[Qa-jenkins-scm] Build failed in Jenkins: reproducible_builder_armhf_41 #390

jenkins at jenkins.debian.net jenkins at jenkins.debian.net
Sat Feb 27 17:11:55 UTC 2016


See <https://jenkins.debian.net/job/reproducible_builder_armhf_41/390/>

------------------------------------------
[...truncated 581 lines...]
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_exp_setup.o `test -f 'ae_exp_setup.cpp' || echo './'`ae_exp_setup.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_fuzzy_set.o `test -f 'ae_fuzzy_set.cpp' || echo './'`ae_fuzzy_set.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_genetic_unit.o `test -f 'ae_genetic_unit.cpp' || echo './'`ae_genetic_unit.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_grid_cell.o `test -f 'ae_grid_cell.cpp' || echo './'`ae_grid_cell.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_individual.o `test -f 'ae_individual.cpp' || echo './'`ae_individual.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_logs.o `test -f 'ae_logs.cpp' || echo './'`ae_logs.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_mutation.o `test -f 'ae_mutation.cpp' || echo './'`ae_mutation.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_output_manager.o `test -f 'ae_output_manager.cpp' || echo './'`ae_output_manager.cpp
ae_output_manager.cpp: In member function 'void ae_output_manager::load(FILE*, bool, bool)':
ae_output_manager.cpp:234:114: warning: format '%d' expects argument of type 'int*', but argument 3 has type 'int8_t* {aka signed char*}' [-Wformat=]
   fscanf( setup_file, "COMPUTE_PHENOTYPIC_CONTRIBUTION_BY_GU %"PRId8"\n", (int8_t*) &_compute_phen_contrib_by_GU );
                                                                                                                  ^
ae_output_manager.cpp:246:64: warning: format '%d' expects argument of type 'int*', but argument 3 has type 'int8_t* {aka signed char*}' [-Wformat=]
     fscanf( setup_file, "TREE_MODE %"PRId8"\n", &tmp_tree_mode );
                                                                ^
ae_output_manager.cpp:268:48: warning: format '%d' expects argument of type 'int*', but argument 3 has type 'int8_t* {aka signed char*}' [-Wformat=]
   fscanf( setup_file, "LOGS %"PRId8"\n", &logs );
                                                ^
ae_output_manager.cpp:218:65: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "BACKUP_STEP %"PRId32"\n", &_backup_step );
                                                                 ^
ae_output_manager.cpp:219:73: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "BIG_BACKUP_STEP %"PRId32"\n", &_big_backup_step );
                                                                         ^
ae_output_manager.cpp:234:115: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "COMPUTE_PHENOTYPIC_CONTRIBUTION_BY_GU %"PRId8"\n", (int8_t*) &_compute_phen_contrib_by_GU );
                                                                                                                   ^
ae_output_manager.cpp:239:48: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "RECORD_TREE %s\n", tmp );
                                                ^
ae_output_manager.cpp:244:66: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
     fscanf( setup_file, "TREE_STEP %"PRId32"\n", &tmp_tree_step );
                                                                  ^
ae_output_manager.cpp:246:65: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
     fscanf( setup_file, "TREE_MODE %"PRId8"\n", &tmp_tree_mode );
                                                                 ^
ae_output_manager.cpp:258:47: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "MAKE_DUMPS %s\n", tmp );
                                               ^
ae_output_manager.cpp:260:61: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "DUMP_STEP %"PRId32"\n", &_dump_step );
                                                             ^
ae_output_manager.cpp:268:49: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
   fscanf( setup_file, "LOGS %"PRId8"\n", &logs );
                                                 ^
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_params_mut.o `test -f 'ae_params_mut.cpp' || echo './'`ae_params_mut.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_phenotype.o `test -f 'ae_phenotype.cpp' || echo './'`ae_phenotype.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_population.o `test -f 'ae_population.cpp' || echo './'`ae_population.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_protein.o `test -f 'ae_protein.cpp' || echo './'`ae_protein.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_jumping_mt.o `test -f 'ae_jumping_mt.cpp' || echo './'`ae_jumping_mt.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_replication_report.o `test -f 'ae_replication_report.cpp' || echo './'`ae_replication_report.