<div dir="ltr"><div><br></div><div>sorry for the wrapped lines in my previous message:</div><div><br>blastn -db "IGH_V_F_CAAT_SIGNAL IGH_V_F_OCTAMER IGH_V_F_N1-REGION IGH_V_F_HEPTANUCLEOTIDE IGH_V_F_L-REGION IGH_V_F_FR1-IMGT IGH_V_F_FR2-IMGT IGH_V_F_D-REGION IGH_V_F_L-PART2 IGH_V_F_L-PART1 IGH_V_F_V-NONAMER IGH_V_F_N2-REGION IGH_V_F_FR4-IMGT IGH_V_F_CDR1-IMGT IGH_V_F_V-HEPTAMER IGH_V_F_JUNCTION IGH_V_F_V-RS IGH_V_F_INTERNAL-HEPTAMER IGH_V_F_CDR2-IMGT IGH_V_F_J-REGION IGH_V_F_FR3-IMGT IGH_V_F_CDR3-IMGT IGH_V_F_TATA_BOX IGH_V_F_PYR-RICH IGH_V_F_P-REGION IGH_V_F_V-REGION IGH_V_F_V-SPACER IGH_V_P_CDR3-IMGT IGH_V_P_V-NONAMER IGH_V_P_L-REGION IGH_V_P_FR2-IMGT IGH_V_P_FR3-IMGT IGH_V_P_PYR-RICH IGH_V_P_V-SPACER IGH_V_P_L-PART2 IGH_V_P_L-PART1 IGH_V_P_CDR1-IMGT IGH_V_P_V-HEPTAMER IGH_V_P_HEPTANUCLEOTIDE IGH_V_P_V-REGION IGH_V_P_TATA_BOX IGH_V_P_CDR2-IMGT IGH_V_P_FR1-IMGT IGH_V_P_OCTAMER IGH_V_P_V-RS IGH_V_ORF_V-REGION IGH_V_ORF_V-HEPTAMER IGH_V_ORF_FR1-IMGT IGH_V_ORF_CDR2-IMGT IGH_V_ORF_L-PART1 IGH_V_ORF_L-PART2 IGH_V_ORF_FR3-IMGT IGH_V_ORF_V-RS IGH_V_ORF_CDR1-IMGT IGH_V_ORF_V-SPACER IGH_V_ORF_V-NONAMER IGH_V_ORF_FR2-IMGT IGH_V_ORF_L-REGION IGH_V_ORF_CDR3-IMGT IGH_J_F_V-SPACER IGH_J_F_J-NONAMER IGH_J_F_J-REGION IGH_J_F_J-RS IGH_J_F_FR3-IMGT IGH_J_F_J-HEPTAMER IGH_J_F_OCTAMER IGH_J_F_FR4-IMGT IGH_J_F_CDR2-IMGT IGH_J_P_J-HEPTAMER IGH_J_P_J-RS IGH_J_P_J-REGION IGH_J_P_J-NONAMER IGH_D_F_N1-REGION IGH_D_F_M2 IGH_D_F_M1 IGH_D_F_3D-SPACER IGH_D_F_CH9 IGH_D_F_CH6 IGH_D_F_CH7 IGH_D_F_JUNCTION IGH_D_F_CH4 IGH_D_F_CH5 IGH_D_F_CH2 IGH_D_F_CH3 IGH_D_F_CH1 IGH_D_F_D-GENE-UNIT IGH_D_F_CH2D2 IGH_D_F_D1-REGION IGH_D_F_CH3D2 IGH_D_F_5D-NONAMER IGH_D_F_CH4D IGH_D_F_5D-HEPTAMER IGH_D_F_CHS IGH_D_F_3D-NONAMER IGH_D_F_L-PART1 IGH_D_F_L-PART2 IGH_D_F_D2-REGION IGH_D_F_CH3-CHS IGH_D_F_CH10 IGH_D_F_CH3D