - 10<br>
Optimizing... \ 11<br>
Optimizing... - 12<br>
Optimizing... / 13<br>
Optimizing... - 14<br>
<br>
15: 5347.92 15: 5347.92<br>
0.516673 0.516673<br>
0.184681 0.184681<br>
0.209158 0.209158<br>
0.795359 0.795359<br>
0.489372 0.489372<br>
0.918414 0.918414<br>
0.489537 0.489537<br>
0.913968 0.913968<br>
0.180359 0.180359<br>
0.797456 0.797456<br>
Initializing data structure............: Done.<br>
Number of distinct sites...............: 365<br>
Initializing data structure............: Done.<br>
Number of distinct sites...............: 365<br>
<br>
Optimizing... / 1<br>
Optimizing... - 2<br>
Optimizing... \ 3<br>
Optimizing... - 4<br>
Optimizing... / 5<br>
Optimizing... - 6<br>
Optimizing... \ 7<br>
Optimizing... - 8<br>
Optimizing... / 9<br>
Optimizing... - 10<br>
Optimizing... \ 11<br>
Optimizing... - 12<br>
Optimizing... / 13<br>
Optimizing... - 14<br>
Optimizing... \ 15<br>
Optimizing... - 16<br>
Optimizing... / 17<br>
<br>
<br>
Optimizing... / 1<br>
Optimizing... - 2<br>
Optimizing... \ 3<br>
Optimizing... - 4<br>
Optimizing... / 5<br>
Optimizing... - 6<br>
Optimizing... \ 7<br>
Optimizing... - 8<br>
Optimizing... / 9<br>
Optimizing... - 10<br>
Optimizing... \ 11<br>
Optimizing... - 12<br>
Optimizing... / 13<br>
Optimizing... - 14<br>
Optimizing... \ 15<br>
Optimizing... - 16<br>
Optimizing... / 17<br>
<br>
18: 5391.43 18: 5391.43<br>
0.60777 0.60777<br>
0.127151 0.127151<br>
0.189039 0.189039<br>
0.788612 0.788612<br>
0.564763 0.564763<br>
0.941319 0.941319<br>
0.565297 0.565297<br>
0.844854 0.844854<br>
0.357532 0.357532<br>
0.717998 0.717998<br>
Initializing data structure............: Done.<br>
Number of distinct sites...............: 375<br>
Initializing data structure............: Done.<br>
Number of distinct sites...............: 375<br>
<br>
Optimizing... / 1<br>
Optimizing... - 2<br>
Optimizing... \ 3<br>
Optimizing... - 4<br>
Optimizing... / 5<br>
Optimizing... - 6<br>
Optimizing... \ 7<br>
Optimizing... - 8<br>
Optimizing... / 9<br>
Optimizing... - 10<br>
Optimizing... \ 11<br>
Optimizing... - 12<br>
Optimizing... / 13<br>
Optimizing... - 14<br>
<br>
<br>
Optimizing... / 1<br>
Optimizing... - 2<br>
Optimizing... \ 3<br>
Optimizing... - 4<br>
Optimizing... / 5<br>
Optimizing... - 6<br>
Optimizing... \ 7<br>
Optimizing... - 8<br>
Optimizing... / 9<br>
Optimizing... - 10<br>
Optimizing... \ 11<br>
Optimizing... - 12<br>
Optimizing... / 13<br>
Optimizing... - 14<br>
<br>
15: 5401.83 15: 5401.83<br>
0.419181 0.419181<br>
0.140299 0.140299<br>
0.295 0.295<br>
0.900203 0.900203<br>
0.411605 0.411605<br>
0.919716 0.919716<br>
0.563041 0.563041<br>
0.813833 0.813833<br>
0.194868 0.194868<br>
0.801315 0.801315<br>
0.444785 0.514541 0.514541<br>
0.137341 0.15071 0.15071<br>
0.219281 0.231066 0.231066<br>
0.759382 0.828058 0.828058<br>
0.549516 0.48858 0.48858<br>
0.925583 0.926483 0.926483<br>
0.527333 0.539292 0.539292<br>
0.891561 0.857552 0.857552<br>
0.331932 0.244253 0.244253<br>
0.523327 0.772256 0.772256<br>
<br>
<br>
...<br>
<br>
93% tests passed, 1 tests failed out of 14<br>
<br>
Total Test time (real) =  31.15 sec<br>
<br>
The following tests FAILED:<br>
   5 - test_likelihood_nh (Failed)<br>
<br>
<br>
I remember that I once had even a test failure on my local amd64 - so<br>
this test might be a bit undetermined.  Please confirm this and I'd be<br>
happy if you could send an *as simple as possible* patch or simply<br>
deactivate the patch.  We are in deep freeze and need to find a quick<br>
and also simple solution.<br>
<br>
Kind regards<br>
<br>
       Andreas.<br>
<br>
<br>
[1] <a href="https://buildd.debian.org/status/package.php?p=libbpp-phyl" rel="noreferrer" target="_blank">https://buildd.debian.org/status/package.php?p=libbpp-phyl</a><br>
[2] <a href="https://buildd.debian.org/status/fetch.php?pkg=libbpp-phyl&arch=s390x&ver=2.4.1-2&stamp=1551477555&raw=0" rel="noreferrer" target="_blank">https://buildd.debian.org/status/fetch.php?pkg=libbpp-phyl&arch=s390x&ver=2.4.1-2&stamp=1551477555&raw=0</a><br>
<br>
-- <br>
<a href="http://fam-tille.de" rel="noreferrer" target="_blank">http://fam-tille.de</a><br>
<br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail-m_94991100830956373gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Julien Y. Dutheil, Ph-D<br>0 (+49) 6421 178 986<div><br>§ Max Planck Institute for Evolutionary Biology<div>Molecular Systems Evolution</div><div>Department of Evolutionary Genetics</div><div>Plön -- GERMANY<br></div><br>§ Institute of Evolutionary Sciences - Montpellier<br>University of Montpellier 2 -- FRANCE</div></div></div></div></div>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Julien Y. Dutheil, Ph-D<br><div>0 (+49) 4522 763 298<br><br>§ Max Planck Institute for Evolutionary Biology</div><div>Molecular Systems Evolution</div><div>Department of Evolutionary Genetics</div><div>Plön -- GERMANY<br></div><div><br>§ Institute of Evolutionary Sciences - Montpellier<br>University of Montpellier 2 -- FRANCE</div></div></div></div></div>