[med-svn] [r-bioc-edger] 08/12: Imported Upstream version 3.6.7+dfsg

Andreas Tille tille at debian.org
Fri Aug 8 13:59:18 UTC 2014


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tille pushed a commit to branch master
in repository r-bioc-edger.

commit 358f03feb4ef0a2bd6c3135c65bcb8a47b514f4a
Author: Andreas Tille <tille at debian.org>
Date:   Fri Aug 8 15:25:46 2014 +0200

    Imported Upstream version 3.6.7+dfsg
---
 DESCRIPTION                          |    16 +-
 NAMESPACE                            |    16 +-
 R/DGEList.R                          |    15 +-
 R/aveLogCPM.R                        |     4 +-
 R/edgeRUsersGuide.R                  |     2 +-
 R/maximizeQuadratic.R                |     4 +-
 R/residDF.R                          |    39 +-
 R/subsetting.R                       |     3 +-
 build/vignette.rds                   |   Bin 228 -> 229 bytes
 data/NC1.txt                         | 17704 -------------------------
 data/NC2.txt                         | 16271 -----------------------
 data/Tu102.txt                       | 22714 ---------------------------------
 data/Tu98.txt                        | 18795 ---------------------------
 data/datalist                        |     4 -
 inst/NEWS.Rd                         |     8 +
 inst/doc/edgeR.pdf                   |   Bin 48051 -> 48051 bytes
 man/DGEExact-class.Rd                |    10 +-
 man/DGEGLM-class.Rd                  |    37 +-
 man/DGELRT-class.Rd                  |    24 +-
 man/DGEList-class.Rd                 |    28 +-
 man/DGEList.Rd                       |     5 +-
 man/Tu102.Rd                         |    22 -
 man/WLEB.Rd                          |     3 +-
 man/aveLogCPM.Rd                     |    11 +-
 man/dispBinTrend.Rd                  |     5 +-
 man/dispCoxReidInterpolateTagwise.Rd |     6 +-
 man/edgeRUsersGuide.Rd               |     2 +-
 man/estimateDisp.Rd                  |    16 +-
 man/estimateGLMCommonDisp.Rd         |     7 +-
 man/estimateGLMRobustDisp.Rd         |     5 +-
 man/estimateGLMTagwiseDisp.Rd        |     7 +-
 man/estimateGLMTrendedDisp.Rd        |     3 +-
 man/gof.Rd                           |     3 +-
 man/meanvar.Rd                       |    22 +-
 man/normalizeChIPtoInput.Rd          |     6 +-
 man/plotExonUsage.Rd                 |     3 +-
 man/plotMDS.DGEList.Rd               |     6 +-
 man/plotSmear.Rd                     |     3 +-
 man/spliceVariants.Rd                |     3 +-
 src/R_cr_adjust.cpp                  |     2 +-
 src/adj_coxreid.cpp                  |    17 +-
 tests/edgeR-Tests.Rout.save          |   183 +-
 42 files changed, 309 insertions(+), 75725 deletions(-)

diff --git a/DESCRIPTION b/DESCRIPTION
index c9dd90c..800276a 100755
--- a/DESCRIPTION
+++ b/DESCRIPTION
@@ -1,14 +1,18 @@
 Package: edgeR
-Version: 3.6.2
-Date: 2014/04/26
+Version: 3.6.7
+Date: 2014/07/15
 Title: Empirical analysis of digital gene expression data in R
 Author: Yunshun Chen <yuchen at wehi.edu.au>, Davis McCarthy <dmccarthy at wehi.edu.au>, Aaron Lun <alun at wehi.edu.au>, Mark Robinson <mark.robinson at imls.uzh.ch>, Xiaobei Zhou <xiaobei.zhou at uzh.ch>, Gordon Smyth <smyth at wehi.edu.au>
 Maintainer: Yunshun Chen <yuchen at wehi.edu.au>, Mark Robinson <mark.robinson at imls.uzh.ch>, Davis McCarthy <dmccarthy at wehi.edu.au>, Gordon Smyth <smyth at wehi.edu.au>
+License: GPL (>=2)
 Depends: R (>= 2.15.0), limma
 Imports: methods
 Suggests: MASS, statmod, splines, locfit, KernSmooth
-biocViews: Bioinformatics, DifferentialExpression, SAGE,
-        HighThroughputSequencing, RNAseq, ChIPseq
+URL: http://bioinf.wehi.edu.au/edgeR
+biocViews: GeneExpression, Transcription, AlternativeSplicing,
+        Coverage, DifferentialExpression, DifferentialSplicing,
+        GeneSetEnrichment, Genetics, Bayesian, Clustering, Regression,
+        TimeCourse, SAGE, Sequencing, ChIPSeq, RNASeq, BatchEffect,
+        MultipleComparison, Normalization, QualityControl
 Description: Differential expression analysis of RNA-seq and digital gene expression profiles with biological replication.  Uses empirical Bayes estimation and exact tests based on the negative binomial distribution.  Also useful for differential signal analysis with other types of genome-scale count data.
-License: GPL (>=2)
-Packaged: 2014-05-10 05:35:45 UTC; biocbuild
+Packaged: 2014-07-16 02:04:59 UTC; biocbuild
diff --git a/NAMESPACE b/NAMESPACE
index 3e830dd..37860d8 100644
--- a/NAMESPACE
+++ b/NAMESPACE
@@ -8,8 +8,10 @@ exportClasses("DGEList","DGEExact","DGEGLM","DGELRT","TopTags")
 exportMethods("show")
 
 import(methods)
-importFrom("limma",camera,is.fullrank,mroast,nonEstimable,plotMDS,roast,subsetListOfArrays)
+importFrom("limma",camera,is.fullrank,loessFit,mroast,nonEstimable,plotMDS,roast,squeezeVar,subsetListOfArrays)
+importClassesFrom("limma","LargeDataObject","Roast","MDS")
 
+S3method(as.data.frame,TopTags)
 S3method(as.matrix,DGEList)
 S3method(dim,DGEList)
 S3method(dim,DGEExact)
@@ -29,8 +31,16 @@ S3method(length,TopTags)
 S3method(length,DGEGLM)
 S3method(length,DGELRT)
 S3method(plotMDS,DGEList)
-S3method(as.data.frame,TopTags)
+S3method(camera,DGEList)
 S3method(roast,DGEList)
 S3method(mroast,DGEList)
-S3method(camera,DGEList)
+S3method(aveLogCPM,DGEList)
+S3method(aveLogCPM,DGEGLM)
+S3method(cpm,DGEList)
+S3method(estimateGLMCommonDisp,DGEList)
+S3method(estimateGLMTrendedDisp,DGEList)
+S3method(estimateGLMTagwiseDisp,DGEList)
+S3method(glmFit,DGEList)
+S3method(predFC,DGEList)
+S3method(rpkm,DGEList)
 S3method(sumTechReps,DGEList)
diff --git a/R/DGEList.R b/R/DGEList.R
index 25aa43e..32d785d 100644
--- a/R/DGEList.R
+++ b/R/DGEList.R
@@ -1,6 +1,6 @@
 DGEList <- function(counts=matrix(0,0,0), lib.size=colSums(counts), norm.factors=rep(1,ncol(counts)), group=rep(1,ncol(counts)), genes=NULL, remove.zeros=FALSE) 
 #	Construct DGEList object from components, with some checking
-#	Last modified 7 April June 2013
+#	Last modified 5 June 2014
 {
 #	Check counts
 	counts <- as.matrix(counts)
@@ -19,7 +19,7 @@ DGEList <- function(counts=matrix(0,0,0), lib.size=colSums(counts), norm.factors
 
 #	Check group
 	if(is.null(group)) group <- rep(1,ncol(counts))
-	group <- as.factor(group)
+	group <- .check.factor(group)
 	if(nlib != length(group)) stop("Length of 'group' must equal number of columns in 'counts'")
 
 	samples <- data.frame(group=group,lib.size=lib.size,norm.factors=norm.factors)
@@ -45,3 +45,14 @@ DGEList <- function(counts=matrix(0,0,0), lib.size=colSums(counts), norm.factors
 
 	x
 }
+
+.check.factor <- function(x)
+{
+	if(is.factor(x)) {
+		i <- table(x)>0
+		if(!all(i)) x <- factor(x,levels=levels(x)[i])
+	} else {
+		x <- factor(x)
+	}
+	x
+}
diff --git a/R/aveLogCPM.R b/R/aveLogCPM.R
index 99ec3a3..35f16ed 100644
--- a/R/aveLogCPM.R
+++ b/R/aveLogCPM.R
@@ -37,7 +37,7 @@ aveLogCPM.DGEGLM <- function(y, prior.count=2, dispersion=NULL, ...)
 aveLogCPM.default <- function(y,lib.size=NULL,offset=NULL,prior.count=2,dispersion=NULL,weights=NULL, ...)
 #	log2(AveCPM)
 #	Gordon Smyth
-#	Created 25 Aug 2012. Last modified 4 Nov 2013.
+#	Created 25 Aug 2012. Last modified 12 July 2014.
 {
 #	Check y
 	y <- as.matrix(y)
@@ -76,7 +76,7 @@ aveLogCPM.default <- function(y,lib.size=NULL,offset=NULL,prior.count=2,dispersi
 	offset <- log(lib.size+2*prior.count.scaled)
 
 #	Add prior counts to y
-	if(is.null(dim(prior.count.scaled))) prior.count.scale <- matrix(1,nrow(y),1) %*% prior.count.scaled
+	if(is.null(dim(prior.count.scaled))) prior.count.scaled <- matrix(1,nrow(y),1) %*% prior.count.scaled
 	y <- y+prior.count.scaled
 
 	abundance <- mglmOneGroup(y,dispersion=dispersion,offset=offset,weights=weights)
diff --git a/R/edgeRUsersGuide.R b/R/edgeRUsersGuide.R
index 3c83026..3ca1a29 100644
--- a/R/edgeRUsersGuide.R
+++ b/R/edgeRUsersGuide.R
@@ -1,5 +1,5 @@
 edgeRUsersGuide <- function(view=TRUE)
-#	Find and optionally view limma User's Guide
+#	Find and optionally view edgeR User's Guide
 #	Gordon Smyth
 #	23 May 2012.
 {
diff --git a/R/maximizeQuadratic.R b/R/maximizeQuadratic.R
index 2418004..8a0e233 100644
--- a/R/maximizeQuadratic.R
+++ b/R/maximizeQuadratic.R
@@ -1,7 +1,7 @@
 maximizeQuadratic <- function(y, x=1:ncol(y))
 #	Maximize a function using quadratic approximation
 #	Yunshun Chen and Gordon Smyth
-#	Created 20 Oct 2011.  Last modified 11 Jan 2012.
+#	Created 20 Oct 2011.  Last modified 13 May 2014.
 {	
 	if(is.vector(y)) 
 		y <- matrix(y, nrow=1)
@@ -14,7 +14,7 @@ maximizeQuadratic <- function(y, x=1:ncol(y))
 		if(!all(dim(x)==dim(y))) stop("The dimensions of x and y not matched.")
 	} else if(is.vector(x)){
 		if(length(x)!=npts) stop("The length of the vector x does not match the dimension of y.")
-		x <- matrix(x, ntags, npts, byrow=T)
+		x <- matrix(x, ntags, npts, byrow=TRUE)
 	} else {
 		stop("x must be either a vector or a matrix")
 	}
diff --git a/R/residDF.R b/R/residDF.R
index 8e7c062..282fd48 100644
--- a/R/residDF.R
+++ b/R/residDF.R
@@ -3,26 +3,49 @@
 {
 	nlib <- ncol(zero)
 	ncoef <- ncol(design)
-	nzero <- rowSums(zero)
+	nzero <- as.integer(rowSums(zero))
 
 #	Default is no zero
 	DF <- rep(nlib-ncoef,length(nzero))
 
 #	All zero case
-	DF[nzero==nlib] <- 0
+	DF[nzero==nlib] <- 0L
 
 #	Anything in between?
-	somezero <- nzero>0 & nzero<nlib
+	somezero <- nzero>0L & nzero<nlib
 	if(any(somezero)) {
-		zero2 <- zero[somezero,,drop=FALSE]	
-		key <- rowSums( 2L^(col(zero2)-1L) * zero2 )
+		zero2 <- zero[somezero,,drop=FALSE]
+
+# Integer packing will only work for 31 libraries at a time.	
+		assembly <- list()	
+		collected <- 0L
+		step <- 31L
+		bits <- as.integer(2^(1:step-1L))
+		while (collected < ncol(zero2)) {
+			upper <- pmin(ncol(zero2) - collected, step)
+			keys <- t(zero2[,collected+1:upper,drop=FALSE]) * bits[1:upper]
+			assembly[[length(assembly)+1L]] <- as.integer(colSums(keys))
+			collected <- collected + step
+		}
+
+# Figuring out the unique components.
+		o <- do.call(order, assembly)
+		nzeros <- sum(somezero)
+		is.different <- logical(nzeros)
+		for (i in 1:length(assembly)) { 
+			is.different <- is.different | c(TRUE, diff(assembly[[i]][o])!=0L)
+		}
+		first.of.each <- which(is.different)
+		last.of.each <- c(first.of.each[-1]-1L, nzeros)
+
+# Identifying the true residual d.f. for each of these rows.			
 		DF2 <- nlib-nzero[somezero]
-		for (u in unique(key)) {
-			i <- which(key==u)
+		for (u in 1:length(first.of.each)) {
+			i <- o[first.of.each[u]:last.of.each[u]]
 			zeroi <- zero2[i[1],]
 			DF2[i] <- DF2[i]-qr(design[!zeroi,,drop=FALSE])$rank
 		}
-		DF2 <- pmax(DF2,0)
+		DF2 <- pmax(DF2, 0L)
 		DF[somezero] <- DF2
 	}
 	DF
diff --git a/R/subsetting.R b/R/subsetting.R
index 1c7b720..5122ecb 100644
--- a/R/subsetting.R
+++ b/R/subsetting.R
@@ -3,7 +3,7 @@
 assign("[.DGEList",
 function(object, i, j, keep.lib.sizes=TRUE)
 #  Subsetting for DGEList objects
-#  24 September 2009.  Last modified 17 March 2014.
+#  24 September 2009.  Last modified 5 June 2014.
 {  
 #	Recognized components
 	IJ <- c("counts","pseudo.counts","offset","weights")
@@ -14,6 +14,7 @@ function(object, i, j, keep.lib.sizes=TRUE)
 
 	out <- subsetListOfArrays(object,i,j,IJ=IJ,IX=IX,I=I,JX=JX)
 	if(!(missing(i) || keep.lib.sizes)) out$samples$lib.size <- colSums(out$counts)
+	if(!missing(j)) out$samples$group <- .check.factor(out$samples$group)
 	out
 })
 