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_dna_replic_report.o `test -f 'ae_dna_replic_report.cpp' || echo './'`ae_dna_replic_report.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_rna.o `test -f 'ae_rna.cpp' || echo './'`ae_rna.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_stats.o `test -f 'ae_stats.cpp' || echo './'`ae_stats.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_stat_record.o `test -f 'ae_stat_record.cpp' || echo './'`ae_stat_record.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_string.o `test -f 'ae_string.cpp' || echo './'`ae_string.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_tree.o `test -f 'ae_tree.cpp' || echo './'`ae_tree.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_vis_a_vis.o `test -f 'ae_vis_a_vis.cpp' || echo './'`ae_vis_a_vis.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_selection.o `test -f 'ae_selection.cpp' || echo './'`ae_selection.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_spatial_structure.o `test -f 'ae_spatial_structure.cpp' || echo './'`ae_spatial_structure.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_gene_tree.o `test -f 'ae_gene_tree.cpp' || echo './'`ae_gene_tree.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_gene_tree_node.o `test -f 'ae_gene_tree_node.cpp' || echo './'`ae_gene_tree_node.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_gene_mutation.o `test -f 'ae_gene_mutation.cpp' || echo './'`ae_gene_mutation.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-param_loader.o `test -f 'param_loader.cpp' || echo './'`param_loader.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-f_line.o `test -f 'f_line.cpp' || echo './'`f_line.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_fuzzy_set_X11.o `test -f 'ae_fuzzy_set_X11.cpp' || echo './'`ae_fuzzy_set_X11.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_individual_X11.o `test -f 'ae_individual_X11.cpp' || echo './'`ae_individual_X11.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_population_X11.o `test -f 'ae_population_X11.cpp' || echo './'`ae_population_X11.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_exp_manager_X11.o `test -f 'ae_exp_manager_X11.cpp' || echo './'`ae_exp_manager_X11.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o libaevol_a-ae_X11_window.o `test -f 'ae_X11_window.cpp' || echo './'`ae_X11_window.cpp
rm -f libaevol.a
ar cru libaevol.a libaevol_a-ae_align.o libaevol_a-ae_codon.o libaevol_a-ae_dna.o libaevol_a-ae_dump.o libaevol_a-ae_environment.o libaevol_a-ae_exp_manager.o libaevol_a-ae_exp_setup.o libaevol_a-ae_fuzzy_set.o libaevol_a-ae_genetic_unit.o libaevol_a-ae_grid_cell.o libaevol_a-ae_individual.o libaevol_a-ae_logs.o libaevol_a-ae_mutation.o libaevol_a-ae_output_manager.o libaevol_a-ae_params_mut.o libaevol_a-ae_phenotype.o libaevol_a-ae_population.o libaevol_a-ae_protein.o libaevol_a-ae_jumping_mt.o libaevol_a-ae_replication_report.o libaevol_a-ae_dna_replic_report.o libaevol_a-ae_rna.o libaevol_a-ae_stats.o libaevol_a-ae_stat_record.o libaevol_a-ae_string.o libaevol_a-ae_tree.o libaevol_a-ae_vis_a_vis.o libaevol_a-ae_selection.o libaevol_a-ae_spatial_structure.o libaevol_a-ae_gene_tree.o libaevol_a-ae_gene_tree_node.o libaevol_a-ae_gene_mutation.o libaevol_a-param_loader.o libaevol_a-f_line.o libaevol_a-ae_fuzzy_set_X11.o libaevol_a-ae_individual_X11.o libaevol_a-ae_population_X11.o libaevol_a-ae_exp_manager_X11.o libaevol_a-ae_X11_window.o   
ar: `u' modifier ignored since `D' is the default (see `U')
ranlib libaevol.a
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
Making all in post_treatments
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o population_statistics.o population_statistics.cpp
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o robustness.o robustness.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_robustness population_statistics.o robustness.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o ancstats.o ancstats.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_ancstats ancstats.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o create_eps.o create_eps.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_create_eps create_eps.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o fixed_mutations.o fixed_mutations.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_fixed_mutations fixed_mutations.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o gene_families.o gene_families.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_gene_families gene_families.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o lineage.o lineage.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_lineage lineage.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o compute_pop_stats.o compute_pop_stats.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_compute_pop_stats population_statistics.o compute_pop_stats.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o extract.o extract.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_extract extract.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o view_generation.o view_generation.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_view_generation view_generation.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o template.o template.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -L../../src/libaevol -Wl,-z,relro -o aevol_misc_template template.o ../../src/libaevol/libaevol.a ../../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src'
