[med-svn] r19845 - in trunk/packages: . sumatra sumatra/trunk sumatra/trunk/debian sumatra/trunk/debian/patches sumatra/trunk/debian/source

Andreas Tille tille at moszumanska.debian.org
Wed Aug 5 15:17:11 UTC 2015


Author: tille
Date: 2015-08-05 15:17:10 +0000 (Wed, 05 Aug 2015)
New Revision: 19845

Added:
   trunk/packages/sumatra/
   trunk/packages/sumatra/trunk/
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/changelog
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/compat
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/control
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/copyright
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/docs
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/install
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/no_zlib
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/series
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/rules
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/source/
   trunk/packages/sumatra/trunk/debian/source/format
Log:
Inject as prepared by Tim Booth for BioLinux


Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/changelog
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/changelog	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/changelog	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1,5 @@
+sumatra (1.0.01-0ubuntu1) trusty; urgency=medium
+
+  * Initial release for QIIME 1.9 
+
+ -- Tim Booth <tbooth at ceh.ac.uk>  Fri, 13 Feb 2015 16:24:17 +0000

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/compat
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/compat	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/compat	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1 @@
+9

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/control
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/control	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/control	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1,28 @@
+Source: sumatra
+Maintainer: Debian Med Packaging Team <debian-med-packaging at lists.alioth.debian.org>
+Uploaders: Tim Booth <tbooth at ceh.ac.uk>
+Section: science
+Priority: optional
+Build-Depends: debhelper (>= 9)
+Standards-Version: 3.9.6
+Homepage: http://metabarcoding.org/sumatra
+
+Package: sumatra
+Architecture: any
+Depends: ${shlibs:Depends},
+         ${misc:Depends}
+Description: fast and exact comparison and clustering of sequences
+ With the development of next-generation sequencing, efficient tools are needed
+ to handle millions of sequences in reasonable amounts of time.
+ .
+ SUMACLUST and SUMATRA are a package of two programs developed by the  LECA.
+ .
+ SUMACLUST and SUMATRA aim to compare sequences in a way that is fast and exact
+ at the same time. These tools have been developed to be adapted to the type of
+ data generated by DNA metabarcoding, i.e. entirely sequenced, short markers.
+ .
+ SUMATRA computes the pairwise alignment scores from one dataset or between two
+ datasets, with the possibility to specify a similarity threshold under which
+ pairs of sequences that have a lower similarity are not reported. The output
+ can then go through a classification process with programs such as  MCL or
+ MOTHUR.