diff --git a/build/vignette.rds b/build/vignette.rds
index 5c206c1..d55a8e8 100644
Binary files a/build/vignette.rds and b/build/vignette.rds differ
diff --git a/data/NC1.txt b/data/NC1.txt
deleted file mode 100755
index 0bb95e8..0000000
--- a/data/NC1.txt
+++ /dev/null
@@ -1,17704 +0,0 @@
-Tag_Sequence	Count
-AAAAAAAAAA	17
-AAAAAAAAGA	1
-AAAAAAACCC	1
-AAAAAAAGCA	1
-AAAAAAATCA	4
-AAAAAAATTT	1
-AAAAAACAAA	1
-AAAAAACCCA	1
-AAAAAACTAA	1
-AAAAAACTCC	1
-AAAAAATACT	1
-AAAAAATATG	1
-AAAAACACCT	1
-AAAAACAGTA	1
-AAAAACCCTT	1
-AAAAACTCCA	1
-AAAAAGAAAA	1
-AAAAAGAATG	1
-AAAAAGACAC	1
-AAAAAGCACA	2
-AAAAAGCAGA	1
-AAAAAGCATT	1
-AAAAAGCTAG	1
-AAAAAGCTGA	1
-AAAAAGGGTT	1
-AAAAAGTTTC	1
-AAAAATAAAG	4
-AAAAATAAAT	1
-AAAAATCCTA	1
-AAAAATCGGC	1
-AAAAATCTTC	1
-AAAAATGCAC	1
-AAAAATGGTA	1
-AAAAATTGGA	3
-AAAACAAAAA	1
-AAAACAATCT	1
-AAAACAGAGG	1
-AAAACAGGAT	1
-AAAACAGTAG	1
-AAAACATACT	1
-AAAACATTAT	2
-AAAACATTCA	1
-AAAACATTCC	4
-AAAACATTCT	161
-AAAACATTTC	1
-AAAACCAAAA	1
-AAAACCCAGT	2
-AAAACCGAGG	1
-AAAACCTACA	1
-AAAACCTAGT	1
-AAAACGCTCC	1
-AAAACTCATT	3
-AAAACTCCTG	1
-AAAACTGAGA	3
-AAAACTGCAC	2
-AAAACTTCTG	3
-AAAACTTTCC	1
-AAAACTTTCT	1
-AAAAGAAAAG	1
-AAAAGAAAAT	1
-AAAAGAAACT	1
-AAAAGAAAGG	1
-AAAAGAGAAA	8
-AAAAGAGAAT	1
-AAAAGAGTGG	19
-AAAAGAGTTA	1
-AAAAGATGCA	1
-AAAAGATGCT	1
-AAAAGATTCT	1
-AAAAGCAGAA	3
-AAAAGGAATG	1
-AAAAGGAGTG	1
-AAAAGGATGC	1
-AAAAGGATGT	1
-AAAAGGCACT	1
-AAAAGGCTTT	1
-AAAAGGGAGA	1
-AAAAGGGCAT	1
-AAAAGGGGCA	1
-AAAAGTCATT	1
-AAAAGTTATT	1
-AAAAGTTGGA	1
-AAAAGTTTTA	1
-AAAATAAACC	1
-AAAATAAACG	4
-AAAATAAACT	1
-AAAATAAATG	1
-AAAATAAGTG	1
-AAAATAGAAA	1
-AAAATAGGTC	1
-AAAATATCCC	1
-AAAATATGCT	1
-AAAATCACTT	1
-AAAATCAGGT	3
-AAAATCCAAT	1
-AAAATCCACA	1
-AAAATCCATC	1
-AAAATCGCTT	1
-AAAATCTACT	1
-AAAATCTCTT	1
-AAAATCTGGA	1
-AAAATGAACA	1
-AAAATGAAGA	1
-AAAATGAGAA	1
-AAAATGATAC	1
-AAAATGATAT	2
-AAAATGCTTT	1
-AAAATGGACA	1
-AAAATGGAGA	1
-AAAATGGCTT	1
-AAAATGGGGT	1
-AAAATGTACT	1
-AAAATGTATC	1
-AAAATGTTCA	1
-AAAATGTTCC	1
-AAAATGTTCT	1
-AAAATTAAAG	1
-AAAATTATCT	1
-AAAATTATGT	2
-AAAATTCCCC	1
-AAAATTGACC	1
-AAAATTGCCA	1
-AAAATTGCTT	1
-AAAATTTAGC	1
-AAAATTTTTG	1
-AAACAAAAAA	1
-AAACAAACTT	1
-AAACAACCAG	1
-AAACAATGGC	1
-AAACACAGCA	1
-AAACACCAAC	1
-AAACACGAAA	1
-AAACACTCTT	2
-AAACACTTGA	1
-AAACAGAGCT	3
-AAACAGAGTT	1
-AAACAGCACA	1
-AAACAGCAGG	1
-AAACAGCCCT	1
-AAACAGCCTA	1
-AAACAGGCAC	2
-AAACAGTAGT	3
-AAACAGTGTA	1
-AAACAGTTGT	1
-AAACATCCTA	9
-AAACATCCTT	1
-AAACATTAGC	1
-AAACATTCTC	1
-AAACATTGGG	7
-AAACATTTTC	1
-AAACCAAAAA	1
-AAACCAACTG	1
-AAACCAATCA	1
-AAACCAATCT	1
-AAACCAATTA	1
-AAACCAATTT	1
-AAACCACTTC	1
-AAACCAGGAG	2
-AAACCATCCA	2
-AAACCATTCT	1
-AAACCCCGTC	2
-AAACCCCGTT	1
-AAACCCCTCA	1
-AAACCGCTTG	1
-AAACCGGGAG	2
-AAACCTCAGG	2
-AAACCTCATT	1
-AAACCTCCAA	1
-AAACCTGAGA	2
-AAACCTGTGT	1
-AAACGAAGAT	1
-AAACGACCAA	1
-AAACGAGACG	2
-AAACGAGCTG	1
-AAACGGCTGG	1
-AAACTAATCC	1
-AAACTAATGA	1
-AAACTACCCC	1
-AAACTACCCT	1
-AAACTAGAAA	1
-AAACTAGGAG	1
-AAACTATTAG	1
-AAACTCCAAC	1
-AAACTCGGGT	2
-AAACTCGTGA	1
-AAACTCTATT	1
-AAACTCTGGG	1
-AAACTCTGTG	3
-AAACTGAATA	2
-AAACTGGACT	1
-AAACTGGCAG	5
-AAACTGTCAG	1
-AAACTGTGGT	2
-AAACTGTTCA	1
-AAACTTACCT	1
-AAACTTACTG	1
-AAACTTCATT	1
-AAACTTCCGC	1
-AAACTTGCTC	7
-AAACTTGTGG	1
-AAACTTTCAC	1
-AAACTTTGTA	3
-AAACTTTTCT	1
-AAAGAAAAAA	1
-AAAGAAAGTG	2
-AAAGAACAGA	1
-AAAGAACATA	1
-AAAGAACGAC	2
-AAAGAAGACT	1
-AAAGAAGGCA	1
-AAAGAAGGCT	1
-AAAGAATGCA	1
-AAAGACATAT	1
-AAAGAGAAAG	1
-AAAGAGCATC	1
-AAAGAGGACC	2
-AAAGAGTCGG	2
-AAAGAGTCTT	1
-AAAGATACAA	1
-AAAGCAAGAA	1
-AAAGCACAAG	1
-AAAGCACGTC	1
-AAAGCAGCAC	3
-AAAGCAGCCG	1
-AAAGCAGGAC	1
-AAAGCATCCC	1
-AAAGCATCCG	1
-AAAGCATTCT	1
-AAAGCATTTT	1
-AAAGCCAAGA	3
-AAAGCCCAGT	1
-AAAGCCCCCC	1
-AAAGCCCTCT	1
-AAAGCCCTTG	1
-AAAGCCGGTA	1
-AAAGCCGTCA	2
-AAAGCCTATA	1
-AAAGCCTTCT	1
-AAAGCGTAAA	4
-AAAGCTCTTC	1
-AAAGCTGACA	1
-AAAGCTGCCT	4
-AAAGCTGGAA	1
-AAAGCTGTGG	1
-AAAGCTGTGT	1
-AAAGGAAAGT	2
-AAAGGAATGA	1
-AAAGGACAGT	1
-AAAGGACTCA	1
-AAAGGCAAGA	1
-AAAGGCAGAG	1
-AAAGGCAGAT	1
-AAAGGCGGGG	1
-AAAGGGAGGT	1
-AAAGGGGCAG	1
-AAAGGGGCCA	1
-AAAGGGGGCA	2
-AAAGGGTGAG	1
-AAAGGTATCA	1
-AAAGGTCAAG	1
-AAAGGTGAAG	1
-AAAGGTTCTT	1
-AAAGGTTTGG	1
-AAAGTACAGG	1
-AAAGTACTAA	1
-AAAGTAGAAG	1
-AAAGTCAATC	1
-AAAGTCAGAA	5
-AAAGTCATCA	1
-AAAGTCATTG	5
-AAAGTCCAGA	1
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-ACCAAGTGGG	3
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-ACCCTTGTGT	1
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-ACCCTTTCCC	1
-ACCCTTTCCT	1
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-ACCGAGCGGA	1
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-ACCGGATCAT	2
-ACCGGCTCTG	1
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-ACCGGTATGA	1
-ACCGTATTCC	2
-ACCGTCCACT	5
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-ACCGTCTTGT	1
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-ACCTAACGAT	1
-ACCTAACTTT	1
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-ACCTAATTGC	1
-ACCTAATTGG	1
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-ACCTAGCCAC	1
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-ACCTATAAGT	2
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-ACCTCAAGGA	1
-ACCTCAATGA	1
-ACCTCAATTA	3
-ACCTCACAAA	1
-ACCTCACCAA	3
-ACCTCACCCA	1
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-ACCTCAGAAG	1
-ACCTCAGCTT	1
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-ACCTCCCACC	1
-ACCTCCCCTT	1
-ACCTCCCGAA	1
-ACCTCCTCAA	1
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-ACCTCTGGCT	1
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-ACCTGAAACC	1
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-ACCTGCACAA	1
-ACCTGCACCC	1
-ACCTGCCACC	2
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-ACCTGCTGAT	1
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-ACCTGGCCTG	1
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-ACCTGTATCC	5
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-ACCTTCAAGT	1
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-ACCTTCTAAC	1
-ACCTTCTATT	2
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-ACCTTGCCTC	1
-ACCTTGCTCA	1
-ACCTTGGAAG	1
-ACCTTGGCAT	1
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-ACCTTGGGCA	1
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-ACCTTGGGTA	1
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-ACCTTGTATC	1
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-ACCTTTACTG	2
-ACCTTTAGAA	1
-ACCTTTCGTG	1
-ACCTTTGCCA	1
-ACCTTTGCCG	1
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-ACCTTTTCTA	1
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-ACGAAACCTT	1
-ACGAACTTAG	1
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-ACGAATAATA	1
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-ACGACCTCGT	1
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-ACGAGGTCAC	1
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-ACGATGGTCC	1
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-ACGCACTCTC	1
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-ACGCAGGGAC	1
-ACGCAGGGAG	142
-ACGCAGTGAC	1
-ACGCCACCCA	1
-ACGCCACTGT	1
-ACGCCCACCT	1
-ACGCCCGCCT	1
-ACGCCGCTAG	1
-ACGCCTATTA	1
-ACGCCTTGAG	1
-ACGCGAAGAC	1
-ACGCGGATGG	2
-ACGCGGCGCA	1
-ACGCTGCAGT	1
-ACGCTGCCCA	1
-ACGCTGCCGC	1
-ACGCTGCTGC	6
-ACGCTTTGGA	1
-ACGGAACAGA	1
-ACGGAAGTTT	6
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-ACGGAGGTTG	1
-ACGGCACTCT	1
-ACGGCAGATG	1
-ACGGCAGGTG	1
-ACGGCCGGCT	2
-ACGGCCTCGG	1
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-ACGGGCCCAA	1
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-ACGGGTATGA	1
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-ACGGTGATGT	4
-ACGGTGGTGG	2
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-ACGTAACAGA	1
-ACGTAACTCT	1
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-ACGTCATCGA	1
-ACGTCGTGTG	1
-ACGTCTGGTC	1
-ACGTGAAAAT	1
-ACGTGAGGCC	1
-ACGTGCAGGT	1
-ACGTGCGTGG	1
-ACGTGGAGGC	1
-ACGTGGATGG	1
-ACGTGGGTTG	1
-ACGTGGTGTA	1
-ACGTGTCCCA	1
-ACGTGTTTTC	1
-ACGTTAACCT	1
-ACGTTGGAAT	1
-ACGTTGGGTG	2
-ACGTTTGCAT	1
-ACGTTTGGTG	1
-ACGTTTTTAC	1
-ACTAAAACAC	11
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-ACTAAACCAG	1
-ACTAACAAAC	1
-ACTAACACCC	229
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-ACTAACACCT	4
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-ACTAATACCC	1
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-ACTAATTCAC	1
-ACTAATTCTC	1
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-ACTACATCTT	1
-ACTACCTTCA	2
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-ACTACCTTTC	1
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-ACTACTCTAC	1
-ACTACTTCAC	1
-ACTAGATTAC	1
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-ACTAGCACCC	1
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-ACTATATATA	1
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-ACTATTTCCA	1
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-ACTCAGGGAT	1
-ACTCAGGTGA	1
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-ACTCAGTTCC	1
-ACTCATCCCA	1
-ACTCATCTGA	1
-ACTCATCTTC	1
-ACTCCAAAAA	9
-ACTCCAAAGG	1
-ACTCCAAGGA	4
-ACTCCAGCTA	1
-ACTCCAGCTG	1
-ACTCCAGGTG	1
-ACTCCAGTGC	2
-ACTCCAGTTT	1
-ACTCCATAGA	2
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-ACTCCCACAA	1
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-ACTCCCCAGC	1
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-ACTTCTGGAA	1
-ACTTCTGTAT	1
-ACTTCTTCAA	2
-ACTTCTTCAC	1
-ACTTCTTTGT	1
-ACTTGAAGCC	1
-ACTTGAGAAG	1
-ACTTGAGACC	1
-ACTTGAGCTT	1
-ACTTGATATT	1
-ACTTGCCATT	2
-ACTTGCCCTT	1
-ACTTGCGAAT	4
-ACTTGCTGGA	1
-ACTTGCTGTG	1
-ACTTGGAGCC	6
-ACTTGGGGAG	1
-ACTTGGGGCT	1
-ACTTGGGTTC	1
-ACTTGTCCCA	1
-ACTTGTGGGG	1
-ACTTGTTCGC	1
-ACTTTAATCC	1
-ACTTTAGCTG	1
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-ACTTTCAAGT	1
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-ACTTTCCAAG	1
-ACTTTCCCAA	1
-ACTTTCTCTA	1
-ACTTTCTTGT	1
-ACTTTGAATG	1
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-ACTTTTACAA	2
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-ACTTTTCCAA	2
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-ACTTTTGGGA	1
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-ACTTTTTCAC	1
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-ACTTTTTCGA	2
-ACTTTTTCTT	1
-ACTTTTTGAG	1
-ACTTTTTGTG	1
-ACTTTTTTAA	2
-ACTTTTTTCA	1
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-AGAAAAACAC	1
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-AGAAAACAGT	1
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-AGAACCACTT	1
-AGAACCCAAA	1
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-AGAACCTGTC	1
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-AGAACTACGT	1
-AGAACTGCTT	2
-AGAACTTCTT	1
-AGAACTTTCC	5
-AGAACTTTTG	1
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-AGAATGGCGT	1
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-AGACCCTGAA	1
-AGACCCTTCC	1
-AGACCTCTGC	1
-AGACCTGCTG	1
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-AGACCTGGGA	1
-AGACCTGTAA	2
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-AGAGACTGGG	1
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-AGAGCACTAC	1
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-AGCAGGGGTG	1
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-AGCAGTTCTC	1
-AGCAGTTGGT	1
-AGCAGTTTGG	1
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-AGCATAGTGC	1
-AGCATTGCTC	1
-AGCATTTCTT	1
-AGCCAAAAAA	2
-AGCCAAAATA	1
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-AGCCAATTAA	1
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-AGCCACCACT	1
-AGCCACCATA	1
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-AGCCACCCTG	1
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-AGCCACCGCG	32
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-AGCCACCTGC	2
-AGCCACGACA	1
-AGCCACGACG	1
-AGCCACGGCG	1
-AGCCACGGTG	1
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-AGCCACTGCT	1
-AGCCACTGGG	1
-AGCCACTGTA	1
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-AGCCAGCAGT	1
-AGCCAGGGTA	1
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-AGCCAGGTGT	1
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-AGCCATCGCA	1
-AGCCATCGCG	1
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-AGCCATTGTG	2
-AGCCCAAGAG	1
-AGCCCAAGGG	1
-AGCCCACAGG	1
-AGCCCACTCA	1
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-AGCCCAGCAG	1
-AGCCCAGCCC	1
-AGCCCAGCTG	3
-AGCCCAGGAA	1
-AGCCCAGGAG	7
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-AGCCCCCCCT	1
-AGCCCCGGGG	1
-AGCCCCGGTG	1
-AGCCCCTGCA	1
-AGCCCCTGTG	2
-AGCCCGAACT	1
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-AGCCCGCCGC	7
-AGCCCGCGAG	2
-AGCCCGGGAG	3
-AGCCCTAACA	2
-AGCCCTACAA	222
-AGCCCTACAT	2
-AGCCCTACCA	1
-AGCCCTACGA	2
-AGCCCTCCCT	20
-AGCCCTCCTG	1
-AGCCCTGCAC	1
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-AGCCCTGGAA	1
-AGCCCTTCAA	1
-AGCCCTTTTA	2
-AGCCGAAAGG	1
-AGCCGACATC	1
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-AGCCGAGATC	5
-AGCCGAGATG	5
-AGCCGAGATT	2
-AGCCGCAAAC	1
-AGCCGCCCGC	1
-AGCCGCTGAG	1
-AGCCGCTGGG	1
-AGCCTACAAA	1
-AGCCTACAAC	1
-AGCCTACAAG	1
-AGCCTACAGG	5
-AGCCTAGAAA	1
-AGCCTAGGCA	1
-AGCCTCAAAA	1
-AGCCTCAACG	1
-AGCCTCCTGT	2
-AGCCTCGGCC	2
-AGCCTCTCAA	1
-AGCCTCTTCA	1
-AGCCTGACTG	1
-AGCCTGAGAG	1
-AGCCTGCAGA	8
-AGCCTGCCTG	4
-AGCCTGCTCA	3
-AGCCTGGAAG	1
-AGCCTGGACT	6
-AGCCTGGAGA	2
-AGCCTGGCCC	1
-AGCCTGGCCT	1
-AGCCTGGGAG	2
-AGCCTGGGCC	1
-AGCCTGGGTG	2
-AGCCTGTAAT	3
-AGCCTGTAGT	5
-AGCCTGTGGT	1
-AGCCTGTTGT	1
-AGCCTTACAA	1
-AGCCTTGGCA	1
-AGCCTTGGGA	1
-AGCCTTTCCG	1
-AGCCTTTCTA	1
-AGCCTTTGCG	1
-AGCCTTTGTT	2
-AGCGACAGCG	1
-AGCGACTGCA	1
-AGCGAGAGGG	1
-AGCGAGCTAG	1
-AGCGAGCTGC	1
-AGCGATCTGG	1
-AGCGATTCCT	1
-AGCGCCTAGC	1
-AGCGCCTTCC	2
-AGCGCTGATG	2
-AGCGGAAGAG	2
-AGCGGAGAGG	1
-AGCGGATCAG	1
-AGCGGCCGCG	10
-AGCGGCCTGC	2
-AGCGGCTACA	8
-AGCGGCTACG	1
-AGCGGTCTAG	1
-AGCGTCGATG	1
-AGCGTCTCTT	1
-AGCGTGGAGG	1
-AGCGTGGTGA	1
-AGCTAATTAA	1
-AGCTACAGAA	1
-AGCTACAGGT	1
-AGCTACTCCA	1
-AGCTACTGCA	1
-AGCTACTGCG	1
-AGCTATTTCT	1
-AGCTCACGAG	1
-AGCTCACTGA	1
-AGCTCAGCCT	1
-AGCTCAGCGT	1
-AGCTCAGCTA	1
-AGCTCAGGAG	4
-AGCTCATATT	1
-AGCTCCCCAG	2
-AGCTCCGTCC	3
-AGCTCCTACC	1
-AGCTCGTGGT	1
-AGCTCTAAGA	1
-AGCTCTCAAT	1
-AGCTCTCACT	1
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-AGCTCTGGTC	1
-AGCTCTTCCT	1
-AGCTCTTGGA	33
-AGCTGAACAG	1
-AGCTGAACTC	1
-AGCTGAAGTC	1
-AGCTGAATTC	1
-AGCTGAGACC	1
-AGCTGAGATC	2
-AGCTGATCAG	3
-AGCTGATGGT	1
-AGCTGCACCT	1
-AGCTGCTGCA	2
-AGCTGCTGGA	1
-AGCTGGAGAA	1
-AGCTGGAGTC	4
-AGCTGGCGAA	1
-AGCTGGCGAC	1
-AGCTGGCTCA	1
-AGCTGGGATG	1
-AGCTGGGCTG	1
-AGCTGGGGAG	2
-AGCTGGGGCC	1
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-AGCTGTCACA	1
-AGCTGTCACT	1
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-AGCTGTCTCA	3
-AGCTGTGGGC	1
-AGCTGTGTGG	1
-AGCTGTTCCT	1
-AGCTGTTCTG	1
-AGCTGTTGCC	3
-AGCTTACATC	1
-AGCTTACATT	2
-AGCTTCACCT	1
-AGCTTCCAGC	5
-AGCTTCCTCT	1
-AGCTTGAGAC	1
-AGCTTGCACA	1
-AGCTTGCCTG	1
-AGCTTGCTCA	1
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-AGCTTTAGTT	1
-AGCTTTATTC	1
-AGCTTTCCTT	1
-AGCTTTCTTG	1
-AGCTTTTGGC	1
-AGGAAAAGAT	5
-AGGAAAAGTG	1
-AGGAAACAAG	1
-AGGAAACCCC	1
-AGGAAACCCT	1
-AGGAAACTGA	1
-AGGAAAGAGA	1
-AGGAAAGCCA	1
-AGGAAAGCTG	14
-AGGAAAGGAT	1
-AGGAAATTTC	1
-AGGAACTGCT	1
-AGGAACTGGG	1
-AGGAACTTTA	1
-AGGAACTTTT	3
-AGGAAGAAGG	1
-AGGAAGATTA	1
-AGGAAGGAAC	1
-AGGAAGGACA	1
-AGGAAGGAGT	1
-AGGAAGGGGT	1
-AGGAAGTCCA	1
-AGGAATGCTT	2
-AGGAATGGCA	1
-AGGAATGTAT	1
-AGGAATTGGT	1
-AGGACAAACC	4
-AGGACAAAGA	1
-AGGACAGCAA	2
-AGGACAGTTG	1
-AGGACCACTT	1
-AGGACTCTGG	1
-AGGACTGCTG	1
-AGGACTGGGG	2
-AGGACTGTGC	1
-AGGACTGTTG	1
-AGGACTTCTG	1
-AGGACTTTCC	1
-AGGACTTTGC	2
-AGGAGAAAGC	1
-AGGAGAACAG	1
-AGGAGACATA	1
-AGGAGAGGCT	1
-AGGAGAGGGG	1
-AGGAGATGGA	1
-AGGAGCAAAG	3
-AGGAGCCTGA	1
-AGGAGCCTTA	1
-AGGAGCGGGG	3
-AGGAGCTCGG	1
-AGGAGCTGCG	1
-AGGAGCTGCT	8
-AGGAGGAAGA	1
-AGGAGGAGCT	1
-AGGAGGCAAA	1
-AGGAGGGATA	1
-AGGAGGTCCG	1
-AGGAGGTCGC	1
-AGGAGGTCGT	1
-AGGAGTCCAG	1
-AGGAGTCGAC	2
-AGGAGTTGTA	1
-AGGATAAACA	1
-AGGATAGAGC	1
-AGGATAGCTA	1
-AGGATAGCTT	1
-AGGATATCCA	1
-AGGATATGAG	1
-AGGATATTAT	1
-AGGATCACCT	1
-AGGATCACTT	1
-AGGATCGCTT	1
-AGGATGACCA	1
-AGGATGACCC	2
-AGGATGAGGC	1
-AGGATGCCAG	2
-AGGATGGTCC	34
-AGGATGTACA	3
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-AGGATGTGTT	1
-AGGATTGTAA	1
-AGGATTGTCC	1
-AGGCAAAAAA	1
-AGGCAAATGC	1
-AGGCAACTAC	1
-AGGCAAGAGG	1
-AGGCAAGGGA	3
-AGGCAAGGGG	1
-AGGCAAGGTG	1
-AGGCAATGAT	1
-AGGCACATCA	1
-AGGCACCATA	1
-AGGCACGCAC	4
-AGGCACGTGG	1
-AGGCACTAAT	1
-AGGCACTGGC	2
-AGGCAGAGAT	1
-AGGCAGAGGC	1
-AGGCAGAGGT	3
-AGGCAGGACT	1
-AGGCAGGAGG	5
-AGGCAGGGGC	1
-AGGCAGGTCA	1
-AGGCAGTGAG	1
-AGGCATCACA	1
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-AGGCCAAATA	1
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-AGGCCAAGGG	21
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-AGGCCAATGA	1
-AGGCCACGAC	1
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-AGGCCAGGAA	1
-AGGCCAGGAG	4
-AGGCCAGGCC	2
-AGGCCAGGGG	1
-AGGCCAGGTG	1
-AGGCCAGTAT	1
-AGGCCATAGG	5
-AGGCCCACCC	1
-AGGCCCTGCT	1
-AGGCCGGAGA	1
-AGGCCGGGAA	1
-AGGCCGGGAT	1
-AGGCCGGTAG	1
-AGGCCGTCCC	2
-AGGCCTCAAG	1
-AGGCCTCCTG	1
-AGGCCTCTTA	1
-AGGCCTGGCA	1
-AGGCCTGGGC	4
-AGGCCTTGAG	1
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-AGGCCTTGGT	3
-AGGCGAGATC	6
-AGGCGAGCTG	3
-AGGCGCGAGG	1
-AGGCGGAGGT	1
-AGGCGTAACA	1
-AGGCTACGAA	1
-AGGCTACGGA	19
-AGGCTATTGG	1
-AGGCTCCCAG	1
-AGGCTGAACG	1
-AGGCTGAGAC	1
-AGGCTGAGGC	7
-AGGCTGCACC	2
-AGGCTGCGAC	1
-AGGCTGCGGA	1
-AGGCTGGATG	4
-AGGCTGGGGT	1
-AGGCTGTCCA	2
-AGGCTGTGTT	7
-AGGCTTCGGT	1
-AGGCTTCTAG	1
-AGGCTTGCAA	1
-AGGCTTTATG	2
-AGGGAAAAAA	1
-AGGGAAAACC	2
-AGGGAAAAGG	1
-AGGGAAACCT	1
-AGGGAACTGC	1
-AGGGAACTTG	1
-AGGGAAGTGC	1
-AGGGAATTCC	1
-AGGGACACGT	1
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-AGGGAGAGGG	3
-AGGGAGCGGT	1
-AGGGAGCTGC	1
-AGGGAGGTGG	1
-AGGGATTCTC	1
-AGGGCAACTA	3
-AGGGCAAGGC	1
-AGGGCAATAA	1
-AGGGCACCAC	1
-AGGGCACTGA	1
-AGGGCAGAGG	3
-AGGGCAGCCC	1
-AGGGCAGCGG	1
-AGGGCAGGAG	1
-AGGGCAGGCG	1
-AGGGCATCGT	1
-AGGGCCAAAA	1
-AGGGCCAGCA	1
-AGGGCCAGGA	1
-AGGGCCATCA	1
-AGGGCCCTCT	1
-AGGGCGAGGC	1
-AGGGCTACTT	1
-AGGGCTGAAG	1
-AGGGCTGACA	1
-AGGGCTGCCA	1
-AGGGCTGCCC	1
-AGGGCTGCCT	1
-AGGGCTGGGG	1
-AGGGCTTCCA	26
-AGGGCTTGAG	4
-AGGGCTTGCC	1
-AGGGCTTTAA	1
-AGGGGAAAGT	1
-AGGGGAAGGT	1
-AGGGGACGGC	1
-AGGGGAGAGG	1
-AGGGGATTCC	1
-AGGGGCAGAA	1
-AGGGGCCCAG	1
-AGGGGCGCAG	3
-AGGGGCGGTG	1
-AGGGGCTACA	1
-AGGGGCTACC	1
-AGGGGCTGCC	5
-AGGGGGCAGG	1
-AGGGGGCTGA	2
-AGGGGGGAAT	1
-AGGGGGGAGG	4
-AGGGGGGCAG	1
-AGGGGGGCGT	1
-AGGGGTTCTT	1
-AGGGGTTGCC	1
-AGGGTAACCG	1
-AGGGTAATTA	1
-AGGGTCATCC	1
-AGGGTCTGGG	1
-AGGGTGAAAC	1
-AGGGTGAACG	1
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-AGGTCAATGA	5
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-AGGTCAGGAC	2
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-AGGTCAGTAG	2
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-AGGTCCCTGC	1
-AGGTCCCTGT	1
-AGGTCCTAGA	1
-AGGTCCTAGC	8
-AGGTCGGGAG	3
-AGGTCGGGAT	1
-AGGTCTAAGG	1
-AGGTCTGCCA	1
-AGGTCTGGGT	1
-AGGTCTTCAA	2
-AGGTCTTGCC	1
-AGGTGAAAGG	1
-AGGTGAACAG	1
-AGGTGAAGCA	1
-AGGTGACGGC	1
-AGGTGACTGG	10
-AGGTGACTTT	1
-AGGTGAGAAA	1
-AGGTGAGAGG	6
-AGGTGAGGAG	1
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-AGGTGCAGAG	2
-AGGTGCCTAA	1
-AGGTGCTGTC	1
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-AGGTGGACAA	1
-AGGTGGACAG	3
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-AGGTGGGCCC	1
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-AGGTGGGGGT	1
-AGGTGTCTTT	1
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-AGGTGTTTTC	1
-AGGTTAGGAG	1
-AGGTTCCTAG	1
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-ATGTGGAGTG	1
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-ATGTGGGCCC	1
-ATGTGGGCTC	7
-ATGTGGGTTA	1
-ATGTGTCCCT	1
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-ATGTTACTAA	1
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-ATGTTAGGGA	2
-ATGTTATCAA	2
-ATGTTATGAG	1
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-ATTGTGACAC	1
-ATTGTGAGGC	4
-ATTGTGAGGG	4
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-ATTGTGCCAT	1
-ATTGTGCTAA	1
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-ATTGTGCTAT	1
-ATTGTGCTTG	1
-ATTGTGGCAC	1
-ATTGTGGCGG	1
-ATTGTGGGTG	1
-ATTGTGTCAC	1
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-ATTTAAGAGA	1
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-ATTTTTTCCT	2
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-CAAAAAAAGA	1
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-CAAGCCCAGC	1
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-CAAGCTCAGA	1
-CAAGCTCAGC	1
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-CAAGGAGAGG	1
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-CAAGGTTTTT	1
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-CAAGTACCTG	3
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-CAATGACCCC	1
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-CCCAAGGACT	1
-CCCAAGGTAC	1
-CCCAAGGTCT	2
-CCCAAGTATT	1
-CCCAAGTGCC	1
-CCCAATCTAT	1
-CCCAATGCAA	3
-CCCACAAAGG	1
-CCCACAACAG	2
-CCCACAACCC	1
-CCCACAAGGA	1
-CCCACAATCC	3
-CCCACACTAC	14
-CCCACACTCC	1
-CCCACACTTT	1
-CCCACAGAAG	1
-CCCACCATCA	1
-CCCACCGCAT	1
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-CCCACCGGTG	2
-CCCACCGTCC	5
-CCCACCGTTA	1
-CCCACCTAAT	1
-CCCACCTCTG	1
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-CCCACTGCAC	1
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-CCCAGATGAT	3
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-CCCAGCCTAG	1
-CCCAGCCTAT	1
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-CCCAGCCTCT	1
-CCCAGCCTGA	1
-CCCAGCCTGC	1
-CCCAGCCTTT	1
-CCCAGCGACT	1
-CCCAGCGTCC	1
-CCCAGCTAAT	8
-CCCAGCTACA	1
-CCCAGCTACT	2
-CCCAGCTAGC	1
-CCCAGCTAGG	1
-CCCAGCTGGC	1
-CCCAGCTGGG	2
-CCCAGCTGTC	1
-CCCAGCTTGC	1
-CCCAGGAAGA	1
-CCCAGGAAGG	1
-CCCAGGACAC	1
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-CCCAGGGCTC	1
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-CCCATCGTCA	4
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-CCCATTTTTA	1
-CCCCAAAAAA	1
-CCCCAAAGCT	1
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-CCCCAACTGC	1
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-CCCCACCCGA	1
-CCCCACCTGC	1
-CCCCACGCTC	1
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-CCCCACGGTC	1
-CCCCACTTGC	1
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-CCCCAGATGC	1
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-CCCCAGCCGG	1
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-CCCCAGGAGA	3
-CCCCAGGATA	1
-CCCCAGGCTC	1
-CCCCAGGCTG	2
-CCCCAGGTCA	1
-CCCCAGGTCC	1
-CCCCAGTAGC	1
-CCCCAGTATA	1
-CCCCAGTCCT	1
-CCCCAGTCGG	17
-CCCCAGTGAA	1
-CCCCAGTGAC	1
-CCCCAGTGAG	2
-CCCCAGTGCT	2
-CCCCAGTGGA	1
-CCCCAGTGGC	1
-CCCCAGTTAA	1
-CCCCAGTTCG	1
-CCCCAGTTGC	42
-CCCCAGTTGT	1
-CCCCATCACC	1
-CCCCATCGTC	4
-CCCCATTAGA	1
-CCCCATTTGC	1
-CCCCCAAAAA	1
-CCCCCAAACT	1
-CCCCCAACAG	1
-CCCCCACCCC	1
-CCCCCACCTA	1
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-CCCCCAGCTA	2
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-CCCCCATATA	1
-CCCCCATCCT	1
-CCCCCATCTC	1
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-CCCCCCATCT	1
-CCCCCCTGGA	1
-CCCCCCTTCT	1
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-CCCCCGCACT	1
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-CCCCCTCCGG	4
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-CCCCCTGCAA	1
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-CCCCCTGCCC	3
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-CCCCCTTCCC	1
-CCCCCTTGCA	5
-CCCCCTTTGC	4
-CCCCGAGTCA	1
-CCCCGCACAT	2
-CCCCGCAGCT	2
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-CCCCGCGGAG	1
-CCCCGCGTGC	1
-CCCCGCTGCC	2
-CCCCGGCCAC	1
-CCCCGGCCAG	1
-CCCCGGCCTT	1
-CCCCGGTCCA	1
-CCCCGTACAG	1
-CCCCGTACGT	1
-CCCCGTACTC	1
-CCCCGTATGG	1
-CCCCGTCATC	2
-CCCCGTGGGT	1
-CCCCTAAAGG	1
-CCCCTAAGTA	1
-CCCCTAATCC	4
-CCCCTATAAG	1
-CCCCTCAAAA	1
-CCCCTCCCCA	3
-CCCCTCCCCC	1
-CCCCTCCCGA	1
-CCCCTCCCTC	3
-CCCCTCCGGG	1
-CCCCTCGTCC	4
-CCCCTCTGAG	1
-CCCCTGAACA	1
-CCCCTGAGCT	1
-CCCCTGCACT	4
-CCCCTGCCTT	1
-CCCCTGCTAG	2
-CCCCTGGATC	1
-CCCCTGGCTG	1
-CCCCTGGGGA	1
-CCCCTGTGGC	1
-CCCCTGTGGT	1
-CCCCTGTTCC	1
-CCCCTTATTG	1
-CCCCTTCAGC	1
-CCCCTTGAAA	1
-CCCCTTGGAT	1
-CCCCTTGGCC	1
-CCCCTTGGGG	1
-CCCCTTGGGT	5
-CCCCTTTGCA	1
-CCCGAAATCC	1
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-CCCGAATAGA	1
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-CCCGACTACT	1
-CCCGAGGGCC	1
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-CCCGCCTGTG	1
-CCCGCGGCCC	2
-CCCGCGGTGG	1
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-CCCGCTCTTG	1
-CCCGCTGCAC	1
-CCCGCTTCGC	1
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-CCCGGCCAGC	2
-CCCGGCCAGG	1
-CCCGGCCCTC	1
-CCCGGCCCTG	1
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-CCCGGCTCCT	8
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-CCCGGGGGAG	1
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-CCCGTACATC	2
-CCCGTAGTCC	3
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-CCCGTCAGCC	8
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-CCCGTCTCTG	1
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-CCCTACAACG	3
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-CCCTACTTCT	1
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-CCCTATAATG	1
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-CCCTCAAAGG	1
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-CCCTCACCTG	1
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-CCCTCCAAGG	1
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-CCCTCCAGCC	1
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-CCCTCCCAGC	3
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-CCCTCCGTGC	1
-CCCTCCTCTC	1
-CCCTCCTGCT	1
-CCCTCCTGGA	3
-CCCTCCTGGG	5
-CCCTCCTTGG	1
-CCCTCCTTGT	1
-CCCTCGCGGA	1
-CCCTCGGAAA	1
-CCCTCGTCCT	3
-CCCTCTCACG	1
-CCCTCTCCCT	1
-CCCTCTCCGG	1
-CCCTCTCTGG	3
-CCCTCTCTGT	3
-CCCTCTGCAT	1
-CCCTCTGTGA	5
-CCCTCTTTGA	1
-CCCTGAAGAG	1
-CCCTGAATCC	1
-CCCTGACTGC	5
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-CCCTGATAAT	1
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-CCCTGCAAGT	1
-CCCTGCAATT	1
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-CCCTGCGCGC	1
-CCCTGCGTTC	1
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-CCCTGGCTGG	1
-CCCTGGCTGT	1
-CCCTGGGGGG	1
-CCCTGGGTTC	23
-CCCTGGTCAA	1
-CCCTGGTTCT	1
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-CCCTGTAATT	1
-CCCTGTACAT	1
-CCCTGTATGT	1
-CCCTGTCTCT	1
-CCCTGTGGTT	1
-CCCTGTTCAC	1
-CCCTGTTGAA	1
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-CCCTTAGCAA	14
-CCCTTAGCTT	16
-CCCTTATTAA	1
-CCCTTATTGG	1
-CCCTTCACGG	1
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-CCCTTCCCAA	1
-CCCTTCCCCG	6
-CCCTTCCGTC	1
-CCCTTCCTCT	1
-CCCTTCGTCC	3
-CCCTTCTATT	1
-CCCTTCTGAT	4
-CCCTTCTGCC	1
-CCCTTCTGGG	1
-CCCTTGACCC	8
-CCCTTGCAAT	1
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-CCCTTGTAAG	1
-CCCTTGTGAA	1
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-CCCTTGTTTG	1
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-CCCTTTCCAG	2
-CCCTTTGCAC	1
-CCCTTTGTCA	1
-CCCTTTGTTT	1
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-CCGACGGGCG	4
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-CCGAGGCAGG	1
-CCGAGGCGAT	1
-CCGAGGCTGC	6
-CCGAGGCTTG	1
-CCGAGGGCAC	1
-CCGAGGTTGA	1
-CCGAGTTGGT	1
-CCGATCACCG	8
-CCGATGTCAT	1
-CCGATTCGTC	1
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-CCGATTGTGG	1
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-CCGCAACTTC	1
-CCGCAAGATT	1
-CCGCAGGAGA	1
-CCGCATCCAG	1
-CCGCATTGGT	1
-CCGCCACGCC	1
-CCGCCACTGC	1
-CCGCCATCCA	1
-CCGCCCACCC	1
-CCGCCCCCAG	1
-CCGCCCCTGA	1
-CCGCCCTCCA	1
-CCGCCGAAGT	3
-CCGCCGAATT	1
-CCGCCGCCGC	1
-CCGCCGGATC	1
-CCGCCGGTCA	1
-CCGCCTCCTA	1
-CCGCGGCCGC	2
-CCGCGTCCCT	8
-CCGCGTGAAG	1
-CCGCTAAACT	1
-CCGCTAATCC	1
-CCGCTGAACT	1
-CCGCTGACTC	1
-CCGCTGATCC	4
-CCGCTGCACT	127
-CCGCTGCAGT	2
-CCGCTGCCTC	1
-CCGCTGCGCT	1
-CCGCTGCTCT	1
-CCGCTGCTTG	1
-CCGCTGGCCC	1
-CCGCTTACTC	1
-CCGCTTCTGA	1
-CCGCTTCTGC	2
-CCGGAAACAC	5
-CCGGAATGTG	1
-CCGGACCTGT	1
-CCGGAGGAGG	1
-CCGGCAACCA	1
-CCGGCAATGC	1
-CCGGCCAACA	1
-CCGGCCAGCG	1
-CCGGCCCTAC	1
-CCGGCCTCTA	1
-CCGGCGCGTG	4
-CCGGCGGGCG	1
-CCGGCTCACA	1
-CCGGCTGGAA	1
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-CCGGGAGTCC	1
-CCGGGAGTCT	1
-CCGGGCACAG	1
-CCGGGCACCC	1
-CCGGGCCCAG	3
-CCGGGCGAAT	1
-CCGGGCGCGC	2
-CCGGGCGCGG	1
-CCGGGCTAAT	2
-CCGGGCTCAC	1
-CCGGGGAGCA	4
-CCGGGGCAAC	1
-CCGGGGCAAT	2
-CCGGGGGCTT	1
-CCGGGTGATG	6
-CCGGGTTATT	1
-CCGGTAATCC	2
-CCGGTAATTC	1
-CCGGTAGTCC	1
-CCGTAATCTC	1
-CCGTACCCGG	1
-CCGTACCTGT	1
-CCGTACGCGC	1
-CCGTAGCAAT	1
-CCGTAGTGCC	3
-CCGTCATCCT	2
-CCGTCCAAGG	18
-CCGTCCAGCG	1
-CCGTCCTCAG	1
-CCGTCGTGGG	1
-CCGTCTGGGA	1
-CCGTGAAGTT	1
-CCGTGAGCCA	2
-CCGTGAGGGT	1
-CCGTGCATTA	1
-CCGTGCCACC	1
-CCGTGCCTCC	1
-CCGTGCTCAT	6
-CCGTGGGGAG	1
-CCGTGGTCAC	6
-CCGTGGTCGT	1
-CCGTTACTGA	1
-CCGTTCCACT	1
-CCGTTCCCTG	2
-CCGTTCTCCT	3
-CCGTTCTGAT	1
-CCGTTCTGGA	6
-CCGTTGCACT	1
-CCGTTGCGAG	1
-CCGTTGGAAA	1
-CCTAAAACCC	1
-CCTAAAAGAG	1
-CCTAAAATCC	1
-CCTAAAGGAG	1
-CCTAACACCC	1
-CCTAACACCT	1
-CCTAACTGAC	1
-CCTAAGGCTA	2
-CCTAAGTGAC	1
-CCTAATCGCA	1
-CCTAATGCTT	1
-CCTAATTTGA	2
-CCTACAAAAA	1
-CCTACAATCC	1
-CCTACAGCTA	6
-CCTACCACAA	1
-CCTACCACAG	1
-CCTACTCATC	1
-CCTACTGCAC	2
-CCTACTGTGG	1
-CCTAGAGCAG	1
-CCTAGCTGGA	16
-CCTAGGACCT	6
-CCTAGGACTT	1
-CCTAGGCCTT	1
-CCTAGGGGAT	1
-CCTAGGGTTC	2
-CCTAGTAAAA	1
-CCTAGTCCAA	1
-CCTAGTGCCT	1
-CCTAGTGGCA	1
-CCTAGTTTCT	1
-CCTAGTTTTA	1
-CCTATAAAAT	1
-CCTATAAACC	1
-CCTATAAGCC	1
-CCTATAATCA	1
-CCTATAATCC	33
-CCTATAATCT	4
-CCTATAATGC	1
-CCTATAATTC	2
-CCTATACATA	1
-CCTATAGGCC	1
-CCTATAGTCC	8
-CCTATAGTCT	1
-CCTATAGTTT	1
-CCTATATAAT	2
-CCTATATATT	1
-CCTATATTCC	1
-CCTATCATCC	1
-CCTATCGTCC	2
-CCTATCTACC	1
-CCTATGATCC	1
-CCTATGCTGG	1
-CCTATGGACC	2
-CCTATGGTCA	1
-CCTATGTAAG	1
-CCTATGTCCT	2
-CCTATGTGTT	1
-CCTATTAAAT	1
-CCTATTGCTT	1
-CCTATTTACT	26
-CCTATTTATT	1
-CCTATTTTCT	1
-CCTCAACGTA	1
-CCTCAAGCTA	1
-CCTCAATGCT	1
-CCTCACAGAT	1
-CCTCACCACG	2
-CCTCACGATA	1
-CCTCACTCTG	1
-CCTCACTTTC	1
-CCTCAGCACT	5
-CCTCAGCAGA	1
-CCTCAGCATA	1
-CCTCAGCCCT	1
-CCTCAGCCTC	4
-CCTCAGCTAC	1
-CCTCAGCTGG	1
-CCTCAGCTTG	1
-CCTCAGGATA	114
-CCTCAGGCTC	2
-CCTCAGGGAC	1
-CCTCAGGTTA	1
-CCTCAGTATA	1
-CCTCAGTCTC	1
-CCTCATCGTC	1
-CCTCATTGTA	1
-CCTCCAAATA	1
-CCTCCAACAT	1
-CCTCCAACTA	3
-CCTCCAAGCC	1
-CCTCCACCAA	1
-CCTCCACCTA	4
-CCTCCACTAC	2
-CCTCCAGATA	1
-CCTCCAGATG	2
-CCTCCAGCAA	2
-CCTCCAGCAC	1
-CCTCCAGCAG	2
-CCTCCAGCAT	1
-CCTCCAGCCA	5
-CCTCCAGCTA	715
-CCTCCAGCTC	2
-CCTCCAGCTG	4
-CCTCCAGGTA	4
-CCTCCAGTAA	1
-CCTCCAGTAC	20
-CCTCCAGTTA	4
-CCTCCAGTTC	1
-CCTCCATCTA	2
-CCTCCATTTA	1
-CCTCCCAAGG	3
-CCTCCCAGCT	2
-CCTCCCAGTA	1
-CCTCCCCCGT	3
-CCTCCCCTCC	1
-CCTCCCCTGC	2
-CCTCCCGAGT	1
-CCTCCCGCTA	1
-CCTCCCTCTG	1
-CCTCCCTGAC	1
-CCTCCCTGAG	1
-CCTCCCTGAT	14
-CCTCCGAAGG	1
-CCTCCGCCTA	1
-CCTCCGCTGC	1
-CCTCCGGCTA	1
-CCTCCTATTA	4
-CCTCCTCCAA	1
-CCTCCTCCTC	1
-CCTCCTCGGG	1
-CCTCCTCTAC	1
-CCTCCTCTGA	1
-CCTCCTGCAC	1
-CCTCCTGCAT	2
-CCTCCTGCCC	1
-CCTCCTGCCT	1
-CCTCCTGGAT	1
-CCTCCTGTCC	1
-CCTCCTGTGT	1
-CCTCCTTAGC	1
-CCTCCTTCTG	1
-CCTCCTTGGC	1
-CCTCGCTCAG	7
-CCTCGCTGTC	1
-CCTCGGAAAA	7
-CCTCGGAGAT	1
-CCTCGGGGAA	5
-CCTCGTATGA	1
-CCTCTAATCC	3
-CCTCTAGCCC	1
-CCTCTAGTCC	4
-CCTCTAGTTA	1
-CCTCTCAGTT	1
-CCTCTCATCC	1
-CCTCTCCATT	1
-CCTCTCCCAG	1
-CCTCTCCTAG	1
-CCTCTCCTCC	6
-CCTCTCGGCC	2
-CCTCTGAATG	1
-CCTCTGCACT	2
-CCTCTGGAGG	7
-CCTCTGGATA	1
-CCTCTGGCAG	1
-CCTCTGGTCC	1
-CCTCTGTTAA	1
-CCTCTTAAGT	1
-CCTCTTCCAA	2
-CCTCTTGCCC	1
-CCTCTTGTAT	1
-CCTCTTTAAA	1
-CCTCTTTAAG	1
-CCTCTTTCCA	3
-CCTCTTTCTA	1
-CCTGAAAAGC	2
-CCTGAAAAGT	1
-CCTGAAACAG	1
-CCTGAAATCC	6
-CCTGAAATCT	1
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-CCTGAACTGC	1
-CCTGAACTGG	1
-CCTGAAGAAG	1
-CCTGAAGCAA	1
-CCTGAAGCGC	1
-CCTGAAGTCC	1
-CCTGAAGTCT	1
-CCTGAAGTGG	1
-CCTGAATCTG	1
-CCTGAATGCA	1
-CCTGACCAGG	2
-CCTGACCCTC	1
-CCTGACCTAT	1
-CCTGACTTCC	2
-CCTGAGAAGA	1
-CCTGAGCCCG	12
-CCTGAGGAAG	1
-CCTGAGGATT	1
-CCTGAGGGTG	1
-CCTGAGGTCC	1
-CCTGAGTCTC	2
-CCTGAGTGAC	1
-CCTGAGTGCG	1
-CCTGAGTGTT	1
-CCTGAGTTGA	1
-CCTGATAGAA	1
-CCTGATCTTG	1
-CCTGATGAAG	1
-CCTGATGTAC	1
-CCTGATGTGG	1
-CCTGATTCCC	1
-CCTGCAATCC	11
-CCTGCAATCT	1
-CCTGCAATTC	1
-CCTGCACACA	1
-CCTGCACACT	3
-CCTGCACCCA	1
-CCTGCACCTT	2
-CCTGCACTCC	2
-CCTGCAGTCC	1
-CCTGCAGTTC	1
-CCTGCCAAAG	3
-CCTGCCACCC	5
-CCTGCCCACC	1
-CCTGCCCAGA	1
-CCTGCCCCCC	20
-CCTGCCCCCT	1
-CCTGCCCCTT	3
-CCTGCCGTCG	1
-CCTGCGCACC	2
-CCTGCGGGGC	1
-CCTGCGGGTC	1
-CCTGCGTGCA	1
-CCTGCGTGTG	1
-CCTGCTGCAA	1
-CCTGCTGCAG	7
-CCTGCTGGGA	1
-CCTGCTGGTG	2
-CCTGCTTGTC	20
-CCTGGAACCC	2
-CCTGGAAGAA	1
-CCTGGAAGAG	30
-CCTGGAATCC	3
-CCTGGAATCG	1
-CCTGGAATGA	1
-CCTGGACTTG	1
-CCTGGAGTCC	1
-CCTGGAGTGG	1
-CCTGGATAAA	1
-CCTGGATCTG	1
-CCTGGCAATG	1
-CCTGGCAGGT	1
-CCTGGCAGTT	5
-CCTGGCATAA	1
-CCTGGCCAAG	2
-CCTGGCCAAT	1
-CCTGGCCACA	1
-CCTGGCCAGA	1
-CCTGGCCCCC	1
-CCTGGCCCTA	3
-CCTGGCCCTT	1
-CCTGGCCGTC	1
-CCTGGCCGTG	1
-CCTGGCCTAT	1
-CCTGGCCTCA	1
-CCTGGCCTCC	1
-CCTGGCCTCT	1
-CCTGGCCTGT	1
-CCTGGCCTTA	2
-CCTGGCTAAA	1
-CCTGGCTAAT	6
-CCTGGCTCAA	1
-CCTGGCTCGA	2
-CCTGGCTGAT	1
-CCTGGCTGTA	1
-CCTGGCTGTT	1
-CCTGGCTTAA	1
-CCTGGCTTGA	1
-CCTGGCTTTT	1
-CCTGGGAAGT	16
-CCTGGGACAC	1
-CCTGGGAGGC	1
-CCTGGGATTC	1
-CCTGGGCTGG	2
-CCTGGGGGTC	1
-CCTGGGTGGG	1
-CCTGGTAATC	1
-CCTGGTCAAG	2
-CCTGGTCCCA	1
-CCTGGTGCCC	1
-CCTGGTGGCG	1
-CCTGGTTGTA	1
-CCTGGTTTAC	1
-CCTGGTTTCT	1
-CCTGTAAAAA	1
-CCTGTAAACC	2
-CCTGTAAACT	1
-CCTGTAAAGC	4
-CCTGTAAATC	2
-CCTGTAAATT	1
-CCTGTAACAC	1
-CCTGTAACAG	1
-CCTGTAACCC	14
-CCTGTAACCT	1
-CCTGTAAGCC	4
-CCTGTAAGCT	2
-CCTGTAAGTG	1
-CCTGTAATAC	6
-CCTGTAATAG	1
-CCTGTAATCA	5
-CCTGTAATCC	448
-CCTGTAATCG	5
-CCTGTAATCT	31
-CCTGTAATGA	1
-CCTGTAATGC	7
-CCTGTAATTC	17
-CCTGTAATTT	2
-CCTGTACTCC	4
-CCTGTACTCT	1
-CCTGTACTTC	1
-CCTGTAGACC	3
-CCTGTAGCAC	1
-CCTGTAGCCA	1
-CCTGTAGCCC	4
-CCTGTAGCCG	1
-CCTGTAGCCT	1
-CCTGTAGCTC	2
-CCTGTAGGCC	1
-CCTGTAGTCA	1
-CCTGTAGTCC	82
-CCTGTAGTCG	1
-CCTGTAGTCT	8
-CCTGTAGTTA	1
-CCTGTAGTTC	4
-CCTGTATATC	1
-CCTGTATCAA	1
-CCTGTATCCC	8
-CCTGTATGTG	1
-CCTGTATTCC	10
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-CCTGTATTGC	1
-CCTGTATTGG	2
-CCTGTCATCC	3
-CCTGTCATTC	1
-CCTGTCCAGC	1
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-CCTGTGTCCC	1
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-CCTGTGTGCT	1
-CCTGTGTGGT	1
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-CCTGTTATCC	2
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-CCTGTTCTTC	1
-CCTGTTGATG	1
-CCTGTTGCTC	1
-CCTGTTGGTC	1
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-CCTTAAGATA	1
-CCTTAATTGG	1
-CCTTACCCAG	1
-CCTTACCTAC	1
-CCTTACTCTT	1
-CCTTACTTTA	1
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-CCTTAGGAGG	1
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-CCTTGATAAA	1
-CCTTGCACAG	1
-CCTTGCATTT	1
-CCTTGCTTTT	4
-CCTTGGAAGG	1
-CCTTGGATGT	1
-CCTTGGCCTG	1
-CCTTGGGTTC	1
-CCTTGGTGCC	6
-CCTTGGTTTC	1
-CCTTGGTTTT	2
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-CCTTGTCACA	1
-CCTTGTCAGT	1
-CCTTGTCCCT	1
-CCTTGTCTGA	1
-CCTTGTGGGC	1
-CCTTTAAGTA	1
-CCTTTAATCC	2
-CCTTTAGTCC	2
-CCTTTCATTG	1
-CCTTTCCACT	1
-CCTTTCCCAG	1
-CCTTTCCTTT	1
-CCTTTCTAGC	1
-CCTTTCTTTG	1
-CCTTTGAACA	5
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-CCTTTGCCCT	6
-CCTTTGGCTA	3
-CCTTTGGTGG	1
-CCTTTGTAAA	1
-CCTTTGTAAG	6
-CCTTTGTTTT	1
-CCTTTTCAGG	1
-CCTTTTCTTT	1
-CCTTTTGAAG	1
-CCTTTTGGTG	1
-CCTTTTTAGT	1
-CCTTTTTCAA	1
-CGAAAAAAAA	2
-CGAAAAGCTT	1
-CGAAACTGTG	1
-CGAAAGCTAT	1
-CGAACTGATG	1
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-CGAAGACTTC	1
-CGAAGCCATA	1
-CGAAGGGCCA	1
-CGAAGGGGCA	2
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-CGAATAAATT	1
-CGAATATACT	1
-CGAATCCAAA	1
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-CGACCCCACG	1
-CGACCGCGTC	1
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-CGAGGATGGG	1
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-CGAGGGGCCG	1
-CGAGGGGCGC	1
-CGAGGTTCCA	1
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-CGAGTTGCTT	1
-CGAGTTTTTT	1
-CGATACTAGT	1
-CGATATAATG	1
-CGATATTCCC	2
-CGATCTCACT	1
-CGATGACACT	2
-CGATGAGCAT	1
-CGATGCTGAC	1
-CGATGGGTGA	1
-CGATGGTCCC	2
-CGATGTGGGG	1
-CGATTACATT	1
-CGATTATTTA	1
-CGATTCAAAA	1
-CGATTCCATT	8
-CGATTCTGGA	2
-CGATTTCACT	1
-CGCAAACATA	1
-CGCAAATTCA	1
-CGCAACTGCG	3
-CGCAACTGGA	1
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-CGCAAGCCGG	1
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-CGCACAAGAA	1
-CGCACACACA	5
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-CGCACAGGTC	1
-CGCACCAGGT	1
-CGCACCATCA	1
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-CGCAGTGTCA	1
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-CGCATCGTCC	1
-CGCATCGTGG	1
-CGCATCTGGT	1
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-CGCCACACTT	1
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-CGCCACTGTG	1
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-CGCCGACTAT	1
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-CGCCGGAATA	1
-CGCCGGGAGC	4
-CGCCGGGGAG	1
-CGCCGGGGCC	1
-CGCCGGGGGC	1
-CGCCGTACGC	1
-CGCCGTATCA	1
-CGCCTAATTG	5
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-CGCCTATGAA	1
-CGCCTATTAA	1
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-CGCCTGGAGC	1
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-CGCCTGTAGT	10
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-CGCCTGTATT	1
-CGCCTGTCAT	3
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-CGCCTGTGGG	1
-CGCCTTTACT	1
-CGCCTTTAGT	1
-CGCGCACCCG	3
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-CGCGGCGAGC	1
-CGCGGGCCCG	1
-CGCGGGCGTG	1
-CGCGGTGCTT	1
-CGCGTCACTA	1
-CGCGTCGCCT	1
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-CGCGTGGAGT	1
-CGCGTGTTGT	1
-CGCGTTGCAC	1
-CGCGTTGCAG	1
-CGCTACTCAC	1
-CGCTACTTTG	1
-CGCTCGGAAA	1
-CGCTCTCTTT	1
-CGCTCTTAGT	1
-CGCTCTTGTA	1
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-CGCTGCACTC	1
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-CGCTGCGTCC	1
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-CGCTGCTTCG	1
-CGCTGGAGGC	1
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-CGGACCCAGC	1
-CGGACCGGCT	1
-CGGACCGTCC	1
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-CGGAGAATAA	1
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-CGGAGCCGGC	1
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-CGGATTTAGG	1
-CGGATTTTAT	1
-CGGATTTTTA	13
-CGGCACTGAG	1
-CGGCAGAGCT	7
-CGGCAGCTGC	1
-CGGCCCAACG	2
-CGGCCCACGT	1
-CGGCCCCGAG	1
-CGGCCTGACG	1
-CGGCCTGGCG	1
-CGGCGAAACA	1
-CGGCGCTCCC	3
-CGGCGGCGAA	1
-CGGCTGAATT	1
-CGGCTGGTGA	11
-CGGCTGTGGG	1
-CGGCTTAGTT	1
-CGGCTTTCTG	1
-CGGCTTTTCT	11
-CGGGAACTTC	2
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-CGGGAGCACC	4
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-CGGGCCGTGC	4
-CGGGCCTCAG	1
-CGGGCGCGGG	1
-CGGGCGGGGG	1
-CGGGCTCTCG	1
-CGGGGAGAGG	1
-CGGGGAGATG	1
-CGGGGCTGCA	1
-CGGGGCTGGT	1
-CGGGGGAAGA	1
-CGGGGGCTCC	1
-CGGGGGGCCA	1
-CGGGGTCACT	1
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-CGGGTCCCCA	1
-CGGGTGCTGC	2
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-CGGTCAAAAG	1
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-CGGTCCCTGA	1
-CGGTCCTCAA	1
-CGGTCTTATG	1
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-CGGTGGAGTA	1
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-CGGTGGGGAA	1
-CGGTGGGGAC	1
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-CGGTTACTGT	7
-CGGTTGGATC	1
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-CGGTTTCCAA	3
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-CGTAAATCGT	1
-CGTAAGAATG	1
-CGTACTGAAC	1
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-CGTAGGAATG	1
-CGTAGGCACT	1
-CGTAGGGGAA	1
-CGTAGGTTTA	1
-CGTATCTCTG	1
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-CGTCACTTTT	1
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-CGTCCACATT	1
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-CGTCTCCACA	2
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-CGTCTCTTCT	1
-CGTCTGTTAT	1
-CGTCTTCTCT	1
-CGTCTTGTCA	2
-CGTCTTTAGT	1
-CGTGACCACT	1
-CGTGAGCCAC	3
-CGTGAGCCGG	1
-CGTGAGGTCT	1
-CGTGCCGACG	1
-CGTGCCGCCT	1
-CGTGCGGCCG	1
-CGTGCGTGTT	1
-CGTGCTGAAA	1
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-CGTGGAAGCA	1
-CGTGGCCACG	1
-CGTGGCCTAA	1
-CGTGGCTTCT	1
-CGTGGGGTGG	1
-CGTGGGTGGG	1
-CGTGGTGGCA	1
-CGTGGTGGCT	1
-CGTGTAATCC	7
-CGTGTACCTC	1
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-CGTGTGCCTG	6
-CGTGTGGGCT	1
-CGTGTGGGGT	1
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-CGTGTTAATG	10
-CGTGTTAGGC	1
-CGTGTTATTG	1
-CGTTATGTGG	1
-CGTTCCCGCG	2
-CGTTCCTGCG	39
-CGTTCCTGGC	1
-CGTTCCTTCG	1
-CGTTCTCACA	1
-CGTTCTGCGG	1
-CGTTGGGCCA	1
-CGTTGGTTAG	1
-CGTTTAATCA	1
-CGTTTCCATT	1
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-CGTTTGCGCG	1
-CGTTTGTCAA	1
-CGTTTTCTGA	3
-CTAAAAAAAA	2
-CTAAAAATTC	1
-CTAAAACTGC	1
-CTAAAATGTA	1
-CTAAACCATC	1
-CTAAACTTTT	1
-CTAAAGACTT	3
-CTAAAGCCCT	1
-CTAAAGGAGG	1
-CTAAATACTG	1
-CTAAATATTC	1
-CTAAATTCTA	1
-CTAACAATCC	1
-CTAACACACA	1
-CTAACAGGAT	1
-CTAACATTTG	1
-CTAACCAGAC	8
-CTAACCAGCT	1
-CTAACCCTTC	1
-CTAACCGACC	1
-CTAACCGTGT	1
-CTAACCTGCC	1
-CTAACGCAGC	3
-CTAACTAGCT	1
-CTAACTAGTT	5
-CTAACTGGTG	1
-CTAACTTAAG	1
-CTAAGAAAAT	1
-CTAAGAACCG	1
-CTAAGAACTC	1
-CTAAGAACTT	1
-CTAAGACATC	1
-CTAAGACCTC	4
-CTAAGACCTG	1
-CTAAGACTAC	2
-CTAAGACTCA	3
-CTAAGACTCC	1
-CTAAGACTGT	1
-CTAAGACTTA	3
-CTAAGACTTC	559
-CTAAGACTTT	5
-CTAAGAGAAG	1
-CTAAGAGATG	1
-CTAAGAGTTC	1
-CTAAGATCTC	1
-CTAAGATTTC	2
-CTAAGCCTTC	2
-CTAAGCTTCA	8
-CTAAGGATAA	1
-CTAAGGATTC	1
-CTAAGGCGAG	1
-CTAAGGCTTC	6
-CTAAGGGTTC	1
-CTAAGGTGGG	1
-CTAAGTGAAA	3
-CTAAGTGACT	1
-CTAAGTGAGT	1
-CTAAGTTACA	1
-CTAAGTTATC	1
-CTAATAAAAG	1
-CTAATCGTCC	1
-CTAATGCTAG	3
-CTAATGTCTG	1
-CTAATTAGAT	1
-CTAATTATTT	1
-CTAATTCAGA	1
-CTAATTTGAC	1
-CTAATTTTAA	1
-CTACAAAAAG	1
-CTACAAGAAG	1
-CTACAAGGGC	1
-CTACAATGTA	1
-CTACAATTTT	1
-CTACACCAGT	1
-CTACACCCTA	1
-CTACACTTAA	1
-CTACAGAGAA	1
-CTACAGCCTG	1
-CTACAGGGAC	1
-CTACATAATG	1
-CTACCAACTT	1
-CTACCAATGG	1
-CTACCAATTC	1
-CTACCACCAA	1
-CTACCAGCAC	1
-CTACCATTAT	1
-CTACCCAAAG	2
-CTACCCCCCT	1
-CTACCTGACT	1
-CTACGACGTC	1
-CTACGCAGAA	1
-CTACGCGCTG	1
-CTACGCTCCA	1
-CTACGCTGCC	1
-CTACGGTGCT	1
-CTACGTGATG	1
-CTACGTGCTC	1
-CTACGTGTTC	1
-CTACTAAGGG	1
-CTACTACTAG	1
-CTACTCACAG	1
-CTACTCGGTC	2
-CTACTCTTCT	2
-CTACTCTTTG	1
-CTACTGAACT	1
-CTACTGATTT	1
-CTACTGCACT	10
-CTACTGCAGT	2
-CTACTGCATT	1
-CTACTGCCCT	1
-CTACTGCTAA	1
-CTACTGTACT	1
-CTACTTCACT	1
-CTACTTGAGG	1
-CTACTTGTGA	1
-CTACTTTGCA	1
-CTAGAACATC	1
-CTAGAAGTAC	5
-CTAGACAGAA	1
-CTAGACAGTA	2
-CTAGACATAC	1
-CTAGACTAAG	1
-CTAGACTTCA	3
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-CTAGAGTGAA	1
-CTAGATTCGG	2
-CTAGATTTTT	1
-CTAGCAGGGA	1
-CTAGCATCAC	1
-CTAGCCAGAC	1
-CTAGCCAGCA	3
-CTAGCCCACG	1
-CTAGCCCCAC	2
-CTAGCCCTTC	1
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-CTAGCCTCAC	172
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-CTAGGACTTC	2
-CTAGGATGAT	5
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-CTAGGCTTTC	1
-CTAGGGTTGG	1
-CTAGGTGGAG	1
-CTAGTCCCGA	1
-CTAGTTTGAA	1
-CTATAAATAC	1
-CTATACTGAA	2
-CTATACTGCA	1
-CTATAGCATA	12
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-CTATATAATG	1
-CTATATCTAT	1
-CTATATTTAT	1
-CTATATTTCC	1
-CTATCAGAAA	2
-CTATCAGTTT	2
-CTATCATTGC	1
-CTATCCTCAC	1
-CTATCGCTGC	1
-CTATGACTTC	3
-CTATGCTAAT	1
-CTATGGAAGC	1
-CTATGGCATA	1
-CTATGGCTTC	7
-CTATGGGAGG	1
-CTATGGGATT	3
-CTATGGGTGT	1
-CTATGGTTGC	1
-CTATGTGTGA	1
-CTATGTGTTA	1
-CTATTAGAGT	1
-CTATTCACTG	1
-CTATTCATCT	1
-CTATTCCTCA	1
-CTATTCTGTT	1
-CTATTGCACT	3
-CTATTGCCCT	1
-CTATTTAGTT	4
-CTATTTGGTC	1
-CTATTTTTGT	1
-CTCAAAAAAA	3
-CTCAAACCGA	1
-CTCAAATGAC	1
-CTCAACAAAT	1
-CTCAACAACC	1
-CTCAACACGC	1
-CTCAACAGCA	2
-CTCAACATCT	14
-CTCAACATTT	2
-CTCAACCCCC	3
-CTCAAGAAAT	1
-CTCAAGAGGG	1
-CTCAAGAGGT	1
-CTCAAGCGGC	1
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-CTCAATGAAA	1
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-CTCACAAGGT	1
-CTCACAAGTT	1
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-CTCCAACCTA	1
-CTCCAACTAA	1
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-CTCCAAGTCC	1
-CTCCAATAAA	3
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-CTCCATTTGC	1
-CTCCCAGGTC	1
-CTCCCATTCT	1
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-CTCCCCATCA	7
-CTCCCCCAAA	4
-CTCCCCCAAC	1
-CTCCCCCAAG	6
-CTCCCCCGAG	1
-CTCCCCTGCC	9
-CTCCCGAATC	1
-CTCCCGGAGC	2
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-CTCCCTTCAG	1
-CTCCCTTGCC	1
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-CTCCTGAATG	1
-CTCCTGAGCC	1
-CTCCTGCACT	2
-CTCCTGGCCC	3
-CTCCTGGGGC	3
-CTCCTGGGTG	1
-CTCCTGTAAT	1
-CTCCTGTGGT	1
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-CTCCTTAAGA	5
-CTCCTTATCT	1
-CTCCTTGATA	2
-CTCCTTGCTG	1
-CTCCTTGTTT	1
-CTCCTTTAGC	2
-CTCGAGGAGG	4
-CTCGCCAAGC	1
-CTCGCCCGGG	1
-CTCGCGCCGG	2
-CTCGCGCGGG	1
-CTCGCGCTGG	109
-CTCGCGCTGT	1
-CTCGCGCTTT	1
-CTCGCGTGAG	1
-CTCGCGTTGG	1
-CTCGCTCCAG	1
-CTCGCTTCAC	1
-CTCGGACTCT	1
-CTCGGAGAAA	1
-CTCGGAGGCC	1
-CTCGGCACTC	1
-CTCGGCGAGC	2
-CTCGGCTAAT	1
-CTCGGGCTGC	1
-CTCGGTACAT	1
-CTCGGTGATG	3
-CTCGTACACT	1
-CTCGTAGCGC	1
-CTCGTGAGGC	1
-CTCGTGTCTC	1
-CTCGTTAAGA	7
-CTCGTTAAGG	1
-CTCGTTAATA	1
-CTCGTTATTT	1
-CTCTAAAAAT	1
-CTCTAAAACC	1
-CTCTAACTGC	2
-CTCTAAGAGT	1
-CTCTAAGTTG	1
-CTCTACAGAA	1
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-GAGTAGAGAA	1
-GAGTAGAGGC	6
-GAGTAGATGA	1
-GAGTCACAGA	1
-GAGTCACTGC	1
-GAGTCAGCAT	1
-GAGTCAGGAC	1
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-GAGTGCAGGT	2
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-GAGTGGGTGG	1
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-GCAAAACTCA	1
-GCAAAACTCC	4
-GCAAAACTCT	4
-GCAAAACTTT	1
-GCAAAAGAAA	1
-GCAAAAGGTA	1
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-GCAAAATCCC	3
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-GCAATTGGCA	1
-GCAATTGTGA	1
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-GCACAAAATA	1
-GCACAACCCG	1
-GCACAAGAAC	1
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-GCACACCGCA	1
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-GCACATAGCA	1
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-GCACCAAGAA	1
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-GCACCACTGT	1
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-GCACCATCCC	1
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-GCACCGCCGG	8
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-GCACGCCCAA	1
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-GCACGCCCCG	1
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-GCACTACTCA	1
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-GCACTCCAGC	3
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-GCAGCCCCTC	1
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-GCAGCCCTTG	1
-GCAGCCGGAT	1
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-GCAGCCTGGA	1
-GCAGCGCTTG	1
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-GCAGCGGGCA	2
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-GCAGCGTGGC	1
-GCAGCGTTCA	1
-GCAGCTAATT	1
-GCAGCTATGT	1