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o aevol_run.o aevol_run.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -Wl,-z,relro -o aevol_run aevol_run.o ../src/libaevol/libaevol.a ../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o aevol_create.o aevol_create.cpp
aevol_create.cpp: In function 'int main(int, char**)':
aevol_create.cpp:169:51: warning: ignoring return value of 'char* fgets(char*, int, FILE*)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
     fgets(rawchromosome, 1000000, chromosome_file);
                                                   ^
aevol_create.cpp:189:45: warning: ignoring return value of 'char* fgets(char*, int, FILE*)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
     fgets(rawplasmid, 1000000, plasmid_file);
                                             ^
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -Wl,-z,relro -o aevol_create aevol_create.o ../src/libaevol/libaevol.a ../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o aevol_modify.o aevol_modify.cpp
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -Wl,-z,relro -o aevol_modify aevol_modify.o ../src/libaevol/libaevol.a ../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
g++ -DPACKAGE_NAME=\"AEVOL\" -DPACKAGE_TARNAME=\"aevol\" -DPACKAGE_VERSION=\"4.4\" -DPACKAGE_STRING=\"AEVOL\ 4.4\" -DPACKAGE_BUGREPORT=\"aevol-bug-report at lists.gforge.liris.cnrs.fr\" -DPACKAGE_URL=\"www.aevol.fr\" -DPACKAGE=\"aevol\" -DVERSION=\"4.4\" -DHAVE_LIBM=1 -DHAVE_LIBZ=1 -DSTDC_HEADERS=1 -DHAVE_SYS_TYPES_H=1 -DHAVE_SYS_STAT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_MEMORY_H=1 -DHAVE_STRINGS_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE_INTTYPES_H=1 -DHAVE_LIMITS_H=1 -DHAVE_STDINT_H=1 -DHAVE_STDLIB_H=1 -DHAVE_STRING_H=1 -DHAVE_UNISTD_H=1 -DHAVE__BOOL=1 -DHAVE_STDBOOL_H=1 -DHAVE_FLOOR=1 -DHAVE_MEMSET=1 -DHAVE_MKDIR=1 -DHAVE_POW=1 -DHAVE_RINT=1 -DHAVE_SQRT=1 -DHAVE_GZREAD=1 -D__X11=1 -DHAVE_LIBX11=1 -DHAVE_X11_XLIB_H=1 -DHAVE_X11_XUTIL_H=1 -DHAVE_X11_KEYSYM_H=1 -DHAVE_X11_XATOM_H=1 -DHAVE_X11_CURSORFONT_H=1 -DSFMT_MEXP=607 -DNDEBUG=1 -I.   -I../src/libaevol -D__STDC_FORMAT_MACROS -D__STDC_CONSTANT_MACROS -D__STDC_LIMIT_MACROS -D_FORTIFY_SOURCE=2 -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -c -o aevol_propagate.o aevol_propagate.cpp
aevol_propagate.cpp: In function 'int main(int, char**)':
aevol_propagate.cpp:203:51: warning: ignoring return value of 'int fscanf(FILE*, const char*, ...)', declared with attribute warn_unused_result [-Wunused-result]
       fscanf( lg_file, "%"PRId32"\n", &num_gener );
                                                   ^
g++ -O3 -ffast-math -pipe -fexpensive-optimizations -g -O2 -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security  -Wl,-z,relro -o aevol_propagate aevol_propagate.o ../src/libaevol/libaevol.a ../src/libaevol/SFMT-src-1.4/libsfmt.a -lX11 -lz -lm 
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
Making all in doc
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[2]: Nothing to be done for 'all'.
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4'
make[2]: Nothing to be done for 'all-am'.
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
make[1]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
   dh_auto_test
	make -j1 check
make[1]: Entering directory '/build/aevol-4.4'
Making check in src
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src'
Making check in libaevol
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
Making check in SFMT-src-1.4
make[4]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol/SFMT-src-1.4'
make[4]: Nothing to be done for 'check'.
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol/SFMT-src-1.4'
Making check in .
make[4]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[4]: Nothing to be done for 'check-am'.
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
Making check in post_treatments
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
make[3]: Nothing to be done for 'check'.
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src'
make[3]: Nothing to be done for 'check-am'.
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
Making check in doc
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[2]: Nothing to be done for 'check'.
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4'
make[2]: Nothing to be done for 'check-am'.