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/copyright
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/copyright	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/copyright	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1,517 @@
+Format: DEP-5 or something like that
+Files: *
+Copyright: Tiayyba Riaz
+           Celine Mercier
+	   Eric Coissac
+License:
+    CONTRAT DE LICENCE DE LOGICIEL LIBRE CeCILL
+
+
+	Avertissement
+
+    Ce contrat est une licence de logiciel libre issue d'une concertation
+    entre ses auteurs afin que le respect de deux grands principes préside à
+    sa rédaction:
+
+	* d'une part, le respect des principes de diffusion des logiciels
+	  libres: accès au code source, droits étendus conférés aux
+	  utilisateurs,
+	* d'autre part, la désignation d'un droit applicable, le droit
+	  français, auquel elle est conforme, tant au regard du droit de la
+	  responsabilité civile que du droit de la propriété intellectuelle
+	  et de la protection qu'il offre aux auteurs et titulaires des
+	  droits patrimoniaux sur un logiciel.
+
+    Les auteurs de la licence CeCILL (pour Ce[a] C[nrs] I[nria] L[ogiciel]
+    L[ibre]) sont:
+
+    Commissariat à l'Energie Atomique - CEA, établissement public de
+    recherche à caractère scientifique, technique et industriel, dont le
+    siège est situé 25 rue Leblanc, immeuble Le Ponant D, 75015 Paris.
+
+    Centre National de la Recherche Scientifique - CNRS, établissement
+    public à caractère scientifique et technologique, dont le siège est
+    situé 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris cedex 16.
+
+    Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique -
+    INRIA, établissement public à caractère scientifique et technologique,
+    dont le siège est situé Domaine de Voluceau, Rocquencourt, BP 105, 78153
+    Le Chesnay cedex.
+
+
+	Préambule
+
+    Ce contrat est une licence de logiciel libre dont l'objectif est de
+    conférer aux utilisateurs la liberté de modification et de
+    redistribution du logiciel régi par cette licence dans le cadre d'un
+    modèle de diffusion en logiciel libre.
+
+    L'exercice de ces libertés est assorti de certains devoirs à la charge
+    des utilisateurs afin de préserver ce statut au cours des
+    redistributions ultérieures.
+
+    L'accessibilité au code source et les droits de copie, de modification
+    et de redistribution qui en découlent ont pour contrepartie de n'offrir
+    aux utilisateurs qu'une garantie limitée et de ne faire peser sur
+    l'auteur du logiciel, le titulaire des droits patrimoniaux et les
+    concédants successifs qu'une responsabilité restreinte.
+
+    A cet égard l'attention de l'utilisateur est attirée sur les risques
+    associés au chargement, à l'utilisation, à la modification et/ou au
+    développement et à la reproduction du logiciel par l'utilisateur étant
+    donné sa spécificité de logiciel libre, qui peut le rendre complexe à
+    manipuler et qui le réserve donc à des développeurs ou des
+    professionnels avertis possédant des connaissances informatiques
+    approfondies. Les utilisateurs sont donc invités à charger et tester
+    l'adéquation du logiciel à leurs besoins dans des conditions permettant
+    d'assurer la sécurité de leurs systèmes et/ou de leurs données et, plus
+    généralement, à l'utiliser et l'exploiter dans les mêmes conditions de
+    sécurité. Ce contrat peut être reproduit et diffusé librement, sous
+    réserve de le conserver en l'état, sans ajout ni suppression de clauses.
+
+    Ce contrat est susceptible de s'appliquer à tout logiciel dont le
+    titulaire des droits patrimoniaux décide de soumettre l'exploitation aux
+    dispositions qu'il contient.
+
+
+	Article 1 - DEFINITIONS
+
+    Dans ce contrat, les termes suivants, lorsqu'ils seront écrits avec une
+    lettre capitale, auront la signification suivante:
+
+    Contrat: désigne le présent contrat de licence, ses éventuelles versions
+    postérieures et annexes.
+
+    Logiciel: désigne le logiciel sous sa forme de Code Objet et/ou de Code
+    Source et le cas échéant sa documentation, dans leur état au moment de
+    l'acceptation du Contrat par le Licencié.
+
+    Logiciel Initial: désigne le Logiciel sous sa forme de Code Source et
+    éventuellement de Code Objet et le cas échéant sa documentation, dans
+    leur état au moment de leur première diffusion sous les termes du Contrat.
+
+    Logiciel Modifié: désigne le Logiciel modifié par au moins une
+    Contribution.
+
+    Code Source: désigne l'ensemble des instructions et des lignes de
+    programme du Logiciel et auquel l'accès est nécessaire en vue de