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-GCAGCTCCTA	1
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-GCAGCTGATG	1
-GCAGCTGCAT	1
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-GCAGCTTAGC	1
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-GCAGCTTTTA	1
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-GCAGGACTGG	1
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-GCAGGAGCCC	1
-GCAGGAGCTC	1
-GCAGGAGGAA	2
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-GCAGGCATTT	1
-GCAGGCCCCT	1
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-GCAGGCCTGC	6
-GCAGGCCTTC	1
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-GCAGGGAGTA	1
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-GCAGGGGAGG	1
-GCAGGGGCCC	1
-GCAGGGGCTC	1
-GCAGGGGTTA	1
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-GCAGTATAGT	1
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-GCAGTGCACG	1
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-GCAGTGTGGG	1
-GCAGTGTGTG	1
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-GCAGTTACTC	1
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-GCATAAACAT	1
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-GCATAAGTAA	1
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-GCATATACAA	1
-GCATATATTT	1
-GCATATGCCT	1
-GCATATGCTT	1
-GCATCAAATC	1
-GCATCAAGTT	1
-GCATCAATTG	1
-GCATCACCAG	1
-GCATCAGCTG	1
-GCATCAGGTA	1
-GCATCAGGTC	2
-GCATCAGTGG	1
-GCATCATCCT	1
-GCATCCACCT	1
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-GCATCTTCAA	1
-GCATCTTCTG	1
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-GCATTAGAAT	1
-GCATTAGATG	1
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-GCATTATCTG	1
-GCATTATTCA	1
-GCATTCCATT	1
-GCATTCCTCC	1
-GCATTCCTCT	1
-GCATTCTACA	1
-GCATTGAGTG	2
-GCATTGCACT	1
-GCATTGGGTC	1
-GCATTGTGGT	1
-GCATTGTTGG	1
-GCATTTAAAT	1
-GCATTTACCA	2
-GCATTTATTG	1
-GCATTTCAGG	2
-GCATTTGACA	2
-GCATTTGGTA	1
-GCATTTTAAA	1
-GCATTTTCAC	1
-GCATTTTCAG	1
-GCCAAAAAAA	1
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-GCCAAACCCC	1
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-GCCAACCTGC	3
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-GCCAAGAAGT	1
-GCCAAGACAC	2
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-GCCAAGATGC	7
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-GCCAAGCCCC	1
-GCCAAGGAAA	1
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-GCCAAGGAGT	3
-GCCAAGGCAG	1
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-GCCAAGGGGC	13
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-GCCAAGTGAA	2
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-GCCAAGTGTG	1
-GCCAAGTTGG	1
-GCCAAGTTTG	4
-GCCAATAGTT	1
-GCCAATCTAG	1
-GCCAATGTGG	1
-GCCACAACAG	1
-GCCACAATAT	1
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-GCCAGACCCC	2
-GCCAGACTCA	1
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-GCCAGATCAG	1
-GCCAGATTGA	2
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-GCCAGCAAGC	1
-GCCAGCCAAG	1
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-GCCAGCCCTT	1
-GCCAGCCGCC	1
-GCCAGCGTCA	2
-GCCAGCTCTG	1
-GCCAGCTGAC	1
-GCCAGCTTCT	1
-GCCAGCTTGC	1
-GCCAGGAAGC	1
-GCCAGGAGCT	19
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-GCCAGGCCTG	1
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-GCCAGGCGTG	1
-GCCAGGCTGG	1
-GCCAGGGCCA	3
-GCCAGGGCGC	3
-GCCAGGGCGG	5
-GCCAGGGCTC	2
-GCCAGGGGGT	1
-GCCAGGTCAC	3
-GCCAGGTCTC	2
-GCCAGGTGGA	2
-GCCAGGTGGT	1
-GCCAGGTTAC	2
-GCCAGGTTGA	1
-GCCAGGTTGC	14
-GCCAGTCAAA	1
-GCCAGTCTGT	2
-GCCAGTGATT	1
-GCCATAGTCG	1
-GCCATATATA	1
-GCCATCAAGT	1
-GCCATCACCA	1
-GCCATCATAG	1
-GCCATCATCC	1
-GCCATCATCT	1
-GCCATCCCCT	27
-GCCATCCCTT	1
-GCCATCCTCC	9
-GCCATCGTCC	1
-GCCATCTCAT	1
-GCCATCTGCA	1
-GCCATCTTCC	1
-GCCATCTTGA	1
-GCCATCTTTG	1
-GCCATTATTA	1
-GCCATTATTT	1
-GCCATTCATT	1
-GCCATTGGCC	1
-GCCCAAAAGA	1
-GCCCAAAATA	1
-GCCCAAAGAC	1
-GCCCAAAGCC	1
-GCCCAAATGA	1
-GCCCAACCCC	1
-GCCCAAGATA	1
-GCCCAAGGTC	1
-GCCCAAGGTT	1
-GCCCAAGTAC	1
-GCCCAAGTCA	1
-GCCCACAAGT	7
-GCCCACACAG	15
-GCCCACACCC	1
-GCCCACAGTA	1
-GCCCACAGTC	1
-GCCCACATAC	1
-GCCCACATTA	1
-GCCCACCCGT	1
-GCCCACGACA	1
-GCCCACGTCA	7
-GCCCACTGCA	1
-GCCCACTTCA	1
-GCCCAGATCA	1
-GCCCAGCAAG	1
-GCCCAGCAGG	1
-GCCCAGCCCT	1
-GCCCAGCGGC	20
-GCCCAGCTCA	7
-GCCCAGCTCT	1
-GCCCAGCTGG	11
-GCCCAGGACA	1
-GCCCAGGAGA	1
-GCCCAGGCCA	1
-GCCCAGGCCC	1
-GCCCAGGCTC	1
-GCCCAGGGAA	1
-GCCCAGGGAC	3
-GCCCAGGGCC	4
-GCCCAGGTCA	519
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-GTTTAAATGG	1
-GTTTAATCTT	1
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-GTTTGTTTGG	1
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-GTTTTCCATA	3
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-GTTTTTGTTT	1
-GTTTTTTACT	1
-TAAAAAAAAA	8
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-TAACAGTTAC	1
-TAACATTCAA	1
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-TAACCAAATA	2
-TAACCAAATC	2
-TAACCAAATG	1
-TAACCAAGAG	1
-TAACCAATCA	4
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-TAACCTGCTA	1
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-TAATGGCGCC	1
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-TAATGGGAGT	1
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-TAATGTAATC	1
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-TAATTAACTC	1
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-TAATTCCAGC	1
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-TAATTTATTG	1
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-TACACACCTA	1
-TACACACGGA	1
-TACACAGAAC	1
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-TACACCCGCT	1
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-TACACTACAT	1
-TACACTACTG	2
-TACACTGCTT	1
-TACACTGTAT	1
-TACACTTGCC	2
-TACAGAATGT	3
-TACAGACACT	1
-TACAGACGGA	1
-TACAGAGACA	1
-TACAGAGAGT	1
-TACAGAGCTC	1
-TACAGAGGGA	4
-TACAGATAGT	1
-TACAGATTTT	1
-TACAGCAGTG	1
-TACAGCGAGC	2
-TACAGCTGCA	1
-TACAGGATCA	1
-TACAGGCCTA	1
-TACAGGGCCC	1
-TACAGGTTGC	1
-TACAGGTTTT	1
-TACAGTATGT	6
-TACAGTCATT	1
-TACAGTGGGT	1
-TACAGTGTTC	1
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-TACAGTTACA	1
-TACAGTTCAG	2
-TACAGTTCCC	1
-TACATAATTA	9
-TACATACACC	1
-TACATACCCT	1
-TACATAGATA	1
-TACATAGTCC	1
-TACATCCGAA	2
-TACATCTATA	1
-TACATTCTGT	16
-TACATTTTAT	2
-TACCAACTCG	1
-TACCAAGACC	7
-TACCAAGGAT	1
-TACCAAGTTT	1
-TACCAGAAGT	1
-TACCAGAGCA	1
-TACCAGAGCG	1
-TACCAGGTTG	2
-TACCAGTGTA	4
-TACCATCAAT	41
-TACCATCAGT	1
-TACCATTAAT	1
-TACCATTACA	1
-TACCATTGAA	1
-TACCCAAGAT	1
-TACCCACAGA	2
-TACCCACCCA	6
-TACCCACTGA	1
-TACCCAGGAG	2
-TACCCCACCC	6
-TACCCCAGAA	1
-TACCCCATAC	1
-TACCCCCGAG	1
-TACCCCCTGA	2
-TACCCCCTGC	1
-TACCCCGGAA	1
-TACCCCTGAA	1
-TACCCGGGAG	1
-TACCCTAAAA	36
-TACCCTACAT	1
-TACCCTAGAA	15
-TACCCTAGCA	1
-TACCCTGCTG	1
-TACCCTGGAA	1
-TACCCTGGCA	3
-TACCCTGGGA	1
-TACCCTTCCT	1
-TACCCTTGTA	1
-TACCCTTTAC	1
-TACCGCCCGT	3
-TACCGTACTT	1
-TACCGTATAT	1
-TACCGTCAAT	1
-TACCGTGGAT	1
-TACCTAATTG	1
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-TACCTATGAT	1
-TACCTATGTA	1
-TACCTATTAA	6
-TACCTATTAC	1
-TACCTCAACA	1
-TACCTCAGAA	1
-TACCTCTGAT	19
-TACCTGCAAT	1
-TACCTGCAGA	2
-TACCTGCCAC	1
-TACCTGTAAT	1
-TACCTGTAGC	1
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-TACCTGTCTG	1
-TACCTTCTCT	1
-TACCTTGACC	1
-TACCTTTGCT	3
-TACGAAGTTC	2
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-TACGTTTAAT	1
-TACGTTTCTC	1
-TACTAAAGTG	1
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-TACTAGTCCT	1
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-TACTCAGAGG	1
-TACTCAGTAG	1
-TACTCCACCC	1
-TACTCCAGAA	2
-TACTCCAGCC	1
-TACTCCTAAG	1
-TACTCCTACC	1
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-TACTCGGCCA	10
-TACTCGTTGA	1
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-TACTCTGCCC	1
-TACTCTGTTG	1
-TACTCTTCTG	1
-TACTCTTGGC	10
-TACTGAAAGG	1
-TACTGACACT	1
-TACTGAGTTT	1
-TACTGCTCGG	7
-TACTGCTTTT	1
-TACTGGAAGG	1
-TACTGGAAGT	2
-TACTGGTAGT	1
-TACTGGTTAC	1
-TACTGGTTGA	2
-TACTGTAAAG	1
-TACTGTACTT	6
-TACTGTAGAC	2
-TACTGTATGT	2
-TACTGTCTAT	2
-TACTGTGATC	1
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-TACTGTGGAT	4
-TACTTCACAG	1
-TACTTCCTCA	1
-TACTTCCTGC	1
-TACTTGAAGC	1
-TACTTGGGAG	5
-TACTTGTGTG	5
-TACTTGTTAC	1
-TACTTTATTT	1
-TACTTTCAGG	1
-TACTTTCCCA	1
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-TACTTTCGTA	1
-TACTTTGTGA	1
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-TAGAAAATGG	1
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-TAGAAGTACA	1
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-TAGAATGAAA	1
-TAGAATGCAA	1
-TAGAATGTCC	1
-TAGAATTTTC	1
-TAGACCAACA	1
-TAGACCAGTA	1
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-TAGACGTTCC	1
-TAGACTAACA	1
-TAGACTAGCA	31
-TAGACTTATT	1
-TAGACTTCCT	1
-TAGAGAATGA	1
-TAGAGAGAGA	1
-TAGAGCCTCA	1
-TAGAGGAGGC	1
-TAGAGGATGT	1
-TAGATAATGA	1
-TAGATGAGGA	1
-TAGCAACCAG	1
-TAGCAAGCCC	1
-TAGCAATCAG	1
-TAGCACCTGC	1
-TAGCACTCTC	1
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-TAGCAGCAAT	1
-TAGCAGCTGG	1
-TAGCAGGACA	1
-TAGCAGTTAC	4
-TAGCAGTTTT	1
-TAGCATAATA	1
-TAGCATTTTG	1
-TAGCCCAAAA	1
-TAGCCCAACA	1
-TAGCCCCAGC	6
-TAGCCCCAGG	1
-TAGCCCCCAG	1
-TAGCCCGGCC	2
-TAGCCCTCCT	1
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-TAGCCGGGAC	4
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-TAGCGCACGC	1
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-TAGCTAGTGA	1
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-TAGTCTAGCA	1
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-TAGTGGCTAT	1
-TAGTGGCTCT	1
-TAGTGTGGTA	3
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-TAGTTCTATA	1
-TAGTTCTATG	1
-TAGTTGAAGT	8
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-TAGTTGTACA	1
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-TAGTTTCTTG	2
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-TATAATTTTT	1
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-TATATCGCGA	1
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-TATATGTGTG	1
-TATATTGATT	2
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-TATATTTTCT	1
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-TATCACCACA	1
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-TATCAGTATT	1
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-TATCCGCTGA	1
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-TATCCTAATT	1
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-TATCCTCTCA	1
-TATCCTCTGG	3
-TATCCTGAAC	1
-TATCCTGAGT	1
-TATCCTGATG	2
-TATCCTGGAA	1
-TATCCTGGTA	1
-TATCGAGAGT	1
-TATCGGGAAT	1
-TATCGTTGCC	4
-TATCTACCTT	1
-TATCTCACTT	1
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-TCCTCAGTGC	1
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-TGCTAATTGT	1
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-TGCTTCTTGG	1
-TGCTTCTTTT	1
-TGCTTGAATC	1
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-TGCTTGATGG	1
-TGCTTGCAGT	1
-TGCTTGCATC	1
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-TGCTTGGGCA	1
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-TGCTTGTAGT	1
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-TGCTTTCACT	1
-TGCTTTCAGT	1
-TGCTTTCATT	1
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-TGCTTTTCTG	1
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-TGGCTAGATT	1
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-TGGCTCAGGA	1
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-TGGGTCAGCT	1
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-TGGGTCCATT	1
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-TGGTGATATT	1
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-TGGTTACTAG	1
-TGGTTAGATA	1
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-TGGTTGAACC	2
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-TGTAACACCC	1
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-TGTAACTACT	1
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-TGTAATTGGG	1
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-TGTACTTATT	2
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-TGTAGATCAA	1
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-TGTAGCCTAT	2
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-TGTAGTCACT	1
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-TGTATTTATA	2
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-TGTGAATAGA	1
-TGTGAATTTT	1
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-TGTGGAAGTT	4
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-TGTGGGAACC	1
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-TGTGGGGACA	1
-TGTGGGGGGC	1
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-TGTGGTATAA	1
-TGTGGTGGCA	1
-TGTGGTGGCG	1
-TGTGGTGGCT	1
-TGTGGTGGTG	1
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-TGTGGTGTGT	1
-TGTGGTTTAA	1
-TGTGGTTTCT	1
-TGTGTAAAAC	1
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-TGTGTCCTTT	1
-TGTGTCTTCC	2
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-TGTGTGGAGC	1
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-TGTGTGTGAC	1
-TGTGTGTGCT	1
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-TGTGTGTTTG	6
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-TGTGTTAGGT	1
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-TGTGTTGAAA	1
-TGTGTTGAGA	52
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-TGTGTTTGTC	1
-TGTGTTTGTT	1
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-TGTTAATGTT	3
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-TGTTATTAAA	1
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-TGTTCACACT	1
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-TGTTCATCAC	1
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-TGTTCGGTTG	1
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-TGTTGATGAG	1
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-TGTTGGGATT	1
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-TGTTTGAATT	1
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-TGTTTGCTCA	3
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-TGTTTGGCTC	1
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-TGTTTTTTTT	1
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-TTAAAAGTCA	1
-TTAAAATGTT	2
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-TTAAATGTGA	1
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-TTAACACACT	1
-TTAACACTAC	1
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-TTAACCCCCC	1
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-TTAACGATCT	1
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-TTAAGATTTC	2
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-TTAAGTCACA	1
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-TTAATACACA	1
-TTAATACTCT	1
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-TTAATTGGGA	1
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-TTAATTTCTC	1
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-TTACCAGGAG	1
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-TTACCCAGGA	1
-TTACCCCTCC	2
-TTACCCGCCC	1
-TTACCCTGCT	1
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-TTACCGTCCC	1
-TTACCTAAAA	1
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-TTACCTCTTC	1
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-TTACGAGGAT	1
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-TTACTCAAAT	1
-TTACTCAGGC	1
-TTACTCTGAA	1
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-TTACTGGCCC	8
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-TTACTTGTAC	1
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-TTACTTTTAG	1
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-TTAGCCTTAG	1
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-TTAGCTGAGT	3
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-TTAGCTGGGA	1
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-TTAGGGAGGA	3
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-TTAGGGGAGG	1
-TTAGGGTTAC	1
-TTAGTAGGGG	1
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-TTAGTCAGGC	4
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-TTAGTTAAGC	2
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-TTAGTTCCAG	1
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-TTAGTTTTAT	1
-TTATAAAAGA	1
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-TTATAACTGA	3
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-TTATCAAATC	1
-TTATCAGGAC	1
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-TTATCTGTGA	1
-TTATGAAGCC	1
-TTATGAGGCC	1
-TTATGAGTGT	1
-TTATGCATAA	1
-TTATGCCACT	1
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-TTATGGGGAG	1
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-TTATGGGTGA	1
-TTATGGTGTA	1
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-TTATGTATAA	1
-TTATGTGATT	1
-TTATTACTGA	1
-TTATTATAAG	1
-TTATTATCTG	1
-TTATTCCATT	1
-TTATTCCCTG	1
-TTATTCTTTT	1
-TTATTGAAGG	1
-TTATTGAGCA	1
-TTATTGCAAG	1
-TTATTGCTTG	1
-TTATTGGAGC	1
-TTATTGTATT	2
-TTATTTCGCC	1
-TTATTTGCCA	1
-TTATTTGGGT	1
-TTATTTTAGA	1
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-TTCAAACACC	1
-TTCAAACCCC	1
-TTCAAACTGT	1
-TTCAAAGGGA	1
-TTCAAAGTGC	1
-TTCAAATAGT	1
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-TTCAACAGGA	1
-TTCAACGAGG	1
-TTCAACGGCC	1
-TTCAAGACCT	1
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-TTCAAGTGAA	1
-TTCAAGTGGA	1
-TTCAAGTTCA	1
-TTCAATAAAA	8
-TTCAATAGAA	1
-TTCAATTAAA	1
-TTCAATTAAC	1
-TTCAATTCTG	2
-TTCAATTTCA	8
-TTCACAAAGA	1
-TTCACAAAGG	4
-TTCACACACC	2
-TTCACACTCG	1
-TTCACAGACA	1
-TTCACAGAGC	1
-TTCACAGATT	2
-TTCACAGCTA	1
-TTCACAGTAG	1
-TTCACAGTGG	5
-TTCACCAACT	1
-TTCACCAGCA	1
-TTCACCAGGG	1
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-TTCACCTTTA	1
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-TTCACTGCCG	1
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-TTCAGAGAAC	1
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-TTCAGCCTGG	1
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-TTCAGGCCAC	1
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-TTCAGGCCCT	2
-TTCAGGCTTT	1
-TTCAGGGCTT	3
-TTCAGGTTGC	1
-TTCAGTATAT	1
-TTCAGTGCCT	2
-TTCATACACA	2
-TTCATACACC	400
-TTCATACACG	2
-TTCATACATC	2
-TTCATACCCC	1
-TTCATACCCT	2
-TTCATACGAC	1
-TTCATACGCC	3
-TTCATACTCC	3
-TTCATAGTCT	2
-TTCATCACCT	2
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-TTCATCTCTT	1
-TTCATCTGAC	1
-TTCATTAATT	1
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-TTCATTCTAA	1
-TTCATTGAGA	1
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-TTCATTGTAG	1
-TTCATTGTGA	1
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-TTCCAAGAAC	1
-TTCCAAGACA	1
-TTCCAAGCTG	1
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-TTCCACTATC	1
-TTCCACTATG	1
-TTCCACTCCT	1
-TTCCACTCGC	1
-TTCCAGACCT	7
-TTCCAGATGG	1
-TTCCATAACC	1
-TTCCATACAT	1
-TTCCATATGC	1
-TTCCATCTGT	1
-TTCCATTGGA	2
-TTCCCAACAT	1
-TTCCCAACTA	1
-TTCCCAGATG	1
-TTCCCCACAG	1
-TTCCCCACCA	1
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-TTCCCCAGAA	1
-TTCCCCGTGT	1
-TTCCCCTCCT	1
-TTCCCGCACA	1
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-TTCCCGTCCC	2
-TTCCCGTGGG	1
-TTCCCTATAT	1
-TTCCCTCATC	1
-TTCCCTCCAA	4
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-TTCCCTGCAA	2
-TTCCCTGGAA	1
-TTCCGAGCCC	1
-TTCCGCGATC	1
-TTCCGCGTGC	4
-TTCCGCGTTC	5
-TTCCGGAGCG	1
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-TTCCTATTAG	1
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-AAGACTGGCC	1
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-AAGGTAGGGC	9
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-AAGGTCGCAA	1
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-AAGTCATAGG	2
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-AATCCCTTAG	1
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-AATCCGATCT	1
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-AATCCGGGGG	1
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-AATTTTTGGG	1
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-ACACCATCAC	1
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-ACATTGAGTG	1
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-ACCAATTGGA	1
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-ACCACACCTA	1
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-ACCACCCATT	1
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-ACCACCCGTG	1
-ACCACGAAGG	1
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-ACCACGCCGT	2
-ACCACTGGGC	1
-ACCACTTATC	1
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-ACCAGACACA	1
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-ACCAGAGACA	1
-ACCAGATAGG	1
-ACCAGCAACA	1
-ACCAGCAAGA	1
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-ACCAGCATAT	1
-ACCAGCCAAA	1
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-ACCAGCCAGA	1
-ACCAGCCCGG	2
-ACCAGCCTGA	2
-ACCAGCGAGA	1
-ACCAGCTCCC	2
-ACCAGCTCTC	2
-ACCAGCTGTC	2
-ACCAGCTGTG	1
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-ACCAGGCCAA	1
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-ACCAGGCCAT	1
-ACCAGGCTAC	1
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-ACCAGTGGCT	1
-ACCAGTGTTT	1
-ACCAGTTGGA	1
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-ACCATTGGCC	1
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-ACCCAATTTG	1
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-ACCCACCCCA	1
-ACCCACGGAC	1
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-ACCCACTCTA	1
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-ACCCAGGACA	1
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-ACCCAGTTGT	2
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-ACCCATTTAA	1
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-ACCCCAAACT	3
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-ACCCCCAAGG	1
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-ACCCCCGGCC	1
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-ACCCCGCAGA	1
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-ACCCCTAAGG	2
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-ACCCGAGCCC	1
-ACCCGATCAG	1
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-ACCCGCCCCG	1
-ACCCGCCGGC	1
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-ACCCGGCTCT	1
-ACCCGGGCAA	1
-ACCCGGGGGC	1
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-ACCCTAGGCC	1
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-ACCCTCGCCC	1
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-ACCCTCTGTG	1
-ACCCTCTTGT	1
-ACCCTGAATG	2
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-ACCCTGCCAA	1
-ACCCTGCCTC	1
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-ACCCTGGAGT	1
-ACCCTGGCCA	1
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-ACCCTTGCCA	1
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-ACCCTTGGGT	1
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-ACCCTTTAAC	1
-ACCCTTTCAC	1
-ACCCTTTGGC	1
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-ACCGAGCTGG	1
-ACCGAGGTGC	1
-ACCGAGTACG	1
-ACCGCACCAC	1
-ACCGCAGTGC	1
-ACCGCAGTGT	1
-ACCGCCGCGG	1
-ACCGCCGTGG	55
-ACCGCCTCTT	1
-ACCGCCTGTG	19
-ACCGCGTTGT	1
-ACCGCTTGTT	3
-ACCGGATCAT	1
-ACCGGCGTGG	1
-ACCGGGACGG	1
-ACCGGGAGGT	1
-ACCGGGGACT	2
-ACCGGTCCGG	1
-ACCGTATTCC	1
-ACCGTCATTA	1
-ACCGTCCACT	3
-ACCGTCTGCT	1
-ACCGTCTTGT	1
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-ACCTCACTTA	1
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-ACCTCAGTCA	1
-ACCTCCAGAA	1
-ACCTCCAGGG	3
-ACCTCCATAG	1
-ACCTCCCACC	1
-ACCTCCCGGT	1
-ACCTCGTGAT	1
-ACCTCTCTAA	2
-ACCTCTGGCT	1
-ACCTCTGTCT	1
-ACCTGAGGAG	1
-ACCTGCATCC	12
-ACCTGCCAAG	1
-ACCTGCCACC	2
-ACCTGCCATA	1
-ACCTGCCATC	1
-ACCTGCCGAC	4
-ACCTGCTCCG	1
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-ACCTGCTTAA	1
-ACCTGGACTG	1
-ACCTGGGCCG	1
-ACCTGGGGAG	11
-ACCTGGGTGC	1
-ACCTGGTAGA	1
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-ACCTGTGTGA	1
-ACCTGTTCCC	1
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-ACCTTATCAA	1
-ACCTTCAAAG	1
-ACCTTCATCT	2
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-ACCTTCCTTC	6
-ACCTTCTCTG	2
-ACCTTCTTCT	1
-ACCTTGACAC	1
-ACCTTGAGCC	1
-ACCTTGATTG	1
-ACCTTGCTCG	1
-ACCTTGCTTC	1
-ACCTTGGACA	1
-ACCTTGGCAC	1
-ACCTTGGCAT	1
-ACCTTGGCCA	1
-ACCTTGGCTT	2
-ACCTTGGGGT	1
-ACCTTGTAAT	2
-ACCTTGTCAG	1
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-ACCTTTACTG	6
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-ACCTTTGGCC	3
-ACCTTTGGGC	1
-ACCTTTGTCA	1
-ACCTTTTCAA	4
-ACCTTTTCCA	1
-ACCTTTTTCA	1
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-ACGAAATCCT	1
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-ACGACTTTCC	1
-ACGAGACCCC	1
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-ACGATGCTGC	1
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-ACGCAGGAGA	1
-ACGCAGGCGC	1
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-ACGCCACTGC	1
-ACGCCAGGAG	1
-ACGCCCGACA	1
-ACGCCCGAGG	1
-ACGCCCTGCT	1
-ACGCCTTGAT	1
-ACGCTGAATA	1
-ACGCTGAGGC	1
-ACGCTGCGGC	1
-ACGCTGCTGC	11
-ACGCTGGAAG	1
-ACGCTGTCTG	1
-ACGGAACGCC	1
-ACGGAAGTTT	3
-ACGGCAGGAG	1
-ACGGCAGGGT	1
-ACGGCCCATA	1
-ACGGCCTCGG	1
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-ACGGCTCCGA	3
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-ACGGGGCAAA	1
-ACGGGGGTAA	1
-ACGGGGTGCA	1
-ACGGGTATGA	1
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-ACGGTGATGT	5
-ACGGTGCCAT	1
-ACGGTTATGT	1
-ACGTAAACGG	1
-ACGTAACAGA	2
-ACGTACTCTT	1
-ACGTCACCAT	1
-ACGTCAGTGA	1
-ACGTCATCGA	1
-ACGTCGTCGA	1
-ACGTCGTGTG	4
-ACGTCTCTAT	1
-ACGTGAGTGC	1
-ACGTGCAAAC	1
-ACGTGGTGAT	2
-ACGTTGGGTG	1
-ACGTTGTGCC	1
-ACTAAAACAC	1
-ACTAAACACC	1
-ACTAAACCCT	1
-ACTAACAAAG	1
-ACTAACAACC	1
-ACTAACAATC	1
-ACTAACACCA	1
-ACTAACACCC	325
-ACTAACACCG	1
-ACTAACACCT	4
-ACTAACACGC	1
-ACTAACCACA	1
-ACTAACCCCT	1
-ACTAACGCCC	1
-ACTAACTCTC	1
-ACTAACTGTG	1
-ACTAAGACCT	1
-ACTAAGTCTG	1
-ACTAATTTTG	1
-ACTACAAATA	4
-ACTACACCCT	1
-ACTACACCTA	1
-ACTACACCTT	1
-ACTACAGCAC	2
-ACTACAGCCA	1
-ACTACAGTGC	1
-ACTACATTTT	1
-ACTACCCCCC	1
-ACTACCTCCC	3
-ACTACCTCTG	2
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-ACTACGGGTC	2
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-ACTATCACCC	1
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-ACTATTCCAT	1
-ACTATTGGCT	1
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-ACTCACCCAG	1
-ACTCACTAGG	1
-ACTCACTGCA	2
-ACTCAGAAAA	1
-ACTCAGAAGA	4
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-ACTCAGATGC	1
-ACTCAGCCCC	2
-ACTCAGGCGG	1
-ACTCAGGTGC	1
-ACTCAGGTTG	1
-ACTCATCTGA	1
-ACTCATTCAT	1
-ACTCATTCTA	1
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-ACTGCTGTCT	1
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-ACTGTGCCTG	1
-ACTGTGGCCG	1
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-ACTGTGTTTT	1
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-ACTGTTGCTA	7
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-ACTGTTTGTT	1
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-ACTTCTGGAA	2
-ACTTCTTCAA	2
-ACTTGAGAAG	4
-ACTTGATGCG	1
-ACTTGATTTG	2
-ACTTGCACAA	1
-ACTTGCAGCC	1
-ACTTGCGTTG	1
-ACTTGGAGCC	9
-ACTTGGTGTC	1
-ACTTGGTTTG	1
-ACTTGTGTTC	1
-ACTTGTTCGC	1
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-ACTTTATATA	1
-ACTTTATCAA	1
-ACTTTATGTG	1
-ACTTTCCAAA	25
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-ACTTTGTATT	1
-ACTTTGTCAA	1
-ACTTTGTCAG	1
-ACTTTGTGGG	2
-ACTTTGTGTT	1
-ACTTTGTTGC	1
-ACTTTGTTTA	1
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-ACTTTTCCAA	3
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-ACTTTTGCCC	1
-ACTTTTTAAA	1
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-ACTTTTTGGC	1
-ACTTTTTTAA	1
-ACTTTTTTCA	3
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-AGAACCAGGA	1
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-AGAACCTGTC	1
-AGAACCTTAA	5
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-AGAACTGGAA	1
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-AGAAGATCTG	1
-AGAAGCAAAA	1
-AGAAGCAAGA	2
-AGAAGCAATT	1
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-AGAAGGGCGT	1
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-AGAGCAGGGA	1
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-AGAGGAGGAG	1
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-AGCAGGCTCA	1
-AGCAGGCTCC	1
-AGCAGGGCCC	1
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-AGCATCCATA	1
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-AGCCAAAAAA	6
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-AGCCCTTTTT	1
-AGCCGAAAGG	1
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-AGCCGGGATT	1
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-AGCCTAACGA	1
-AGCCTACAAA	5
-AGCCTAGGGT	1
-AGCCTATGGG	1
-AGCCTCAGGG	1
-AGCCTCCACG	1
-AGCCTCGGGC	2
-AGCCTCTCAC	1
-AGCCTCTCCT	1
-AGCCTCTTCA	1
-AGCCTGACTG	3
-AGCCTGAGAT	1
-AGCCTGATTT	1
-AGCCTGCAGA	6
-AGCCTGCCAC	1
-AGCCTGCCAG	1
-AGCCTGCCTG	2
-AGCCTGCTCA	1
-AGCCTGCTCT	1
-AGCCTGCTGG	1
-AGCCTGGAAG	1
-AGCCTGGACT	7
-AGCCTGGAGA	2
-AGCCTGGGAG	3
-AGCCTGGGCC	3
-AGCCTGTAGT	1
-AGCCTGTTTA	1
-AGCCTTGCTG	1
-AGCCTTTAGT	1
-AGCCTTTCCG	1
-AGCGAAGCCC	1
-AGCGACAAAC	1
-AGCGACCGTA	1
-AGCGACTTCT	1
-AGCGAGAGAG	2
-AGCGATGATG	1
-AGCGATTCTT	1
-AGCGCCGATG	1
-AGCGCCTTCC	1
-AGCGCGAGGC	1
-AGCGCTGGGG	1
-AGCGGCCAGG	1
-AGCGGCCCTA	1
-AGCGGCCTGC	1
-AGCGGCTACA	2
-AGCGTAATAG	1
-AGCGTCACGT	1
-AGCGTCGATG	2
-AGCGTCTGTG	1
-AGCGTGGCTC	1
-AGCTAAACTT	1
-AGCTAACTTT	1
-AGCTAAGTTT	1
-AGCTACCACG	3
-AGCTACGGAA	1
-AGCTACTTCC	1
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-AGCTCACACC	2
-AGCTCACTCC	1
-AGCTCACTGA	1
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-AGCTCATAAA	1
-AGCTCCCCAA	1
-AGCTCCGTCC	5
-AGCTCCTGGA	1
-AGCTCCTTGA	1
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-AGCTCTATGA	1
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-AGCTCTCGGA	1
-AGCTCTCGTG	1
-AGCTCTGAAG	1
-AGCTCTGCTG	2
-AGCTCTGGAA	1
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-AGCTCTTGGT	1
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-AGCTGATCAG	3
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-AGCTGCTGTG	1
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-AGCTGGAGCC	1
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-AGCTGGATGA	1
-AGCTGGCACC	1
-AGCTGGGATG	3
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-AGCTGGGGGC	2
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-AGCTGTTCTG	1
-AGCTGTTGCC	1
-AGCTGTTTCT	5
-AGCTTATTGA	1
-AGCTTCCAGC	3
-AGCTTCTATA	1
-AGCTTCTTGA	1
-AGCTTGCAGG	1
-AGCTTGCCAA	1
-AGCTTGCGCT	2
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-AGCTTGGAAG	1
-AGCTTTAGGA	1
-AGCTTTAGTG	1
-AGCTTTATGA	1
-AGCTTTTTCC	1
-AGGAAAAGAT	5
-AGGAAACCTC	1
-AGGAAACTGC	2
-AGGAAAGCTG	41
-AGGAAATGAA	2
-AGGAACAAAT	1
-AGGAACAGAA	1
-AGGAAGAGCC	3
-AGGAAGGAAC	4
-AGGAATCACA	1
-AGGAATGCTT	3
-AGGAATGGCC	1
-AGGAATTGAA	1
-AGGACAAACC	1
-AGGACACCAA	1
-AGGACACCGC	4
-AGGACACCGG	1
-AGGACAGAAG	3
-AGGACATAAC	1
-AGGACCAGCA	1
-AGGACCCCAC	1
-AGGACGGGCT	1
-AGGACGTCAT	1
-AGGACTACTA	1
-AGGACTATAG	1
-AGGACTCTCT	1
-AGGACTCTGG	1
-AGGACTTCTG	1
-AGGACTTTGC	6
-AGGACTTTGG	1
-AGGAGAAGGT	1
-AGGAGAGAGG	1
-AGGAGAGCTG	1
-AGGAGAGGGC	1
-AGGAGCAAAG	1
-AGGAGCAACT	1
-AGGAGCAGAC	1
-AGGAGCCGGG	1
-AGGAGCGGGG	16
-AGGAGCGTGG	1
-AGGAGCTCGG	1
-AGGAGCTGAG	1
-AGGAGCTGCT	11
-AGGAGGGAGG	2
-AGGAGGGTGG	2
-AGGAGGTCCC	1
-AGGAGGTTAA	1
-AGGAGTTTCC	1
-AGGAGTTTGA	1
-AGGATAACAG	1
-AGGATAGCTT	1
-AGGATGAAAG	1
-AGGATGACAT	1
-AGGATGACCA	5
-AGGATGAGGC	1
-AGGATGCCCG	1
-AGGATGCCTG	1
-AGGATGGCGG	1
-AGGATGGTCC	19
-AGGATGTGGC	1
-AGGATGTGGG	14
-AGGATTGGTA	1
-AGGCAAACCA	1
-AGGCAAGGGA	3
-AGGCACACAA	1
-AGGCACGCAC	3
-AGGCACTAAT	1
-AGGCACTGGC	2
-AGGCAGAGGT	1
-AGGCAGCTCT	1
-AGGCAGGAGG	1
-AGGCAGGGGC	2
-AGGCAGTAGT	1
-AGGCATAGCG	1
-AGGCATATGG	1
-AGGCATTGAA	1
-AGGCCAAAAC	1
-AGGCCAAGGG	6
-AGGCCAAGGT	1
-AGGCCACACT	1
-AGGCCACCCT	2
-AGGCCAGGAG	1
-AGGCCAGGCC	1
-AGGCCAGTAT	2
-AGGCCATAGG	3
-AGGCCATCCC	1
-AGGCCCACAA	1
-AGGCCCAGCT	1
-AGGCCCATAC	1
-AGGCCCCAGA	1
-AGGCCCCAGG	1
-AGGCCCCGGA	1
-AGGCCCCTTA	2
-AGGCCCTGCT	2
-AGGCCGGGAG	2
-AGGCCGTCCC	2
-AGGCCTGGGC	2
-AGGCCTGGGG	2
-AGGCCTTGGT	8
-AGGCCTTGTC	1
-AGGCCTTTGG	1
-AGGCGAGATC	5
-AGGCGAGCTG	1
-AGGCGCTTAG	2
-AGGCGGAGGT	3
-AGGCGTGCTG	1
-AGGCTAAAAG	1
-AGGCTAAGCC	1
-AGGCTACGAA	1
-AGGCTACGGA	46
-AGGCTATGTA	1
-AGGCTCAACT	1
-AGGCTCAGAT	1
-AGGCTCCTGG	1
-AGGCTCGACA	1
-AGGCTGAAGG	1
-AGGCTGAGCA	1
-AGGCTGAGGC	5
-AGGCTGAGGT	1
-AGGCTGCCCA	1
-AGGCTGCGAC	3
-AGGCTGGATG	2
-AGGCTGGGGG	1
-AGGCTGTCCA	5
-AGGCTGTCCC	1
-AGGCTGTGTT	2
-AGGCTGTTGG	3
-AGGCTTAAAG	1
-AGGCTTACGG	1
-AGGCTTTATG	1
-AGGCTTTCCC	1
-AGGGAAAATG	1
-AGGGAAAGAG	3
-AGGGAAAGGG	1
-AGGGAAGAAA	1
-AGGGAAGGAA	1
-AGGGAATGAA	1
-AGGGAATGTG	1
-AGGGAGAAAG	1
-AGGGAGAGGC	1
-AGGGAGAGGG	2
-AGGGAGGCAG	2
-AGGGAGGTGG	1
-AGGGAGTTGA	1
-AGGGATGGAC	1
-AGGGATGGAG	1
-AGGGATTCCC	1
-AGGGCAAACC	1
-AGGGCAACTA	2
-AGGGCACAGG	1
-AGGGCACTAA	3
-AGGGCAGAAG	1
-AGGGCAGAGC	1
-AGGGCAGAGG	1
-AGGGCAGCCC	2
-AGGGCAGGCG	1
-AGGGCAGGGA	1
-AGGGCAGGGT	1
-AGGGCCAGCA	1
-AGGGCCAGGA	1
-AGGGCCCGGG	1
-AGGGCCCTCT	1
-AGGGCCGACT	1
-AGGGCGATCT	1
-AGGGCTAAAA	1
-AGGGCTACTT	1
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-AGGGCTCCTC	1
-AGGGCTGAGG	1
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-AGGGCTGTGA	1
-AGGGCTTCCA	41
-AGGGCTTGAC	1
-AGGGCTTGAG	1
-AGGGCTTGGA	1
-AGGGGAGAGG	3
-AGGGGATTCC	2
-AGGGGCACCT	1
-AGGGGCGCAG	5
-AGGGGCTGCC	3
-AGGGGGCCAC	1
-AGGGGGCTGA	3
-AGGGGGGAGG	2
-AGGGGGGGAG	1
-AGGGGTCCAA	1
-AGGGGTGCCA	1
-AGGGGTTCTT	1
-AGGGGTTTTC	1
-AGGGTCAGGA	1
-AGGGTCCCCG	1
-AGGGTCTGCC	1
-AGGGTCTGGG	1
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-AGGGTTAAAG	1
-AGGGTTCCAA	2
-AGGGTTCTCT	1
-AGGGTTGCGT	1
-AGGGTTGCTT	1
-AGGGTTTTTC	2
-AGGTAATAAA	1
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-AGGTCATCTG	1
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-AGGTCCTAGC	12
-AGGTCGGGAG	2
-AGGTCGTCGA	5
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-AGGTCTTCAA	3
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-AGGTTTTCAT	3
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-AGTAAACCAT	1
-AGTAACTGCT	1
-AGTAAGGGAA	1
-AGTAAGTGTG	1
-AGTAATTTCA	1
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-AGTACCACCC	1
-AGTACGAATG	5
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-AGTAGCCGTG	2
-AGTAGCGAAC	2
-AGTAGCTTGA	2
-AGTAGGTGGC	14
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-AGTATCTGGG	2
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-AGTGAGTGTC	1
-AGTGAGTGTG	1
-AGTGATAAAA	1
-AGTGATGGCG	1
-AGTGATGTCA	2
-AGTGATTTGC	2
-AGTGCAAAAT	1
-AGTGCAAGAC	40
-AGTGCACGTG	2
-AGTGCAGTTT	1
-AGTGCCAACC	1
-AGTGCCGTGT	6
-AGTGCCTGGC	1
-AGTGCTAGCG	1
-AGTGCTCACT	3
-AGTGCTGAGG	1
-AGTGCTTTTA	1
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-AGTGGATAAA	1
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-AGTGGCCTTC	1
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-AGTGGGGTGT	1
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-ATAAGCCTAG	1
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-ATGACTCTAA	1
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-ATGAGCTCTC	1
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-ATGCAGATTT	1
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-ATGCATCCTT	1
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-ATGCCCAAGG	1
-ATGCCCAATG	1
-ATGCCCCGGG	1
-ATGCCCGTGA	2
-ATGCCCTATC	1
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-ATGCCGCCAG	1
-ATGCCGCCGC	1
-ATGCCTACAG	1
-ATGCCTACTC	1
-ATGCCTGAAA	1
-ATGCCTTGGG	2
-ATGCCTTTGA	1
-ATGCCTTTTT	1
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-ATGCGAATCA	1
-ATGCGCACCC	1
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-ATGCGGACTC	1
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-ATGCGGCAGA	1
-ATGCGGCCAC	1
-ATGCGGGAAA	1
-ATGCGGGAGA	39
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-ATGCTAGAAA	1
-ATGCTAGGTT	1
-ATGCTATGGA	1
-ATGCTCAGCC	3
-ATGCTCATAC	1
-ATGCTCCCTG	13
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-ATGCTGAGAG	1
-ATGCTGATCC	1
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-ATGCTGCCAA	3
-ATGCTGCCCG	2
-ATGCTGCTTT	1
-ATGCTGTACA	5
-ATGCTGTTTT	3
-ATGCTTATTG	2
-ATGCTTCTGG	1
-ATGCTTTATA	1
-ATGCTTTCAC	1
-ATGCTTTTCA	1
-ATGGAAAATC	1
-ATGGAAAGGA	1
-ATGGAACCCC	1
-ATGGAACTGA	4
-ATGGAACTGT	1
-ATGGAAGCTG	1
-ATGGAAGGGC	1
-ATGGAAGGTG	2
-ATGGAATATG	1
-ATGGAATGCT	5
-ATGGACTGTA	1
-ATGGAGACTT	1
-ATGGAGAGCA	1
-ATGGAGATCC	1
-ATGGAGATTT	1
-ATGGAGCAAG	1
-ATGGAGCCCA	2
-ATGGAGCGAC	1
-ATGGAGCGCA	2
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-ATGGAGTACA	1
-ATGGATACGG	1
-ATGGATATGA	1
-ATGGATCAGT	1
-ATGGATGCAC	1
-ATGGATGGTA	1
-ATGGCAACAG	1
-ATGGCAAGCC	1
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-ATGGCAAGGT	1
-ATGGCACACA	1
-ATGGCACATC	2
-ATGGCACCAC	1
-ATGGCACGCA	2
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-ATGGCACGTG	2
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-ATGGCAGCCT	1
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-ATGGCAGGCA	2
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-ATGGCAGGTG	1
-ATGGCAGTGC	1
-ATGGCATCAC	1
-ATGGCCAACT	2
-ATGGCCAGAA	1
-ATGGCCAGGC	2
-ATGGCCAGGT	1
-ATGGCCATAG	2
-ATGGCCCAGT	2
-ATGGCCCATA	15
-ATGGCCCGGG	1
-ATGGCCGACT	1
-ATGGCCTCCT	4
-ATGGCCTGCG	1
-ATGGCCTGTA	1
-ATGGCGACTG	6
-ATGGCGAGGG	2
-ATGGCGAGTG	1
-ATGGCGATCT	7
-ATGGCGATGT	1
-ATGGCGCACG	2
-ATGGCGCAGT	2
-ATGGCGCCAC	1
-ATGGCGCGCA	1
-ATGGCGCTGC	1
-ATGGCGGACG	1
-ATGGCGGATG	1
-ATGGCGGCGA	1
-ATGGCGGGAC	1
-ATGGCGGGCC	1
-ATGGCGGGCG	1
-ATGGCGGGTG	6
-ATGGCGTCAC	1
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-ATGGCTCATT	1
-ATGGCTCCGT	1
-ATGGCTCTTG	1
-ATGGCTGCTG	3
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-ATGGCTTAAC	1
-ATGGCTTGTA	1
-ATGGCTTTCT	1
-ATGGCTTTGT	1
-ATGGGAACCA	1
-ATGGGCAGCC	3
-ATGGGCGCAT	1
-ATGGGCTTGA	18
-ATGGGGAAAG	1
-ATGGGGCAAA	1
-ATGGGGGTGA	3
-ATGGGTGGAT	1
-ATGGGTGGGT	1
-ATGGGTTTGC	2
-ATGGTAAGGG	1
-ATGGTAGAGG	1
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-ATGGTCAGTA	2
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-ATGGTCGGAG	1
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-ATGGTCTCGT	1
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-ATGGTGACGG	1
-ATGGTGACTC	1
-ATGGTGCACG	1
-ATGGTGCCAC	4
-ATGGTGCCTT	1
-ATGGTGCGCG	1
-ATGGTGGAGC	1
-ATGGTGGGAC	1
-ATGGTGGGCA	2
-ATGGTGGGGG	30
-ATGGTGGGTG	3
-ATGGTGGTAT	1
-ATGGTGGTGC	1
-ATGGTGGTGG	10
-ATGGTGGTTG	1
-ATGGTGTAAT	1
-ATGGTGTATT	1
-ATGGTGTGGT	1
-ATGGTGTGTG	4
-ATGGTTAAAG	1
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-ATGTACATTT	1
-ATGTACCTGA	4
-ATGTACTCTG	1
-ATGTAGAATG	1
-ATGTATGCTG	1
-ATGTCATCAA	2
-ATGTCATCTG	1
-ATGTCATTGT	1
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-ATGTCGCTCT	1
-ATGTCGGATT	1
-ATGTCGTGGT	1
-ATGTCTTATG	1
-ATGTCTTTGA	1
-ATGTCTTTTC	2
-ATGTGAAGCA	1
-ATGTGAGGAT	1
-ATGTGATCCG	1
-ATGTGCAGGC	1
-ATGTGCGTGG	8
-ATGTGCTACT	1
-ATGTGCTCCG	1
-ATGTGCTGCA	2
-ATGTGGAGGT	1
-ATGTGGCACA	2
-ATGTGGCCTC	1
-ATGTGGCGGC	1
-ATGTGGCTCA	1
-ATGTGGCTGG	1
-ATGTGGCTTC	1
-ATGTGGGCTC	2
-ATGTGGGGGA	1
-ATGTGGTTGT	1
-ATGTGTACAA	1
-ATGTGTGGAG	1
-ATGTGTGGGG	1
-ATGTGTTCAC	1
-ATGTGTTTCA	1
-ATGTTATCAA	1
-ATGTTCAGCA	1
-ATGTTCAGTG	1
-ATGTTCCCAC	1
-ATGTTGCACA	1
-ATGTTGCCCC	2
-ATGTTGCCCT	1
-ATGTTGCTGA	1
-ATGTTGGGTG	1
-ATGTTGTCAA	1
-ATGTTTTTAA	1
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-ATTAAAGGAG	1
-ATTAAAGTAG	1
-ATTAACAAAG	5
-ATTAACACAG	1
-ATTAACACCC	1
-ATTAACACTT	1
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-ATTAATCTGA	1
-ATTAATTCCT	1
-ATTACACCAC	2
-ATTACACCCG	1
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-ATTACCCCAG	1
-ATTACCTGAA	1
-ATTACCTGAC	1
-ATTACGCCAC	1
-ATTACGCCCT	1
-ATTACTCCAC	1
-ATTACTTCAC	1
-ATTACTTCTT	1
-ATTAGAAGGG	1
-ATTAGCCTGA	1
-ATTAGGAACT	1
-ATTAGTCACG	1
-ATTAGTGCAT	1
-ATTAGTGTTG	1
-ATTATAATCT	1
-ATTATCCAGC	1
-ATTATCCAGG	1
-ATTATCCTGA	1
-ATTATCCTGG	2
-ATTATGATGT	1
-ATTATGCCAT	1
-ATTATGCCGC	1
-ATTATGGGAG	1
-ATTATGGGCA	1
-ATTATGTGGA	1
-ATTATTGAAG	1
-ATTATTGGAT	2
-ATTATTTTCT	1
-ATTATTTTTC	1
-ATTCAACTCA	1
-ATTCACCCCC	1
-ATTCAGCACC	4
-ATTCAGCCCC	1
-ATTCAGGGGA	1
-ATTCAGTTAA	1
-ATTCCAACTG	1
-ATTCCAAGGA	2
-ATTCCAATCT	2
-ATTCCACCAC	1
-ATTCCCATAA	1
-ATTCCCCCTA	1
-ATTCCGCCAC	1
-ATTCCGGGCC	1
-ATTCCTGAGC	2
-ATTCCTGGGA	1
-ATTCGAAAGC	2
-ATTCGAGAAG	2
-ATTCGGAGGG	1
-ATTCGGTTAG	1
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-ATTCTCATTT	1
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-ATTCTGCCCA	2
-ATTCTGCCTC	1
-ATTCTGGTCA	1
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-ATTCTTTGGG	1
-ATTCTTTTTA	1
-ATTGAAGCCT	1
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-ATTGACCACC	1
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-ATTTTTCTGA	1
-ATTTTTGCCC	1
-ATTTTTGTAC	2
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-CCCCGTCATT	1
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-CCGGAATGTG	2
-CCGGACCTGT	1
-CCGGAGAGGT	1
-CCGGCAATGA	1
-CCGGCACCCC	1
-CCGGCCAAGG	1
-CCGGCCCGTG	1
-CCGGCCCTAC	6
-CCGGCCCTGA	1
-CCGGCGCAGG	1
-CCGGCGCGTG	2
-CCGGCTAGAG	1
-CCGGCTCTGG	1
-CCGGCTTGAG	4
-CCGGCTTGGA	1
-CCGGGAGTCC	1
-CCGGGCCGGG	1
-CCGGGCGCAG	2
-CCGGGCGCGG	2
-CCGGGCGGGG	1
-CCGGGCTCAC	3
-CCGGGCTGAT	1
-CCGGGGAGCA	5
-CCGGGGATAG	1
-CCGGGGCAAT	9
-CCGGGGGGCC	2
-CCGGGGTCAC	1
-CCGGGTGATG	2
-CCGGGTGCCC	1
-CCGGGTGGTG	1
-CCGGTAGAAG	1
-CCGGTATCCC	1
-CCGGTGCACT	1
-CCGGTGGAGC	1
-CCGGTGTACT	1
-CCGGTGTGGT	1
-CCGTAAAAAA	1
-CCGTAAATCT	1
-CCGTACCCAG	1
-CCGTACGTCG	1
-CCGTAGGTGG	2
-CCGTAGTGCC	3
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-CCGTCATCCT	1
-CCGTCCAAAG	1
-CCGTCCAAGG	60
-CCGTCCAATG	2
-CCGTCCAGGG	1
-CCGTCCCAGG	1
-CCGTCTCTCA	1
-CCGTGAAAAA	1
-CCGTGAAGTT	1
-CCGTGAATTT	1
-CCGTGAGACC	1
-CCGTGAGGGT	1
-CCGTGCACAT	1
-CCGTGCACTC	2
-CCGTGCTCAT	12
-CCGTGGTCAC	5
-CCGTGGTCCT	1
-CCGTGGTCGT	4
-CCGTGGTGCG	1
-CCGTGTCCGC	1
-CCGTTCTCCT	1
-CCGTTCTGGA	8
-CCGTTGCACT	1
-CCGTTGCATT	1
-CCGTTGTACT	1
-CCGTTTCCTT	1
-CCTAAAAAAA	1
-CCTAAAGGAG	2
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-CCTAACCCCA	1
-CCTAACTCTG	1
-CCTAAGGAAG	1
-CCTAAGGCTA	1
-CCTAAGGGAG	1
-CCTAAGTGTG	1
-CCTAATCTTG	1
-CCTACAATCC	1
-CCTACACCTA	1
-CCTACAGCTA	2
-CCTACCACAG	2
-CCTACCACCA	2
-CCTACCTGGA	2
-CCTACTACGT	1
-CCTACTGCAC	3
-CCTACTGGAG	1
-CCTACTGGAT	1
-CCTAGAGGCA	1
-CCTAGCAGTG	1
-CCTAGCCGGA	1
-CCTAGCTGGA	27
-CCTAGGACCT	4
-CCTAGGGTTC	2
-CCTATAATAA	1
-CCTATAATCC	15
-CCTATAGTCC	6
-CCTATAGTCG	2
-CCTATAGTCT	1
-CCTATATAAT	2
-CCTATCAAAA	1
-CCTATCGTCC	2
-CCTATGAATA	1
-CCTATGGAAA	1
-CCTATGGCTG	1
-CCTATGTAAA	1
-CCTATGTAAG	5
-CCTATGTGTC	1
-CCTATGTTAC	1
-CCTATGTTCC	1
-CCTATTAAAT	1
-CCTATTAAGC	1
-CCTATTACTG	1
-CCTATTTACT	21
-CCTCAAAAGT	1
-CCTCAACTAA	1
-CCTCAATGCT	1
-CCTCACAAAT	1
-CCTCACCTTC	1
-CCTCACGTTT	1
-CCTCACTTTC	1
-CCTCACTTTT	1
-CCTCAGCCCG	1
-CCTCAGCCCT	4
-CCTCAGCCTC	1
-CCTCAGCCTT	1
-CCTCAGCTAC	1
-CCTCAGGAAA	1
-CCTCAGGATA	124
-CCTCAGGATG	1
-CCTCAGGCTC	3
-CCTCAGGGTA	1
-CCTCAGGTTA	1
-CCTCAGTATA	1
-CCTCAGTCGG	1
-CCTCATCTTT	1
-CCTCCAAAGG	1
-CCTCCAACTA	3
-CCTCCAAGTA	1
-CCTCCAATAA	2
-CCTCCAATCC	1
-CCTCCACATT	1
-CCTCCACCTA	10
-CCTCCACGAA	1
-CCTCCACTAC	2
-CCTCCAGATA	2
-CCTCCAGCAA	2
-CCTCCAGCAG	6
-CCTCCAGCCA	3
-CCTCCAGCCC	2
-CCTCCAGCTA	458
-CCTCCAGCTC	1
-CCTCCAGCTG	1
-CCTCCAGTAA	1
-CCTCCAGTAC	8
-CCTCCAGTAG	1
-CCTCCAGTCG	1
-CCTCCAGTTA	1
-CCTCCAGTTG	1
-CCTCCATCCT	2
-CCTCCATCTC	1
-CCTCCCAAGA	1
-CCTCCCACGT	1
-CCTCCCAGAG	1
-CCTCCCAGCA	1
-CCTCCCCCGT	4
-CCTCCCCGAA	2
-CCTCCCCTGA	1
-CCTCCCGAAG	1
-CCTCCCTAAA	1
-CCTCCCTGAT	14
-CCTCCGCTAC	1
-CCTCCGGCCA	1
-CCTCCGGCGA	1
-CCTCCGGCTA	1
-CCTCCTATTA	5
-CCTCCTCCCT	1
-CCTCCTCCTC	1
-CCTCCTCGAC	1
-CCTCCTCGTG	1
-CCTCCTCTGC	1
-CCTCCTGACC	1
-CCTCCTGCAC	1
-CCTCCTGCAT	1
-CCTCCTGCCC	2
-CCTCCTGGGG	1
-CCTCCTGTAC	1
-CCTCCTTTTT	1
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-CCTCGCTTTT	1
-CCTCGGAAAA	10
-CCTCGGAAGA	1
-CCTCGGAATA	1
-CCTCGGAGAA	2
-CCTCGGAGAT	2
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-CCTCGGGGAA	1
-CCTCGTATGA	3
-CCTCTAAACA	1
-CCTCTAAAGA	1
-CCTCTAACAC	1
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-CCTCTATCTA	1
-CCTCTATGTT	1
-CCTCTCCCAC	1
-CCTCTCCTCC	2
-CCTCTCGGCC	1
-CCTCTGAGAA	1
-CCTCTGCATT	1
-CCTCTGGAGG	5
-CCTCTGGCAG	2
-CCTCTGTACT	2
-CCTCTGTTTC	1
-CCTCTTAGCA	1
-CCTCTTCAGG	2
-CCTCTTGCAG	1
-CCTCTTGGTG	1
-CCTGAAAAAA	1
-CCTGAAAAGC	3
-CCTGAAACAT	1
-CCTGAAACCC	1
-CCTGAAATCC	3
-CCTGAAATTT	1
-CCTGAAGAAG	1
-CCTGAAGTCC	1
-CCTGAATCTG	4
-CCTGACAATC	1
-CCTGACAGCG	1
-CCTGACCAGG	2
-CCTGACCCCC	2
-CCTGACCTCA	1
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-CCTGACGGGC	1
-CCTGACTCCC	2
-CCTGACTTTC	1
-CCTGAGAAGT	1
-CCTGAGCACA	1
-CCTGAGCCCG	5
-CCTGAGCCTG	2
-CCTGAGCGCC	1
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-CCTGAGTCTC	1
-CCTGAGTTGA	1
-CCTGATAACA	1
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-CCTGATCCTC	1
-CCTGATGAAG	2
-CCTGATGATT	1
-CCTGATGGCC	1
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-CCTGCACAGA	1
-CCTGCACCCA	5
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-CCTGCAGTCC	2
-CCTGCATCCC	2
-CCTGCATTCC	1
-CCTGCCAAAG	4
-CCTGCCACCC	4
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-CCTGCCCAGA	1
-CCTGCCCCCC	30
-CCTGCCCCCG	2
-CCTGCCCCTG	1
-CCTGCCCCTT	1
-CCTGCCTACC	1
-CCTGCCTCTT	1
-CCTGCGCCCA	1
-CCTGCGGGAA	1
-CCTGCGGTCA	1
-CCTGCGTGTA	1
-CCTGCTAATT	1
-CCTGCTCGGG	1
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-CCTGCTGGGA	1
-CCTGCTGGTG	1
-CCTGCTGTCG	1
-CCTGCTGTGA	1
-CCTGCTTGGT	1
-CCTGCTTGTC	23
-CCTGGAAATT	1
-CCTGGAACCC	1
-CCTGGAAGAA	1
-CCTGGAAGAG	26
-CCTGGAATCC	1
-CCTGGAGCAA	5
-CCTGGAGCAG	1
-CCTGGAGCGC	1
-CCTGGAGGGA	2
-CCTGGAGTCC	1
-CCTGGAGTGG	3
-CCTGGATAAA	2
-CCTGGCAAAA	1
-CCTGGCAAAT	1
-CCTGGCAATG	1
-CCTGGCAATT	1
-CCTGGCAGTC	1
-CCTGGCAGTT	4
-CCTGGCCACT	1
-CCTGGCCAGA	1
-CCTGGCCAGC	1
-CCTGGCCCAG	1
-CCTGGCCCTA	1
-CCTGGCCCTG	1
-CCTGGCCTAA	1
-CCTGGCCTCT	2
-CCTGGCCTTT	1
-CCTGGCGAAT	1
-CCTGGCTAAA	2
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-CCTGGCTGAA	1
-CCTGGCTGCT	1
-CCTGGCTGTA	2
-CCTGGCTTTT	1
-CCTGGGAAGT	22
-CCTGGGACTC	1
-CCTGGGATGC	1
-CCTGGGCACT	1
-CCTGGGCCAA	1
-CCTGGGCGTG	1
-CCTGGGCTGG	1
-CCTGGGGGCC	1
-CCTGGGTACC	1
-CCTGGGTTAG	1
-CCTGGTCAGT	2
-CCTGGTCCCA	1
-CCTGGTTCTG	4
-CCTGGTTGAT	1
-CCTGGTTGGT	1
-CCTGGTTTCT	1
-CCTGTAAACA	1
-CCTGTAAAGC	4
-CCTGTAAATC	2
-CCTGTAACCC	3
-CCTGTAAGCA	1
-CCTGTAAGGG	1
-CCTGTAAGTT	1
-CCTGTAATCA	3
-CCTGTAATCC	227
-CCTGTAATCG	3
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-CCTGTAATGT	1
-CCTGTAATTA	1
-CCTGTAATTC	11
-CCTGTACCCC	3
-CCTGTACTCC	3
-CCTGTACTCT	1
-CCTGTAGAAC	1
-CCTGTAGACC	3
-CCTGTAGGCC	1
-CCTGTAGTAC	1
-CCTGTAGTCC	46
-CCTGTAGTCG	2
-CCTGTAGTCT	3
-CCTGTAGTTC	2
-CCTGTATCCC	3
-CCTGTATGGC	1
-CCTGTATGTT	1
-CCTGTATTCC	9
-CCTGTATTGG	1
-CCTGTATTTG	1
-CCTGTCAGCC	1
-CCTGTCATCC	4
-CCTGTCATTT	1
-CCTGTCCAGC	1
-CCTGTCCCCT	1
-CCTGTCCTCA	1
-CCTGTCCTGC	8
-CCTGTCTAGC	2
-CCTGTCTGAT	1
-CCTGTCTGCA	1
-CCTGTCTGCC	22
-CCTGTCTTTT	1
-CCTGTGAATA	1
-CCTGTGACAA	1
-CCTGTGACAG	27
-CCTGTGAGAA	1
-CCTGTGATCC	7
-CCTGTGCACT	1
-CCTGTGCTCT	1
-CCTGTGCTGC	1
-CCTGTGGCCA	1
-CCTGTGGTCC	19
-CCTGTGGTCT	1
-CCTGTGGTTC	1
-CCTGTGTATG	2
-CCTGTGTGGC	1
-CCTGTGTGTG	3
-CCTGTGTTCC	2
-CCTGTGTTGG	5
-CCTGTTATCC	2
-CCTGTTCAAT	1
-CCTGTTCTCC	3
-CCTGTTGTCC	2
-CCTTAAATCA	1
-CCTTAAGGAT	1
-CCTTAAGGTT	1
-CCTTACACAA	1
-CCTTACCTAC	1
-CCTTACTCCT	2
-CCTTACTCTT	1
-CCTTAGGATA	1
-CCTTATATTT	1
-CCTTATGGAA	1
-CCTTATTCAC	1
-CCTTATTTTC	1
-CCTTCAAATC	17
-CCTTCAAATT	1
-CCTTCAGCAG	1
-CCTTCAGCGG	1
-CCTTCAGCTA	2
-CCTTCAGCTT	1
-CCTTCAGGGT	2
