<div dir="ltr"><div>control: forwarded -1 <a href="https://github.com/seqan/needle/issues/128">https://github.com/seqan/needle/issues/128</a></div><div><br></div><div>They are different programs, with different interfaces, alas.<br></div><div><br></div><div>So a workaround will be needed: probably we should rename the binary `seqan-needle` and provide a directory with a regular `needle` that can be added to a user's `PATH`.<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Nov 16, 2022 at 4:26 PM Andreas Tille <<a href="mailto:andreas@an3as.eu">andreas@an3as.eu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Michael,<br>
<br>
Am Thu, Nov 10, 2022 at 01:34:32PM +0100 schrieb Andreas Beckmann:<br>
> Package: seqan-needle<br>
> Version: 1.0.1.0.0.git.3011926+ds-1<br>
> Severity: serious<br>
> <br>
> There is already a (unrelated?) /usr/bin/needle binary in the Debian<br>
> archive, provided by the emboss package.<br>
<br>
Do you think this "needle" (which is an unfortunate name in both<br>
packages) is a drop in replacement for needle inside emboss or<br>
is it something else?<br>
<br>
Kind regards<br>
   Andreas. <br>
<br>
-- <br>
<a href="http://fam-tille.de" rel="noreferrer" target="_blank">http://fam-tille.de</a><br>
</blockquote></div><br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div></div><div><div>Michael R. Crusoe ; he/him<br></div><div><a href="https://orcid.org/0000-0002-2961-9670" target="_blank">https://orcid.org/0000-0002-2961-9670</a></div><div><span><span>CWL Project Leader, Software Freedom Conservancy, Common Workflow Language project</span></span></div><div>Promovendus, VU Amsterdam, <span><span>Computer Systems & Bioinformatics</span></span></div><div><span><span><span><span>Project Leader Compute Platform in ELIXIR-NL</span></span>, DTL Projects<br>ELIXIR-DE Communication Officer, Research Center Jülich<br></span></span></div></div></div></div>