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
make[1]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
 fakeroot debian/rules binary
dh binary  --with autotools-dev
   dh_testroot
   dh_prep
   dh_auto_install
	make -j1 install DESTDIR=/build/aevol-4.4/debian/aevol AM_UPDATE_INFO_DIR=no
make[1]: Entering directory '/build/aevol-4.4'
Making install in src
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src'
Making install in libaevol
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
Making install in SFMT-src-1.4
make[4]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol/SFMT-src-1.4'
make[5]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol/SFMT-src-1.4'
make[5]: Nothing to be done for 'install-exec-am'.
make[5]: Nothing to be done for 'install-data-am'.
make[5]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol/SFMT-src-1.4'
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol/SFMT-src-1.4'
Making install in .
make[4]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[5]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[5]: Nothing to be done for 'install-exec-am'.
make[5]: Nothing to be done for 'install-data-am'.
make[5]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/libaevol'
Making install in post_treatments
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
make[4]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
 /bin/mkdir -p '/build/aevol-4.4/debian/aevol/usr/bin'
  /usr/bin/install -c aevol_misc_robustness aevol_misc_ancstats aevol_misc_create_eps aevol_misc_fixed_mutations aevol_misc_gene_families aevol_misc_lineage aevol_misc_compute_pop_stats aevol_misc_extract aevol_misc_view_generation '/build/aevol-4.4/debian/aevol/usr/bin'
make[4]: Nothing to be done for 'install-data-am'.
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src/post_treatments'
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src'
make[4]: Entering directory '/build/aevol-4.4/src'
 /bin/mkdir -p '/build/aevol-4.4/debian/aevol/usr/bin'
  /usr/bin/install -c aevol_run aevol_create aevol_modify aevol_propagate '/build/aevol-4.4/debian/aevol/usr/bin'
make[4]: Nothing to be done for 'install-data-am'.
make[4]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/src'
Making install in doc
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[3]: Nothing to be done for 'install-exec-am'.
 /bin/mkdir -p '/build/aevol-4.4/debian/aevol/usr/share/man/man1'
 /usr/bin/install -c -m 644 aevol_create.1 aevol_run.1 aevol_modify.1 aevol_propagate.1 aevol_misc_lineage.1 aevol_misc_ancstats.1 aevol_misc_robustness.1 aevol_misc_compute_pop_stats.1 aevol_misc_view_generation.1 aevol_misc_create_eps.1 aevol_misc_extract.1 aevol_misc_fixed_mutations.1 aevol_misc_gene_families.1 '/build/aevol-4.4/debian/aevol/usr/share/man/man1'
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4/doc'
make[2]: Entering directory '/build/aevol-4.4'
make[3]: Entering directory '/build/aevol-4.4'
make[3]: Nothing to be done for 'install-exec-am'.
make[3]: Nothing to be done for 'install-data-am'.
make[3]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
make[2]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
make[1]: Leaving directory '/build/aevol-4.4'
   dh_installdocs
   dh_installchangelogs
   dh_installman
   dh_perl
   dh_link
   dh_strip_nondeterminism
   dh_compress
   dh_fixperms
   dh_strip
   dh_makeshlibs
   dh_shlibdeps
dpkg-shlibdeps: warning: package could avoid a useless dependency if debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_gene_families debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_extract debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_create_eps debian/aevol/usr/bin/aevol_run debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_lineage debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_compute_pop_stats debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_ancstats debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_fixed_mutations debian/aevol/usr/bin/aevol_propagate debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_view_generation debian/aevol/usr/bin/aevol_modify debian/aevol/usr/bin/aevol_misc_robustness debian/aevol/usr/bin/aevol_create were not linked against ld-linux-armhf.so.3 (they use none of the library's symbols)
   dh_installdeb
   dh_gencontrol
dpkg-gencontrol: warning: File::FcntlLock not available; using flock which is not NFS-safe
dpkg-gencontrol: warning: File::FcntlLock not available; using flock which is not NFS-safe
   dh_md5sums
   dh_builddeb
dpkg-deb: building package 'aevol-dbgsym' in '../aevol-dbgsym_4.4-1_armhf.deb'.
dpkg-deb: building package 'aevol' in '../aevol_4.4-1_armhf.deb'.
Terminated
FATAL: null
java.lang.NullPointerException
	at hudson.plugins.build_timeout.BuildTimeoutWrapper$EnvironmentImpl.tearDown(BuildTimeoutWrapper.java:199)
	at hudson.model.Build$BuildExecution.doRun(Build.java:173)
	at hudson.model.AbstractBuild$AbstractBuildExecution.run(AbstractBuild.java:534)
	at hudson.model.Run.execute(Run.java:1738)
	at hudson.model.FreeStyleBuild.run(FreeStyleBuild.java:43)
	at hudson.model.ResourceController.execute(ResourceController.java:98)
	at hudson.model.Executor.run(Executor.java:410)



More information about the Qa-jenkins-scm mailing list