+    modifier le Logiciel.
+
+    Code Objet: désigne les fichiers binaires issus de la compilation du
+    Code Source.
+
+    Titulaire: désigne le ou les détenteurs des droits patrimoniaux d'auteur
+    sur le Logiciel Initial.
+
+    Licencié: désigne le ou les utilisateurs du Logiciel ayant accepté le
+    Contrat.
+
+    Contributeur: désigne le Licencié auteur d'au moins une Contribution.
+
+    Concédant: désigne le Titulaire ou toute personne physique ou morale
+    distribuant le Logiciel sous le Contrat.
+
+    Contribution: désigne l'ensemble des modifications, corrections,
+    traductions, adaptations et/ou nouvelles fonctionnalités intégrées dans
+    le Logiciel par tout Contributeur, ainsi que tout Module Interne.
+
+    Module: désigne un ensemble de fichiers sources y compris leur
+    documentation qui permet de réaliser des fonctionnalités ou services
+    supplémentaires à ceux fournis par le Logiciel.
+
+    Module Externe: désigne tout Module, non dérivé du Logiciel, tel que ce
+    Module et le Logiciel s'exécutent dans des espaces d'adressage
+    différents, l'un appelant l'autre au moment de leur exécution.
+
+    Module Interne: désigne tout Module lié au Logiciel de telle sorte
+    qu'ils s'exécutent dans le même espace d'adressage.
+
+    GNU GPL: désigne la GNU General Public License dans sa version 2 ou
+    toute version ultérieure, telle que publiée par Free Software Foundation
+    Inc.
+
+    Parties: désigne collectivement le Licencié et le Concédant.
+
+    Ces termes s'entendent au singulier comme au pluriel.
+
+
+	Article 2 - OBJET
+
+    Le Contrat a pour objet la concession par le Concédant au Licencié d'une
+    licence non exclusive, cessible et mondiale du Logiciel telle que
+    définie ci-après à l'article 5 pour toute la durée de protection des droits
+    portant sur ce Logiciel.
+
+
+	Article 3 - ACCEPTATION
+
+    3.1 L'acceptation par le Licencié des termes du Contrat est réputée
+    acquise du fait du premier des faits suivants:
+
+	* (i) le chargement du Logiciel par tout moyen notamment par
+	  téléchargement à partir d'un serveur distant ou par chargement à
+	  partir d'un support physique;
+	* (ii) le premier exercice par le Licencié de l'un quelconque des
+	  droits concédés par le Contrat.
+
+    3.2 Un exemplaire du Contrat, contenant notamment un avertissement
+    relatif aux spécificités du Logiciel, à la restriction de garantie et à
+    la limitation à un usage par des utilisateurs expérimentés a été mis à
+    disposition du Licencié préalablement à son acceptation telle que
+    définie à l'article 3.1 ci dessus et le Licencié reconnaît en avoir pris
+    connaissance.
+
+
+	Article 4 - ENTREE EN VIGUEUR ET DUREE
+
+
+	  4.1 ENTREE EN VIGUEUR
+
+    Le Contrat entre en vigueur à la date de son acceptation par le Licencié
+    telle que définie en 3.1.
+
+
+	  4.2 DUREE
+
+    Le Contrat produira ses effets pendant toute la durée légale de
+    protection des droits patrimoniaux portant sur le Logiciel.
+
+
+	Article 5 - ETENDUE DES DROITS CONCEDES
+
+    Le Concédant concède au Licencié, qui accepte, les droits suivants sur
+    le Logiciel pour toutes destinations et pour la durée du Contrat dans
+    les conditions ci-après détaillées.
+
+    Par ailleurs, si le Concédant détient ou venait à détenir un ou
+    plusieurs brevets d'invention protégeant tout ou partie des
+    fonctionnalités du Logiciel ou de ses composants, il s'engage à ne pas
+    opposer les éventuels droits conférés par ces brevets aux Licenciés
+    successifs qui utiliseraient, exploiteraient ou modifieraient le
+    Logiciel. En cas de cession de ces brevets, le Concédant s'engage à
+    faire reprendre les obligations du présent alinéa aux cessionnaires.
+
+
+	  5.1 DROIT D'UTILISATION
+
+    Le Licencié est autorisé à utiliser le Logiciel, sans restriction quant
+    aux domaines d'application, étant ci-après précisé que cela comporte:
+
+       1. la reproduction permanente ou provisoire du Logiciel en tout ou
+	  partie par tout moyen et sous toute forme.
+
+       2. le chargement, l'affichage, l'exécution, ou le stockage du
+	  Logiciel sur tout support.
+
+       3. la possibilité d'en observer, d'en étudier, ou d'en tester le
+	  fonctionnement afin de déterminer les idées et principes qui sont
+	  à la base de n'importe quel élément de ce Logiciel; et ceci,
+	  lorsque le Licencié effectue toute opération de chargement,
+	  d'affichage, d'exécution, de transmission ou de stockage du
+	  Logiciel qu'il est en droit d'effectuer en vertu du Contrat.
+
+
+	  5.2 DROIT D'APPORTER DES CONTRIBUTIONS
+
+    Le droit d'apporter des Contributions comporte le droit de traduire,