IGH_D_F_CH2D IGH_D_F_CH1D IGH_D_F_CH4D2 IGH_D_F_M IGH_D_F_5D-SPACER IGH_D_F_P-REGION IGH_D_F_CONNECTING-REGION IGH_D_F_3D-HEPTAMER IGH_D_F_CDR3-IMGT IGH_D_F_H1 IGH_D_F_H2 IGH_D_F_D-REGION IGH_D_F_H IGH_D_F_N2-REGION IGH_D_P_D-GENE-UNIT IGH_D_P_5D-SPACER IGH_D_P_3D-NONAMER IGH_D_P_3D-HEPTAMER IGH_D_P_D-REGION IGH_D_P_3D-SPACER IGH_D_P_5D-HEPTAMER IGH_D_P_5D-NONAMER IGH_C_F_CH4-CHS IGH_C_F_CH4D3 IGH_C_F_CH4D2 IGH_C_F_H1 IGH_C_F_H3 IGH_C_F_H2 IGH_C_F_H4 IGH_C_F_CH3-CHS IGH_C_F_OCTAMER IGH_C_F_CH3D3 IGH_C_F_CH3D2 IGH_C_F_CONNECTING-REGION IGH_C_F_CH2D3 IGH_C_F_CH2D2 IGH_C_F_M2 IGH_C_F_M1 IGH_C_F_CHS IGH_C_F_CH2D IGH_C_F_CH7 IGH_C_F_CH9 IGH_C_F_CH1 IGH_C_F_CH2 IGH_C_F_CH3 IGH_C_F_CH4 IGH_C_F_CH5 IGH_C_F_CH3D IGH_C_F_CH6 IGH_C_F_CH4D IGH_C_F_TATA_BOX IGH_C_F_M IGH_C_F_H IGH_C_F_CH10 IGH_C_F_CH1D IGH_C_P_CH3-CHS IGH_C_P_CH3D2 IGH_C_P_CH3D3 IGH_C_P_CH2D3 IGH_C_P_CH2D2 IGH_C_P_CH4-CHS IGH_C_P_CHS IGH_C_P_H5 IGH_C_P_H4 IGH_C_P_H1 IGH_C_P_H3 IGH_C_P_H2 IGH_C_P_CH4D3 IGH_C_P_CH4D2 IGH_C_P_CH6 IGH_C_P_CH5 IGH_C_P_CH7 IGH_C_P_CH2 IGH_C_P_CH1 IGH_C_P_CH4 IGH_C_P_CH3 IGH_C_P_M2 IGH_C_P_M1 IGH_C_P_H IGH_C_P_M IGH_C_P_CH3D IGH_C_P_CH4D IGH_C_P_CH2D IGH_C_P_CONNECTING-REGION IGK_V_F_CAAT_SIGNAL IGK_V_F_OCTAMER IGK_V_F_TATA_BOX IGK_V_F_CDR2-IMGT IGK_V_F_V-REGION IGK_V_F_N-REGION IGK_V_F_FR1-IMGT IGK_V_F_PENTADECAMER IGK_V_F_J-REGION IGK_V_F_P-REGION IGK_V_F_CDR1-IMGT IGK_V_F_V-SPACER IGK_V_F_FR3-IMGT IGK_V_F_CDR3-IMGT IGK_V_F_V-NONAMER IGK_V_F_L-REGION IGK_V_F_JUNCTION IGK_V_F_FR2-IMGT IGK_V_F_V-RS IGK_V_F_L-PART1 IGK_V_F_L-PART2 IGK_V_F_DECAMER IGK_V_F_V-HEPTAMER IGK_V_P_V-SPACER IGK_V_P_CDR1-IMGT IGK_V_P_DECAMER IGK_V_P_FR1-IMGT IGK_V_P_L-REGION IGK_V_P_V-HEPTAMER IGK_V_P_OCTAMER IGK_V_P_FR2-IMGT IGK_V_P_FR3-IMGT IGK_V_P_V-RS IGK_V_P_CDR2-IMGT IGK_V_P_L-PART2 IGK_V_P_L-PART1 