<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Mon, 8 Oct 2018 at 14:10, Alyson Saenz <<a href="mailto:neuro.alyson@gmail.com">neuro.alyson@gmail.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div>Does anyone know a paper in which someone has explored the effect of different searchlight radius?</div><div><br></div><div>I know that a bigger radius increases performance but also processing time, and that at some point you will get bad performances, but, has anyone systematically explored this?</div></div></blockquote><div><br></div><div>In addition to Yarik's and Jo's great suggestions and observations, let me add:</div><div><br></div><div>- In general, the optimal radius would depend on the spatial extent and distributed nature of the effect of interest. Different neural mechanisms may have a different spatial distribution / scale.</div><div><br></div><div>- the original paper by Kriegeskorte et al (2006): "For the information-based analysis, we chose a searchlight radius of 4 mm, because this radius yielded the best detection performance in the simulation". In my experience, such small radii are not common these days; most studies report larger radii, typically 6-12 mm .</div><div><br></div><div>- with shameless self-promotion, there is a paper [1] possibly useful for surface-based approaches.<span style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif"> Note that the analyses focused in M1 and S1 regions with discrimination of different digits (fingers); your mileage may vary with different tasks or brain regions.</span></div><div><span style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif"><br></span></div><div><span style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif">[1] </span><span style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif">Oosterhof, Nikolaas N., et al. "Surface-based information mapping reveals crossmodal vision–action representations in human parietal and occipitotemporal cortex." </span><i style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif">Journal of Neurophysiology</i><span style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif"> 104.2 (2010): 1077-1089.</span></div><div><span style="font-size:13px;font-family:Arial,sans-serif"><br></span></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex"></blockquote></div></div></div></div></div>