-CCTTCAGTTA	1
-CCTTCCAAAT	8
-CCTTCCAGCT	1
-CCTTCCAGTA	1
-CCTTCCCAGC	1
-CCTTCCCTGA	6
-CCTTCGAAGA	1
-CCTTCGAGAT	12
-CCTTCTGCTG	1
-CCTTCTGGTG	1
-CCTTCTTCCA	1
-CCTTCTTCCT	1
-CCTTCTTGCT	1
-CCTTGAAACA	1
-CCTTGAAATC	1
-CCTTGAAGGT	1
-CCTTGACCAA	1
-CCTTGAGTAC	2
-CCTTGATAGA	1
-CCTTGATAGC	1
-CCTTGCATTC	1
-CCTTGCCCAG	2
-CCTTGCCCCC	1
-CCTTGCTTTT	5
-CCTTGGACCA	1
-CCTTGGCTGA	1
-CCTTGGGTGA	1
-CCTTGGTGCC	6
-CCTTGGTTCA	1
-CCTTGGTTTT	2
-CCTTGTAAAT	1
-CCTTGTGTAT	1
-CCTTGTGTCC	1
-CCTTTAAATG	1
-CCTTTAATCC	1
-CCTTTAGTCC	1
-CCTTTAGTTG	1
-CCTTTATAGA	1
-CCTTTATTAC	1
-CCTTTCAAGC	1
-CCTTTCACAC	2
-CCTTTCCATA	2
-CCTTTCCCCA	1
-CCTTTCCTTT	3
-CCTTTCGTCT	1
-CCTTTCTCCT	1
-CCTTTCTCTC	2
-CCTTTGAAAC	1
-CCTTTGAACA	3
-CCTTTGCCCT	4
-CCTTTGCCTC	1
-CCTTTGGCTA	4
-CCTTTGGTGG	1
-CCTTTGTAAA	1
-CCTTTGTAAG	4
-CCTTTGTCCC	1
-CCTTTTACCT	1
-CCTTTTACTC	1
-CCTTTTGGGT	2
-CCTTTTTCAA	1
-CCTTTTTGTA	1
-CGAAAAAAAA	2
-CGAAACCCTG	4
-CGAAACCTCG	1
-CGAACAAAAG	3
-CGAAGGCTGT	1
-CGAATAAAAT	1
-CGAATAGATC	1
-CGAATATGCA	1
-CGAATGACCC	1
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-CGACACTTCA	1
-CGACAGCCCA	1
-CGACCCACAA	3
-CGACCCCACG	1
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-CGACCGTCAC	2
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-CGACTGCACT	2
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-CGAGATCCAA	1
-CGAGCAGGAT	1
-CGAGCAGGCA	1
-CGAGCATCCC	1
-CGAGCCTGAA	1
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-CGAGGATGGG	1
-CGAGGCAACC	1
-CGAGGGATGG	1
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-CGAGGGTCGT	1
-CGAGTGCACT	1
-CGATACATCA	1
-CGATATTCCC	2
-CGATCAGTTT	2
-CGATCGGGTG	2
-CGATGCCACA	1
-CGATGCTGAC	2
-CGATGGCCCC	1
-CGATGGTCCC	6
-CGATGGTGGG	1
-CGATGTGTCC	1
-CGATGTTAAA	1
-CGATGTTGCC	1
-CGATTATTTA	1
-CGATTCTGGA	2
-CGATTGCGCG	1
-CGATTTCACT	2
-CGCAAAGGAG	1
-CGCAAATGCT	1
-CGCAACCTCA	1
-CGCAACTGCG	2
-CGCAAGACTA	2
-CGCAAGACTT	1
-CGCAATGTCC	1
-CGCACACACA	1
-CGCACCAGCA	1
-CGCACCATTG	7
-CGCACGAACA	1
-CGCAGAGCCT	2
-CGCAGAGGCC	1
-CGCAGCAATG	1
-CGCAGCGCCC	2
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-CGCAGGGCTC	1
-CGCAGTCTCG	1
-CGCAGTCTGC	1
-CGCAGTCTTT	1
-CGCAGTGAAT	1
-CGCAGTGTCC	26
-CGCATAAATA	1
-CGCATAATAA	1
-CGCATCGTGG	1
-CGCATCGTTC	1
-CGCATCTGGC	1
-CGCATCTTCT	1
-CGCATTAAAG	2
-CGCATTGCCC	1
-CGCATTTCTC	1
-CGCCACCACG	1
-CGCCACCTCT	1
-CGCCACTGCG	1
-CGCCAGAGCT	1
-CGCCAGGCGG	6
-CGCCAGGTGC	2
-CGCCAGTGTC	1
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-CGCCCACCTC	1
-CGCCCCCACA	1
-CGCCCCCTGC	3
-CGCCCCTGAA	1
-CGCCCCTGAT	1
-CGCCCGAGGC	1
-CGCCCGCGGT	1
-CGCCCGGGAG	1
-CGCCCGGTGC	1
-CGCCCTACAA	1
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-CGCCGACGAT	14
-CGCCGACGGC	1
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-CGCCGCTGTG	1
-CGCCGCTTCC	2
-CGCCGCTTCT	2
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-CGCCGGAGCA	1
-CGCCGGATAC	1
-CGCCGTCGGC	1
-CGCCGTGGTG	1
-CGCCGTTCCT	1
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-CGCCTATAAT	1
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-CGCCTCTGAC	1
-CGCCTGAAGG	1
-CGCCTGCACC	1
-CGCCTGGGTG	1
-CGCCTGGTAA	1
-CGCCTGGTGA	1
-CGCCTGTAAC	1
-CGCCTGTAAT	8
-CGCCTGTAGT	6
-CGCCTGTCGT	1
-CGCCTGTGGT	1
-CGCCTTTACT	1
-CGCGCACACA	1
-CGCGCACCCG	2
-CGCGCCCGGC	16
-CGCGCCTGTA	1
-CGCGCGCACA	1
-CGCGCGCGCA	1
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-CGCGCTGTGG	2
-CGCGGCGGGC	1
-CGCGGGAGAT	1
-CGCGGTGGCT	1
-CGCGTCACTA	3
-CGCGTCCTCC	2
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-CGCGTGCGCA	1
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-CGCTCCTGCG	1
-CGCTCCTGGA	1
-CGCTCGCCCC	1
-CGCTCTCTTT	1
-CGCTGAAGGC	1
-CGCTGAGCCA	1
-CGCTGCCCTC	1
-CGCTGGTCCA	1
-CGCTGGTTCA	1
-CGCTGGTTCC	42
-CGCTGGTTCT	1
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-CGCTGTGTGC	7
-CGCTTCCGCT	1
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-CGCTTGAATG	1
-CGCTTGTAAT	1
-CGCTTGTAGT	1
-CGCTTTAGGG	1
-CGCTTTGCGC	1
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-CGGAAATGCA	1
-CGGAACAACG	1
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-CGGACAATCA	2
-CGGACAGCCA	1
-CGGACCCCCC	1
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-CGGAGCCGGC	3
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-CGGAGTGGTT	1
-CGGAGTTTTA	1
-CGGATAAAGG	1
-CGGATAACCA	3
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-CGGATGGTGG	1
-CGGATTCACT	1
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-CGGATTTTTA	8
-CGGCAAAAAA	1
-CGGCAAGCCA	1
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-CGGCACTGAG	1
-CGGCAGAACT	1
-CGGCAGAGCT	4
-CGGCAGAGTG	1
-CGGCAGTCGC	1
-CGGCATTCAG	1
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-CGGCCACCCC	1
-CGGCCAGTGA	1
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-CGGCTGCGCT	1
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-CGGCTTTCTG	1
-CGGCTTTTCT	10
-CGGGACTTCA	2
-CGGGAGAACC	1
-CGGGAGCCGG	1
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-CGGGAGTCGG	30
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-CGGGCCGTGC	1
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-CTAAAGGAGG	1
-CTAAAGTTGA	1
-CTAAATATAC	1
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-CTAACCAGAC	4
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-CTAACTGCGA	1
-CTAAGAAAAA	1
-CTAAGAAAAG	2
-CTAAGAACTT	1
-CTAAGAAGCA	1
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-CTAAGACCTC	1
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-CTGCCCTCCC	3
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-CTGGCCAGGC	1
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-CTGGCCATAG	1
-CTGGCCATCG	4
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-CTGGCCCGAA	1
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-CTGGGCAGCT	2
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-CTGGGCTCGC	1
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-CTGGGGCCTC	1
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-CTGGGGGAGA	1
-CTGGGGGAGG	2
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-CTGGGGTTAC	1
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-CTGGGTCTCC	4
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-CTGGTACCCT	1
-CTGGTACCTG	2
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-CTGGTAGTCC	1
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-CTGGTCCCTG	1
-CTGGTCCTCC	7
-CTGGTCTCGA	1
-CTGGTCTGAC	1
-CTGGTCTGCA	1
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-CTGGTGAACC	1
-CTGGTGAATT	1
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-CTGGTGCCTT	1
-CTGGTGGCAT	1
-CTGGTGGCTG	1
-CTGGTGGGCA	2
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-CTGGTTGGTG	1
-CTGGTTTCTC	1
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-CTGTACAAAG	2
-CTGTACAGAC	25
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-CTGTACTAAG	1
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-CTGTACTCAA	1
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-CTGTATAATT	1
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-CTGTCATTTG	2
-CTGTCCACCA	1
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-CTGTGTAATT	1
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-CTGTGTGCCC	2
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-GAGCACGGGA	1
-GAGCACTCAC	1
-GAGCACTTGG	2
-GAGCAGAGCA	1
-GAGCAGAGTT	1
-GAGCAGCTAA	1
-GAGCAGCTGG	1
-GAGCAGGAGC	1
-GAGCAGGCAA	1
-GAGCAGGCAT	1
-GAGCAGGTGC	1
-GAGCATAATA	1
-GAGCATATCT	1
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-GAGCCAATCT	1
-GAGCCAGAGG	1
-GAGCCAGGTG	1
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-GAGCTCTGCG	1
-GAGCTCTGTG	1
-GAGCTGAAAT	1
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-GAGGGCCTTG	1
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-GAGGGTCTTG	2
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-GATCCCAGCA	1
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-GATTGATTCA	1
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-GCAACCGCCA	1
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-GCAACTGTGA	1
-GCAACTTAGA	3
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-GCAAGGAAAA	1
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-GCAAGGCCTC	2
-GCAAGGGCTA	1
-GCAAGGGCTG	1
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-GCAAGGGTTT	1
-GCAAGGTCAG	1
-GCAAGTCAGA	1
-GCAAGTCTCA	1
-GCAAGTGGGG	1
-GCAAGTTGAT	1
-GCAATAAATG	1
-GCAATAAGGC	1
-GCAATAAGTG	3
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-GCAATATCCA	1
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-GCAATCCTTA	1
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-GCAATGGCCA	1
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-GCAATGTTTA	1
-GCAATTAAAA	1
-GCAATTTAAC	1
-GCAATTTGTG	1
-GCACAAAATG	1
-GCACAAACGG	1
-GCACAACAAG	1
-GCACAACCTA	1
-GCACAAGAAG	7
-GCACAAGCCA	1
-GCACAAGGAG	1
-GCACAATGAG	1
-GCACAATTGT	1
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-GCACACAGAG	1
-GCACACTAGC	1
-GCACACTGTG	1
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-GCACATTTTG	1
-GCACCAAATG	1
-GCACCACAAG	1
-GCACCACCTT	1
-GCACCACTGC	1
-GCACCAGCAA	1
-GCACCAGCGG	1
-GCACCATAAT	2
-GCACCCAACA	1
-GCACCCAACG	1
-GCACCCCACC	3
-GCACCCCAGC	1
-GCACCCCGAA	1
-GCACCCGCCT	2
-GCACCCTCAC	1
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-GCACCGCCGG	1
-GCACCGCGGC	1
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-GCACCGGGGG	1
-GCACCGGTCG	1
-GCACCGTAAG	3
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-GCACCTAGTG	2
-GCACCTATTG	2
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-GCACCTGAAC	1
-GCACCTGCAG	1
-GCACCTGTCG	9
-GCACCTGTTT	1
-GCACCTTATT	1
-GCACCTTCAC	1
-GCACCTTCAG	1
-GCACGAGAAC	1
-GCACGAGGGG	1
-GCACGCGTAA	1
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-GCACGTGCCT	1
-GCACGTGTAT	1
-GCACGTGTCT	2
-GCACGTGTTC	1
-GCACGTTTGA	1
-GCACTAAATG	1
-GCACTAATAT	1
-GCACTCATCC	1
-GCACTCCAAG	1
-GCACTCCACC	1
-GCACTCCAGC	3
-GCACTCCCAG	1
-GCACTCTGAT	8
-GCACTGAACC	1
-GCACTGAATA	2
-GCACTGACTG	1
-GCACTGATGT	1
-GCACTGCACT	3
-GCACTGCCAT	2
-GCACTGGACG	1
-GCACTGGACT	1
-GCACTGGCTG	2
-GCACTGTCGA	1
-GCACTGTGTC	1
-GCACTTACAA	4
-GCACTTCAGC	1
-GCACTTCGGT	1
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-GCACTTGCTA	1
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-GCAGAAAGTT	3
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-GCAGAACCCT	1
-GCAGAACCTG	1
-GCAGAACCTT	1
-GCAGAACGCC	1
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-GCAGAAGCAC	1
-GCAGAAGCTG	1
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-GCAGACAGCA	1
-GCAGACATCA	1
-GCAGACCCAC	2
-GCAGACCCTT	1
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-GCAGACGCAC	1
-GCAGACTCAG	3
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-GCAGACTTTG	1
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-GCAGCAGTGC	1
-GCAGCATCCG	1
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-GCAGCCACAC	1
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-GCAGCCGGCC	1
-GCAGCCGTCC	1
-GCAGCCTCCA	3
-GCAGCCTCGG	1
-GCAGCCTCTC	1
-GCAGCCTGGG	1
-GCAGCCTGTT	1
-GCAGCGATGA	1
-GCAGCGCCTG	2
-GCAGCGGGCG	1
-GCAGCGTGCA	1
-GCAGCTAATT	1
-GCAGCTATCC	1
-GCAGCTCAGG	8
-GCAGCTCCAA	1
-GCAGCTCCAT	1
-GCAGCTCCTG	47
-GCAGCTGCAG	1
-GCAGCTGCCC	1
-GCAGCTGCCT	1
-GCAGCTGCTG	1
-GCAGCTGGCT	1
-GCAGCTGGGC	1
-GCAGCTGTGG	1
-GCAGCTTAGC	2
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-GCAGGAAGAA	1
-GCAGGAATAA	1
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-GCAGGAGAGG	2
-GCAGGAGGAT	3
-GCAGGAGGCC	2
-GCAGGAGGTG	13
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-GCAGGAGTCA	1
-GCAGGATCGG	5
-GCAGGATTGG	1
-GCAGGCACTC	1
-GCAGGCATCA	1
-GCAGGCCCGG	1
-GCAGGCCTAA	1
-GCAGGCCTCA	3
-GCAGGCCTGC	4
-GCAGGCGCCT	1
-GCAGGCTGCA	1
-GCAGGCTGTG	1
-GCAGGCTTAG	1
-GCAGGGAGGG	3
-GCAGGGATGT	1
-GCAGGGCCTC	165
-GCAGGGCCTT	1
-GCAGGGCTTC	1
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-GCAGGGTCTC	1
-GCAGGGTGGA	1
-GCAGGGTGGG	1
-GCAGGTACAC	1
-GCAGGTGCCT	1
-GCAGGTGGCT	1
-GCAGGTGGTT	7
-GCAGGTGTAA	2
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-GCAGTAGGAA	1
-GCAGTAGTCC	1
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-GCAGTCCCAG	1
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-GCAGTGGCCT	7
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-GCATAATTGG	1
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-GCATAGCTGC	1
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-GCATCAGGTC	2
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-GCATCCATCC	2
-GCATCCGGAG	3
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-GCATCCGGGG	1
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-GCATCCTGTT	1
-GCATCTAGAA	1
-GCATCTGGGA	2
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-GCATTAAAAA	1
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-GCATTCTCCG	1
-GCATTCTTGT	1
-GCATTGAAGT	1
-GCATTGAATT	1
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-GCATTGATGT	1
-GCATTGGGTA	1
-GCATTTAAAA	1
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-GCATTTCAGG	1
-GCATTTCCAA	1
-GCATTTGACA	5
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-GCCAAGGGGC	7
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-GCCAAGTTTG	3
-GCCAATAGTC	1
-GCCAATAGTT	1
-GCCAATATGG	1
-GCCAATCCCG	1
-GCCAATGATA	1
-GCCAATGTGG	1
-GCCACAACCT	1
-GCCACACCCC	2
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-GCCACCAAGT	5
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-GCTGGGCTAA	1
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-GGAGTGGGCT	3
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-GGATAAATGA	1
-GGATAATAGG	1
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-GGATAGCACA	1
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-GGATCTTGGG	1
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-GGATGAGTTT	2
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-GGCAAACAGC	1
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-GGCAAACGGA	1
-GGCAAAGACT	2
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-GGCAACAACA	1
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-GGCAACACAG	2
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-GGCAACCATT	1
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-GGCAAGAAGA	3
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-GGCAAGCAGG	2
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-GGCAATACTT	1
-GGCAATTTAC	1
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-GGCAGCCAGC	1
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-GGCAGGGCCT	1
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-GGCATCTGGC	3
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-GGCCACCACA	2
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-GGCCAGCGAT	1
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-GGCCAGGAGT	1
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-GGCCCAGCAG	2
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-GGCCGCTCCC	1
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-GGCCGGGGGC	2
-GGCCGGTGTC	1
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-TGACAGAGTG	10
-TGACAGCCCA	2
-TGACAGCTGA	1
-TGACAGCTTT	1
-TGACAGGAAT	1
-TGACATATGA	1
-TGACATATTG	1
-TGACCAAACC	1
-TGACCAAGTT	1
-TGACCACTGA	1
-TGACCAGGCC	1
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-TGACCATTTC	1
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-TGAGAGAATA	1
-TGAGAGACAT	2
-TGAGAGGAGA	2
-TGAGAGGGTG	4
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-TGATTAAGGT	3
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-TGCAGACAGA	1
-TGCAGACCAG	1
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-TGCCGAATGT	1
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-TGCCTTGAAA	2
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-TGCGCGCTGA	1
-TGCGGATGAC	1
-TGCGGCGGTG	1
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-TGCGTGAACC	1
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-TGCGTGGGTG	1
-TGCGTGTATG	1
-TGCGTTGCAC	1
-TGCTAAAAAA	2
-TGCTAAAGCA	1
-TGCTAACTGC	1
-TGCTACGAAA	2
-TGCTACTGGT	3
-TGCTACTTGC	1
-TGCTACTTGG	1
-TGCTAGAACT	1
-TGCTAGATGT	1
-TGCTAGATTG	2
-TGCTAGCACA	1
-TGCTAGGAAG	2
-TGCTATCATT	1
-TGCTCAACAG	1
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-TGCTCGTGTC	1
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-TGCTCTTTCC	1
-TGCTGAACTG	1
-TGCTGAATCA	3
-TGCTGACCTA	1
-TGCTGACTGA	1
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-TGCTGAGGGA	1
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-TGCTGCTGTC	1
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-TGCTGGGAAA	1
-TGCTGGGCTG	1
-TGCTGGGGTT	1
-TGCTGGGTGG	9
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-TGCTGTAAAA	1
-TGCTGTCTCT	1
-TGCTGTCTGG	1
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-TGCTTATTCA	1
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-TGCTTGCACC	1
-TGCTTGCCTG	1
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-TGCTTGTTGG	1
-TGCTTTAACT	1
-TGCTTTAGTG	1
-TGCTTTATGT	1
-TGCTTTCAAA	2
-TGCTTTCTTA	1
-TGCTTTGAGC	1
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-TGCTTTTAGT	1
-TGCTTTTGGA	1
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-TGGAACCCTT	1
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-TGGAATGTGC	1
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-TGGACACCCA	1
-TGGACAGATG	1
-TGGACAGCAG	1
-TGGACATAAA	1
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-TGGACCACAG	1
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-TGGACCAGTG	2
-TGGACCCAAC	2
-TGGACCCCCC	1
-TGGACCCCCT	1
-TGGACCCCGG	1
-TGGACCTGGT	1
-TGGACTAGCA	1
-TGGACTTTGT	1
-TGGAGAAACC	1
-TGGAGAAAGA	1
-TGGAGAAGAG	7
-TGGAGAAGGC	1
-TGGAGACAAC	2
-TGGAGAGAGG	1
-TGGAGAGCAA	2
-TGGAGAGCCG	1
-TGGAGAGTCG	3
-TGGAGAGTGA	1
-TGGAGATAAC	1
-TGGAGATGTG	2
-TGGAGCAACA	1
-TGGAGCAGTT	2
-TGGAGCATCG	1
-TGGAGCGCTA	2
-TGGAGGCCAG	3
-TGGAGGGCAT	1
-TGGAGGGGCC	2
-TGGAGGGTGT	1
-TGGAGGTGGG	1
-TGGAGTAGAG	1
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-TGGATAGATT	1
-TGGATAGTGA	1
-TGGATATGTG	1
-TGGATCACCA	1
-TGGATCAGAT	1
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-TGGATCCTCG	3
-TGGATGGAAA	1
-TGGATGGAGT	1
-TGGATGGCTT	1
-TGGATGTACA	3
-TGGATGTATA	1
-TGGATGTATT	1
-TGGATGTCTG	1
-TGGATTAACC	1
-TGGATTGGCC	1
-TGGATTTCTG	1
-TGGCAAAAAA	2
-TGGCAAACGT	3
-TGGCAAAGCC	2
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-TGGCAAGTTT	1
-TGGCACACAC	2
-TGGCACACTA	2
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-TGGCAGACAG	1
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-TGGCAGGGCC	1
-TGGCAGTACC	1
-TGGCAGTATA	1
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-TGGCCAATAA	1
-TGGCCAATGT	1
-TGGCCACAGT	1
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-TGGCCCCACA	2
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-TGGCCTGTTC	1
-TGGCCTTTCG	2
-TGGCGAGTGA	1
-TGGCGCGTGT	8
-TGGCGCTTGG	1
-TGGCGGAGTC	1
-TGGCGGCCAT	1
-TGGCGGGCAC	1
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-TGGCGTAACG	1
-TGGCGTACGG	4
-TGGCGTTACG	1
-TGGCGTTCAG	1
-TGGCTAAAAA	1
-TGGCTAAAGA	1
-TGGCTAAATG	2
-TGGCTAAATT	1
-TGGCTAATGA	1
-TGGCTACTCC	1
-TGGCTACTGC	1
-TGGCTACTTA	9
-TGGCTACTTC	1
-TGGCTAGATT	2
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-TGGCTGGAGC	2
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-AAGCAGCTGG	1
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-AAGCCAGCCA	1
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-AAGCCAGTCT	1
-AAGCCATCGC	1
-AAGCCCAGGC	1
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-AAGCCCTCTA	1
-AAGCCGGCCC	1
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-AAGCCTTCCC	2
-AAGCCTTCTT	1
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-ACCCTCTCCA	1
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-ACCCTCTGTG	3
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-ACCCTGCCCT	1
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-ACTGTACAAT	1
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-ACTGTCTGTC	1
-ACTGTCTTAG	1
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-ACTGTTGCTA	7
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-ACTGTTTAAG	1
-ACTGTTTATG	1
-ACTGTTTCTT	1
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-ACTTAAAATA	1
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-ACTTAATCAA	2
-ACTTAATCTT	1
-ACTTAATTAA	1
-ACTTAATTCA	1
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-ACTTACCTGC	17
-ACTTACCTGT	1
-ACTTAGAGTT	1
-ACTTAGCCTA	1
-ACTTAGGAAA	1
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-ACTTGACAGT	1
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-ACTTGCCATT	1
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-ACTTGGCCTG	1
-ACTTGGGGCA	1
-ACTTGGGTGG	1
-ACTTGTACTG	1
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-ACTTTAAAAA	2
-ACTTTAAACT	2
-ACTTTAAAGA	1
-ACTTTACAAA	1
-ACTTTAGAAT	1
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-ACTTTGAATG	1
-ACTTTGAATT	1
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-ACTTTTACAA	2
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-AGAAAACTGG	1
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-AGAAATGCGG	1
-AGAAATGTAT	1
-AGAAATGTGA	1
-AGAAATTCAG	1
-AGAAATTTCC	1
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-AGAACAAAAC	6
-AGAACAACAA	1
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-AGAACACAAA	1
-AGAACACTTT	1
-AGAACAGAGG	1
-AGAACAGGGC	1
-AGAACAGTTT	2
-AGAACATTCT	1
-AGAACCAAAT	1
-AGAACCAACA	1
-AGAACCCAGG	1
-AGAACCCGGC	2
-AGAACCGCTT	1
-AGAACCTGCA	1
-AGAACCTTAA	1
-AGAACCTTCA	1
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-AGACCTCCAG	2
-AGACCTCCCT	1
-AGACCTGGGT	1
-AGACGCACTC	1
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-AGACGCTGTC	1
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-AGACGGAGGT	2
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-AGACTAACAC	2
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-AGACTCGCTT	1
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-AGAGACTCTG	1
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-AGAGAGAAGA	1
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-AGAGAGGAAA	1
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-AGGTCGGGAG	6
-AGGTCGGGGG	1
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-AGGTCTATTC	1
-AGGTCTTACT	1
-AGGTCTTAGC	1
-AGGTGAATCT	1
-AGGTGAGAGA	1
-AGGTGAGAGG	3
-AGGTGATACT	1
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-AGGTGCGGGG	5
-AGGTGGAAAG	1
-AGGTGGCAAG	3
-AGGTGGGGAG	1
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-AGGTGTAGTA	1
-AGGTGTCTTT	3
-AGGTGTTTCT	1
-AGGTGTTTTC	2
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-AGGTTCGGAC	1
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-AGGTTGATGG	1
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-CACTGTCCAG	1
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-CAGAAGATGC	1
-CAGAAGATGG	1
-CAGAAGATGT	1
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-CAGAAGCAGT	1
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-CAGAATACAA	2
-CAGAATACGA	1
-CAGAATCCAC	1
-CAGAATGACT	1
-CAGAATGAGC	2
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-CAGACCAGAG	1
-CAGACCATTG	1
-CAGACCCAAA	1
-CAGACCCCTG	1
-CAGACCCGCA	1
-CAGACCCTCC	1
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-CAGACTAACT	1
-CAGACTATGG	1
-CAGACTATGT	1
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-CAGACTTTTG	2
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-CAGAGACACA	3
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-CAGCAGATAA	1
-CAGCAGATGT	1
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-CAGCAGCTAG	1
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-CAGCAGGGCT	1
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-CAGCAGTAGC	2
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-CATATCTCAA	1
-CATATGATCC	1
-CATATGATGG	1
-CATATGCCTG	1
-CATATGTACT	1
-CATATGTTTA	1
-CATATGTTTT	1
-CATATTATGT	1
-CATATTTCAC	2
-CATATTTTTT	1
-CATCAAATCT	1
-CATCAATGAG	1
-CATCACAGTG	1
-CATCACCACA	1
-CATCACCGGC	1
-CATCACGCTC	1
-CATCACTACC	1
-CATCACTTCT	1
-CATCAGTAAA	1
-CATCAGTAGC	1
-CATCAGTCCT	1
-CATCATAGCT	1
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-CATCATCTGG	1
-CATCATTCCT	1
-CATCATTGGC	1
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-CATCCACGTT	1
-CATCCAGAGG	1
-CATCCAGGGT	1
-CATCCATCTG	1
-CATCCATTGG	1
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-CATCCTCTCT	1
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-CATCGTGCGA	1
-CATCGTGGTG	1
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-CATCTAGCGT	1
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-CATCTTCACA	1
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-CATCTTCTGT	1
-CATCTTGGAG	1
-CATCTTTAAG	2
-CATCTTTTTA	1
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-CATTACTGTA	1
-CATTACTTCT	1
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-CATTATGCAA	1
-CATTATTCAA	1
-CATTATTTTA	1
-CATTATTTTT	1
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-CATTCTTCTC	1
-CATTCTTGTA	1
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-CATTGCATTG	1
-CATTGCTGCT	2
-CATTGGCTTA	1
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-CATTGTACGA	1
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-CATTGTCTTC	1
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-CATTTATATT	1
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-CATTTCAATA	2
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-CATTTCCTTA	1
-CATTTCTGAC	1
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-CATTTTTTGG	1
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-CCAAATCCTA	1
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-CCAAATTTAC	1
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-CCAACAGATG	1
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-CCAACTGCAC	1
-CCAACTGCGG	1
-CCAACTGGGC	1
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-CCAAGGTCAC	1
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-CCAATTGCAT	1
-CCAATTTCAA	1
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-CCACACGTGA	1
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-CCACAGCACT	4
-CCACAGCATT	1
-CCACAGCCAC	1
-CCACAGCCTA	1
-CCACAGCCTG	1
-CCACAGCTGA	1
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-CCACCACACT	4
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-CCACCACTCC	1
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-CCACCCCCAC	6
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-CCACCTGGAT	2
-CCACCTTTCC	2
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-CCACGAGAGG	1
-CCACGAGTAA	1
-CCACGCGAAA	1
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-CCACGTCCTA	1
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-CCACGTGGTC	1
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-CCACTAATTT	1
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-CCACTATACT	2
-CCACTATATT	1
-CCACTATGCC	1
-CCACTCAAGT	1
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-CCACTCACTC	1
-CCACTCACTG	1
-CCACTCCTCA	2
-CCACTCCTCC	1
-CCACTCTGCT	1
-CCACTCTGGC	1
-CCACTCTGTG	1
-CCACTCTTGA	1
-CCACTGAACT	5
-CCACTGAATT	2
-CCACTGACTA	1
-CCACTGACTC	1
-CCACTGAGAT	1
-CCACTGAGCA	2
-CCACTGCAAT	1
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-CCACTGCATT	21
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-CCACTGCTAC	1
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-CCACTGCTGC	1
-CCACTGCTTC	1
-CCACTGGACT	4
-CCACTGGCAT	1
-CCACTGTACA	2
-CCACTGTACC	1
-CCACTGTACT	28
-CCACTGTATT	1
-CCACTGTGCC	1
-CCACTGTGCT	3
-CCACTGTGTT	1
-CCACTTACGA	1
-CCACTTACTC	1
-CCACTTATTC	1
-CCACTTCACT	5
-CCACTTCCTC	1
-CCACTTCTCT	1
-CCACTTGCAC	1
-CCACTTTGCA	1
-CCAGAAAATC	3
-CCAGAAACTG	1
-CCAGAAAGAT	1
-CCAGAACAGA	40
-CCAGAACAGC	1
-CCAGAAGCTG	1
-CCAGAATCCT	1
-CCAGAATGCT	1
-CCAGACACAT	1
-CCAGACACTG	1
-CCAGACAGCT	1
-CCAGACCAGA	1
-CCAGACTGAA	1
-CCAGAGAAAA	2
-CCAGAGAACT	13
-CCAGAGACTT	1
-CCAGAGAGTT	1
-CCAGAGATAT	1
-CCAGAGCAGA	1
-CCAGAGCCGG	1
-CCAGAGCTCT	1
-CCAGAGGAAA	1
-CCAGAGGCTA	1
-CCAGAGGCTG	67
-CCAGAGGTAG	1
-CCAGAGGTGC	1
-CCAGAGGTGT	1
-CCAGAGTCTC	2
-CCAGATAGAT	1
-CCAGATGAAA	1
-CCAGATGTAC	1
-CCAGATTTTG	2
-CCAGCAAGAG	2
-CCAGCACGCC	1
-CCAGCAGACC	1
-CCAGCAGCTA	1
-CCAGCAGTAA	1
-CCAGCCACTG	1
-CCAGCCAGAA	1
-CCAGCCCCAT	1
-CCAGCCCCGT	6
-CCAGCCCGGG	1
-CCAGCCCTAC	1
-CCAGCCCTGG	1
-CCAGCCGGGG	1
-CCAGCCTGGA	2
-CCAGCCTGGG	13
-CCAGCCTTCA	1
-CCAGCCTTGG	1
-CCAGCGCACC	1
-CCAGCGCAGC	1
-CCAGCGGAGA	1
-CCAGCGGCCC	1
-CCAGCGGCCG	1
-CCAGCTACAA	1
-CCAGCTACTC	1
-CCAGCTCAAT	1
-CCAGCTGAGG	1
-CCAGCTGCCA	9
-CCAGCTGCCC	1
-CCAGCTGCCT	1
-CCAGCTGCGA	1
-CCAGCTGTTG	1
-CCAGCTTGAT	1
-CCAGCTTGGG	1
-CCAGGAACAA	2
-CCAGGAAGGG	1
-CCAGGACAAC	1
-CCAGGACAGA	1
-CCAGGACTGA	1
-CCAGGACTGC	1
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-CCAGGATTTC	1
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-CCAGGCGTCA	4
-CCAGGCGTGG	1
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-CCAGGGGGCC	1
-CCAGGGTGGG	1
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-CCAGGTCATT	1
-CCAGGTCCAC	1
-CCAGGTCCTA	1
-CCAGGTCCTG	1
-CCAGGTGAGG	1
-CCAGGTGCTG	1
-CCAGGTGGAA	1
-CCAGGTGTGG	1
-CCAGGTTCTG	1
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-CCAGTAACCC	4
-CCAGTAAGAA	1
-CCAGTAATCC	4
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-CCAGTACACT	1
-CCAGTAGAAG	2
-CCAGTAGGTA	1
-CCAGTCAGAA	2
-CCAGTCAGAT	1
-CCAGTCAGGA	1
-CCAGTCCGCC	6
-CCAGTCTACG	1
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-CCAGTGGCCT	1
-CCAGTGGCTC	4
-CCAGTGGCTG	1
-CCAGTGGGAA	1
-CCAGTGGGAT	1
-CCAGTGGGCC	1
-CCAGTGGTCC	1
-CCAGTGGTCT	1
-CCAGTGTAGC	1
-CCAGTGTATT	1
-CCAGTTCCTG	3
-CCAGTTCTCA	1
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-CCAGTTGGCA	1
-CCAGTTTCTT	1
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-CCATAACTGT	1
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-CCATACTGCC	1
-CCATAGAACT	1
-CCATAGCACT	1
-CCATAGGTTG	1
-CCATCAACCA	1
-CCATCAAGCC	1
-CCATCACACC	1
-CCATCACAGC	1
-CCATCACTGC	2
-CCATCAGTGT	2
-CCATCATCCG	1
-CCATCCAGTG	3
-CCATCCTCCT	1
-CCATCCTGAA	1
-CCATCCTGCC	1
-CCATCCTGGG	1
-CCATCCTTGT	2
-CCATCGAAAC	1
-CCATCGAGAC	1
-CCATCGCACT	2
-CCATCGGGTA	1
-CCATCGTCCT	9
-CCATCTTCCT	1
-CCATCTTGGA	1
-CCATCTTGGG	1
-CCATTAAAAA	1
-CCATTAAAAC	1
-CCATTACACG	1
-CCATTACACT	3
-CCATTACGCT	1
-CCATTAGACT	1
-CCATTATACC	1
-CCATTCCATT	1
-CCATTCCCCA	1
-CCATTCTCCT	8
-CCATTCTCTT	1
-CCATTCTTCT	2
-CCATTGAAAC	2
-CCATTGAACT	1
-CCATTGCAAT	1
-CCATTGCACC	1
-CCATTGCACT	106
-CCATTGCAGT	4
-CCATTGCATT	6
-CCATTGCCAC	1
-CCATTGCCCT	1
-CCATTGCGCT	3
-CCATTGCTCT	1
-CCATTGGACT	1
-CCATTGGTCA	1
-CCATTGGTGA	1
-CCATTGTACC	1
-CCATTGTACT	9
-CCATTTCTCC	1
-CCATTTCTGC	1
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-CCATTTGTCA	1
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-CCCAAACTTT	1
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-CCCAACCACA	1
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-CCCAACGTGG	1
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-CCCAAGGGTT	1
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-CCCAATCAAA	1
-CCCAATGATG	1
-CCCAATGCAA	1
-CCCAATGGTC	1
-CCCAATGTGT	1
-CCCAATTTTC	1
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-CCCACTCCCG	1
-CCCACTGACC	1
-CCCACTGCAC	1
-CCCACTGCCA	1
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-CCCAGAACCA	2
-CCCAGAAGGA	1
-CCCAGAATAC	1
-CCCAGAGACT	1
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-CCCAGATAAT	1
-CCCAGATGAT	3
-CCCAGATTTC	1
-CCCAGCAAAT	1
-CCCAGCAAGA	1
-CCCAGCCAAC	2
-CCCAGCCAAG	1
-CCCAGCCAAT	3
-CCCAGCCACA	2
-CCCAGCCACT	2
-CCCAGCCAGC	3
-CCCAGCCAGT	2
-CCCAGCCATT	1
-CCCAGCCCCA	1
-CCCAGCCCCT	1
-CCCAGCCGTG	1
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-CCCAGCCTAC	1
-CCCAGCCTAG	1
-CCCAGCCTAT	2
-CCCAGCCTCC	1
-CCCAGCCTCT	1
-CCCAGCCTGA	1
-CCCAGCCTGG	1
-CCCAGCCTTC	1
-CCCAGCCTTG	1
-CCCAGCGTCC	2
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-CCCAGCTGTC	1
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-CCCAGGCACC	1
-CCCAGGCAGT	1
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-CCCAGGGGCT	1
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-CCCAGTTAAT	3
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-CCCAGTTGTA	1
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-CCCATAGCCT	1
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-CCCATCAATA	1
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-CCCATCCGCA	1
-CCCATCCGGA	2
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-CCCATCGCCC	10
-CCCATCGCCT	1
-CCCATCGGCC	5
-CCCATCGGCT	1
-CCCATCGGTC	3
-CCCATCGTAC	1
-CCCATCGTCA	4
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-CCCATCGTCG	2
-CCCATCGTCT	7
-CCCATCGTGG	1
-CCCATCGTTC	6
-CCCATTAAGC	1
-CCCATTCACT	3
-CCCATTCCTC	2
-CCCATTCGGA	2
-CCCATTCGTC	2
-CCCATTGCAC	2
-CCCATTGTCC	7
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-CCCCACCCGC	1
-CCCCACCTAA	2
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-CCCCACTAAA	1
-CCCCACTGCA	1
-CCCCAGACCG	1
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-CCCCAGCCCC	2
-CCCCAGGAGA	2
-CCCCAGGCTC	1
-CCCCAGTCGC	1
-CCCCAGTCGG	1
-CCCCAGTGAG	1
-CCCCAGTGTA	1
-CCCCAGTTGC	24
-CCCCAGTTTC	1
-CCCCATACAT	1
-CCCCATAGAC	1
-CCCCATCGGC	1
-CCCCATCGTC	4
-CCCCATTAAG	1
-CCCCATTTCA	1
-CCCCCAAACT	2
-CCCCCAAGTC	1
-CCCCCAATGC	6
-CCCCCACCTA	15
-CCCCCACTTC	1
-CCCCCAGAGA	1
-CCCCCAGCAC	1
-CCCCCAGCTA	1
-CCCCCAGGAG	1
-CCCCCAGGCC	2
-CCCCCATTCC	1
-CCCCCCACAC	1
-CCCCCCACAG	1
-CCCCCCACTC	2
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-CCCCCCCTTT	1
-CCCCCCGGAG	1
-CCCCCCGTCG	1
-CCCCCCTTCT	2
-CCCCCGAACA	1
-CCCCCGAACG	1
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-CCCCCGACAG	1
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-CCCCCGCGGA	12
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-CCCCCTACAT	1
-CCCCCTCCGG	3
-CCCCCTCCTT	1
-CCCCCTCGTG	1
-CCCCCTGCCC	2
-CCCCCTGCCG	1
-CCCCCTGCTC	1
-CCCCCTGGAT	38
-CCCCCTTACT	1
-CCCCCTTGCA	2
-CCCCGAACAT	1
-CCCCGAATCC	1
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-CCCCGTACTC	2
-CCCCGTAGGT	1
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-CCCCGTATGG	2
-CCCCGTCATC	1
-CCCCGTCCAT	1
-CCCCGTCCGG	1
-CCCCGTCTCC	1
-CCCCGTGCAG	1
-CCCCGTGCAT	1
-CCCCTAAAAT	1
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-CCCTCCATTT	3
-CCCTCCCAGC	1
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-CCCTCCTCCC	1
-CCCTCCTCTC	1
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-CCCTCGCGGA	1
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-CCGCTGCCCT	1
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-CCGTCATCTT	1
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-CCTAAAGCCT	1
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-CCTAAGAATT	1
-CCTAAGCTAG	1
-CCTAAGGAGG	1
-CCTAAGGCAA	1
-CCTAAGGCTA	2
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-CCTAATAGGA	1
-CCTAATAGTT	1
-CCTAATGTGT	1
-CCTAATTAAG	1
-CCTACAATCC	1
-CCTACAGATA	1
-CCTACAGCTA	1
-CCTACAGTAT	1
-CCTACAGTCC	2
-CCTACATAGT	1
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-CCTACCTAAC	1
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-CCTACTCAGG	1
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-CCTACTTACT	1
-CCTACTTTGG	1
-CCTAGAGGGA	1
-CCTAGAGTAC	1
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-CCTAGCTGAT	1
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-CCTAGCTGTG	1
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-CCTAGGACCT	1
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-CCTAGGCCTT	1
-CCTAGGCTGG	2
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-CCTAGGTGGA	1
-CCTAGTAAAA	2
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-CCTAGTTGAT	1
-CCTAGTTTTG	1
-CCTATAACCC	1
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-CCTATAATCT	3
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-CCTATAATTC	2
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-CCTATATTCC	1
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-CCTATCGCTC	1
-CCTATCGTCC	3
-CCTATCTACT	1
-CCTATCTCTA	1
-CCTATGAATA	1
-CCTATGACCC	1
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-CCTATGCAGC	1
-CCTATGCGTT	1
-CCTATGTAAG	2
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-CCTATGTCCC	1
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-CCTATTCACA	1
-CCTATTCTCC	1
-CCTATTCTGC	1
-CCTATTGTTT	1
-CCTATTTACC	1
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-CCTCACTGAG	1
-CCTCACTTTC	1
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-CCTCAGGCTC	1
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-CCTCATTCTG	1
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-CCTCCAGGTT	1
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-CCTCCAGTTA	1
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-CCTCCCCCGT	3
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-CCTCCCGCCC	1
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-CCTCCCTCCC	1
-CCTCCCTCTC	1
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-CCTCCTATCT	1
-CCTCCTCCCT	1
-CCTCCTCCGA	1
-CCTCCTCCTG	2
-CCTCCTCTGA	1
-CCTCCTCTGC	1
-CCTCCTCTGG	1
-CCTCCTGCCC	3
-CCTCCTGGAT	1
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-CCTCCTTTCT	1
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-CCTCGCTCAT	1
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-CCTCGGAAGA	1
-CCTCGGAATG	1
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-CCTCGTATGA	1
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-CCTCTCGACC	1
-CCTCTCTACT	1
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-CCTCTGGAGG	4
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-CCTCTGGGGT	2
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-CCTCTGGTCT	1
-CCTCTGGTGT	1
-CCTCTGTAAG	1
-CCTCTGTAAT	1
-CCTCTGTACT	2
-CCTCTGTCTC	1
-CCTCTGTGTG	1
-CCTCTTCAGG	3
-CCTCTTGGCC	1
-CCTCTTGGGA	1
-CCTCTTTCCA	1
-CCTGAAACAT	1
-CCTGAAACCC	1
-CCTGAAAGGC	1
-CCTGAAATCC	3
-CCTGAAATCG	1
-CCTGAAATTT	4
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-CCTGAACCCA	1
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-CCTGAAGAAG	3
-CCTGAAGCCC	1
-CCTGAAGTCC	1
-CCTGAATCCC	1
-CCTGAATCTG	1
-CCTGACCAGA	1
-CCTGACCCCG	1
-CCTGACCTAA	1
-CCTGACGGAT	1
-CCTGACGGCA	1
-CCTGACTGCA	1
-CCTGACTGGT	1
-CCTGAGAAAG	1
-CCTGAGAAGA	1
-CCTGAGAATT	1
-CCTGAGACGT	1
-CCTGAGACTA	1
-CCTGAGACTT	1
-CCTGAGATAG	1
-CCTGAGCCCG	8
-CCTGAGCTTG	1
-CCTGAGGATA	1
-CCTGAGGCCC	1
-CCTGAGGGCA	2
-CCTGAGGGTA	3
-CCTGAGGTCA	1
-CCTGAGTAAG	1
-CCTGAGTCCT	1
-CCTGAGTGCA	1
-CCTGATAATT	1
-CCTGATGAAG	2
-CCTGATGAGC	1
-CCTGATGATT	1
-CCTGATGGCA	1
-CCTGATGTAG	1
-CCTGCAACCC	1
-CCTGCAATCA	1
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-CCTGCAATTC	1
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-CCTGCAGAGA	1
-CCTGCAGTAC	1
-CCTGCAGTCA	1
-CCTGCAGTCC	7
-CCTGCAGTCT	2
-CCTGCAGTGT	1
-CCTGCAGTTC	2
-CCTGCCAAAG	2
-CCTGCCACCA	1
-CCTGCCATCC	1
-CCTGCCATCT	1
-CCTGCCCACC	2
-CCTGCCCCAT	1
-CCTGCCCCCA	1
-CCTGCCCCCC	4
-CCTGCCCCTT	3
-CCTGCCCTCC	1
-CCTGCCCTGC	1
-CCTGCCCTTC	1
-CCTGCCGCAG	1
-CCTGCCGTCG	3
-CCTGCCTAGG	1
-CCTGCCTCTT	1
-CCTGCCTGTA	1
-CCTGCCTTTT	1
-CCTGCGCCAC	1
-CCTGCGGAAC	1
-CCTGCGGACT	1
-CCTGCTCAGC	1
-CCTGCTCCCT	4
-CCTGCTCTAT	1
-CCTGCTGCAG	9
-CCTGCTGCCG	1
-CCTGCTGCTA	1
-CCTGCTGGGG	1
-CCTGCTGTGA	1
-CCTGCTTGCA	1
-CCTGCTTGTC	5
-CCTGCTTTAC	1
-CCTGGAAACC	1
-CCTGGAACCC	1
-CCTGGAAGAA	1
-CCTGGAAGAG	16
-CCTGGAATCC	2
-CCTGGAATGA	3
-CCTGGAATGT	1
-CCTGGACGGA	1
-CCTGGACTGC	1
-CCTGGAGAGG	1
-CCTGGAGCAA	1
-CCTGGAGCGC	3
-CCTGGAGGCC	1
-CCTGGAGGGG	1
-CCTGGAGTCC	3
-CCTGGAGTGG	2
-CCTGGAGTTT	1
-CCTGGATAAC	1
-CCTGGATCCT	1
-CCTGGATTCT	1
-CCTGGCAAAG	1
-CCTGGCAGGA	1
-CCTGGCAGTT	6
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-CCTGGCCTGT	2
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-CCTGGCTAGT	1
-CCTGGCTATT	1
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-CCTGGCTGTA	3
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-CCTGGTCAAG	1
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-CCTGTAATAT	2
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-CCTGTACTTC	1
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-CCTGTAGAGG	1
-CCTGTAGCCC	5
-CCTGTAGCCT	2
-CCTGTAGCTA	1
-CCTGTAGTAC	3
-CCTGTAGTCA	1
-CCTGTAGTCC	89
-CCTGTAGTCG	2
-CCTGTAGTCT	11
-CCTGTAGTGC	3
-CCTGTAGTTC	8
-CCTGTATCAA	2
-CCTGTATCCC	3
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-CCTGTATCTG	1
-CCTGTATGAA	1
-CCTGTATTCC	5
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-CCTGTGATCG	3
-CCTGTGATCT	1
-CCTGTGATTC	3
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-CCTGTGCACT	2
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-CCTGTGCCTG	1
-CCTGTGCGTC	1
-CCTGTGGGCC	1
-CCTGTGGTCC	35
-CCTGTGGTCT	1
-CCTGTGGTTC	6
-CCTGTGGTTT	1
-CCTGTGTCCC	1
-CCTGTGTGCA	2
-CCTGTGTGTG	4
-CCTGTGTGTT	1
-CCTGTGTTCC	1
-CCTGTGTTCT	1
-CCTGTGTTGG	5
-CCTGTGTTGT	1
-CCTGTTAACC	1
-CCTGTTACCC	1
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-CCTGTTGCAC	1
-CCTGTTGTCC	2
-CCTGTTTCCC	1
-CCTTAAAAAA	1
-CCTTAAACAA	1
-CCTTAATCCC	1
-CCTTACCCAG	2
-CCTTACCTTG	1
-CCTTACTCTT	1
-CCTTACTTGA	1
-CCTTACTTTA	1
-CCTTAGAAGT	2
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-CCTTAGGATA	1
-CCTTAGTGGA	1
-CCTTAGTTCT	1
-CCTTAGTTTC	1
-CCTTAGTTTT	2
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-CCTTTTTTAG	1
-CCTTTTTTTC	1
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-CGAAGGTGTG	1
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-CGACCACGGG	1
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-CGACCGTACA	1
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-CGACGAGGGC	1
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-CGACGTCCTG	1
-CGACTGCATT	1
-CGACTGGGCT	1
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-CGCACGTGGG	1
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-CGCAGGGACG	1
-CGCAGGGCCA	1
-CGCAGGTAAA	1
-CGCAGTGTCC	6
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-CGCATCGTAC	1
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-CGCATTCACA	1
-CGCCACCACA	1
-CGCCACCACG	1
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-CGCCAGACCA	1
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-CGCCCAGCTA	1
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-CGCCCCCACA	1
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-CGCCTATTAA	1
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-CGCCTGGGTT	1
-CGCCTGTAAA	1
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-CGCCTTGTGA	1
-CGCCTTTACT	1
-CGCCTTTCGT	1
-CGCGACCACG	1
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-CGCGAGCACC	1
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-CGCGATGGCC	1
-CGCGCACCCG	1
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-CGCGCTAACC	1
-CGCGCTGTGG	1
-CGCGCTTCGA	1
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-CGCGGGCGTG	1
-CGCGGTGGCT	1
-CGCGTAACTA	1
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-CGCGTCCGCA	1
-CGCGTGCACA	8
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-CGGCAGCTGC	1
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-CGGCGATTCT	1
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-CGGCTGAATT	3
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-CGGGAACTTC	1
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-CGGGAGAGCT	1
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-CGGGAGCTGG	1
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-CGGGATATAG	1
-CGGGATGCAG	1
-CGGGATTCCT	3
-CGGGCACCCC	1
-CGGGCAGAAA	1
-CGGGCATAGC	1
-CGGGCCGTGC	3
-CGGGCCTCAG	1
-CGGGCTAAGG	1
-CGGGGAAGAG	1
-CGGGGAAGGA	1
-CGGGGCCGCA	1
-CGGGGCGCGG	1
-CGGGGGAAAG	1
-CGGGGTACCC	1
-CGGGGTGAAG	1
-CGGGTAGTAT	1
-CGGGTGGGCT	1
-CGGTAAGTAT	1
-CGGTACAGGG	1
-CGGTAGACAT	1
-CGGTCACCTA	1
-CGGTCAGATG	1
-CGGTCAGGAG	1
-CGGTCCCATT	1
-CGGTCCTCAA	1
-CGGTCCTCCT	1
-CGGTCGGGCA	1
-CGGTCGTGGG	1
-CGGTGACATT	1
-CGGTGAGTTT	1
-CGGTGGATGC	1
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-CGGTGGGACC	3
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-CGGTGTCCAA	1
-CGGTGTCCCA	1
-CGGTGTGAGG	1
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-CGTACATATA	1
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-CGTATAGCAC	1
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-CGTATTAGCG	1
-CGTATTATTC	1
-CGTATTTTAG	1
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-CGTCAGAATA	1
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-CGTCCTGGTA	1
-CGTCCTTCCT	1
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-CGTCGCTGGG	1
-CGTCTATCCA	1
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-CGTCTCCACA	1
-CGTCTGTAAG	2
-CGTCTGTGGT	1
-CGTCTTCTCT	1
-CGTCTTTATC	1
-CGTCTTTCGT	1
-CGTGAAAAAA	1
-CGTGAATGCA	1
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-CGTGACCCCT	1
-CGTGACCTGG	1
-CGTGAGGGAA	1
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-CGTGGCCTTT	1
-CGTGGCTCAG	1
-CGTGGGAAAC	1
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-CGTGGGGTGG	2
-CGTGGGTGGG	1
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-CGTGGTGCCG	1
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-CGTGTAGTCC	1
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-CGTGTGCCTG	7
-CGTGTGGGCT	1
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-CGTGTGTGCT	1
-CGTGTGTGTG	1
-CGTGTTAATG	3
-CGTGTTGTTC	3
-CGTTAAAACT	1
-CGTTAAACTG	1
-CGTTACTGCT	1
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-CGTTCAGGAC	1
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-CTAAAAACCA	1
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-CTAAAACTTC	2
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-CTAAAAGGTC	1
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-CTAAACATCT	1
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-CTAAATATTC	1
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-CTAACCAGCA	1
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-CTAACGAGCT	1
-CTAACGCAGC	1
-CTAACGGGGC	1
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-CTAACTGCTT	1
-CTAACTGTGG	1
-CTAACTTCAA	1
-CTAACTTTGT	1
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-CTAAGAATTC	2
-CTAAGACATC	1
-CTAAGACCTC	2
-CTAAGACTCC	2
-CTAAGACTTC	249
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-CTAAGATTAT	1
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-CTAAGCACTG	1
-CTAAGCGAGG	1
-CTAAGCTTCT	1
-CTAAGGCGAG	44
-CTAAGGCTTC	2
-CTAAGGCTTT	1
-CTAAGGGCGA	1
-CTAAGGGGGA	1
-CTAAGTCAAG	1
-CTAAGTTTAA	1
-CTAATAAATG	3
-CTAATAATAG	1
-CTAATACAAG	1
-CTAATACTTG	1
-CTAATATTGG	1
-CTAATGCAAA	1
-CTAATGCGAA	1
-CTAATGTGAA	1
-CTAATTACAA	1
-CTAATTCAGA	1
-CTAATTCTCG	1
-CTACAAAAAG	3
-CTACAAGATT	1
-CTACAATCAG	1
-CTACAATTTT	2
-CTACACACGA	1
-CTACACCAGT	2
-CTACAGAGCA	1
-CTACAGCACG	1
-CTACAGCCAG	1
-CTACAGTGTC	1
-CTACATAGGC	1
-CTACCAACAA	1
-CTACCAATGA	1
-CTACCACACC	1
-CTACCACGCC	2
-CTACCAGCAC	3
-CTACCCAACA	3
-CTACCCACTA	1
-CTACCCGGTT	1
-CTACCCTGTT	1
-CTACCCTTTC	2
-CTACCGCACT	1
-CTACCTCTGA	1
-CTACCTGACT	1
-CTACGAAAAG	1
-CTACGAAGAC	1
-CTACGAGTGA	1
-CTACGCTCAA	1
-CTACGGTCGT	1
-CTACGTTTTC	1
-CTACTCAGAA	1
-CTACTCGGGA	1
-CTACTCTTCT	1
-CTACTCTTTG	1
-CTACTGACTC	1
-CTACTGCACT	13
-CTACTGCCAA	1
-CTACTGGAGA	2
-CTACTGTACT	2
-CTACTGTCTA	1
-CTACTGTGAG	1
-CTACTGTTGG	1
-CTACTTAATA	1
-CTACTTATCA	1
-CTACTTCACT	1
-CTACTTCCTT	1
-CTACTTGCGA	1
-CTACTTGGGA	1
-CTACTTTTAG	2
-CTACTTTTTA	1
-CTAGAAAAAA	1
-CTAGAAAAGA	1
-CTAGAAAGAG	3
-CTAGAAATCC	1
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-CTAGAAGTTT	1
