[Debian-astro-maintainers] Bug#1054775: astropy: FTBFS: dh_auto_test: error: pybuild --test --test-pytest -i python{version} -p 3.11 returned exit code 13
Lucas Nussbaum
lucas at debian.org
Fri Oct 27 20:29:26 BST 2023
Source: astropy
Version: 5.3.4-1
Severity: serious
Justification: FTBFS
Tags: trixie sid ftbfs
User: lucas at debian.org
Usertags: ftbfs-20231027 ftbfs-trixie
Hi,
During a rebuild of all packages in sid, your package failed to build
on amd64.
Relevant part (hopefully):
> make[1]: Entering directory '/<<PKGBUILDDIR>>'
> dh_auto_test
> I: pybuild base:310: cd /<<PKGBUILDDIR>>/.pybuild/cpython3_3.11/build; python3.11 -m pytest --astropy-header -m "not hypothesis"
> [1m============================= test session starts ==============================[0m
> platform linux -- Python 3.11.6, pytest-7.4.3, pluggy-1.3.0
> Matplotlib: 3.6.3
> Freetype: 2.13.2
>
> Running tests with Astropy version 5.3.4.
> Running tests in .pybuild/cpython3_3.11/build.
>
> Date: 2023-10-27T05:40:14
>
> Platform: Linux-6.1.0-10-cloud-amd64-x86_64-with-glibc2.37
>
> Executable: /usr/bin/python3.11
>
> Full Python Version:
> 3.11.6 (main, Oct 8 2023, 05:06:43) [GCC 13.2.0]
>
> encodings: sys: utf-8, locale: UTF-8, filesystem: utf-8
> byteorder: little
> float info: dig: 15, mant_dig: 15
>
> Package versions:
> Numpy: 1.24.2
> Scipy: 1.10.1
> Matplotlib: 3.6.3
> h5py: 3.9.0
> Pandas: not available
> PyERFA: 2.0.1.1
> Cython: 0.29.36
> Scikit-image: 0.22.0
> asdf: not available
> pyarrow: not available
>
> Using Astropy options: remote_data: none.
>
> CI: undefined
> ARCH_ON_CI: undefined
> IS_CRON: undefined
>
> rootdir: /<<PKGBUILDDIR>>
> configfile: setup.cfg
> plugins: remotedata-0.4.1, hypothesis-6.88.1, mock-3.11.1, doctestplus-1.0.0, cov-4.1.0, mpl-0.0.0, filter-subpackage-0.1.2, astropy-header-0.2.2, astropy-0.11.0, arraydiff-0.5.0
> collected 27264 items / 70 deselected / 12 skipped / 27194 selected
>
> astropy/config/configuration.py [32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/config/tests/test_configs.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33ms[0m[33ms[0m[33ms[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/constants/__init__.py [32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/constants/tests/test_constant.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/constants/tests/test_pickle.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/constants/tests/test_prior_version.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/constants/tests/test_sciencestate.py [32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/convolution/convolve.py [32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/convolution/kernels.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%][0m
> astropy/convolution/tests/test_convolve.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m [ 0%]
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> astropy/io/misc/tests/test_yaml.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 41%]
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> astropy/io/registry/tests/test_registry_help.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 42%][0m
> astropy/io/votable/tests/converter_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 42%][0m
> astropy/io/votable/tests/exception_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 42%][0m
> astropy/io/votable/tests/resource_test.py [32m.[0m[33m [ 42%][0m
> astropy/io/votable/tests/table_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0mValidation report for /<<PKGBUILDDIR>>/.pybuild/cpython3_3.11/build/astropy/io/votable/tests/data/regression.xml
>
> 11: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <PARAM datatype="float" name="wrong_arraysize" value="0.000000,0.00...
> ^
>
> 11: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 0, got 2
> <PARAM datatype="float" name="wrong_arraysize" value="0.000000,0.00...
> ^
>
> 12: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <PARAM datatype="float" name="INPUT" value="0.000000,0.000000" arra...
> ^
>
> 20: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <PARAM ID="awesome" datatype="float" name="INPUT" value="0.000000,0...
> ^
>
> 21: W50: Invalid unit string 'foo'
> <PARAM ID="empty_value" arraysize="*" datatype="char" name="empty_v...
> ^
>
> 27: W11: The gref attribute on LINK is deprecated in VOTable 1.1
> <LINK href="http://www.foo.com/" gref="DECPRECATED">
> ^
>
> 28: W10: Unknown tag 'DESCRIPTION'. Ignoring
> <DESCRIPTION>Really, this link is totally bogus.</DESCRIPTION>
> ^
>
> 34: W26: 'INFO' inside 'TABLE' added in VOTable 1.2
> <INFO name="Error" ID="ErrorInfo" value="One might expect to find s...
> ^
>
> 38: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <PARAM datatype="float" name="INPUT2" value="0.000000,0.000000" arr...
> ^
>
> 41: W09: ID attribute not capitalized
> <FIELD id="string_test" name="string test" datatype="char" arraysiz...
