<html><head></head><body>Okay I'll add the same<br><br>Thanks :)<br><br><div class="gmail_quote">On 11 August 2022 10:15:24 pm IST, Chris Lamb <chris@reproducible-builds.org> wrote:<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<pre dir="auto" class="k9mail">Hey,<br><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 1ex 0.8ex; border-left: 1px solid #729fcf; padding-left: 1ex;">So I've added in a patch to replace  EBROOTHTSLIB with <br>/usr/include/htslib for including the installed lib headers and now the <br>reprotest passes[1] \o/<br></blockquote><br>Ah, great to hear!<br><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 1ex 0.8ex; border-left: 1px solid #729fcf; padding-left: 1ex;">Indeed the problem was with htslib dir. The htslib dir is included as a <br>git submodule in the upstream source whereas we use the debian packaged <br>version of the library for delly. So infact there is no actual use of <br>the embedded directory anywhere.<br></blockquote><br>.oO( I wonder if this is worthy of a note in debian/README.source...? )<br><br><br>Best wishes,<br><br><div class="k9mail-signature">-- <br>      o<br>    ⬋   ⬊      Chris Lamb<br>   o     o     reproducible-builds.org 💠<br>    ⬊   ⬋<br>      o<br><br><br></div></pre></blockquote></div></body></html>