-CTAGAATGGA	1
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-CTAGACTATT	1
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-CTAGAGCTGA	1
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-CTAGCAGAGC	2
-CTAGCATCCC	1
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-CTAGCCTTAC	1
-CTAGCGCGCG	1
-CTAGCTCAGT	1
-CTAGCTGCCT	2
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-CTAGGACTTC	1
-CTAGGCAAGC	2
-CTAGGCATTC	1
-CTAGGCTTAA	1
-CTAGGCTTCA	1
-CTAGGGAAAG	1
-CTAGGGACAG	1
-CTAGGGGCAA	1
-CTAGGTTTAT	1
-CTAGTCAGCT	1
-CTAGTCAGTT	1
-CTAGTCTACC	1
-CTAGTCTCAG	1
-CTAGTGAAAC	1
-CTAGTGCACA	1
-CTAGTGGATG	1
-CTAGTGTGGT	1
-CTAGTGTTAT	1
-CTATAAATGT	1
-CTATAACTGA	1
-CTATAAGTAT	1
-CTATAATAAA	1
-CTATAATCCC	1
-CTATACAAAC	1
-CTATAGGAGA	1
-CTATAGTTAC	1
-CTATATGTAA	1
-CTATATTTTT	1
-CTATCAGAAA	1
-CTATCAGTCT	3
-CTATCAGTTT	3
-CTATCATAAT	1
-CTATCCATTA	1
-CTATCCTCAC	1
-CTATCTATCT	1
-CTATCTCCTG	1
-CTATCTCTGT	1
-CTATCTCTTC	1
-CTATCTGTTC	1
-CTATCTTGCC	1
-CTATCTTTTC	1
-CTATGAAGCT	1
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-CTATGATGTC	1
-CTATGCACTT	1
-CTATGCAGTA	1
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-CTATGGCTTC	1
-CTATGGGAGG	1
-CTATGGTGTT	1
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-CTATGTATCA	1
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-CTATGTGTTA	1
-CTATGTTACA	1
-CTATGTTGCC	1
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-CTATTAAGAA	1
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-CTATTCCTAG	1
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-CTATTGCCCG	1
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-CTCAAAGCTT	1
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-CTCAACAGCA	4
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-CTCAACATAT	2
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-CTCAACATTG	1
-CTCAACCCCC	6
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-CTCAAGCTCT	1
-CTCAAGGATT	1
-CTCAAGGGTT	1
-CTCAAGTTGA	1
-CTCAAGTTTG	1
-CTCAATAAAA	1
-CTCAATAAAT	1
-CTCAATACTC	1
-CTCAATGCTC	1
-CTCACAAGAG	1
-CTCACAAGGA	1
-CTCACACATT	10
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-CTCACACTTC	1
-CTCACCTGCA	1
-CTCACGCCTG	1
-CTCACTAAAC	1
-CTCACTAGTG	2
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-CTCACTTTAT	1
-CTCACTTTTT	1
-CTCAGAACTG	1
-CTCAGACAGA	1
-CTCAGACAGT	5
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-CTCAGAGTTT	1
-CTCAGATTCA	1
-CTCAGATTTG	1
-CTCAGCAATG	3
-CTCAGCACGT	1
-CTCAGCAGAT	2
-CTCAGCATCA	2
-CTCAGCCAAT	1
-CTCAGCCACC	1
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-CTCAGCTCTT	1
-CTCAGCTGGA	1
-CTCAGGAAAT	5
-CTCAGGATTC	2
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-CTCAGGTTCT	1
-CTCAGTACTT	1
-CTCAGTCAGT	1
-CTCAGTCCCC	2
-CTCAGTGACT	1
-CTCAGTTAAG	1
-CTCATAAAAA	3
-CTCATAAATG	1
-CTCATAAGAA	2
-CTCATAAGGA	111
-CTCATACACC	1
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-CTCATACTCC	1
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-CTCATAGGGA	1
-CTCATATGGA	1
-CTCATATTGA	1
-CTCATCAATC	1
-CTCATCAGCT	3
-CTCATCCCCG	2
-CTCATCCTTT	1
-CTCATCGTCC	1
-CTCATCTGCT	2
-CTCATTAAGA	1
-CTCATTAAGG	1
-CTCATTATGA	1
-CTCATTCACC	1
-CTCATTCAGC	2
-CTCATTCCCC	1
-CTCATTCCTA	1
-CTCATTCCTT	1
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-CTCATTGCTG	1
-CTCATTGTAG	1
-CTCATTTATG	1
-CTCATTTCAG	1
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-CTCCAAAAAA	4
-CTCCAAACTA	1
-CTCCAAATCC	1
-CTCCAACCGG	1
-CTCCAACCTG	1
-CTCCAATAAA	2
-CTCCACAAAT	2
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-CTGGCCTTCT	1
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-CTGGCGCCGA	1
-CTGGCGCGAG	1
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-CTGGCGGGTG	1
-CTGGCGTGTG	1
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-CTGGCTACTA	1
-CTGGCTAGGC	1
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-CTGGCTGCTT	1
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-CTGGCTTCTT	1
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-CTGGCTTGGT	1
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-CTGGGACTGA	2
-CTGGGACTGC	1
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-CTGGGATTGC	1
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-CTGGGTTATT	1
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-CTGGTCCTCC	3
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-CTGGTCTAGG	5
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-CTGGTCTTAA	1
-CTGGTCTTGA	1
-CTGGTGAACT	1
-CTGGTGACTC	1
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-CTGGTGATGG	2
-CTGGTGCATA	1
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-CTTTTTTTTC	1
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-GAACACCATT	1
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-GAACCCTACT	1
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-GAACCTACTG	1
-GAACCTGACA	1
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-GAACCTGGAT	1
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-GAACGCCTAC	1
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-GAACGGGATG	2
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-GAACGTCTTA	3
-GAACTAGAAG	1
-GAACTCAATG	2
-GAACTCAGGC	4
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-GAACTCTGGT	1
-GAACTGAATA	1
-GAACTGACTT	2
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-GAACTGGATT	1
-GAACTGGTTT	1
-GAACTGTGAG	1
-GAACTTAACA	1
-GAACTTAATT	1
-GAACTTATTA	1
-GAACTTCTCT	1
-GAACTTGTCT	1
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-GAAGCTTTGT	1
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-GAAGGACTGG	1
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-GAAGGCATCT	2
-GAAGGCCTCA	1
-GAAGGCCTCT	1
-GAAGGCGTGT	1
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-GAAGGCTGAG	1
-GAAGGCTGTC	1
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-GAAGGGCAGA	1
-GAAGGGCTGG	1
-GAAGGGCTTT	1
-GAAGGGGATG	1
-GAAGGGGCCC	1
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-GAAGGGTTTT	1
-GAAGGTGCTG	1
-GAAGGTGTGC	1
-GAAGGTTCTC	1
-GAAGGTTGTG	2
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-GAAGTACAGT	1
-GAAGTACCTA	1
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-GAAGTGGCTT	1
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-GAAGTGGGGG	1
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-GAAGTGGTGG	1
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-GAAGTTGCAG	1
-GAAGTTGCCT	1
-GAAGTTGCTG	1
-GAAGTTGGAA	1
-GAAGTTTTAC	3
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-GAATAATAGG	1
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-GAATACGACT	1
-GAATACTGAA	1
-GAATACTTGT	1
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-GAATAGTGTG	1
-GAATATACAC	1
-GAATATAGGC	2
-GAATATCCTA	1
-GAATATCCTG	1
-GAATATCTTC	1
-GAATATCTTT	1
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-GAATATTCAA	1
-GAATATTTTT	1
-GAATCAACAA	1
-GAATCAATTT	1
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-GAATCACCCT	1
-GAATCACTGC	1
-GAATCATACT	1
-GAATCATTTT	1
-GAATCCAACT	7
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-GAATCGAAGT	1
-GAATCGGTTA	3
-GAATCGTCAG	1
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-GAATCTCATC	1
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-GAATCTGATA	1
-GAATCTGATG	1
-GAATCTGTGC	2
-GAATGAACTG	1
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-GAATGCACTT	1
-GAATGCAGTT	2
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-GAATGGAATA	1
-GAATGGCTTG	1
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-GAATGGGCTG	6
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-GAATGTAAGT	3
-GAATGTATCT	1
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-GAATGTTATT	1
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-GAATGTTCTT	1
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-GAATTCCTCG	2
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-GACAGGGGCC	1
-GACAGGTCAT	1
-GACAGTCACT	1
-GACAGTCAGA	1
-GACAGTCGGT	5
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-GACAGTGACG	2
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-GACAGTGTGG	4
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-GACATACAGA	1
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-GACATATGTA	3
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-GACCAATCAG	1
-GACCACACCG	1
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-GACCACGGCG	2
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-GACCACTCTT	1
-GACCACTGTT	1
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-GCTTGGATCT	2
-GCTTGGCTCC	3
-GCTTGGCTGG	1
-GCTTGGGATG	1
-GCTTGGTACT	1
-GCTTGTACCT	1
-GCTTGTAGCC	1
-GCTTGTGCCT	1
-GCTTGTGCTT	1
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-GGACCAAAGT	1
-GGACCAATTT	1
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-GGACCACCGA	1
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-GGACCCACAA	1
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-GGACTAAATG	1
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-GGACTGCGCC	1
-GGACTGGCCC	1
-GGACTGTAGT	1
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-GGACTTAGAG	1
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-GGAGAAAATG	1
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-GGAGAACCTA	1
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-GGAGAATAAA	1
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-GGAGGTGGAG	4
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-GGAGGTGTAG	1
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-GGAGTCAGTG	1
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-GGATACAAAT	1
-GGATACAACC	2
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-GGATACTAAT	1
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-GGATAGCTGC	1
-GGATAGGGAA	4
-GGATAGTACA	1
-GGATATAGTC	1
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-GGATCAAGCA	1
-GGATCACCAG	1
-GGATCAGGAA	1
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-GGATCATTTG	1
-GGATCCAAGT	1
-GGATCCAGTA	1
-GGATCCCAAG	1
-GGATCCTAGT	1
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-GGATCGCTTG	1
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-GGATCTGCTG	1
-GGATCTGGCC	1
-GGATCTGTGC	1
-GGATCTTCAT	1
-GGATGAGAAC	1
-GGATGAGTAC	1
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-GGATGGCGGC	1
-GGATGGCTTA	1
-GGATGGGCCA	1
-GGATGGTGAG	1
-GGATGTAAAC	1
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-GGATGTATTG	1
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-GGATGTCATC	1
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-GGATGTGGAG	1
-GGATTAAAGA	1
-GGATTAAGAG	1
-GGATTACAGG	1
-GGATTACTTG	1
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-GGATTATACA	1
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-GGATTGTATG	1
-GGATTGTCTG	11
-GGATTTCACT	1
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-GGATTTGTCC	1
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-GGATTTTGTA	1
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-GGATTTTTGA	1
-GGATTTTTTT	1
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-GGCAAAGACC	1
-GGCAAAGACT	2
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-GGCAACAACA	1
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-GGCAACATAA	1
-GGCAACCAGA	1
-GGCAACCGCG	1
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-GGCAACGGGA	1
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-GGCAAGAAGA	7
-GGCAAGAAGC	1
-GGCAAGAATA	1
-GGCAAGAGAA	1
-GGCAAGAGAC	1
-GGCAAGCAGA	1
-GGCAAGCCCA	1
-GGCAAGCCCC	46
-GGCAAGCCCT	1
-GGCAAGCCGC	1
-GGCAAGGACT	1
-GGCAAGGCCC	1
-GGCAAGGGCT	1
-GGCAAGGGGG	6
-GGCAAGTGAT	1
-GGCAAGTGTC	1
-GGCAAGTTAC	1
-GGCAATATAG	1
-GGCAATATGG	1
-GGCAATCTGA	1
-GGCAATGTGG	2
-GGCAATTCAA	2
-GGCAATTGGC	2
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-GGCACAATCA	1
-GGCACACCTT	2
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-GGCACAGAGA	1
-GGCACAGAGT	1
-GGCACAGTAA	3
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-GGCACAGTTG	1
-GGCACATACA	1
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-GGCACGCTGA	1
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-GGCACTGAAT	1
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-GGCAGCAGCA	1
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-GGCAGCCCTG	1
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-GGCAGCGCCC	1
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-GGCAGCTGTC	1
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-GGCAGGAGGA	1
-GGCAGGAGTA	1
-GGCAGGATCA	1
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-GGCAGGCACC	1
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-GGCAGGCGGG	3
-GGCAGGGAAG	1
-GGCAGGGCCT	1
-GGCAGGGCGA	1
-GGCAGGGGGT	1
-GGCAGGGTAC	1
-GGCAGGTGGT	1
-GGCAGTGCCC	1
-GGCAGTGTAG	1
-GGCAGTTTCT	1
-GGCATACACT	1
-GGCATAGCCC	1
-GGCATATCCT	1
-GGCATATGCC	1
-GGCATCAGAG	1
-GGCATCAGGA	1
-GGCATCAGGG	2
-GGCATCATCG	1
-GGCATCCTGC	1
-GGCATCTATT	1
-GGCATCTCTC	1
-GGCATTAGGG	1
-GGCATTCTTA	1
-GGCATTGAAG	1
-GGCATTGAGA	1
-GGCATTGCTG	2
-GGCATTGTTC	3
-GGCATTTGAC	1
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-GGCATTTTGT	1
-GGCATTTTTC	4
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-GGCCAAAAGC	1
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-GGCCAAAGAG	1
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-GGCCAAGCCT	1
-GGCCAATAAG	1
-GGCCAATGGA	1
-GGCCACCAAA	1
-GGCCACCAGC	1
-GGCCACGTAG	1
-GGCCACTAAA	1
-GGCCACTCTA	5
-GGCCACTGCA	1
-GGCCACTGCT	1
-GGCCACTGTT	1
-GGCCAGAAGC	1
-GGCCAGACCT	3
-GGCCAGAGGA	1
-GGCCAGCAAG	1
-GGCCAGCCCT	6
-GGCCAGCCTT	1
-GGCCAGGAAG	3
-GGCCAGGAGA	1
-GGCCAGGAGG	1
-GGCCAGGCAC	1
-GGCCAGGCGC	1
-GGCCAGGTAT	2
-GGCCAGGTGG	5
-GGCCAGTAAC	1
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-GGCCAGTGGC	1
-GGCCAGTGTT	2
-GGCCATAAAG	1
-GGCCATCCAA	1
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-GGCCCACACC	6
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-GGCCCACTGA	2
-GGCCCACTGG	1
-GGCCCAGAGC	2
-GGCCCAGGAC	1
-GGCCCAGGCC	1
-GGCCCAGGGA	2
-GGCCCAGGGG	1
-GGCCCATATG	3
-GGCCCCATTG	2
-GGCCCCATTT	1
-GGCCCCCTAA	2
-GGCCCCGGAC	5
-GGCCCCTCCC	1
-GGCCCGAGTT	1
-GGCCCGCTCA	1
-GGCCCGGCTT	3
-GGCCCGGTCA	5
-GGCCCGTACA	1
-GGCCCTACAG	1
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-GGCCCTCTGA	1
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-GGCCCTGCAG	1
-GGCCCTGCTA	1
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-GGCCCTTGCC	2
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-GGCCGCCGCT	1
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-GGCCGCTGCT	2
-GGCCGGGCCC	1
-GGCCGGGGGC	4
-GGCCGGGTGC	1
-GGCCGGTTCC	1
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-GGCCTAGGCA	1
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-GGCCTATGAG	1
-GGCCTCAACC	1
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-GGCCTCCCAG	1
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-GGCCTCGCAG	1
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-GGCCTCTCAA	1
-GGCCTCTCTT	1
-GGCCTCTGAG	3
-GGCCTCTGAT	1
-GGCCTCTGGA	1
-GGCCTGAACC	1
-GGCCTGCAGG	4
-GGCCTGCTGC	5
-GGCCTGGAAG	1
-GGCCTGGATG	1
-GGCCTGGCCA	1
-GGCCTGGGAG	1
-GGCCTGGGGA	1
-GGCCTGGGGG	1
-GGCCTGTAAT	1
-GGCCTTAACC	1
-GGCCTTACCC	1
-GGCCTTCCTT	2
-GGCCTTCTCT	1
-GGCCTTCTGC	1
-GGCCTTGGGA	1
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-GGCCTTTTTT	3
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-GGCGACACAG	1
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-GGCGATGTCT	1
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-GGCGCTTTTC	1
-GGCGGAAGAT	1
-GGCGGCCTGG	1
-GGCGGCGGAG	1
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-GGCGGGTCGG	1
-GGCGGTAACT	1
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-GGCGTTGTCT	1
-GGCGTTGTGT	1
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-GGCTACGCCT	1
-GGCTACGGTA	1
-GGCTACTCAC	1
-GGCTAGAATC	2
-GGCTAGTACT	1
-GGCTATAGGC	1
-GGCTATAGGG	3
-GGCTATATGG	1
-GGCTATGACA	1
-GGCTATGCCA	4
-GGCTCAAAAC	1
-GGCTCAAGCC	1
-GGCTCAAGCT	1
-GGCTCAAGTG	1
-GGCTCACACC	1
-GGCTCAGAGG	1
-GGCTCAGCAC	1
-GGCTCAGGGC	1
-GGCTCAGGGG	1
-GGCTCCACAG	3
-GGCTCCACCC	1
-GGCTCCACGG	1
-GGCTCCCAAG	2
-GGCTCCCACT	15
-GGCTCCTACC	1
-GGCTCCTCAC	1
-GGCTCCTCCT	1
-GGCTCCTCGA	9
-GGCTCCTGGC	11
-GGCTCCTGGG	1
-GGCTCCTGTA	2
-GGCTCGCCAG	1
-GGCTCGGGAT	5
-GGCTCTACGG	1
-GGCTCTAGGC	1
-GGCTCTAGGG	4
-GGCTCTAGGT	1
-GGCTCTGCTC	1
-GGCTCTGGAA	1
-GGCTCTGGGA	1
-GGCTCTGTCA	1
-GGCTCTTTTC	1
-GGCTGAACCA	1
-GGCTGAAGGG	2
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-GGCTGACCCC	1
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-GGCTGAGCTC	5
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-GGCTGAGGGC	1
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-GGCTGATACT	1
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-GGCTGATTAT	1
-GGCTGATTTT	2
-GGCTGCACCG	1
-GGCTGCAGGT	1
-GGCTGCAGTC	1
-GGCTGCATAC	1
-GGCTGCCACT	2
-GGCTGCCCTG	4
-GGCTGCCTGC	2
-GGCTGCGCAG	1
-GGCTGCTCTA	1
-GGCTGCTGCA	1
-GGCTGCTGGA	1
-GGCTGCTGGC	1
-GGCTGCTTCT	1
-GGCTGGAGAC	1
-GGCTGGGCAC	1
-GGCTGGGCCT	8
-GGCTGGGCGC	1
-GGCTGGGCTC	1
-GGCTGGGGGC	26
-GGCTGGGGGG	1
-GGCTGGGTCT	1
-GGCTGGGTTT	5
-GGCTGGTCAC	3
-GGCTGGTCCC	1
-GGCTGGTCTC	2
-GGCTGGTTAA	1
-GGCTGTAAGT	2
-GGCTGTACCC	6
-GGCTGTACTC	1
-GGCTGTCCCC	1
-GGCTGTGACG	3
-GGCTGTGGCG	1
-GGCTTAAGGG	1
-GGCTTAGGGA	1
-GGCTTAGTGA	3
-GGCTTCACGG	1
-GGCTTCAGTG	1
-GGCTTCCAGG	1
-GGCTTCCATC	1
-GGCTTCCCAA	2
-GGCTTCCTGC	1
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-GGGTCAGCTG	1
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-GGGTCAGGGG	5
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-GGGTCCTTGA	1
-GGGTCGGGAA	1
-GGGTCGGGAG	1
-GGGTCGGTCC	1
-GGGTCTAGAA	1
-GGGTCTCCAG	1
-GGGTCTCCTG	2
-GGGTCTCGTA	1
-GGGTCTGCAG	1
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-GGGTCTGTGA	2
-GGGTCTTTTT	1
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-GGGTGCTTGG	4
-GGGTGGACTC	1
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-GGTAAGTAGT	1
-GGTAATCAGA	1
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-GGTAGGAAGG	1
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-GGTAGTAAGG	1
-GGTAGTACAG	1
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-GGTATTATAA	1
-GGTATTTATA	2
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-GGTCAACTGT	1
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-GGTCAATTAA	1
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-GGTCACATTT	1
-GGTCACCGAA	1
-GGTCACTGCA	1
-GGTCACTGCT	1
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-GGTCAGCCTT	1
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-GGTCAGTCGG	75
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-GGTCTCCTGC	1
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-GGTCTTGCCT	1
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-GGTGAACACT	1
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-GGTGAAGGTA	1
-GGTGAATAGA	1
-GGTGAATTGT	1
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-GGTGACTATC	1
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-GTAACGGGCG	1
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-GTAACTTGGT	1
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-GTAAGACCCC	1
-GTAAGACCCT	2
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-GTAAGAGAAA	1
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-GTAAGATATG	1
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-GTAAGATTTA	1
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-GTAAGCCGTG	1
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-GTAATCTCTT	1
-GTAATCTGCT	1
-GTAATCTTCT	1
-GTAATCTTGC	3
-GTAATGAAGC	3
-GTAATGAATG	1
-GTAATGGGGT	1
-GTAATGGGTA	1
-GTAATGTTAA	1
-GTAATGTTCT	1
-GTAATGTTTT	1
-GTAATTTCCA	1
-GTAATTTTAA	1
-GTAATTTTGG	1
-GTACAAAAAT	1
-GTACAAAATT	1
-GTACAACGCC	1
-GTACAAGATG	1
-GTACACAAGT	1
-GTACACACAC	2
-GTACACCCCC	1
-GTACACCCGG	1
-GTACACCTGT	1
-GTACACTATA	1
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-GTACAGAAGG	1
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-GTCTTTTCTG	1
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-GTGAACATCC	1
-GTGAACCACG	1
-GTGAACCCAC	1
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-GTGAACCCTG	7
-GTGAACCCTT	3
-GTGAACCGGG	1
-GTGAACCTCC	1
-GTGAACCTGG	1
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-GTGAACTGGC	1
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-GTGAAGCTCT	1
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-GTGAATCCCT	2
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-GTGACAAGAA	1
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-GTGACACCGC	1
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-GTGACACGGT	1
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-GTGACCAAGG	1
-GTGACCACAA	1
-GTGACCACAG	4
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-GTGACCACTG	1
-GTGACCAGCA	1
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-GTGACCCCCC	1
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-GTGACCGCGG	4
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-GTGACCTTGT	1
-GTGACGCCCC	1
-GTGACGCCGT	1
-GTGACGCTGG	1
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-GTGACGGGTG	1
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-GTGAGACCAT	1
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-GTGAGACCTT	1
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-GTGAGATCCT	2
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-GTGAGCACGG	1
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-TGAGGCAGGG	1
-TGAGGCCAGG	6
-TGAGGCCTCT	5
-TGAGGGAATA	31
-TGAGGGAGCC	1
-TGAGGGAGGG	2
-TGAGGGATAA	1
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-TGAGGGATGG	1
-TGAGGGCAGA	2
-TGAGGGCTGG	1
-TGAGGGGAAG	1
-TGAGGGGCAG	1
-TGAGGGGTAA	1
-TGAGGGGTGA	3
-TGAGGGGTGG	1
-TGAGGGTTAG	1
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-TGCAATAGGT	1
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-TGCCTGCAGT	1
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-TGCGGAGGCC	1
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-TGCGGCTGGG	1
-TGCGGCTGGT	3
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-TGCGTTGAGA	1
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-TGCTACTGCT	1
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-TGCTCAGTGG	1
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-TGCTCCCTGG	1
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-TGCTCTGTGC	1
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-TGCTGATTTA	1
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-TGCTGCCTCA	3
-TGCTGCCTCT	1
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-TGCTGCTGCT	1
-TGCTGGAATG	1
-TGCTGGAGAA	2
-TGCTGGATTG	1
-TGCTGGGGAC	1
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-TGCTTATACT	1
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-TGCTTCAACT	1
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-TGCTTGATTG	1
-TGCTTGCACC	1
-TGCTTGCGCA	1
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-TGCTTGTCCC	8
-TGCTTGTCTC	1
-TGCTTGTGGT	1
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-TGGAAGGGCT	5
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-TGGAAGTGTG	1
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-TGGAATCTGG	1
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-TGGAATGGGC	1
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-TGGAGGTGCC	1
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-TTGGCTTCTC	1
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-TTGGGGCAGA	1
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-TTGGTCAGGT	3
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-TTGGTCCCTG	1
-TTGGTCCGGC	2
-TTGGTCCTAT	2
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-TTGGTCGGGC	2
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-TTGGTCTCTG	1
-TTGGTCTGAG	1
-TTGGTCTTCC	1
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-ACCGTAATCT	1
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-ACCTACGATG	1
-ACCTACGCGC	1
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-ACTGTCAGTC	1
-ACTGTGAACC	1
-ACTGTGATCC	1
-ACTGTGCCAC	1
-ACTGTGCCAT	1
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-ACTGTTAAGA	1
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-ACTGTTCTCT	1
-ACTGTTGATC	1
-ACTGTTGCTA	5
-ACTGTTGTCA	1
-ACTGTTTGTC	1
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-ACTTAACACC	1
-ACTTAAGGAA	3
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-ACTTCTGCAA	1
-ACTTCTGGAA	1
-ACTTCTGTGA	1
-ACTTCTTAAG	1
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-ACTTTTAAAA	2
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-AGAACTGCTT	1
-AGAACTGGCC	1
-AGAACTGGGT	1
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-AGAAGACTGA	1
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-AGAAGGTTGC	1
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-AGAATTACTT	1
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-AGACTCTGTC	1
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-AGACTTAAAG	2
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-AGACTTGGCA	1
-AGACTTGTTT	1
-AGACTTTCCC	1
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-AGATTTTTTT	1
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-AGCACTCCGG	1
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-AGCACTGCAC	1
-AGCACTGCAG	1
-AGCACTGCTG	1
-AGCACTGTAC	1
-AGCACTTACT	1
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-AGCAGACCAG	1
-AGCAGACTCC	1
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-AGCAGGCTCC	1
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-AGCAGTGTGA	1
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-AGCATCCTGC	1
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-AGCCACTCCG	1
-AGCCACTCGC	1
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-AGCCACTGCC	1
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-AGCCAGGGTC	1
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-AGCCCGGGCT	1
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-AGCCCTGGCT	1
-AGCCCTTACA	1
-AGCCCTTCCT	1
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-AGCCGAGATG	1
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-AGCCGCCACA	1
-AGCCGCCGCA	1
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-AGCCGCCGTG	1
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-AGCCGGATGC	1
-AGCCGGCAAA	1
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-AGCCGGGCGA	1
-AGCCGGGCTT	1
-AGCCGGGGAG	1
-AGCCGTCCGA	1
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-AGCCTAAGGA	1
-AGCCTAGAAG	1
-AGCCTAGTTG	1
-AGCCTATTGT	1
-AGCCTCAAAA	1
-AGCCTCCAAA	1
-AGCCTCCTGT	1
-AGCCTCGTGA	1
-AGCCTGCAGA	5
-AGCCTGCCTG	3
-AGCCTGGAAG	1
-AGCCTGGACT	5
-AGCCTGGAGA	6
-AGCCTGGGAG	7
-AGCCTGGGCC	1
-AGCCTGGTAG	1
-AGCCTGTACC	1
-AGCCTGTAGG	1
-AGCCTGTGAC	1
-AGCCTGTGGT	1
-AGCCTGTTTA	1
-AGCCTTAAAA	1
-AGCCTTACAA	2
-AGCCTTGGGG	1
-AGCCTTGGTA	2
-AGCCTTTCCG	3
-AGCCTTTGTT	3
-AGCGAAGGCA	1
-AGCGAATTGT	1
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-AGCGATGCAG	2
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-AGCGCCTCCA	1
-AGCGCCTCCT	1
-AGCGCGGCCA	1
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-AGCGGCCGCG	2
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-AGCTACCGTG	1
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-AGCTATTCTG	1
-AGCTATTGAG	1
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-AGCTCATCCT	1
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-AGCTCCTCAA	1
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-AGCTCTAGGC	1
-AGCTCTCCCC	1
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-AGCTGACCCC	1
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-AGCTGATCCC	2
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-AGCTGCTCCC	3
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-AGCTGTTAAT	1
-AGCTGTTACC	2
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-AGCTGTTCAC	6
-AGCTGTTCAT	1
-AGCTGTTCCA	2
-AGCTGTTCCC	890
-AGCTGTTCTC	1
-AGCTGTTCTG	2
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-AGCTGTTTTT	1
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-AGGCCCACAA	5
-AGGCCCAGCT	1
-AGGCCCCTAC	1
-AGGCCCTGCT	1
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-AGGCCGGCCT	1
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-AGGCCGTCCC	4
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-AGGCCTGTGG	1
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-AGGCTGAGGC	8
-AGGCTGAGGT	1
-AGGCTGCACC	2
-AGGCTGCCCA	1
-AGGCTGCGCT	1
-AGGCTGCGGT	1
-AGGCTGGATG	2
-AGGCTGGGCC	1
-AGGCTGGGGG	1
-AGGCTGTATT	1
-AGGCTGTGCT	1
-AGGCTGTGTT	1
-AGGCTGTTGG	1
-AGGCTTAAAG	1
-AGGCTTCAGT	1
-AGGCTTCCAA	1
-AGGCTTCTAG	1
-AGGCTTGCAA	1
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-AGGCTTTCAG	1
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-ATGGTGGGCG	1
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-ATTGCGAAGA	1
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-ATTGCTGGGG	1
-ATTGCTGTAA	1
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-ATTGGCAGAG	1
-ATTGGCCGGG	1
-ATTGGCTCTT	2
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-ATTGGGCCAC	1
-ATTGGGCCAT	2
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-ATTGGTGGTG	1
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-ATTGTACTGG	1
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-ATTGTATGAC	1
-ATTGTCAGAA	1
-ATTGTCAGGG	2
-ATTGTCCCAG	1
-ATTGTCTATA	1
-ATTGTCTGCA	1
-ATTGTGAAGG	1
-ATTGTGACTC	1
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-ATTGTGAGGG	14
-ATTGTGAGGT	1
-ATTGTGATAG	1
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-ATTGTGCCAT	1
-ATTGTGCCCC	1
-ATTGTGCCTC	1
-ATTGTGCTAC	2
-ATTGTGGCTG	1
-ATTGTGTGGA	2
-ATTGTTACAA	1
-ATTGTTATGG	1
-ATTGTTGCAG	1
-ATTGTTTATG	12
-ATTGTTTCTT	1
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-ATTTAACATC	1
-ATTTAACATT	1
-ATTTAAGAAG	1
-ATTTAAGGTC	1
-ATTTAATGGA	1
-ATTTACAACA	1
-ATTTACCTAT	1
-ATTTACTCAT	1
-ATTTACTCTT	1
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-ATTTAGAAGT	1
-ATTTAGAGTG	1
-ATTTAGCAGA	1
-ATTTAGTCAG	1
-ATTTATAAAT	1
-ATTTATAATC	2
-ATTTATATCT	1
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-ATTTATGGAC	1
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-ATTTCAATAT	1
-ATTTCACCCT	1
-ATTTCAGAAG	4
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-ATTTCCAGGT	1
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-ATTTCGCGCT	1
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-ATTTCTTCAG	1
-ATTTCTTCGA	1
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-ATTTGGAGTG	1
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-ATTTGGGAAC	1
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-ATTTTATTAA	2
-ATTTTATTTT	1
-ATTTTCAAAA	1
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-ATTTTCTAAA	1
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-ATTTTCTTTA	1
-ATTTTGACCC	1
-ATTTTGAGAA	1
-ATTTTGATAA	1
-ATTTTGCCAA	1
-ATTTTGCCAC	1
-ATTTTGCCTG	1
-ATTTTGCTTG	1
-ATTTTGGGGG	1
-ATTTTGGTTA	1
-ATTTTGTGTC	2
-ATTTTTAAAT	1
-ATTTTTACTC	1
-ATTTTTCAAA	1
-ATTTTTCAAG	1
-ATTTTTCTTA	1
-ATTTTTCTTT	1
-ATTTTTGTAT	1
-ATTTTTTCCA	1
-ATTTTTTCCT	1
-CAAAAAAAAA	7
-CAAAAAATCA	1
-CAAAAAATGC	1
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-CAAAAATCAG	1
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-CAAAAGAATG	1
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-CAAAAGATTA	2
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-CAAAAGTTCT	1
-CAAAATAATA	1
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-CAAAATCAGG	1
-CAAAATCCTT	1
-CAAAATGCAA	3
-CAAAATGCAG	1
-CAAAATGCTT	1
-CAAAATGGAC	1
-CAAAATTTTG	1
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-CAAACAACTA	1
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-CAAACCCTGG	1
-CAAACCTCCA	1
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-CAAACGATCC	1
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-CAAAGACTTG	1
-CAAAGAGGCT	1
-CAAAGATCTT	1
-CAAAGATGCA	1
-CAAAGATTTT	1
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-CAAATACTGG	1
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-CAACCATTTA	1
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-CAAGAAAATT	1
-CAAGAAACTC	1
-CAAGACAACT	1
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-CAAGACTGAG	1
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-CAAGATGATA	1
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-CACGTATGCA	1
-CACGTCGTGC	1
-CACGTCTGCT	1
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-CACGTGTAGT	1
-CACGTTCCCT	1
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-CACTAATCAG	1
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-CAGCCTCTGC	1
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-CAGGGCGGGC	1
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-CAGGGGCTGG	2
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-CAGGTCCTGC	1
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-CCACCAGATT	1
-CCACCAGTTC	1
-CCACCATATT	1
-CCACCATTCC	1
-CCACCATTCT	1
-CCACCCCCAC	5
-CCACCCCGAA	14
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-CCACCGCACA	1
-CCACCGCACC	1
-CCACCGCACT	8
-CCACCGCATT	1
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-CCACCTCCTC	1
-CCACCTGCTT	1
-CCACCTTGGC	1
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-CCACGTGTTT	1
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-CCACTGCAGT	1
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-CCACTGGACT	3
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-CCACTGTGCT	1
-CCACTGTGTC	1
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-CCAGCCTGGC	1
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-CCAGCCTTTA	1
-CCAGCGCACC	1
-CCAGCGCAGC	1
-CCAGCGCCTG	1
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-CCAGCTCCTG	1
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-CCAGCTGTCA	1
-CCAGCTTGAT	1
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-CCAGGATTGA	1
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-CCAGGCCGTA	1
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-CCAGGCTGCG	2
-CCAGGCTGGG	2
-CCAGGGAGGG	1
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-CCAGGGCCTA	1
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-CCAGGTACTA	1
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-CCAGGTCTGG	1
-CCAGGTTCTG	1
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-CCAGTGGTCC	1
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-CCAGTGTGCA	1
-CCAGTGTGCC	1
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-CCAGTTTGTA	1
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-CCATAAGACT	1
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-CCATCCAGTG	2
-CCATCCCTTA	1
-CCATCCTCCC	1
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-CCATCGCACT	3
-CCATCGCATT	1
-CCATCTAAGC	1
-CCATCTAGCC	1
-CCATCTCACT	1
-CCATCTGAGG	1
-CCATCTTTGA	1
-CCATTAAATT	1
-CCATTACACT	2
-CCATTATTTC	1
-CCATTCCCCA	1
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-CCATTCTCTT	1
-CCATTGAAAC	5
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-CCATTGTACT	11
-CCATTTCACT	1
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-CCCAAGGGTT	3
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-CCCAATAAGA	1
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-CCCACCCTTG	1
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-CCCAGCCAAA	1
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-CCCAGCCAGT	1
-CCCAGCCATA	1
-CCCAGCCATT	2
-CCCAGCCCCA	1
-CCCAGCCCCC	1
-CCCAGCCCTA	1
-CCCAGCCGAT	1
-CCCAGCCTAA	2
-CCCAGCCTAG	2
-CCCAGCCTAT	1
-CCCAGCCTCC	1
-CCCAGCCTCT	1
-CCCAGCCTGA	2
-CCCAGCCTGT	1
-CCCAGCCTTC	1
-CCCAGCCTTG	2
-CCCAGCGAGC	1
-CCCAGCGTGA	1
-CCCAGCTAAG	2
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-CCCATCAGGG	1
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-CCCCCACGAG	1
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-CCCCCAGATG	2
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-CCCCCCGCTC	1
-CCCCCCGGAG	1
-CCCCCCTTCT	2
-CCCCCGAAAC	1
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-CCCCCGATTC	1
-CCCCCGCACT	1
-CCCCCGCGGA	4
-CCCCCGCGTA	1
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-CCCCCGTGCA	1
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-CCCCCTCTTG	1
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-CCCCCTTGCA	4
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-CCCCGTGTCA	1
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-CCCCTCTCCC	1
-CCCCTCTGAG	5
-CCCCTCTTTA	1
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-CCCCTGCTAG	1
-CCCCTGCTGT	1
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-CCCCTGGTGG	1
-CCCCTGGTTC	1
-CCCCTGTACT	1
-CCCCTGTAGT	1
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-CCCCTTAAAA	1
-CCCCTTATAA	1
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-CCCCTTCACT	1
-CCCCTTGGGT	1
-CCCCTTGTTA	1
-CCCCTTTTCT	1
-CCCGAATAAC	1
-CCCGACCTCC	1
-CCCGACGTGC	2
-CCCGACTAGC	1
-CCCGACTCCA	1
-CCCGACTTCC	1
-CCCGAGGAAG	1
-CCCGAGTACT	1
-CCCGCAAGGC	1
-CCCGCAATCC	1
-CCCGCATCGT	1
-CCCGCATTAG	1
-CCCGCCCCAA	1
-CCCGCCCCCG	1
-CCCGCCCGGA	1
-CCCGCCGGAA	1
-CCCGCCTATT	1
-CCCGCCTCTT	16
-CCCGCGATCC	1
-CCCGCTGCGG	1
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-CCCGGCCAAT	1
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-CCCGGCCAGC	1
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-CCCGGCCATA	1
-CCCGGCCCAG	1
-CCCGGCCCCT	1
-CCCGGCCCTT	1
-CCCGGCCTCT	2
-CCCGGCCTGC	1
-CCCGGCGACA	1
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-CCCGGCTCCT	2
-CCCGGCTCTT	1
-CCCGGCTGAT	1
-CCCGGCTTTT	1
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-CCCGGGGAGG	1
-CCCGGGGCCT	2
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-CCCGTACATC	4
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-CCCGTAGTCC	4
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-CCCGTTCATC	1
-CCCGTTGTCC	2
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-CCCTAAACTG	1
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-CCCTAATTCT	1
-CCCTAATTGG	1
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-CCCTACTAAG	1
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-CCCTATCACA	1
-CCCTATCACT	1
-CCCTATGGAT	1
-CCCTATGTTT	1
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-CCCTATTAGT	1
-CCCTATTTAG	1
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-CCCTCAGTAA	1
-CCCTCATCCC	1
-CCCTCCCAGC	1
-CCCTCCCAGG	1
-CCCTCCCCAA	1
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-CCCTCGCAGT	1
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-CCCTCTGGCT	1
-CCCTCTGTGA	2
-CCCTGAAGAC	1
-CCCTGAATCC	2
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-CCCTGCACGT	1
-CCCTGCACTC	1
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-CCCTGCATTC	1
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-CCCTGCCTTA	1
-CCCTGCCTTG	4
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-CCCTGCTATT	1
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-CCCTGCTGTT	1
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-CCCTTAATTG	2
-CCCTTAGATT	1
-CCCTTAGCAA	3
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-CCCTTAGTCC	1
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-CCCTTCACTG	1
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-CCCTTCCAAA	1
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-CCCTTTTAAG	1
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-CCGACTTTCT	1
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-CCGATGCACT	1
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-CCGATGTTAG	1
-CCGATTTTTA	1
-CCGCACCACT	1
-CCGCAGCTCA	1
-CCGCAGGCAG	1
-CCGCCACACT	1
-CCGCCACATC	1
-CCGCCACTTA	2
-CCGCCAGCAT	1
-CCGCCCAAGG	1
-CCGCCCAGGC	1
-CCGCCCCCAG	2
-CCGCCCCGCC	1
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-CCGCGCTGAG	1
-CCGCGCTGGC	1
-CCGCTAACCG	1
-CCGCTATACT	1
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-CCGCTGCATT	1
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-CCGCTGCGTG	1
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-CCGCTGTACT	1
-CCGCTGTGCT	1
-CCGCTTACTC	1
-CCGGAACCGC	1
-CCGGACCTGT	1
-CCGGCCAGCG	1
-CCGGCCATCG	1
-CCGGCCCCCA	1
-CCGGCCCTAC	3
-CCGGCCCTTA	1
-CCGGCGCGTG	1
-CCGGCTACTC	1
-CCGGGCACAG	1
-CCGGGCCCAG	4
-CCGGGCCTTA	1
-CCGGGCGCGG	1
-CCGGGCTAAC	1
-CCGGGCTGTG	1
-CCGGGGAGCA	1
-CCGGGGCAAT	4
-CCGGGGGAGC	2
-CCGGGGGCTT	1
-CCGGGGGGCC	1
-CCGGGTGATG	4
-CCGGGTGCCC	1
-CCGGTATCCC	1
-CCGGTCCAAA	1
-CCGGTCGGTT	2
-CCGGTCTCAA	1
-CCGGTCTCGA	1
-CCGGTGGCCT	1
-CCGGTTCCTC	2
-CCGGTTGGCA	4
-CCGGTTTAGA	1
-CCGTAAAAGC	1
-CCGTAAATCA	1
-CCGTACACCA	1
-CCGTAGTGCC	3
-CCGTATGAAG	1
-CCGTCATCCT	6
-CCGTCCAAGG	16
-CCGTGAAAAA	1
-CCGTGAAACC	1
-CCGTGACAAT	1
-CCGTGAGGGT	1
-CCGTGCTCAT	4
-CCGTGGCTGA	1
-CCGTGGTCAC	2
-CCGTGGTCGT	6
-CCGTGTTAAA	1
-CCGTGTTTAA	1
-CCGTTCCTTG	1
-CCGTTCTCCT	2
-CCGTTCTGGA	3
-CCGTTGCACC	1
-CCGTTGCACG	1
-CCGTTGCACT	4
-CCGTTGCTGA	1
-CCGTTGTAGC	1
-CCGTTTCTTT	1
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-CCTAAATCTG	1
-CCTAACACCC	1
-CCTAACTGAC	2
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-CCTAATATTT	1
-CCTAATCCAT	1
-CCTAATGTGT	2
-CCTAATGTTC	1
-CCTACAATCC	1
-CCTACAGAAG	1
-CCTACAGACA	1
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-CCTACTAGGA	1
-CCTACTATCC	1
-CCTACTCACC	1
-CCTACTCAGG	1
-CCTACTTTCA	1
-CCTAGATACT	1
-CCTAGCAGGA	1
-CCTAGCCCAA	1
-CCTAGCTCGA	1
-CCTAGCTGGA	48
-CCTAGGAAAC	1
-CCTAGGAAGT	1
-CCTAGGACCT	3
-CCTAGGATAC	1
-CCTAGGGAGA	1
-CCTAGTAATC	1
-CCTATAAGTC	1
-CCTATAATAT	1
-CCTATAATCC	25
-CCTATAATCT	2
-CCTATAATGC	2
-CCTATAATTT	1
-CCTATAGTCC	7
-CCTATAGTCT	3
-CCTATATATA	1
-CCTATATCCC	1
-CCTATATTCC	1
-CCTATCAAAG	1
-CCTATCAAGA	1
-CCTATCACCG	1
-CCTATCGTCT	1
-CCTATCTGGA	1
-CCTATGATCC	2
-CCTATGTAAG	1
-CCTATGTCCT	1
-CCTATGTTCC	1
-CCTATTAAGC	4
-CCTATTAAGG	1
-CCTATTAGCA	1
-CCTATTCTGC	1
-CCTATTGTCC	1
-CCTATTTACT	13
-CCTCAAGAGG	1
-CCTCAAGGAA	1
-CCTCAATATA	1
-CCTCAATGCT	1
-CCTCAATTTC	1
-CCTCACCACG	1
-CCTCACTGCC	1
-CCTCAGAAAA	1
-CCTCAGAAGC	1
-CCTCAGCAAC	1
-CCTCAGCATC	1
-CCTCAGCCAC	2
-CCTCAGCCAG	2
-CCTCAGCCCT	1
-CCTCAGCTCA	1
-CCTCAGCTCC	1
-CCTCAGCTTC	1
-CCTCAGGAAT	1
-CCTCAGGAGA	1
-CCTCAGGATA	120
-CCTCAGGATC	2
-CCTCAGGATG	1
-CCTCAGGATT	1
-CCTCAGGCTC	5
-CCTCAGGGTA	1
-CCTCAGGTTA	1
-CCTCAGGTTC	1
-CCTCATCAGC	1
-CCTCATTGAT	1
-CCTCCAACTA	2
-CCTCCAATAA	2
-CCTCCACACC	1
-CCTCCACATC	1
-CCTCCACCTA	12
-CCTCCACCTG	1
-CCTCCAGCCC	1
-CCTCCAGCTA	131
-CCTCCAGCTG	1
-CCTCCAGTAC	2
-CCTCCAGTAG	1
-CCTCCATTTA	1
-CCTCCCAACT	1
-CCTCCCACCA	1
-CCTCCCAGCA	1
-CCTCCCAGCT	1
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-CGCCGTTCTT	1
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-CGCCTTGGGG	1
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-CGCGAGCCAA	1
-CGCGAGTCGG	1
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-CGCGCACCCG	2
-CGCGCAGGGG	1
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-CGCGCGCTGG	3
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-CGCGGTGGGC	1
-CGCGTCACTA	17
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-CGCGTGCGCA	3
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-CGCGTTTTAT	1
-CGCTACTCAC	1
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-CGCTCGCCCG	2
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-CGCTCTCTGC	1
-CGCTCTCTTT	1
-CGCTCTGGGC	1
-CGCTGAGTTA	1
-CGCTGATTAA	1
-CGCTGCAGGG	1
-CGCTGCTGCG	1
-CGCTGGGCGT	3
-CGCTGGGCTG	1
-CGCTGGGGCA	1
-CGCTGGTCAG	1
-CGCTGGTCCA	1
-CGCTGGTTCA	1
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-CGCTGTGTGC	1
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-CGGACCTATT	1
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-CGGAGTCCAT	2
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-CTACATTCTA	1
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-GACACAAGCA	2
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-GACACAGAAC	1
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-GACACCAAGT	1
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-GACACCGAGG	1
-GACACCTCCT	2
-GACACGGGAG	1
-GACACTGAAA	5
-GACACTGATA	1
-GACACTTGGA	1
-GACAGAGGCT	1
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-GACAGATAGA	1
-GACAGATGCA	1
-GACAGATGGA	5
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-GACAGCCTTA	1
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-GACAGCTGTG	1
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-GACCCCAGGG	1
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-GACCCCTAAA	1
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-GACCCCTCGC	1
-GACCCCTGAA	1
-GACCCCTTTA	1
-GACCCGGCCC	1
-GACCCGGGAG	1
-GACCCTAAGA	1
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-GACCCTGACT	3
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-GACCCTTCTC	1
-GACCGAGGTG	1
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-GACCTAAAGC	1
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-GACCTCACTG	2
-GACCTCCTGC	2
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-GACCTGTGAG	1
-GACCTGTGTT	1
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-GACCTTGCTC	1
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-GCAGGAGAGG	1
-GCAGGAGCAG	1
-GCAGGAGGAC	1
-GCAGGAGGAT	1
-GCAGGAGTAG	1
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-GCAGGCAAAA	1
-GCAGGCACTG	1
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-GTGAAGTTGC	1
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-GTGAATCTCC	1
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-GTGAATTGAG	1
-GTGACAAAGT	1
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-GTGACTATAA	1
-GTGACTATGC	1
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-GTGACTCATA	1
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-GTGACTGTGG	1
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-TTGGTGCTTG	3
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-TTGGTGTTGA	2
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-TTGTCATTAC	1
-TTGTCATTGG	1
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-TTGTCCAGGC	8
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-TTGTCCTTGC	1
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-TTGTCGTATG	1
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-TTTAACCAAA	1
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-TTTAAGGTGT	1
-TTTAATACAT	1
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-TTTACACTCT	1
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-TTTTGTGAGT	1
-TTTTGTGTAT	1
-TTTTGTGTGA	1
-TTTTGTTATG	1
-TTTTGTTTTG	1
-TTTTTAAATT	1
-TTTTTAATGT	8
-TTTTTACTGA	8
-TTTTTAGAAT	4
-TTTTTAGTGT	1
-TTTTTATCCA	1
-TTTTTATCTT	1
-TTTTTATGCC	1
-TTTTTATTGC	1
-TTTTTATTTA	1
-TTTTTCAAGA	1
-TTTTTCAGAC	1
-TTTTTCATTA	1
-TTTTTCCAAA	1
-TTTTTCCCCT	1
-TTTTTCCTTC	3
-TTTTTCTCCT	1
-TTTTTCTGAT	1
-TTTTTGAAAA	1
-TTTTTGAAAC	1
-TTTTTGAAGG	3
-TTTTTGATAA	4
-TTTTTGATCA	15
-TTTTTGATGA	1
-TTTTTGCCAA	1
-TTTTTGGAGG	1
-TTTTTGGATA	1
-TTTTTGTACA	6
-TTTTTGTAGG	2
-TTTTTGTATA	1
-TTTTTGTATT	1
-TTTTTGTCAT	1
-TTTTTGTTAC	1
-TTTTTTATTT	1
-TTTTTTCTTC	1
-TTTTTTGCTT	1
-TTTTTTTAAT	1
-TTTTTTTTTC	1
-TTTTTTTTTT	2
diff --git a/data/datalist b/data/datalist
deleted file mode 100644
index 8e292fc..0000000
--- a/data/datalist
+++ /dev/null
@@ -1,4 +0,0 @@
-NC1
-NC2
-Tu102
-Tu98
diff --git a/inst/NEWS.Rd b/inst/NEWS.Rd
index d6e6913..99db9db 100644
--- a/inst/NEWS.Rd
+++ b/inst/NEWS.Rd
@@ -2,6 +2,14 @@
 \title{edgeR News}
 \encoding{UTF-8}
 