IGK_V_P_PENTADECAMER IGK_V_P_V-REGION IGK_V_P_V-NONAMER IGK_V_P_CDR3-IMGT IGK_V_P_TATA_BOX IGK_V_ORF_DECAMER IGK_V_ORF_V-SPACER IGK_V_ORF_V-HEPTAMER IGK_V_ORF_CDR2-IMGT IGK_V_ORF_FR2-IMGT IGK_V_ORF_V-REGION IGK_V_ORF_L-REGION IGK_V_ORF_CDR1-IMGT IGK_V_ORF_L-PART1 IGK_V_ORF_L-PART2 IGK_V_ORF_FR3-IMGT IGK_V_ORF_V-RS IGK_V_ORF_PENTADECAMER IGK_V_ORF_V-NONAMER IGK_V_ORF_TATA_BOX IGK_V_ORF_FR1-IMGT IGK_V_ORF_OCTAMER IGK_V_ORF_CDR3-IMGT IGK_J_F_FR4-IMGT IGK_J_F_J-HEPTAMER IGK_J_F_J-RS IGK_J_F_J-REGION IGK_J_F_CH2D IGK_J_F_V-HEPTAMER IGK_J_F_J-NONAMER IGK_J_P_J-REGION IGK_J_P_J-NONAMER IGK_J_ORF_J-REGION IGK_J_ORF_J-NONAMER IGK_J_ORF_J-HEPTAMER IGK_J_ORF_J-RS IGK_C_F_CL IGL_V_F_OCTAMER IGL_V_F_CDR2-IMGT IGL_V_F_FR4-IMGT IGL_V_F_FR1-IMGT IGL_V_F_L-PART2 IGL_V_F_L-PART1 IGL_V_F_J-REGION IGL_V_F_TATA_BOX IGL_V_F_CDR1-IMGT IGL_V_F_P-REGION IGL_V_F_V-RS IGL_V_F_V-SPACER IGL_V_F_V-REGION IGL_V_F_FR2-IMGT IGL_V_F_FR3-IMGT IGL_V_F_L-REGION IGL_V_F_DECAMER IGL_V_F_V-NONAMER IGL_V_F_JUNCTION IGL_V_F_CDR3-IMGT IGL_V_F_PENTADECAMER IGL_V_F_V-HEPTAMER IGL_V_F_N-REGION IGL_V_P_FR1-IMGT IGL_V_P_CDR1-IMGT IGL_V_P_TATA_BOX IGL_V_P_PENTADECAMER IGL_V_P_L-PART2 IGL_V_P_L-PART1 IGL_V_P_DECAMER IGL_V_P_V-HEPTAMER IGL_V_P_FR3-IMGT IGL_V_P_CDR2-IMGT IGL_V_P_V-NONAMER IGL_V_P_V-RS IGL_V_P_FR2-IMGT IGL_V_P_L-REGION IGL_V_P_V-REGION IGL_V_P_OCTAMER IGL_V_P_CDR3-IMGT IGL_V_P_V-SPACER IGL_J_F_FR4-IMGT IGL_J_F_J-REGION IGL_J_F_J-HEPTAMER IGL_J_F_L-REGION IGL_J_F_J-NONAMER IGL_J_F_EX1 IGL_J_F_J-RS IGL_J_P_J-HEPTAMER IGL_J_P_J-REGION IGL_J_P_J-RS IGL_J_P_J-NONAMER IGL_J_ORF_J-REGION IGL_C_F_CL IGL_C_F_EX3 IGL_C_P_CL IGI_V_F_V-SPACER IGI_V_F_CDR1-IMGT IGI_V_F_FR4-IMGT IGI_V_F_V-RS IGI_V_F_L-PART1 IGI_V_F_L-PART2 IGI_V_F_FR1-IMGT IGI_V_F_FR3-IMGT IGI_V_F_JUNCTION IGI_V_F_V-NONAMER IGI_V_F_V-HEPTAMER