> ^
>
> 44: W13: 'unicodeString' is not a valid VOTable datatype, should be
> 'unicodeChar'
> <FIELD ID="fixed_unicode_test" name="unicode test" datatype="unicod...
> ^
>
> 46: W13: 'string' is not a valid VOTable datatype, should be 'char'
> <FIELD ID="string_array_test" name="string array test" datatype="st...
> ^
>
> 49: W51: Value '-32769' is out of range for a 16-bit integer field
> <VALUES null="-32769"/>
> ^
>
> 57: W10: Unknown tag 'IGNORE_ME'. Ignoring
> <IGNORE_ME/>
> ^
>
> 97: W17: GROUP element contains more than one DESCRIPTION element
> This should warn of a second description.
> ^
>
> 104: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <PARAM datatype="float" name="INPUT3" value="0.000000,0.000000" a...
> ^
>
> 42: W32: Duplicate ID 'string_test' renamed to 'string_test_2' to
> ensure uniqueness
> <FIELD ID="string_test" name="fixed string test" datatype="char" ar...
> ^
>
> 112: W46: char value is too long for specified length of 10
> <TD>Fixed string long test</TD> <!-- Should truncate -->
> ^
>
> 114: W46: unicodeChar value is too long for specified length of 10
> <TD>Ceçi n'est pas un pipe</TD>
> ^
>
> 115: W46: char value is too long for specified length of 4
> <TD>ab cd</TD>
> ^
>
> 134: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 4, got 1
> <TD/>
> ^
>
> 134: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 142: W46: char value is too long for specified length of 10
> <TD>0123456789A</TD>
> ^
>
> 145: W46: char value is too long for specified length of 4
> <TD>0123456789A</TD>
> ^
>
> 146: W51: Value '256' is out of range for a 8-bit unsigned integer
> field
> <TD>256</TD> <!-- should overflow to 0 -->
> ^
>
> 147: W51: Value '65536' is out of range for a 16-bit integer field
> <TD>65536</TD> <!-- should overflow to 0-->
> ^
>
> 149: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD></TD>
> ^
>
> 152: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <TD>42 32, 12 32</TD>
> ^
>
> 168: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 16, got 0
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields.
> <TD/>
> ^
>
> 168: W49: Empty cell illegal for integer fields. (suppressing further
> warnings of this type...)
> <TD/>
> ^
>
> 174: W46: unicodeChar value is too long for specified length of 10
> <TD>0123456789A</TD>
> ^
>
> 176: W51: Value '-23' is out of range for a 8-bit unsigned integer
> field
> <TD>-23</TD> <!-- negative, should wrap around to positive -->
> ^
>
> 198: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 16, got 0
> <TD/>
> ^
>
> 207: W51: Value '65535' is out of range for a 16-bit integer field
> <TD>0xffff</TD> <!-- hex - negative value -->
> ^
>
> 212: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <TD>NaN, 23</TD>
> ^
>
> 214: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 6, got 0
> <TD/>
> ^
>
> 222: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 4, got 1
> <TD/>
> ^
>
> 228: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 16, got 0
> <TD/>
> ^
>
> 236: W51: Value '256' is out of range for a 8-bit unsigned integer
> field
> <TD>0x100</TD> <!-- hex, overflow -->
> ^
>
> 237: W51: Value '65536' is out of range for a 16-bit integer field
> <TD>0x10000</TD> <!-- hex, overflow -->
> ^
>
> 242: W01: Array uses commas rather than whitespace
> <TD>31, -1</TD>
> ^
>
> 244: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 6, got 0
> <TD/>
> ^
>
> 252: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 4, got 1
> <TD/>
> ^
>
> 254: E02: Incorrect number of elements in array. Expected multiple of
> 4, got 1 (suppressing further warnings of this type...)
> <TD/>
> ^
>
> 272: W46: char value is too long for specified length of 10
> <TD>Fixed string long test</TD> <!-- Should truncate -->
> ^
>
> 274: W46: unicodeChar value is too long for specified length of 10
> <TD>Ceçi n'est pas un pipe</TD>
> ^
>
> 275: W46: char value is too long for specified length of 4
> <TD>ab cd</TD>
> ^
>
> [32m.[0mValidation report for /<<PKGBUILDDIR>>/.pybuild/cpython3_3.11/build/astropy/io/votable/tests/data/valid_votable.xml
>
> astropy.io.votable found no violations.
>
> [32m.[0mValidation report for /<<PKGBUILDDIR>>/.pybuild/cpython3_3.11/build/astropy/io/votable/tests/data/valid_votable.xml
>
> astropy.io.votable found no violations.
>
> [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 42%]
> [0m[32m.[0m[33m [ 42%][0m
> astropy/io/votable/tests/tree_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 43%][0m
> astropy/io/votable/tests/ucd_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 43%][0m
> astropy/io/votable/tests/util_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 43%][0m
> astropy/io/votable/tests/vo_test.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33mX[0m[32m.[0m[33m [ 43%]
> [0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33mX[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33mX[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 43%]
> [0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33mX[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0mValidation report for /<<PKGBUILDDIR>>/.pybuild/cpython3_3.11/build/astropy/io/votable/tests/data/empty_table.xml
>
> astropy.io.votable found no violations.