+\section{Version 3.6.3}{\itemize{
+\item
+The SAGE datasets from Zhang et al (1997) are no longer included with the edgeR package.
+
+\item
+A variety of minor code improvements and bug fixes have been implemented.
+}}
+
 \section{Version 3.6.0}{\itemize{
 
 \item
diff --git a/inst/doc/edgeR.pdf b/inst/doc/edgeR.pdf
index 4c96e55..7c5c896 100644
Binary files a/inst/doc/edgeR.pdf and b/inst/doc/edgeR.pdf differ
diff --git a/man/DGEExact-class.Rd b/man/DGEExact-class.Rd
index 0232040..36e9d1d 100644
--- a/man/DGEExact-class.Rd
+++ b/man/DGEExact-class.Rd
@@ -13,12 +13,10 @@ For objects of this class, rows correspond to genomic features and columns to st
 The genomic features are called genes, but in reality might correspond to transcripts, tags, exons etc.
 
 Objects of this class contain the following list components:
-\tabular{ll}{
-  \code{table } \tab data frame containing columns for the log2-fold-change, \code{logFC}, the average log2-counts-per-million, \code{logCPM}, and the two-sided p-value \code{PValue}.\cr
-  
-  \code{comparison } \tab vector giving the two experimental groups/conditions being compared.\cr
-  
-  \code{genes } \tab a data frame containing information about each gene (can be \code{NULL}).\cr
+\describe{
+  \item{\code{table:}}{ data frame containing columns for the log2-fold-change, \code{logFC}, the average log2-counts-per-million, \code{logCPM}, and the two-sided p-value \code{PValue}.}
+  \item{\code{comparison:}}{ vector giving the two experimental groups/conditions being compared.}
+  \item{\code{genes:}}{ a data frame containing information about each gene (can be \code{NULL}).}
 }
 }
 
