<div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sat, Dec 21, 2019 at 2:36 AM John Marshall <<a href="mailto:John.W.Marshall@glasgow.ac.uk">John.W.Marshall@glasgow.ac.uk</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">On 20 Dec 2019, at 19:21, Debian Bug Tracking System <<a href="mailto:owner@bugs.debian.org" target="_blank">owner@bugs.debian.org</a>> wrote:<br>
> htslib (1.10.2-1) unstable; urgency=medium<br>
> .<br>
>   * New upstream version<br>
>   * debian/source/options: ignore changes to aclocal.m4 <a href="http://config.h.in" rel="noreferrer" target="_blank">config.h.in</a> configure<br>
>   * debian/control: remove libhts-private-dev (Closes: #947066)<br>
<br>
These changes have not yet been pushed to <a href="http://salsa.debian.org/med-team/htslib.git" rel="noreferrer" target="_blank">salsa.debian.org/med-team/htslib.git</a> so it is difficult to verify the bug fix.<br></blockquote><div><br></div><div>Oops, mea culpa. I've pushed them up.<br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<br>
What is the purpose of the htslib-test subpackage? Its description says it contains the test data and scripts (from test/*), presumably so the upstream HTSlib test suite can be run against the library and tools installed from libhts3 and the subpackage currently named tabix. Why then does it also include HTSlib source code and an incomplete copy of HTSlib's build infrastructure?<br></blockquote><div><br></div><div>I believe that was the easiest way to build and run the unit tests against the installed libhts library. If you can find a simpler or smaller method to build + run the unit tests (especially if any changes needed can be incorporated upstream) then that would be very welcome!<br></div></div><br clear="all"></div>Cheers,<br><div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr" style="font-size:small"><span style="font-size:12.8px">Michael R. Crusoe</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>