IGI_V_F_CDR3-IMGT IGI_V_F_CDR2-IMGT IGI_V_F_L-REGION IGI_V_F_FR2-IMGT IGI_V_F_V-REGION IGI_V_P_CDR3-IMGT IGI_V_P_L-REGION IGI_V_P_FR2-IMGT IGI_V_P_V-SPACER IGI_V_P_V-RS IGI_V_P_V-NONAMER IGI_V_P_V-REGION IGI_V_P_FR3-IMGT IGI_V_P_CDR1-IMGT IGI_V_P_CDR2-IMGT IGI_V_P_L-PART2 IGI_V_P_L-PART1 IGI_V_P_V-HEPTAMER IGI_V_P_FR1-IMGT IGI_V_ORF_V-REGION IGI_V_ORF_FR1-IMGT IGI_V_ORF_FR3-IMGT IGI_V_ORF_CDR3-IMGT IGI_V_ORF_CDR1-IMGT IGI_V_ORF_CDR2-IMGT IGI_V_ORF_FR2-IMGT IGI_J_F_J-HEPTAMER IGI_J_F_J-REGION IGI_J_F_J-NONAMER IGI_J_F_FR4-IMGT IGI_J_F_J-RS IGI_J_P_J-RS IGI_J_P_J-HEPTAMER IGI_J_P_J-REGION IGI_J_P_J-NONAMER TRA_V_F_CDR3-IMGT TRA_V_F_V-NONAMER TRA_V_F_V-RS TRA_V_F_L-PART1 TRA_V_F_EX3 TRA_V_F_L-PART2 TRA_V_F_FR3-IMGT TRA_V_F_J-REGION TRA_V_F_FR1-IMGT TRA_V_F_V-SPACER TRA_V_F_CDR2-IMGT TRA_V_F_N-REGION TRA_V_F_V-REGION TRA_V_F_CDR1-IMGT TRA_V_F_JUNCTION TRA_V_F_V-HEPTAMER TRA_V_F_FR2-IMGT TRA_V_F_L-REGION TRA_V_P_V-HEPTAMER TRA_V_P_CDR2-IMGT TRA_V_P_V-RS TRA_V_P_V-REGION TRA_V_P_V-NONAMER TRA_V_P_L-REGION TRA_V_P_FR2-IMGT TRA_V_P_CDR3-IMGT TRA_V_P_L-PART2 TRA_V_P_L-PART1 TRA_V_P_FR1-IMGT TRA_V_P_V-SPACER TRA_V_P_CDR1-IMGT TRA_V_P_FR3-IMGT TRA_J_F_J-HEPTAMER TRA_J_F_J-NONAMER TRA_J_F_V-NONAMER TRA_J_F_V-RS TRA_J_F_J-REGION TRA_J_F_J-RS TRA_J_F_FR4-IMGT TRA_J_P_J-NONAMER TRA_J_P_J-REGION TRA_J_P_J-HEPTAMER TRA_J_P_J-RS TRA_J_ORF_J-REGION TRA_D_F_CDR3-IMGT TRA_D_F_CDR1-IMGT TRA_D_F_JUNCTION TRA_D_F_FR1-IMGT TRA_D_F_N-REGION TRA_D_F_CDR2-IMGT TRA_D_F_FR3-IMGT TRA_D_F_FR2-IMGT TRA_D_F_L-PART2 TRA_C_F_EX1 TRA_C_F_EX3 TRA_C_F_EX2 TRA_C_F_EX4 TRB_V_F_V-RS TRB_V_F_N2-REGION TRB_V_F_FR3-IMGT TRB_V_F_D-REGION TRB_V_F_FR2-IMGT TRB_V_F_V-NONAMER TRB_V_F_L-REGION TRB_V_F_DECAMER TRB_V_F_CDR3-IMGT TRB_V_F_J-REGION TRB_V_F_V-REGION TRB_V_F_V-SPACER TRB_V_F_CAAT_SIGNAL TRB_V_F_TATA_BOX