diff --git a/man/DGEGLM-class.Rd b/man/DGEGLM-class.Rd
index 73f8071..cc0647d 100644
--- a/man/DGEGLM-class.Rd
+++ b/man/DGEGLM-class.Rd
@@ -13,30 +13,19 @@ For objects of this class, rows correspond to genomic features and columns to co
 The genomic features are called genes, but in reality might correspond to transcripts, tags, exons etc.
 
 Objects of this class contain the following list components:
-\tabular{ll}{
- \code{coefficients } \tab matrix containing the coefficients computed from fitting the model defined by the design matrix to each gene in the dataset.\cr
-
-  \code{df.residual } \tab vector containing the residual degrees of freedom for the model fit to each gene in the dataset.\cr
-
-  \code{deviance } \tab vector giving the deviance from the model fit to each gene.\cr
-
-  \code{design } \tab design matrix for the full model from the likelihood ratio test.\cr
-
-  \code{offset } \tab scalar, vector or matrix of offset values to be included in the GLMs for each gene.\cr
-
-  \code{samples } \tab data frame containing information about the samples comprising the dataset.\cr
-
-  \code{genes } \tab data frame containing information about the genes or tags for which we have DGE data (can be \code{NULL} if there is no information available).\cr
-
-  \code{dispersion } \tab scalar or vector providing the value of the dispersion parameter used in the negative binomial GLM for each gene.\cr
-
-  \code{lib.size } \tab vector providing the effective library size for each sample in the dataset.\cr
-
-  \code{weights } \tab matrix of weights used in the GLM fitting for each gene.\cr
-
-  \code{fitted.values } \tab the fitted (expected) values from the GLM for each gene.\cr
-
-  \code{AveLogCPM } \tab numeric vector giving average log2 counts per million for each gene.
+\describe{
+  \item{\code{coefficients:}}{ matrix containing the coefficients computed from fitting the model defined by the design matrix to each gene in the dataset.}
+  \item{\code{df.residual:}}{ vector containing the residual degrees of freedom for the model fit to each gene in the dataset.}
+  \item{\code{deviance:}}{ vector giving the deviance from the model fit to each gene.}
+  \item{\code{design:}}{ design matrix for the full model from the likelihood ratio test.}
+  \item{\code{offset:}}{ scalar, vector or matrix of offset values to be included in the GLMs for each gene.}
+  \item{\code{samples:}}{ data frame containing information about the samples comprising the dataset.}
+  \item{\code{genes:}}{ data frame containing information about the genes or tags for which we have DGE data (can be \code{NULL} if there is no information available).}
+  \item{\code{dispersion:}}{ scalar or vector providing the value of the dispersion parameter used in the negative binomial GLM for each gene.}
+  \item{\code{lib.size:}}{ vector providing the effective library size for each sample in the dataset.}
+  \item{\code{weights:}}{ matrix of weights used in the GLM fitting for each gene.}
+  \item{\code{fitted.values:}}{ the fitted (expected) values from the GLM for each gene.}
+  \item{\code{AveLogCPM:}}{ numeric vector giving average log2 counts per million for each gene.}
 }
 }
 
diff --git a/man/DGELRT-class.Rd b/man/DGELRT-class.Rd
index 42a6bfe..751faca 100644
--- a/man/DGELRT-class.Rd
+++ b/man/DGELRT-class.Rd
@@ -13,26 +13,22 @@ For objects of this class, rows correspond to genomic features and columns to st
 The genomic features are called genes, but in reality might correspond to transcripts, tags, exons etc.
 
 Objects of this class contain the following list components:
-\tabular{ll}{
-  \code{table } \tab data frame containing the log-concentration (i.e. expression level), the log-fold change in expression between the two groups/conditions and the exact p-value for differential expression, for each gene.\cr
-  
-  \code{coefficients.full } \tab matrix containing the coefficients
+\describe{
+  \item{\code{table:}}{ data frame containing the log-concentration (i.e. expression level), the log-fold change in expression between the two groups/conditions and the exact p-value for differential expression, for each gene.}
+  \item{\code{coefficients.full:}}{ matrix containing the coefficients
   computed from fitting the full model (fit using \code{glmFit} and a
-  given design matrix) to each gene in the dataset.\cr
-
-  \code{coefficients.null } \tab matrix containing the coefficients
+  given design matrix) to each gene in the dataset.}
+  \item{\code{coefficients.null:}}{ matrix containing the coefficients
   computed from fitting the null model to each gene in the
   dataset.  The null model is the model to which the full model is
   compared, and is fit using \code{glmFit} and dropping selected
-  column(s) (i.e. coefficient(s)) from the design matrix for the full model.\cr
-
-  \code{design } \tab design matrix for the full model from the likelihood
-  ratio test.\cr
-
-  \code{\dots } \tab if the argument \code{y} to \code{glmLRT} (which
+  column(s) (i.e. coefficient(s)) from the design matrix for the full model.}
+  \item{\code{design:}}{ design matrix for the full model from the likelihood
+  ratio test.}
+  \item{\code{\dots:}}{ if the argument \code{y} to \code{glmLRT} (which
   produces the \code{DGELRT} object) was itself a \code{DGEList} object, then
   the \code{DGELRT} will contain all of the elements of \code{y},
-  except for the table of counts and the table of pseudocounts.\cr
+  except for the table of counts and the table of pseudocounts.}
 }
 }
 
diff --git a/man/DGEList-class.Rd b/man/DGEList-class.Rd
index d3afb0f..3ee757d 100644
--- a/man/DGEList-class.Rd
+++ b/man/DGEList-class.Rd
@@ -11,25 +11,19 @@ A list-based S4 class for storing read counts and associated information from di
 For objects of this class, rows correspond to genomic features and columns to samples.
 The genomic features are called genes, but in reality might correspond to transcripts, tags, exons etc.
 Objects of this class contain the following essential list components:
-\tabular{ll}{
-  \code{counts } \tab numeric matrix of read counts, one row for each gene and one column for each sample.\cr
-  
-  \code{samples } \tab data.frame with a row for each sample and columns \code{group}, \code{lib.size} and \code{norm.factors} containing the group labels, library sizes and normalization factors.
-  Other columns can be optionally added to give more detailed sample information.
+\describe{
+  \item{\code{counts:}}{ numeric matrix of read counts, one row for each gene and one column for each sample.}
+  \item{\code{samples:}}{ data.frame with a row for each sample and columns \code{group}, \code{lib.size} and \code{norm.factors} containing the group labels, library sizes and normalization factors.
+  Other columns can be optionally added to give more detailed sample information.}
 }
 Optional components include:
-\tabular{ll}{
-  \code{genes } \tab data.frame giving annotation information for each gene.  Same number of rows as \code{counts}.\cr
-
-  \code{AveLogCPM } \tab numeric vector giving average log2 counts per million for each gene.\cr
-  
-  \code{common.dispersion } \tab numeric scalar giving the overall dispersion estimate.\cr
-  
-  \code{trended.dispersion } \tab numeric vector giving trended dispersion estimates for each gene.\cr
-    
-  \code{tagwise.dispersion } \tab numeric vector giving tagwise dispersion estimates for each gene.\cr
-  
-  \code{offset } \tab numeric matrix of same size as \code{counts} giving offsets for use in log-linear models.
+\describe{
+  \item{\code{genes:}}{ data.frame giving annotation information for each gene.  Same number of rows as \code{counts}.}
+  \item{\code{AveLogCPM:}}{ numeric vector giving average log2 counts per million for each gene.}
+  \item{\code{common.dispersion:}}{ numeric scalar giving the overall dispersion estimate.}
+  \item{\code{trended.dispersion:}}{ numeric vector giving trended dispersion estimates for each gene.}
+  \item{\code{tagwise.dispersion:}}{ numeric vector giving tagwise dispersion estimates for each gene.}
+  \item{\code{offset:}}{ numeric matrix of same size as \code{counts} giving offsets for use in log-linear models.}
 }
 }
 
diff --git a/man/DGEList.Rd b/man/DGEList.Rd
index 56fd89c..5c6fefa 100644
--- a/man/DGEList.Rd
+++ b/man/DGEList.Rd
@@ -10,8 +10,9 @@ Creates a \code{DGEList} object from a table of counts (rows=features, columns=s
 }
 
 \usage{
-DGEList(counts = matrix(0, 0, 0), lib.size = colSums(counts), norm.factors = rep(1,ncol(counts)),
-     group = rep(1,ncol(counts)), genes = NULL, remove.zeros = FALSE)
+DGEList(counts = matrix(0, 0, 0), lib.size = colSums(counts),
+        norm.factors = rep(1,ncol(counts)), group = rep(1,ncol(counts)), genes = NULL,
+        remove.zeros = FALSE)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/Tu102.Rd b/man/Tu102.Rd
deleted file mode 100644
index a53fe11..0000000
--- a/man/Tu102.Rd
+++ /dev/null
@@ -1,22 +0,0 @@
-\name{Tu102}
-\alias{Tu102}
-\alias{Tu98}
-\alias{NC1}
-\alias{NC2}
-\docType{data}
-\title{Raw Data for Several SAGE Libraries from the Zhang 1997 Science Paper.}
-\description{
-  SAGE dataset for 2 tumour samples, 2 normal samples.
-}
-\usage{data(Tu102)}
-\format{
-  Data frames with 22713, 18794, 16270 and 17703 observations (for Tu102, Tu98, NC2, NC1, respectively) on the following 2 variables.
-  \describe{
-    \item{\code{Tag_Sequence}}{a character vector}
-    \item{\code{Count}}{a numeric vector}
-  }
-}
-\source{
-Zhang et al. (1997) Gene Expression Profiles in Normal and Cancer Cells. \emph{Science}, 276, 1268-72.
-}
-\keyword{datasets}
diff --git a/man/WLEB.Rd b/man/WLEB.Rd
index bad5966..7c270d5 100644
--- a/man/WLEB.Rd
+++ b/man/WLEB.Rd
@@ -8,7 +8,8 @@ Estimates the parameters which maximize the given log-likelihood matrix using em
 }
 
 \usage{
-WLEB(theta, loglik, prior.n, covariate, trend.method="locfit", span=NULL, overall=TRUE, trend=TRUE, individual=TRUE, m0=NULL, m0.out=FALSE)
+WLEB(theta, loglik, prior.n, covariate, trend.method="locfit", span=NULL, overall=TRUE,
+     trend=TRUE, individual=TRUE, m0=NULL, m0.out=FALSE)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/aveLogCPM.Rd b/man/aveLogCPM.Rd
index 62371f4..34251c6 100644
--- a/man/aveLogCPM.Rd
+++ b/man/aveLogCPM.Rd
@@ -12,7 +12,8 @@ Compute average log2 counts-per-million for each row of counts.
 
