<div dir="auto">On Thu, 11 Feb 2021 22:54:54 +0000 peter green <<a href="mailto:plugwash@p10link.net">plugwash@p10link.net</a>> wrote:<br>> Package: openms<br>> Version: 2.6.0+cleaned1-2<br>> Severity: serious<br>> <br>> openms build-depends on seqan-dev which was built by the sequan source<br>> package, which was removed from unstable and testing recently. The person<br>> requesting the removal stated that "There are no other users of seqan 1.x<br>> in Debian." but it seems this was not correct.<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">I'm very sorry for this. I don't know why my search didn't reveal that openms had never upgraded to SeqAn 2 or 3.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto"><br>> I tried removing the build-dependency as there did not appear to be<br>> a corresponding runtime depedency, but that made configure fail.<br>> <br>> I then tried with libseqan3-dev but that also made configure fail<br>> <br>> I then tried with libseqan2-dev, in that case configure succeeded<br>> but the build failed with<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">There is no smooth upgrade path between major SeqAn versions, so I don't recommend trying that further.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">I suggest adding the parts of SeqAn needed to debian/ as a quick(er) fix.</div><div dir="auto"><br><br><div data-smartmail="gmail_signature" dir="auto">--  <br>Michael R. Crusoe</div></div></div></div>