<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Below is the output of data.summary() for one subject: <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Dataset: 211x260502@float32, <sa: chunks,targets>, <fa: voxel_indices>, <a: mapper><br>stats: mean=-0.0847961 std=0.967814 var=0.936665 min=-22.0178 max=24.7773<br>No details due to large number of targets or chunks. Increase maxc and maxt if desired<br>Summary for targets across chunks<br>  targets  mean std min max #chunks<br>    0     0.502 0.5  0   1    106<br>    1     0.498 0.5  0   1    105<br>Sequence statistics for 211 entries from set [0, 1]<br>Counter-balance table for orders up to 2:<br>Targets/Order  O1      |   O2      |<br>      0:       0  105  |  105  0   |<br>      1:      105  0   |   0  104  |<br>Correlations: min=-0.99 max=0.98 mean=-0.0048 sum(abs)=1e+02<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, May 17, 2018 at 7:21 AM, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:yoh@onerussian.com" target="_blank">yoh@onerussian.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">


<div>Please share output of <br>
<br>
print data.summary()<br>
<br>
Right before your give it to searchlight<div><div class="h5"><br><br><div class="gmail_quote">On May 17, 2018 3:59:39 AM EDT, Tyler Adkins <<a href="mailto:adkinsty@umich.edu" target="_blank">adkinsty@umich.edu</a>> wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0pt 0pt 0pt 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">

<div name="messageBodySection" style="font-size:14px;font-family:-apple-system,BlinkMacSystemFont,sans-serif"><span style="font-family:georgia,serif">Hello,</span></div>
<div name="messageReplySection" style="font-size:14px;font-family:-apple-system,BlinkMacSystemFont,sans-serif"><br>
<span style="font-family:georgia,serif">I am running a searchlight analysis and I encountered a strange feature of the resulting classification accuracies. All of the non-zero accuracies have only one decimal point of precision (e.g., .5, .6., .7., .8, etc.). Unfortunately, I'm not able to figure out what aspect of my code is leading to this truncating or rounding of the accuracies.</span><br>
<font face="georgia, serif"><br></font><span style="font-family:georgia,serif">I attached my code below, but here's some information about my analysis. Please let me know if you would like me to provide any other information about the analysis. My searchlight repeats a 10-fold cross-validation procedure for a linear support vector classifier with default parameters. The number of classes is 2 and the total number of samples is roughly 240. The sequence of samples is randomized and balanced so that there is an equal number of instances of the two classes in each of the 10 folds. The searchlight also applies the mean_sample() postproc so that the resulting classification accuracies are averaged over the cross-validation folds. </span><br>
<br>
<div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;display:inline">As mentioned above, I'm unsure what about my script is leading to the rounding/truncating of the accuracies. Most of the script is copied from one of the PyMVPA searchlight tutorials, which further adds to my confusion, since the tutorial searchlight clearly outputs accuracies with greater than 1-decimal precision. ​</div>
<div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;display:inline">I would greatly appreciate any ideas you might have about what could be causing this problem or how to address it.</div>
<br>
<font face="georgia, serif"><br></font><span style="font-family:georgia,serif">Thank you for your time.</span><br>
<font face="georgia, serif"><br></font>
<div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif;display:inline">Best, </div>
 <br>
<font face="georgia, serif"><br></font><span style="font-family:georgia,serif">Tyler Adkins</span><br>
<span style="font-family:georgia,serif">PhD Pre-candidate | Cognition and Cognitive Neuroscience</span><br>
<span style="font-family:georgia,serif">University of Michigan Department of Psychology</span><br>
<span style="font-family:georgia,serif"><a href="https://maps.google.com/?q=530+Church+Street+Ann+Arbor,+MI+48109&entry=gmail&source=g">530 Church Street Ann Arbor, MI 48109</a>-1043</span><br>
<span style="font-family:georgia,serif">Email:</span> <a href="mailto:adkinsty@umich.edu" style="font-family:georgia,serif" target="_blank">adkinsty@umich.edu</a><br>
<span style="font-family:georgia,serif">Office: 3036 East Hall</span><br>
<span style="font-family:georgia,serif">Lab: B018 East Hall</span><br>
<blockquote type="cite" style="margin:5px 5px;padding-left:10px;border-left:thin solid #1abc9c">
<div dir="ltr">
<div style="font-family:georgia,serif;display:inline" class="gmail_default"><br></div>
</div>
</blockquote>
</div>


</blockquote></div><br></div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">
-- <br>
Sent from a phone which beats iPhone.</font></span></div></blockquote></div><br></div>