>
> xmllint passed
> [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 43%][0m
> astropy/modeling/core.py [32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[32m.[0m[33m [ 43%][0m
> astropy/modeling/functional_models.py [32m.[0m[33m [ 43%][0m
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> ra, dec, pmr, pmd, px, rv, stat = erfa_ufunc.pvstar([96mself[39;49;00m.pv)[90m[39;49;00m
> assert_array_equal(stat, np.zeros([96mself[39;49;00m.pv.shape, dtype=[33m"[39;49;00m[33mi4[39;49;00m[33m"[39;49;00m))[90m[39;49;00m
> [94massert[39;49;00m ra.unit == u.radian[90m[39;49;00m
> assert_quantity_allclose(ra, [[94m0[39;49;00m, [94m90[39;49;00m] * u.deg)[90m[39;49;00m
> [94massert[39;49;00m dec.unit == u.radian[90m[39;49;00m
> assert_array_equal(dec.value, np.zeros([96mself[39;49;00m.pv.shape)) [90m# latitude[39;49;00m[90m[39;49;00m
> [94massert[39;49;00m pmr.unit == u.radian / u.year[90m[39;49;00m
> assert_quantity_allclose(pmr, [[94m0.0125[39;49;00m, [94m0.0125[39;49;00m] * u.radian / u.day)[90m[39;49;00m
> [94massert[39;49;00m pmd.unit == u.radian / u.year[90m[39;49;00m
> assert_array_equal(pmd.value, np.zeros([96mself[39;49;00m.pv.shape))[90m[39;49;00m
> [94massert[39;49;00m px.unit == u.arcsec[90m[39;49;00m
> assert_quantity_allclose(px, [94m1[39;49;00m * u.radian)[90m[39;49;00m
> [94massert[39;49;00m rv.unit == u.km / u.s[90m[39;49;00m
> > assert_array_equal(rv.value, np.zeros([96mself[39;49;00m.pv.shape))[90m[39;49;00m
>
> [1m[31mastropy/units/tests/test_structured_erfa_ufuncs.py[0m:142:
> _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _ _
>
> args = (<built-in function eq>, array([0.00078125, 0.00078125]), array([0., 0.]))
> kwds = {'err_msg': '', 'header': 'Arrays are not equal', 'strict': False, 'verbose': True}
>
> [37m at wraps[39;49;00m(func)[90m[39;49;00m
> [94mdef[39;49;00m [92minner[39;49;00m(*args, **kwds):[90m[39;49;00m
> [94mwith[39;49;00m [96mself[39;49;00m._recreate_cm():[90m[39;49;00m
> > [94mreturn[39;49;00m func(*args, **kwds)[90m[39;49;00m
> [1m[31mE AssertionError: [0m
> [1m[31mE Arrays are not equal[0m
> [1m[31mE [0m
> [1m[31mE Mismatched elements: 2 / 2 (100%)[0m
> [1m[31mE Max absolute difference: 0.00078125[0m
> [1m[31mE Max relative difference: inf[0m
> [1m[31mE x: array([0.000781, 0.000781])[0m
> [1m[31mE y: array([0., 0.])[0m
>
> [1m[31m/usr/lib/python3.11/contextlib.py[0m:81: AssertionError
> [36m[1m=========================== short test summary info ============================[0m
> [31mFAILED[0m astropy/units/tests/test_structured_erfa_ufuncs.py::[1mTestPVUfuncs::test_pvstar[0m - AssertionError:
> [31m= [31m[1m1 failed[0m, [32m26211 passed[0m, [33m620 skipped[0m, [33m70 deselected[0m, [33m177 xfailed[0m, [33m197 xpassed[0m[31m in 318.71s (0:05:18)[0m[31m =[0m
> E: pybuild pybuild:395: test: plugin distutils failed with: exit code=1: cd /<<PKGBUILDDIR>>/.pybuild/cpython3_3.11/build; python3.11 -m pytest --astropy-header -m "not hypothesis"
> dh_auto_test: error: pybuild --test --test-pytest -i python{version} -p 3.11 returned exit code 13
The full build log is available from:
http://qa-logs.debian.net/2023/10/27/astropy_5.3.4-1_unstable.log
All bugs filed during this archive rebuild are listed at:
https://bugs.debian.org/cgi-bin/pkgreport.cgi?tag=ftbfs-20231027;users=lucas@debian.org
or:
https://udd.debian.org/bugs/?release=na&merged=ign&fnewerval=7&flastmodval=7&fusertag=only&fusertagtag=ftbfs-20231027&fusertaguser=lucas@debian.org&allbugs=1&cseverity=1&ctags=1&caffected=1#results
A list of current common problems and possible solutions is available at
http://wiki.debian.org/qa.debian.org/FTBFS . You're welcome to contribute!
If you reassign this bug to another package, please mark it as 'affects'-ing
this package. See https://www.debian.org/Bugs/server-control#affects
If you fail to reproduce this, please provide a build log and diff it with mine
so that we can identify if something relevant changed in the meantime.
More information about the Debian-astro-maintainers
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