 \usage{
 \method{aveLogCPM}{DGEList}(y, normalized.lib.sizes=TRUE, prior.count=2, dispersion=NULL, \dots)
-\method{aveLogCPM}{default}(y, lib.size=NULL, offset=NULL, prior.count=2, dispersion=NULL, weights=NULL, \dots)
+\method{aveLogCPM}{default}(y, lib.size=NULL, offset=NULL, prior.count=2, dispersion=NULL,
+          weights=NULL, \dots)
 }
 
 \arguments{
@@ -30,8 +31,12 @@ Compute average log2 counts-per-million for each row of counts.
 This function uses \code{mglmOneGroup} to compute average counts-per-million (AveCPM) for each row of counts, and returns log2(AveCPM).
 An average value of \code{prior.count} is added to the counts before running \code{mglmOneGroup}.
 
-This function is similar to \code{rowMeans(cpm(y, log=TRUE, \dots))}, but with the refinement that larger library sizes are given more weight in the average.
-This function converges to \code{rowMeans(cpm(y, log=TRUE, \dots))} for large values of \code{dispersion}, 
+This function is similar to
+
+\code{rowMeans(cpm(y, log=TRUE, \dots))},
+
+but with the refinement that larger library sizes are given more weight in the average.
+The two versions will agree for large values of the dispersion.
 }
 
 \value{
diff --git a/man/dispBinTrend.Rd b/man/dispBinTrend.Rd
index 83fb990..59083d6 100644
--- a/man/dispBinTrend.Rd
+++ b/man/dispBinTrend.Rd
@@ -8,8 +8,9 @@ Estimate the abundance-dispersion trend by computing the common dispersion for b
 }
 
 \usage{
-dispBinTrend(y, design=NULL, offset=NULL, df = 5, span=0.3, min.n=400, method.bin="CoxReid",
-          method.trend="spline", AveLogCPM=NULL, weights=NULL, \dots)
+dispBinTrend(y, design=NULL, offset=NULL, df = 5, span=0.3, min.n=400,
+             method.bin="CoxReid", method.trend="spline", AveLogCPM=NULL,
+             weights=NULL, \dots)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/dispCoxReidInterpolateTagwise.Rd b/man/dispCoxReidInterpolateTagwise.Rd
index 70aa4f7..d7beabf 100644
--- a/man/dispCoxReidInterpolateTagwise.Rd
+++ b/man/dispCoxReidInterpolateTagwise.Rd
@@ -8,8 +8,10 @@ Estimate tagwise dispersion parameters across multiple negative binomial general
 }
 
 \usage{
-dispCoxReidInterpolateTagwise(y, design, offset=NULL, dispersion, trend=TRUE, AveLogCPM=NULL,
-          min.row.sum=5, prior.df=10, span=0.3, grid.npts=11, grid.range=c(-6,6), weights=NULL)
+dispCoxReidInterpolateTagwise(y, design, offset=NULL, dispersion, trend=TRUE,
+                              AveLogCPM=NULL, min.row.sum=5, prior.df=10,
+                              span=0.3, grid.npts=11, grid.range=c(-6,6),
+                              weights=NULL)
 }
 
 \arguments{ 
diff --git a/man/edgeRUsersGuide.Rd b/man/edgeRUsersGuide.Rd
index 5d2f54b..50ed1a9 100644
--- a/man/edgeRUsersGuide.Rd
+++ b/man/edgeRUsersGuide.Rd
@@ -16,7 +16,7 @@ edgeRUsersGuide(view=TRUE)
 If \code{view=TRUE}, the PDF document reader is started and the User's Guide is opened, as a side effect.}
 
 \details{
-The function \code{vignette("edgeR")} will find the short edgeR Vignette which describes how to obtain the Limma User's Guide.
+The function \code{vignette("edgeR")} will find the short edgeR Vignette which describes how to obtain the edgeR User's Guide.
 The User's Guide is not itself a true vignette because it is not automatically generated using \code{\link{Sweave}} during the package build process.
 This means that it cannot be found using \code{vignette}, hence the need for this special function.
 
diff --git a/man/estimateDisp.Rd b/man/estimateDisp.Rd
index 0fd4613..1f5ef0e 100644
--- a/man/estimateDisp.Rd
+++ b/man/estimateDisp.Rd
@@ -8,7 +8,9 @@ Maximizes the negative binomial likelihood to give the estimate of the common, t
 }
 
 \usage{
-estimateDisp(y, design=NULL, prior.df=NULL, trend.method="locfit", span=NULL, grid.length=21, grid.range=c(-10,10), robust=FALSE, winsor.tail.p=c(0.05,0.1), tol=1e-06)
+estimateDisp(y, design=NULL, prior.df=NULL, trend.method="locfit", span=NULL,
+             grid.length=21, grid.range=c(-10,10), robust=FALSE,
+             winsor.tail.p=c(0.05,0.1), tol=1e-06)
 }
 
 \arguments{
@@ -48,13 +50,11 @@ This function calculates a matrix of likelihoods for each gene at a set of dispe
 }
 
 \references{
-McCarthy, DJ, Chen, Y, Smyth, GK (2012). Differential expression analysis of multifactor RNA-Seq experiments with respect to biological variation.
-\emph{Nucleic Acids Research} 40, 4288-4297.
-\url{http://nar.oxfordjournals.org/content/40/10/4288}
-
-Robinson, MD, and Smyth, GK (2007). Moderated statistical tests for
-assessing differences in tag abundance. \emph{Bioinformatics} 23, 2881-2887.
-\url{http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/23/21/2881}
+Chen, Y, Lun, ATL, and Smyth, GK (2014).
+Differential expression analysis of complex RNA-seq experiments using edgeR.
+In: \emph{Statistical Analysis of Next Generation Sequence Data},
+Somnath Datta and Daniel S Nettleton (eds), Springer, New York.
+\url{http://www.statsci.org/smyth/pubs/edgeRChapterPreprint.pdf}
 }
 
 \author{Yunshun Chen, Gordon Smyth}
diff --git a/man/estimateGLMCommonDisp.Rd b/man/estimateGLMCommonDisp.Rd
index ad186d2..32421e6 100644
--- a/man/estimateGLMCommonDisp.Rd
+++ b/man/estimateGLMCommonDisp.Rd
@@ -10,8 +10,11 @@ Estimates a common negative binomial dispersion parameter for a DGE dataset with
 }
 
 \usage{
-\S3method{estimateGLMCommonDisp}{DGEList}(y, design=NULL, method="CoxReid", subset=10000, verbose=FALSE, \dots)
-\S3method{estimateGLMCommonDisp}{default}(y, design=NULL, offset=NULL, method="CoxReid", subset=10000, AveLogCPM=NULL, verbose=FALSE, weights=NULL,\dots)
+\S3method{estimateGLMCommonDisp}{DGEList}(y, design=NULL, method="CoxReid",
+                      subset=10000, verbose=FALSE, \dots)
+\S3method{estimateGLMCommonDisp}{default}(y, design=NULL, offset=NULL,
+                      method="CoxReid", subset=10000, AveLogCPM=NULL,
+                      verbose=FALSE, weights=NULL,\dots)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/estimateGLMRobustDisp.Rd b/man/estimateGLMRobustDisp.Rd
index 5e46d4b..c1e1b58 100644
--- a/man/estimateGLMRobustDisp.Rd
+++ b/man/estimateGLMRobustDisp.Rd
@@ -8,7 +8,10 @@ Compute a robust estimate of the negative binomial dispersion parameter for each
 }
 
 \usage{
-estimateGLMRobustDisp(y, design = NULL, prior.df = 10, update.trend = TRUE, trend.method = "bin.loess", maxit = 6, k = 1.345, residual.type = "pearson", verbose = FALSE, record = FALSE) 
+estimateGLMRobustDisp(y, design = NULL, prior.df = 10, update.trend = TRUE,
+                      trend.method = "bin.loess", maxit = 6, k = 1.345,
+                      residual.type = "pearson", verbose = FALSE,
+                      record = FALSE)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/estimateGLMTagwiseDisp.Rd b/man/estimateGLMTagwiseDisp.Rd
index 5918245..ca0711f 100644
--- a/man/estimateGLMTagwiseDisp.Rd
+++ b/man/estimateGLMTagwiseDisp.Rd
@@ -12,9 +12,10 @@ Compute an empirical Bayes estimate of the negative binomial dispersion paramete
 
 \usage{
 \S3method{estimateGLMTagwiseDisp}{DGEList}(y, design=NULL, prior.df=10,
-          trend=!is.null(y$trended.dispersion), span=NULL, \dots)
-\S3method{estimateGLMTagwiseDisp}{default}(y, design=NULL, offset=NULL, dispersion, prior.df=10,
-          trend=TRUE, span=NULL, AveLogCPM=NULL, weights=NULL, \dots)
+                       trend=!is.null(y$trended.dispersion), span=NULL, \dots)
+\S3method{estimateGLMTagwiseDisp}{default}(y, design=NULL, offset=NULL, dispersion,
+                            prior.df=10, trend=TRUE, span=NULL, AveLogCPM=NULL,
+                            weights=NULL, \dots)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/estimateGLMTrendedDisp.Rd b/man/estimateGLMTrendedDisp.Rd
index 8c951a2..fbbf89c 100644
--- a/man/estimateGLMTrendedDisp.Rd
+++ b/man/estimateGLMTrendedDisp.Rd
@@ -11,7 +11,8 @@ Estimates the abundance-dispersion trend by Cox-Reid approximate profile likelih
 
 \usage{
 \S3method{estimateGLMTrendedDisp}{DGEList}(y, design=NULL, method="auto", \dots)
-\S3method{estimateGLMTrendedDisp}{default}(y, design=NULL, offset=NULL, AveLogCPM=NULL, method="auto", weights=NULL, \dots)
+\S3method{estimateGLMTrendedDisp}{default}(y, design=NULL, offset=NULL, AveLogCPM=NULL,
+                       method="auto", weights=NULL, \dots)
 }
 
 \arguments{ 
diff --git a/man/gof.Rd b/man/gof.Rd
index bcd92f1..c047736 100644
--- a/man/gof.Rd
+++ b/man/gof.Rd
@@ -6,7 +6,8 @@
 \description{Conducts deviance goodness of fit tests for each fit in a \code{DGEGLM} object}
 
 \usage{
-gof(glmfit, pcutoff=0.1, adjust="holm", plot=FALSE, main="qq-plot of genewise goodness of fit", \dots)
+gof(glmfit, pcutoff=0.1, adjust="holm", plot=FALSE,
+    main="qq-plot of genewise goodness of fit", \dots)
 }
 \arguments{ 
 
diff --git a/man/meanvar.Rd b/man/meanvar.Rd
index 83f8459..2b4f553 100644
--- a/man/meanvar.Rd
+++ b/man/meanvar.Rd
@@ -9,8 +9,9 @@
 
 \usage{
 plotMeanVar(object, meanvar=NULL, show.raw.vars=FALSE, show.tagwise.vars=FALSE,
-     show.binned.common.disp.vars=FALSE, show.ave.raw.vars=TRUE, scalar=NULL,
-     NBline=FALSE, nbins=100, log.axes="xy", xlab=NULL, ylab=NULL,  \dots) 
+            show.binned.common.disp.vars=FALSE, show.ave.raw.vars=TRUE,
+            scalar=NULL, NBline=FALSE, nbins=100, log.axes="xy", xlab=NULL,
+            ylab=NULL,  \dots)
 binMeanVar(x, group, nbins=100, common.dispersion=FALSE, object=NULL)
 }
 
@@ -70,13 +71,16 @@ This function is useful for exploring the mean-variance relationship in the data
 y <- matrix(rnbinom(1000,mu=10,size=2),ncol=4)
 d <- DGEList(counts=y,group=c(1,1,2,2),lib.size=c(1000:1003))
 plotMeanVar(d) # Produce a straight-forward mean-variance plot
-meanvar <- plotMeanVar(d, show.raw.vars=TRUE) # Produce a mean-variance plot with the raw variances shown and save the means and variances for later use
-
+# Produce a mean-variance plot with the raw variances shown and save the means
+# and variances for later use
+meanvar <- plotMeanVar(d, show.raw.vars=TRUE) 
 ## If we want to show estimated tagwise variances on the plot, we must first estimate them!
 d <- estimateCommonDisp(d) # Obtain an estimate of the dispersion parameter
 d <- estimateTagwiseDisp(d)  # Obtain tagwise dispersion estimates
-plotMeanVar(d, meanvar=meanvar, show.tagwise.vars=TRUE, NBline=TRUE) # Use previously saved object to speed up plotting;
-## We could also estimate common/tagwise dispersions using the Cox-Reid methods with an appropriate design matrix
+# Use previously saved object to speed up plotting
+plotMeanVar(d, meanvar=meanvar, show.tagwise.vars=TRUE, NBline=TRUE) 
+## We could also estimate common/tagwise dispersions using the Cox-Reid methods with an
+## appropriate design matrix
 }
 
 \seealso{
@@ -85,8 +89,4 @@ plotMeanVar(d, meanvar=meanvar, show.tagwise.vars=TRUE, NBline=TRUE) # Use previ
 
 }
 
-\keyword{algebra}
-
-
-
-
+\keyword{algebra}
\ No newline at end of file
diff --git a/man/normalizeChIPtoInput.Rd b/man/normalizeChIPtoInput.Rd
index 453e93e..f7fe461 100644
--- a/man/normalizeChIPtoInput.Rd
+++ b/man/normalizeChIPtoInput.Rd
@@ -9,8 +9,10 @@ Normalize ChIP-Seq read counts to input control values, then test for significan
 }
 
 \usage{
-normalizeChIPtoInput(input, response, dispersion=0.01, niter=6, loss="p", plot=FALSE, verbose=FALSE, \dots)
-calcNormOffsetsforChIP(input, response, dispersion=0.01, niter=6, loss="p", plot=FALSE, verbose=FALSE, \dots)
+normalizeChIPtoInput(input, response, dispersion=0.01, niter=6, loss="p", plot=FALSE,
+                     verbose=FALSE, \dots)
+calcNormOffsetsforChIP(input, response, dispersion=0.01, niter=6, loss="p", plot=FALSE,
+                       verbose=FALSE, \dots)
 }
 
 \arguments{
diff --git a/man/plotExonUsage.Rd b/man/plotExonUsage.Rd
index 944a4f5..fb9728a 100644
--- a/man/plotExonUsage.Rd
+++ b/man/plotExonUsage.Rd
@@ -6,7 +6,8 @@
 \description{Create a plot of exon usage for a given gene by plotting the (un)transformed counts for each exon, coloured by experimental group.}
 
 \usage{
-plotExonUsage(y, geneID, group=NULL, transform="none", counts.per.million=TRUE, legend.coords=NULL, \dots)
+plotExonUsage(y, geneID, group=NULL, transform="none", counts.per.million=TRUE,
+              legend.coords=NULL, \dots)
 }
 \arguments{ 
 
diff --git a/man/plotMDS.DGEList.Rd b/man/plotMDS.DGEList.Rd
index d604788..de23f70 100644
--- a/man/plotMDS.DGEList.Rd
+++ b/man/plotMDS.DGEList.Rd
@@ -7,8 +7,10 @@ Distances on the plot represent coefficient of variation of expression between s
 for the top genes that best distinguish the samples.
 }
 \usage{
-\method{plotMDS}{DGEList}(x, top=500, labels=colnames(x), col=NULL, cex=1, dim.plot=c(1,2),
-     ndim=max(dim.plot), xlab=NULL, ylab=NULL, method="logFC", prior.count=2, gene.selection="pairwise", \dots)
+\method{plotMDS}{DGEList}(x, top=500, labels=colnames(x), col=NULL, cex=1,
+	        dim.plot=c(1,2), ndim=max(dim.plot), xlab=NULL,
+	        ylab=NULL, method="logFC", prior.count=2,
+	        gene.selection="pairwise", \dots)
 }
 \arguments{
   \item{x}{an \code{DGEList} object.}
diff --git a/man/plotSmear.Rd b/man/plotSmear.Rd
index e806c38..fc8e5f3 100644
--- a/man/plotSmear.Rd
+++ b/man/plotSmear.Rd
@@ -10,10 +10,9 @@ Both of these functions plot the log-fold change (i.e. the log of the ratio of e
 plotSmear(object, pair=NULL, de.tags=NULL, xlab="Average logCPM", ylab="logFC", pch=19,
      cex=0.2, smearWidth=0.5, panel.first=grid(), smooth.scatter=FALSE, lowess=FALSE, \dots)
 }
-%- maybe also 'usage' for other objects documented here.
 \arguments{
  \item{object}{\code{DGEList}, \code{DGEExact} or \code{DGELRT} object containing data to produce an MA-plot.}
-  \item{pair}{pair of experimental conditions to plot (if \code{NULL}, the first two conditions are used)}
+  \item{pair}{pair of experimental conditions to plot (if \code{NULL}, the first two conditions are used). Ignored if \code{object} is a \code{DGELRT} object.}
   \item{de.tags}{rownames for tags identified as being differentially expressed; use \code{exactTest} to identify DE genes}
   \item{xlab}{x-label of plot}
   \item{ylab}{y-label of plot}
diff --git a/man/spliceVariants.Rd b/man/spliceVariants.Rd
index 87dcbf2..ea0e211 100644
--- a/man/spliceVariants.Rd
+++ b/man/spliceVariants.Rd
@@ -6,7 +6,8 @@
 \description{Identify genes exhibiting evidence for splice variants (alternative exon usage/transcript isoforms) from exon-level count data using negative binomial generalized linear models.}
 
 \usage{
-spliceVariants(y, geneID, dispersion=NULL, group=NULL, estimate.genewise.disp=TRUE, trace=FALSE)
+spliceVariants(y, geneID, dispersion=NULL, group=NULL, estimate.genewise.disp=TRUE,
+               trace=FALSE)
 }
 \arguments{ 
 
diff --git a/src/R_cr_adjust.cpp b/src/R_cr_adjust.cpp
index 1263fac..aca987c 100644
--- a/src/R_cr_adjust.cpp
+++ b/src/R_cr_adjust.cpp
@@ -26,7 +26,7 @@ SEXP R_cr_adjust (SEXP w, SEXP x, SEXP nlibs) try {
     double* out_ptr=NUMERIC_POINTER(output);
     try {
 		// Running through each tag.
-       	for (long tag=0; tag<num_tags; ++tag) {
+       	for (int tag=0; tag<num_tags; ++tag) {
 			std::pair<double, bool> x=acr.compute(wptr);
 			if (!x.second) { 
 				std::stringstream errout;
diff --git a/src/adj_coxreid.cpp b/src/adj_coxreid.cpp
index b38c24f..13b2fdd 100644
--- a/src/adj_coxreid.cpp
+++ b/src/adj_coxreid.cpp
@@ -37,7 +37,7 @@ adj_coxreid::~adj_coxreid () {
 }
 
 std::pair<double, bool> adj_coxreid::compute(const double* wptr) {
-    /* Setting working weight_matrix to 'A=XtWX' with column-major storage.
+    /* Setting working weight_matrix to 'A=Xt %*% diag(W) %*% X' with column-major storage.
  	 * This represents the expected Fisher information. The overall strategy is
  	 * to compute the determinant of the information matrix in order to compute
  	 * the adjustment factor for the likelihood (in order to account for uncertainty
@@ -63,13 +63,22 @@ std::pair<double, bool> adj_coxreid::compute(const double* wptr) {
     /* For triangular matrices, we need the diagonal to compute the determinant. Fortunately, 
  	 * this remains the diagonal of the output matrix despite the permutations performed by 
  	 * the pivoting. We sum over all log'd diagonal elements to get the log determinant of the 
- 	 * information matrix (valid because det(AB)=det(A)*det(B) and we're using the result of 
- 	 * the decomposition). We then have to halve the resulting value. 
+ 	 * information matrix (valid because det(LDL*)=det(L)*det(D)*det(L*) and we're using the 
+ 	 * result of the decomposition). We then have to halve the resulting value. 
+ 	 *
+ 	 * Note the protection against zero. This just replaces it with an appropriately small
+ 	 * non-zero value, if the diagnoal element is zero or NA. This is valid because the set
+ 	 * of fitted values which are zero will be constant at all dispersions. Thus, any replacement
+ 	 * value will eventually cancel out during interpolation to obtain the CRAPLE.
      */
     double sum_log_diagonals=0;
     for (int i=0; i<ncoefs; ++i) { 
         const double& cur_val=working_matrix[i*ncoefs+i];
-        sum_log_diagonals+=(cur_val < low_value ? log_low_value : std::log(cur_val));
+		if (cur_val < low_value || !std::isfinite(cur_val))  { 
+			sum_log_diagonals += log_low_value; 
+		} else {
+			sum_log_diagonals += std::log(cur_val);
+		}
     }
 	return std::make_pair(sum_log_diagonals*0.5, true);
 }
diff --git a/tests/edgeR-Tests.Rout.save b/tests/edgeR-Tests.Rout.save
index bb3f88c..07a738b 100644
--- a/tests/edgeR-Tests.Rout.save
+++ b/tests/edgeR-Tests.Rout.save
@@ -1,7 +1,7 @@
 
-R Under development (unstable) (2013-11-30 r64358) -- "Unsuffered Consequences"
-Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing
-Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)
+R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
+Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
+Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
 
 R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
 You are welcome to redistribute it under certain conditions.
@@ -42,16 +42,16 @@ Loading required package: limma
 > topTags(de)
 Comparison of groups:  2-1 
             logFC   logCPM     PValue       FDR
-Tag.17  2.0450964 13.73716 0.01975954 0.4347099
-Tag.21 -1.7265870 13.38314 0.06131012 0.6744114
-Tag.6  -1.6329986 12.81499 0.12446044 0.8982100
-Tag.2   4.0861092 11.54169 0.16331090 0.8982100
-Tag.16  0.9324996 13.57085 0.29050785 0.9655885
-Tag.20  0.8543138 13.76374 0.31736609 0.9655885
-Tag.12  0.7081170 14.31396 0.37271028 0.9655885
-Tag.19 -0.7976602 13.31391 0.40166354 0.9655885
-Tag.3  -0.7300410 13.54143 0.42139935 0.9655885
-Tag.8  -0.7917906 12.86373 0.47117217 0.9655885
+Tag.17  2.0450964 13.73726 0.01975954 0.4347099
+Tag.21 -1.7265870 13.38327 0.06131012 0.6744114
+Tag.6  -1.6329986 12.81479 0.12446044 0.8982100
+Tag.2   4.0861092 11.54121 0.16331090 0.8982100
+Tag.16  0.9324996 13.57074 0.29050785 0.9655885
+Tag.20  0.8543138 13.76364 0.31736609 0.9655885
+Tag.12  0.7081170 14.31389 0.37271028 0.9655885
+Tag.19 -0.7976602 13.31405 0.40166354 0.9655885
+Tag.3  -0.7300410 13.54155 0.42139935 0.9655885
+Tag.8  -0.7917906 12.86353 0.47117217 0.9655885
 > 
 > d2 <- estimateTagwiseDisp(d,trend="none",prior.df=20)
 > summary(d2$tagwise.dispersion)
@@ -61,31 +61,31 @@ Tag.8  -0.7917906 12.86373 0.47117217 0.9655885
 > topTags(de)
 Comparison of groups:  2-1 
             logFC   logCPM     PValue       FDR
-Tag.17  2.0450964 13.73716 0.01975954 0.4347099
-Tag.21 -1.7265870 13.38314 0.06131012 0.6744114
-Tag.6  -1.6329986 12.81499 0.12446044 0.8982100
-Tag.2   4.0861092 11.54169 0.16331090 0.8982100
-Tag.16  0.9324996 13.57085 0.29050785 0.9655885
-Tag.20  0.8543138 13.76374 0.31736609 0.9655885
-Tag.12  0.7081170 14.31396 0.37271028 0.9655885
-Tag.19 -0.7976602 13.31391 0.40166354 0.9655885
-Tag.3  -0.7300410 13.54143 0.42139935 0.9655885
-Tag.8  -0.7917906 12.86373 0.47117217 0.9655885
+Tag.17  2.0450964 13.73726 0.01975954 0.4347099
+Tag.21 -1.7265870 13.38327 0.06131012 0.6744114
+Tag.6  -1.6329986 12.81479 0.12446044 0.8982100
+Tag.2   4.0861092 11.54121 0.16331090 0.8982100
+Tag.16  0.9324996 13.57074 0.29050785 0.9655885
+Tag.20  0.8543138 13.76364 0.31736609 0.9655885
+Tag.12  0.7081170 14.31389 0.37271028 0.9655885
+Tag.19 -0.7976602 13.31405 0.40166354 0.9655885
+Tag.3  -0.7300410 13.54155 0.42139935 0.9655885
+Tag.8  -0.7917906 12.86353 0.47117217 0.9655885
 > 
 > de <- exactTest(d2)
 > topTags(de)
 Comparison of groups:  2-1 
             logFC   logCPM     PValue       FDR
-Tag.17  2.0450987 13.73716 0.01327001 0.2919403
-Tag.21 -1.7265897 13.38314 0.05683886 0.6252275
-Tag.6  -1.6329910 12.81499 0.11460208 0.8404152
-Tag.2   4.0861092 11.54169 0.16126207 0.8869414
-Tag.16  0.9324975 13.57085 0.28103256 0.9669238
-Tag.20  0.8543178 13.76374 0.30234789 0.9669238
-Tag.12  0.7081149 14.31396 0.37917895 0.9669238
-Tag.19 -0.7976633 13.31391 0.40762735 0.9669238
-Tag.3  -0.7300478 13.54143 0.40856822 0.9669238
-Tag.8  -0.7918243 12.86373 0.49005179 0.9669238
+Tag.17  2.0450987 13.73726 0.01327001 0.2919403
+Tag.21 -1.7265897 13.38327 0.05683886 0.6252275
+Tag.6  -1.6329910 12.81479 0.11460208 0.8404152
+Tag.2   4.0861092 11.54121 0.16126207 0.8869414
+Tag.16  0.9324975 13.57074 0.28103256 0.9669238
+Tag.20  0.8543178 13.76364 0.30234789 0.9669238
+Tag.12  0.7081149 14.31389 0.37917895 0.9669238
+Tag.19 -0.7976633 13.31405 0.40762735 0.9669238
+Tag.3  -0.7300478 13.54155 0.40856822 0.9669238
+Tag.8  -0.7918243 12.86353 0.49005179 0.9669238
 > 
 > d2 <- estimateTagwiseDisp(d,trend="movingave",span=0.4,prior.df=20)
 > summary(d2$tagwise.dispersion)
@@ -95,16 +95,16 @@ Tag.8  -0.7918243 12.86373 0.49005179 0.9669238
 > topTags(de)
 Comparison of groups:  2-1 
             logFC   logCPM     PValue       FDR
-Tag.17  2.0450951 13.73716 0.02427872 0.5341319
-Tag.21 -1.7265927 13.38314 0.05234833 0.5758316
-Tag.6  -1.6330014 12.81499 0.12846308 0.8954397
-Tag.2   4.0861092 11.54169 0.16280722 0.8954397
-Tag.16  0.9324887 13.57085 0.24308201 0.9711975
-Tag.20  0.8543044 13.76374 0.35534649 0.9711975
-Tag.19 -0.7976535 13.31391 0.38873717 0.9711975
-Tag.3  -0.7300525 13.54143 0.40001438 0.9711975
-Tag.12  0.7080985 14.31396 0.43530228 0.9711975
-Tag.8  -0.7918376 12.86373 0.49782701 0.9711975
+Tag.17  2.0450951 13.73726 0.02427872 0.5341319
+Tag.21 -1.7265927 13.38327 0.05234833 0.5758316
+Tag.6  -1.6330014 12.81479 0.12846308 0.8954397
+Tag.2   4.0861092 11.54121 0.16280722 0.8954397
+Tag.16  0.9324887 13.57074 0.24308201 0.9711975
+Tag.20  0.8543044 13.76364 0.35534649 0.9711975
+Tag.19 -0.7976535 13.31405 0.38873717 0.9711975
+Tag.3  -0.7300525 13.54155 0.40001438 0.9711975
+Tag.12  0.7080985 14.31389 0.43530228 0.9711975
+Tag.8  -0.7918376 12.86353 0.49782701 0.9711975
 > 
 > summary(exactTest(d2,rejection="smallp")$table$PValue)
    Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
@@ -116,40 +116,40 @@ Tag.8  -0.7918376 12.86373 0.49782701 0.9711975
 > d2 <- estimateTagwiseDisp(d,trend="loess",span=0.8,prior.df=20)
 > summary(d2$tagwise.dispersion)
    Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
- 0.1165  0.1448  0.1832  0.1848  0.2116  0.2826 
+ 0.1165  0.1449  0.1832  0.1848  0.2116  0.2825 
 > de <- exactTest(d2)
 > topTags(de)
 Comparison of groups:  2-1 
             logFC   logCPM     PValue       FDR
-Tag.17  2.0450979 13.73716 0.01545949 0.3401087
-Tag.21 -1.7266049 13.38314 0.03542770 0.3897047
-Tag.6  -1.6329841 12.81499 0.10631799 0.7796653
-Tag.2   4.0861092 11.54169 0.16058047 0.8831926
-Tag.16  0.9324935 13.57085 0.26348077 0.9658392
-Tag.20  0.8543140 13.76374 0.31676619 0.9658392
-Tag.19 -0.7976354 13.31391 0.35563266 0.9658392
-Tag.3  -0.7300593 13.54143 0.38829455 0.9658392
-Tag.12  0.7081040 14.31396 0.41516367 0.9658392
-Tag.8  -0.7918152 12.86373 0.48481833 0.9658392
+Tag.17  2.0450979 13.73726 0.01546795 0.3402949
+Tag.21 -1.7266049 13.38327 0.03545446 0.3899990
+Tag.6  -1.6329841 12.81479 0.10632987 0.7797524
+Tag.2   4.0861092 11.54121 0.16057893 0.8831841
+Tag.16  0.9324935 13.57074 0.26348818 0.9658389
+Tag.20  0.8543140 13.76364 0.31674090 0.9658389
+Tag.19 -0.7976354 13.31405 0.35564858 0.9658389
+Tag.3  -0.7300593 13.54155 0.38833737 0.9658389
+Tag.12  0.7081041 14.31389 0.41513004 0.9658389
+Tag.8  -0.7918152 12.86353 0.48483449 0.9658389
 > 
 > d2 <- estimateTagwiseDisp(d,trend="tricube",span=0.8,prior.df=20)
 > summary(d2$tagwise.dispersion)
    Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
- 0.1165  0.1448  0.1832  0.1848  0.2116  0.2826 
+ 0.1165  0.1449  0.1832  0.1848  0.2116  0.2825 
 > de <- exactTest(d2)
 > topTags(de)
 Comparison of groups:  2-1 
             logFC   logCPM     PValue       FDR
-Tag.17  2.0450979 13.73716 0.01545949 0.3401087
-Tag.21 -1.7266049 13.38314 0.03542770 0.3897047
-Tag.6  -1.6329841 12.81499 0.10631799 0.7796653
-Tag.2   4.0861092 11.54169 0.16058047 0.8831926
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-Tag.20  0.8543140 13.76374 0.31676619 0.9658392
-Tag.19 -0.7976354 13.31391 0.35563266 0.9658392
-Tag.3  -0.7300593 13.54143 0.38829455 0.9658392
-Tag.12  0.7081040 14.31396 0.41516367 0.9658392
-Tag.8  -0.7918152 12.86373 0.48481833 0.9658392
+Tag.17  2.0450979 13.73726 0.01546795 0.3402949
+Tag.21 -1.7266049 13.38327 0.03545446 0.3899990
+Tag.6  -1.6329841 12.81479 0.10632987 0.7797524
+Tag.2   4.0861092 11.54121 0.16057893 0.8831841
+Tag.16  0.9324935 13.57074 0.26348818 0.9658389
+Tag.20  0.8543140 13.76364 0.31674090 0.9658389
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+Tag.12  0.7081041 14.31389 0.41513004 0.9658389
+Tag.8  -0.7918152 12.86353 0.48483449 0.9658389
 > 
 > # mglmOneWay
 > design <- model.matrix(~group,data=d$samples)
@@ -178,7 +178,34 @@ $fitted.values
  [7,]  7.5  7.5  9.5  9.5
  [8,]  7.0  7.0  4.0  4.0
  [9,]  4.5  4.5  5.5  5.5
-[10,] 10.0 10/dispersion.true)
+[10,] 10.0 10.0 13.0 13.0
+
+> mglmOneWay(d[10.2000  0.3469 
+> dglm <- estimateGLMTrendedDisp(dglm,design,method="spline")
+Loading required package: splines
+> summary(dglm$trended.dispersion)
+   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
+0.09353 0.11080 0.15460 0.19010 0.23050 0.52010 
+> dglm <- estimateGLMTrendedDisp(dglm,design,method="bin.spline")
+> summary(dglm$trended.dispersion)
+   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
+ 0.1997  0.1997  0.1997  0.1997  0.1997  0.1997 
+> dglm <- estimateGLMTagwiseDisp(dglm,design,prior.df=20)
+> summary(dglm$tagwise.dispersion)
+   Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max. 
+ 0.1385  0.1792  0.1964  0.1935  0.2026  0.2709 
+> 
+> # Continuous trend
+> nlibs <- 3
+> ntags <- 1000
+> dispersion.true <- 0.1
+> # Make first transcript respond to covariate x
+> x <- 0:2
+> design <- model.matrix(~x)
+> beta.true <- cbind(Beta1=2,Beta2=c(2,rep(0,ntags-1)))
+> mu.true <- 2^(beta.true %*% t(design))
+> # Generate count data
+> y <- rnbinom(ntags*nlibs,mu=mu.true,size=1/dispersion.true)
 > y <- matrix(y,ntags,nlibs)
 > colnames(y) <- c("x0","x1","x2")
 > rownames(y) <- paste("Gene",1:ntags,sep="")
@@ -191,14 +218,14 @@ Coefficient:  x
             logFC   logCPM        LR       PValue          FDR
 Gene1    2.907024 13.56183 38.738512 4.845536e-10 4.845536e-07
 Gene61   2.855317 10.27136 10.738307 1.049403e-03 5.247015e-01
-Gene62  -2.123902 10.53184  8.818703 2.981585e-03 8.334760e-01
-Gene134 -1.949073 10.53365  8.125889 4.363759e-03 8.334760e-01
-Gene740 -1.610046 10.94916  8.013408 4.643227e-03 8.334760e-01
-Gene354  2.022698 10.45075  7.826308 5.149118e-03 8.334760e-01
-Gene5    1.856816 10.45258  7.214238 7.232750e-03 8.334760e-01
-Gene746 -1.798331 10.53103  6.846262 8.882693e-03 8.334760e-01
-Gene110  1.623148 10.68616  6.737984 9.438120e-03 8.334760e-01
-Gene383  1.637140 10.75421  6.687530 9.708965e-03 8.334760e-01
+Gene62  -2.123902 10.53174  8.818703 2.981585e-03 8.334760e-01
+Gene134 -1.949073 10.53355  8.125889 4.363759e-03 8.334760e-01
+Gene740 -1.610046 10.94907  8.013408 4.643227e-03 8.334760e-01
+Gene354  2.022698 10.45066  7.826308 5.149118e-03 8.334760e-01
+Gene5    1.856816 10.45249  7.214238 7.232750e-03 8.334760e-01
+Gene746 -1.798331 10.53094  6.846262 8.882693e-03 8.334760e-01
+Gene110  1.623148 10.68607  6.737984 9.438120e-03 8.334760e-01
+Gene383  1.637140 10.75412  6.687530 9.708965e-03 8.334760e-01
 > d <- estimateGLMCommonDisp(d, design, verbose=TRUE)
 Disp = 0.10253 , BCV = 0.3202 
 > glmFit(d,design,dispersion=dispersion.true, prior.count=0.5/3)
@@ -276,7 +303,7 @@ x1     1     4176    1.0014172
 x2     1     3971    0.9977138
 
 $AveLogCPM
-[1] 13.561832  9.682859 10.447107 10.532113 10.452583
+[1] 13.561832  9.682757 10.447014 10.532113 10.452489
 995 more elements ...
 
 > 
@@ -394,8 +421,8 @@ $n0
 > 
 > proc.time()
    user  system elapsed 
-   3.29    0.04    3.32 
-                                                                                                                                                                                                                                      edgeR/vignettes/                                                                                    0000755 0001263 0001264 00000000000 12333335261 015174  5                                                                                                    ustar [...]
+   3.41    0.03    3.44 
+                                                                                                                                                                                                                                                                      edgeR/vignettes/                                                                                    0000755 0001263 0001264 00000000000 12361356713 015202  5                                                                          [...]
 %\VignetteKeyword{RNA-Seq}
 %\VignetteKeyword{differential expression}
 %\VignettePackage{edgeR}
@@ -443,4 +470,4 @@ In other operating systems, type
 at the R prompt to open the User's Guide in a pdf viewer.
 
 \end{document}
-                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             [...]
\ No newline at end of file
+                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             [...]
\ No newline at end of file

-- 
Alioth's /usr/local/bin/git-commit-notice on /srv/git.debian.org/git/debian-med/r-bioc-edger.git



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