TRB_V_F_FR1-IMGT TRB_V_F_L-PART1 TRB_V_F_L-PART2 TRB_V_F_CDR2-IMGT TRB_V_F_CDR1-IMGT TRB_V_F_N-REGION TRB_V_F_V-HEPTAMER TRB_V_F_N1-REGION TRB_V_F_JUNCTION TRB_V_P_V-HEPTAMER TRB_V_P_FR3-IMGT TRB_V_P_V-NONAMER TRB_V_P_L-REGION TRB_V_P_FR2-IMGT TRB_V_P_JUNCTION TRB_V_P_CDR3-IMGT TRB_V_P_FR1-IMGT TRB_V_P_CAAT_SIGNAL TRB_V_P_DECAMER TRB_V_P_TATA_BOX TRB_V_P_V-RS TRB_V_P_CDR1-IMGT TRB_V_P_D-REGION TRB_V_P_J-REGION TRB_V_P_L-PART1 TRB_V_P_L-PART2 TRB_V_P_CDR2-IMGT TRB_V_P_V-REGION TRB_V_P_V-SPACER TRB_V_ORF_DECAMER TRB_J_F_V-RS TRB_J_F_J-NONAMER TRB_J_F_J-HEPTAMER TRB_J_F_J-RS TRB_J_F_TATA_BOX TRB_J_F_J-REGION TRB_J_F_FR4-IMGT TRB_J_P_J-REGION TRB_J_P_J-RS TRB_J_P_J-NONAMER TRB_J_P_J-HEPTAMER TRB_J_ORF_J-NONAMER TRB_J_ORF_J-REGION TRB_J_ORF_J-HEPTAMER TRB_J_ORF_J-RS TRB_D_F_3D-NONAMER TRB_D_F_3D-HEPTAMER TRB_D_F_3D-SPACER TRB_D_F_5D-SPACER TRB_D_F_D-REGION TRB_D_F_5D-HEPTAMER TRB_D_F_5D-NONAMER TRB_D_F_D-GENE-UNIT TRB_D_P_5D-SPACER TRB_D_P_5D-NONAMER TRB_D_P_5D-HEPTAMER TRB_C_F_EX2 TRB_C_F_EX1 TRB_C_F_EX4 TRB_C_F_EX3 TRB_C_P_EX3 TRB_C_P_EX4 TRB_C_P_EX1 TRB_C_P_EX2 TRD_V_F_CDR1-IMGT TRD_V_F_V-HEPTAMER TRD_V_F_OCTAMER TRD_V_F_FR2-IMGT TRD_V_F_L-REGION TRD_V_F_TATA_BOX TRD_V_F_CDR3-IMGT TRD_V_F_V-RS TRD_V_F_V-REGION TRD_V_F_N-REGION TRD_V_F_V-NONAMER TRD_V_F_L-PART1 TRD_V_F_L-PART2 TRD_V_F_JUNCTION TRD_V_F_V-SPACER TRD_V_F_FR3-IMGT TRD_V_F_CDR2-IMGT TRD_V_F_DECAMER TRD_V_F_FR1-IMGT TRD_V_P_V-NONAMER TRD_V_P_V-RS TRD_V_P_V-HEPTAMER TRD_V_P_FR3-IMGT TRD_V_P_L-PART1 TRD_V_P_L-PART2 TRD_V_P_FR1-IMGT TRD_V_P_CDR3-IMGT TRD_V_P_V-REGION TRD_V_P_CDR1-IMGT TRD_V_P_V-SPACER TRD_V_P_CDR2-IMGT TRD_V_P_FR2-IMGT TRD_V_P_L-REGION TRD_J_F_J-NONAMER TRD_J_F_FR4-IMGT TRD_J_F_J-REGION TRD_J_F_J-RS TRD_J_F_J-HEPTAMER TRD_J_P_J-NONAMER TRD_J_P_J-REGION TRD_J_P_J-HEPTAMER TRD_J_P_J-RS TRD_D_F_N-REGION