<div dir="ltr"><div>Control: forwarded -1 <a href="https://github.com/sanger-pathogens/Bio-Tradis/issues/116">https://github.com/sanger-pathogens/Bio-Tradis/issues/116</a></div><div><br></div><div><br></div><div>On Fri, 27 Dec 2019 11:42:05 +0100 Paul Gevers <<a href="mailto:elbrus@debian.org">elbrus@debian.org</a>> wrote:</div>> Dear maintainers,<br>> <br>> With a recent upload of bio-tradis the autopkgtest of bio-tradis fails<br>> in testing when that autopkgtest is run with the binary packages of<br>> bio-tradis from unstable. It passes when run with only packages from<br><div>> testing. <br></div><div><br></div><div>Why are we mixing testing scripts and binaries?</div><div><br></div><div>> Additionally, looking at the failure mode in unstable, it seems some</div>> package (samtools?) made your (test?) dependencies non-installable in<br>> unstable. You probably need to fix that as well, or raise the issue with<br><div>> the samtools maintainer.</div><div><br></div><div>Yes, we did this. bio-tradis has a version parsing bug and it thinks that samtools 1.10 is older than samtools 1.0, thus passing arguments to samtools in the wrong form</div><div><br></div><div>This has been fixed in <a href="https://salsa.debian.org/med-team/bio-tradis">https://salsa.debian.org/med-team/bio-tradis</a> but there are other test issues, so I've asked upstream to investigate their seriousness at <a href="https://github.com/sanger-pathogens/Bio-Tradis/issues/116">https://github.com/sanger-pathogens/Bio-Tradis/issues/116</a></div><br></div>