<div dir="ltr"><div dir="ltr"><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, 25 May 2020 at 20:10, Andreas Tille <<a href="mailto:tille@debian.org">tille@debian.org</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Chris,<br>
<br>
On Mon, May 25, 2020 at 10:49:28AM +0100, Chris Lamb wrote:<br>
> This should have read:<br>
> <br>
>   Whilst you do patch out -fdebug-prefix-map in<br>
>   debian/patches/reproducible.patch, you also need to filter<br>
>   -ffile-prefix-map.<br>
<br>
I've tried this in Git[1] but the resulting bowtie2 package fails the<br>
autopkgtest in my pbuilder environment.  I remember issues with<br>
autopkgtest in pbuilder before and I suspect this might be the case<br>
here as well.  However, before I really upload I'd invite others to<br>
have a look.<br></blockquote><div><br></div><div>I can confirm that this passes for me.</div><div><br></div><div>autopkgtest [20:46:44]: test binary-run: [-----------------------<br>autopkgtest [20:46:45]: test binary-run: -----------------------]<br>autopkgtest [20:46:45]: test binary-run:  - - - - - - - - - - results - - - - - - - - - -<br>binary-run           PASS<br>autopkgtest [20:46:45]: @@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ summary<br>check-wo-arguments   PASS<br>indexing-ref-genome  PASS<br>binary-run           PASS</div><div><br></div><div>Just maybe, this is a false positive again, at your end.</div><div><br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
[1] <a href="https://salsa.debian.org/med-team/bowtie2/-/commit/97052bc2de1b271f368dd8415cfafde5356e2fe8" rel="noreferrer" target="_blank">https://salsa.debian.org/med-team/bowtie2/-/commit/97052bc2de1b271f368dd8415cfafde5356e2fe8</a></blockquote><div><br></div><div>Kind regards,</div><div>Nilesh<br></div></div></div>