TRD_D_F_3D-SPACER TRD_D_F_D3-REGION TRD_D_F_D1-REGION TRD_D_F_D-GENE-UNIT TRD_D_F_5D-NONAMER TRD_D_F_N1-REGION TRD_D_F_5D-SPACER TRD_D_F_D2-REGION TRD_D_F_D-REGION TRD_D_F_5D-HEPTAMER TRD_D_F_N3-REGION TRD_D_F_3D-NONAMER TRD_D_F_3D-HEPTAMER TRD_C_F_EX3 TRD_C_F_EX4 TRD_C_F_EX1 TRD_C_F_EX2 TRG_V_F_V-RS TRG_V_F_V-SPACER TRG_V_F_CDR2-IMGT TRG_V_F_CDR3-IMGT TRG_V_F_V-HEPTAMER TRG_V_F_CDR1-IMGT TRG_V_F_TATA_BOX TRG_V_F_V-NONAMER TRG_V_F_FR1-IMGT TRG_V_F_N-REGION TRG_V_F_JUNCTION TRG_V_F_FR3-IMGT TRG_V_F_DECAMER TRG_V_F_FR2-IMGT TRG_V_F_L-REGION TRG_V_F_CAAT_SIGNAL TRG_V_F_L-PART1 TRG_V_F_L-PART2 TRG_V_F_V-REGION TRG_V_P_CDR1-IMGT TRG_V_P_FR2-IMGT TRG_V_P_L-REGION TRG_V_P_V-SPACER TRG_V_P_CDR3-IMGT TRG_V_P_V-RS TRG_V_P_V-NONAMER TRG_V_P_V-REGION TRG_V_P_FR3-IMGT TRG_V_P_FR1-IMGT TRG_V_P_L-PART2 TRG_V_P_L-PART1 TRG_V_P_V-HEPTAMER TRG_V_P_CDR2-IMGT TRG_V_ORF_FR3-IMGT TRG_V_ORF_V-RS TRG_V_ORF_CDR3-IMGT TRG_V_ORF_V-REGION TRG_V_ORF_CDR2-IMGT TRG_V_ORF_V-SPACER TRG_V_ORF_L-PART2 TRG_V_ORF_L-PART1 TRG_V_ORF_V-HEPTAMER TRG_V_ORF_FR1-IMGT TRG_V_ORF_FR2-IMGT TRG_V_ORF_L-REGION TRG_V_ORF_CDR1-IMGT TRG_V_ORF_V-NONAMER TRG_J_F_J-RS TRG_J_F_J-REGION TRG_J_F_J-NONAMER TRG_J_F_J-HEPTAMER TRG_J_F_FR4-IMGT TRG_J_F_EX1 TRG_J_P_J-NONAMER TRG_J_P_J-HEPTAMER TRG_J_P_J-RS TRG_J_P_J-REGION TRG_C_F_CONNECTING-REGION TRG_C_F_EX4 TRG_C_F_EX3 TRG_C_F_EX2 TRG_C_F_EX1 TRG_C_F_EX2T TRG_C_F_EX2R TRG_C_F_EX2A TRG_C_F_EX2B TRG_C_F_EX2C TRG_C_P_EX1 TRG_C_P_EX2 TRG_C_P_EX3 TRG_C_P_CONNECTING-REGION TRG_C_P_EX2B TRG_C_P_EX2C TRG_C_P_EX2A" -outfmt 15 -out test_out.json -query test_seq.fa -perc_identity 85 -task blastn -word_size 11 -gapopen 4 -gapextend 2 -penalty -3 -reward 2 -evalue 0.1 -max_target_seqs 500000 -best_hit_overhang 0.1 -best_hit_score_edge 0.1 -num_threads 2<br><br></div><div><br></div></div>