+    d'adapter, d'arranger ou d'apporter toute autre modification au Logiciel
+    et le droit de reproduire le logiciel en résultant.
+
+    Le Licencié est autorisé à apporter toute Contribution au Logiciel sous
+    réserve de mentionner, de façon explicite, son nom en tant qu'auteur de
+    cette Contribution et la date de création de celle-ci.
+
+
+	  5.3 DROIT DE DISTRIBUTION
+
+    Le droit de distribution comporte notamment le droit de diffuser, de
+    transmettre et de communiquer le Logiciel au public sur tout support et
+    par tout moyen ainsi que le droit de mettre sur le marché à titre
+    onéreux ou gratuit, un ou des exemplaires du Logiciel par tout procédé.
+
+    Le Licencié est autorisé à distribuer des copies du Logiciel, modifié ou
+    non, à des tiers dans les conditions ci-après détaillées.
+
+
+	    5.3.1 DISTRIBUTION DU LOGICIEL SANS MODIFICATION
+
+    Le Licencié est autorisé à distribuer des copies conformes du Logiciel,
+    sous forme de Code Source ou de Code Objet, à condition que cette
+    distribution respecte les dispositions du Contrat dans leur totalité et
+    soit accompagnée:
+
+       1. d'un exemplaire du Contrat,
+
+       2. d'un avertissement relatif à la restriction de garantie et de
+	  responsabilité du Concédant telle que prévue aux articles 8
+	  et 9,
+
+    et que, dans le cas où seul le Code Objet du Logiciel est redistribué,
+    le Licencié permette aux futurs Licenciés d'accéder facilement au Code
+    Source complet du Logiciel en indiquant les modalités d'accès, étant
+    entendu que le coût additionnel d'acquisition du Code Source ne devra
+    pas excéder le simple coût de transfert des données.
+
+
+	    5.3.2 DISTRIBUTION DU LOGICIEL MODIFIE
+
+    Lorsque le Licencié apporte une Contribution au Logiciel, les conditions
+    de distribution du Logiciel Modifié en résultant sont alors soumises à
+    l'intégralité des dispositions du Contrat.
+
+    Le Licencié est autorisé à distribuer le Logiciel Modifié, sous forme de
+    code source ou de code objet, à condition que cette distribution
+    respecte les dispositions du Contrat dans leur totalité et soit
+    accompagnée:
+
+       1. d'un exemplaire du Contrat,
+
+       2. d'un avertissement relatif à la restriction de garantie et de
+	  responsabilité du Concédant telle que prévue aux articles 8
+	  et 9,
+
+    et que, dans le cas où seul le code objet du Logiciel Modifié est
+    redistribué, le Licencié permette aux futurs Licenciés d'accéder
+    facilement au code source complet du Logiciel Modifié en indiquant les
+    modalités d'accès, étant entendu que le coût additionnel d'acquisition
+    du code source ne devra pas excéder le simple coût de transfert des données.
+
+
+	    5.3.3 DISTRIBUTION DES MODULES EXTERNES
+
+    Lorsque le Licencié a développé un Module Externe les conditions du
+    Contrat ne s'appliquent pas à ce Module Externe, qui peut être distribué
+    sous un contrat de licence différent.
+
+
+	    5.3.4 COMPATIBILITE AVEC LA LICENCE GNU GPL
+
+    Le Licencié peut inclure un code soumis aux dispositions d'une des
+    versions de la licence GNU GPL dans le Logiciel modifié ou non et
+    distribuer l'ensemble sous les conditions de la même version de la
+    licence GNU GPL.
+
+    Le Licencié peut inclure le Logiciel modifié ou non dans un code soumis
+    aux dispositions d'une des versions de la licence GNU GPL et distribuer
+    l'ensemble sous les conditions de la même version de la licence GNU GPL.
+
+
+	Article 6 - PROPRIETE INTELLECTUELLE
+
+
+	  6.1 SUR LE LOGICIEL INITIAL
+
+    Le Titulaire est détenteur des droits patrimoniaux sur le Logiciel
+    Initial. Toute utilisation du Logiciel Initial est soumise au respect
+    des conditions dans lesquelles le Titulaire a choisi de diffuser son
+    oeuvre et nul autre n'a la faculté de modifier les conditions de
+    diffusion de ce Logiciel Initial.
+
+    Le Titulaire s'engage à ce que le Logiciel Initial reste au moins régi
+    par le Contrat et ce, pour la durée visée à l'article 4.2.
+
+
+	  6.2 SUR LES CONTRIBUTIONS
+
+    Le Licencié qui a développé une Contribution est titulaire sur celle-ci
+    des droits de propriété intellectuelle dans les conditions définies par
+    la législation applicable.
+
+
+	  6.3 SUR LES MODULES EXTERNES
+
+    Le Licencié qui a développé un Module Externe est titulaire sur celui-ci
+    des droits de propriété intellectuelle dans les conditions définies par
+    la législation applicable et reste libre du choix du contrat régissant
+    sa diffusion.
+
+
+	  6.4 DISPOSITIONS COMMUNES
+
+    Le Licencié s'engage expressément:
+
+       1. à ne pas supprimer ou modifier de quelque manière que ce soit les
+	  mentions de propriété intellectuelle apposées sur le Logiciel;
+
+       2. à reproduire à l'identique lesdites mentions de propriété
+	  intellectuelle sur les copies du Logiciel modifié ou non.
+
+    Le Licencié s'engage à ne pas porter atteinte, directement ou
+    indirectement, aux droits de propriété intellectuelle du Titulaire et/ou
+    des Contributeurs sur le Logiciel et à prendre, le cas échéant, à
+    l'égard de son personnel toutes les mesures nécessaires pour assurer le
+    respect des dits droits de propriété intellectuelle du Titulaire et/ou
+    des Contributeurs.
+
+
+	Article 7 - SERVICES ASSOCIES
+
+    7.1 Le Contrat n'oblige en aucun cas le Concédant à la réalisation de
+    prestations d'assistance technique ou de maintenance du Logiciel.
+
+    Cependant le Concédant reste libre de proposer ce type de services. Les
+    termes et conditions d'une telle assistance technique et/ou d'une telle
+    maintenance seront alors déterminés dans un acte séparé. Ces actes de
+    maintenance et/ou assistance technique n'engageront que la seule
+    responsabilité du Concédant qui les propose.
+
+    7.2 De même, tout Concédant est libre de proposer, sous sa seule
+    responsabilité, à ses licenciés une garantie, qui n'engagera que lui,
+    lors de la redistribution du Logiciel et/ou du Logiciel Modifié et ce,
+    dans les conditions qu'il souhaite. Cette garantie et les modalités
+    financières de son application feront l'objet d'un acte séparé entre le
+    Concédant et le Licencié.
+
+
+	Article 8 - RESPONSABILITE
+
+    8.1 Sous réserve des dispositions de l'article 8.2, le Licencié a la 
+    faculté, sous réserve de prouver la faute du Concédant concerné, de
+    solliciter la réparation du préjudice direct qu'il subirait du fait du
+    Logiciel et dont il apportera la preuve.
+
+    8.2 La responsabilité du Concédant est limitée aux engagements pris en
+    application du Contrat et ne saurait être engagée en raison notamment:
+    (i) des dommages dus à l'inexécution, totale ou partielle, de ses
+    obligations par le Licencié, (ii) des dommages directs ou indirects
+    découlant de l'utilisation ou des performances du Logiciel subis par le
+    Licencié et (iii) plus généralement d'un quelconque dommage indirect. En
+    particulier, les Parties conviennent expressément que tout préjudice
+    financier ou commercial (par exemple perte de données, perte de
+    bénéfices, perte d'exploitation, perte de clientèle ou de commandes,
+    manque à gagner, trouble commercial quelconque) ou toute action dirigée
+    contre le Licencié par un tiers, constitue un dommage indirect et
+    n'ouvre pas droit à réparation par le Concédant.
+
+
+	Article 9 - GARANTIE
+
+    9.1 Le Licencié reconnaît que l'état actuel des connaissances
+    scientifiques et techniques au moment de la mise en circulation du
+    Logiciel ne permet pas d'en tester et d'en vérifier toutes les
+    utilisations ni de détecter l'existence d'éventuels défauts. L'attention
+    du Licencié a été attirée sur ce point sur les risques associés au
+    chargement, à l'utilisation, la modification et/ou au développement et à
+    la reproduction du Logiciel qui sont réservés à des utilisateurs avertis.
+
+    Il relève de la responsabilité du Licencié de contrôler, par tous
+    moyens, l'adéquation du produit à ses besoins, son bon fonctionnement et
+    de s'assurer qu'il ne causera pas de dommages aux personnes et aux biens.
+
+    9.2 Le Concédant déclare de bonne foi être en droit de concéder
+    l'ensemble des droits attachés au Logiciel (comprenant notamment les
+    droits visés à l'article 5).
+
+    9.3 Le Licencié reconnaît que le Logiciel est fourni "en l'état" par le
+    Concédant sans autre garantie, expresse ou tacite, que celle prévue à
+    l'article 9.2 et notamment sans aucune garantie sur sa valeur commerciale, 
+    son caractère sécurisé, innovant ou pertinent.
+
+    En particulier, le Concédant ne garantit pas que le Logiciel est exempt
+    d'erreur, qu'il fonctionnera sans interruption, qu'il sera compatible
+    avec l'équipement du Licencié et sa configuration logicielle ni qu'il
+    remplira les besoins du Licencié.
+
+    9.4 Le Concédant ne garantit pas, de manière expresse ou tacite, que le
+    Logiciel ne porte pas atteinte à un quelconque droit de propriété
+    intellectuelle d'un tiers portant sur un brevet, un logiciel ou sur tout
+    autre droit de propriété. Ainsi, le Concédant exclut toute garantie au
+    profit du Licencié contre les actions en contrefaçon qui pourraient être
