<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Hi, </div><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><p style="box-sizing:border-box;margin-bottom:16px;color:rgb(36,41,46);font-family:-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Helvetica,Arial,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji";font-size:14px;margin-top:0px">I've narrowed the issue down to one (or a few) sequences. Basically this error occurs whenever a query sequence is less than five nucleotides (and is independent of the length of sequences in the database file). Besides, it's not specific to the Debian package. I encountered the same error when I compiled from the upstream source, but it went away when I downloaded the compiled binary, so it's probably something to do with the way it is compiled.</p><p style="box-sizing:border-box;margin-bottom:16px;color:rgb(36,41,46);font-family:-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Helvetica,Arial,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji";font-size:14px;margin-top:0px">I've reported this on the Github issue page <a href="https://github.com/bbuchfink/diamond/issues/351">here</a> along with the smallest dataset that can be used to reproduce this issue. Maybe now we wait for upstream to take a look? </p><p style="box-sizing:border-box;margin-bottom:16px;color:rgb(36,41,46);font-family:-apple-system,BlinkMacSystemFont,"Segoe UI",Helvetica,Arial,sans-serif,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji";font-size:14px;margin-top:0px">Regards, <br>Pranav</p></div></div><div hspace="streak-pt-mark" style="max-height:1px"><img alt="" style="width:0px;max-height:0px;overflow:hidden" src="https://mailfoogae.appspot.com/t?sender=aYmFsbGFuZXlwcmFuYXZAZ21haWwuY29t&type=zerocontent&guid=2a1e4309-314c-4ddf-977f-a32516b83fec"><font color="#ffffff" size="1">ᐧ</font></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, May 22, 2020 at 3:37 AM Andreas Tille <<a href="mailto:andreas@an3as.eu">andreas@an3as.eu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">On Thu, May 21, 2020 at 06:33:05PM +0530, Pranav Ballaney wrote:<br>
> Yes, I've been able to reproduce and roughly pin point the issue, but it<br>
> needs some more work before it's solved.<br>
<br>
That's pretty good news.  Just take the time you need.<br>
<br>
Thanks for your effort<br>
<br>
      Andreas.<br>
<br>
-- <br>
<a href="http://fam-tille.de" rel="noreferrer" target="_blank">http://fam-tille.de</a><br>
</blockquote></div>