+    diligentées au titre de l'utilisation, de la modification, et de la
+    redistribution du Logiciel. Néanmoins, si de telles actions sont
+    exercées contre le Licencié, le Concédant lui apportera son aide
+    technique et juridique pour sa défense. Cette aide technique et
+    juridique est déterminée au cas par cas entre le Concédant concerné et
+    le Licencié dans le cadre d'un protocole d'accord. Le Concédant dégage
+    toute responsabilité quant à l'utilisation de la dénomination du
+    Logiciel par le Licencié. Aucune garantie n'est apportée quant à
+    l'existence de droits antérieurs sur le nom du Logiciel et sur
+    l'existence d'une marque.
+
+
+	Article 10 - RESILIATION
+
+    10.1 En cas de manquement par le Licencié aux obligations mises à sa
+    charge par le Contrat, le Concédant pourra résilier de plein droit le
+    Contrat trente (30) jours après notification adressée au Licencié et
+    restée sans effet.
+
+    10.2 Le Licencié dont le Contrat est résilié n'est plus autorisé à
+    utiliser, modifier ou distribuer le Logiciel. Cependant, toutes les
+    licences qu'il aura concédées antérieurement à la résiliation du Contrat
+    resteront valides sous réserve qu'elles aient été effectuées en
+    conformité avec le Contrat.
+
+
+	Article 11 - DISPOSITIONS DIVERSES
+
+
+	  11.1 CAUSE EXTERIEURE
+
+    Aucune des Parties ne sera responsable d'un retard ou d'une défaillance
+    d'exécution du Contrat qui serait dû à un cas de force majeure, un cas
+    fortuit ou une cause extérieure, telle que, notamment, le mauvais
+    fonctionnement ou les interruptions du réseau électrique ou de
+    télécommunication, la paralysie du réseau liée à une attaque
+    informatique, l'intervention des autorités gouvernementales, les
+    catastrophes naturelles, les dégâts des eaux, les tremblements de terre,
+    le feu, les explosions, les grèves et les conflits sociaux, l'état de
+    guerre...
+
+    11.2 Le fait, par l'une ou l'autre des Parties, d'omettre en une ou
+    plusieurs occasions de se prévaloir d'une ou plusieurs dispositions du
+    Contrat, ne pourra en aucun cas impliquer renonciation par la Partie
+    intéressée à s'en prévaloir ultérieurement.
+
+    11.3 Le Contrat annule et remplace toute convention antérieure, écrite
+    ou orale, entre les Parties sur le même objet et constitue l'accord
+    entier entre les Parties sur cet objet. Aucune addition ou modification
+    aux termes du Contrat n'aura d'effet à l'égard des Parties à moins
+    d'être faite par écrit et signée par leurs représentants dûment habilités.
+
+    11.4 Dans l'hypothèse où une ou plusieurs des dispositions du Contrat
+    s'avèrerait contraire à une loi ou à un texte applicable, existants ou
+    futurs, cette loi ou ce texte prévaudrait, et les Parties feraient les
+    amendements nécessaires pour se conformer à cette loi ou à ce texte.
+    Toutes les autres dispositions resteront en vigueur. De même, la
+    nullité, pour quelque raison que ce soit, d'une des dispositions du
+    Contrat ne saurait entraîner la nullité de l'ensemble du Contrat.
+
+
+	  11.5 LANGUE
+
+    Le Contrat est rédigé en langue française et en langue anglaise, ces
+    deux versions faisant également foi.
+
+
+	Article 12 - NOUVELLES VERSIONS DU CONTRAT
+
+    12.1 Toute personne est autorisée à copier et distribuer des copies de
+    ce Contrat.
+
+    12.2 Afin d'en préserver la cohérence, le texte du Contrat est protégé
+    et ne peut être modifié que par les auteurs de la licence, lesquels se
+    réservent le droit de publier périodiquement des mises à jour ou de
+    nouvelles versions du Contrat, qui posséderont chacune un numéro
+    distinct. Ces versions ultérieures seront susceptibles de prendre en
+    compte de nouvelles problématiques rencontrées par les logiciels libres.
+
+    12.3 Tout Logiciel diffusé sous une version donnée du Contrat ne pourra
+    faire l'objet d'une diffusion ultérieure que sous la même version du
+    Contrat ou une version postérieure, sous réserve des dispositions de
+    l'article 5.3.4.
+
+
+	Article 13 - LOI APPLICABLE ET COMPETENCE TERRITORIALE
+
+    13.1 Le Contrat est régi par la loi française. Les Parties conviennent
+    de tenter de régler à l'amiable les différends ou litiges qui
+    viendraient à se produire par suite ou à l'occasion du Contrat.
+
+    13.2 A défaut d'accord amiable dans un délai de deux (2) mois à compter
+    de leur survenance et sauf situation relevant d'une procédure d'urgence,
+    les différends ou litiges seront portés par la Partie la plus diligente
+    devant les Tribunaux compétents de Paris.
+
+
+    Version 2.0 du 2006-09-05.

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/docs
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/docs	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/docs	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1 @@
+*.pdf

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/install
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/install	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/install	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1,2 @@
+sumaclust/sumaclust /usr/bin
+sumatra/sumatra /usr/bin

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/no_zlib
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/no_zlib	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/no_zlib	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1,12 @@
+There is no actual use of Zlib, so no need to build against it.
+--- a/sumatra/Makefile
++++ b/sumatra/Makefile
+@@ -8,7 +8,7 @@
+ 
+ SRCS= $(SUMATRA_SRC)
+ 
+-LIB= -lfasta -llcs -lfile -lutils -lz -lm
++LIB= -lfasta -llcs -lfile -lutils -lm
+ 
+ LIBFASTA = ../libfasta/libfasta.a
+ LIBLCS   = ../liblcs/liblcs.a

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/series
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/series	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/patches/series	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1 @@
+no_zlib

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/rules
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/rules	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/rules	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1,26 @@
+#!/usr/bin/make -f
+# -*- makefile -*-
+# Sample debian/rules that uses debhelper.
+# This file was originally written by Joey Hess and Craig Small.
+# As a special exception, when this file is copied by dh-make into a
+# dh-make output file, you may use that output file without restriction.
+# This special exception was added by Craig Small in version 0.37 of dh-make.
+
+# Uncomment this to turn on verbose mode.
+#export DH_VERBOSE=1
+
+%:
+	dh $@
+
+override_dh_clean:
+	dh_clean
+	#Upstream is very messy.  Scrub out all the .svn stuff
+	#and .o files.
+	find -name debian -prune -o \( -name '.?*' -prune -print0 \) | xargs -0 rm -rf
+	find lib* -name '*.[oa]' -delete
+	cd sumaclust && make clean
+	cd sumatra && make clean
+
+override_dh_auto_build:
+	dh_auto_build --sourcedir=sumaclust
+	dh_auto_build --sourcedir=sumatra


Property changes on: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/rules
___________________________________________________________________
Added: svn:executable
   + *

Added: trunk/packages/sumatra/trunk/debian/source/format
===================================================================
--- trunk/packages/sumatra/trunk/debian/source/format	                        (rev 0)
+++ trunk/packages/sumatra/trunk/debian/source/format	2015-08-05 15:17:10 UTC (rev 19845)
@@ -0,0 +1 @@
+3.0 (quilt)




More information about the debian-med-commit mailing list