[med-svn] [Git][med-team/quorum][master] 2 commits: Remove examples and test data

Shruti Sridhar (@shruti_sridhar) gitlab at salsa.debian.org
Wed May 26 12:18:20 BST 2021 


Shruti Sridhar pushed to branch master at Debian Med / quorum


Commits:
c078107c by Shruti Sridhar at 2021-05-26T16:37:56+05:30
Remove examples and test data

- - - - -
5160b495 by Shruti Sridhar at 2021-05-26T16:38:49+05:30
Fix autopkgtests

- - - - -


6 changed files:

- debian/README.test
- − debian/examples
- debian/tests/control
- − debian/tests/data/sample_R1.fastq
- − debian/tests/data/sample_R2.fastq
- debian/tests/run-unit-test


Changes:

=====================================
debian/README.test
=====================================
@@ -9,6 +9,5 @@ in order to confirm its integrity.
 
 Notes on the files used for testing 
 ────────────────────────────────────────
-Files: debian/tests/data/*
-Source: https://github.com/arvestad/jprime/tree/master/sample_data
+
 


=====================================
debian/examples deleted
=====================================
@@ -1 +0,0 @@
-debian/tests/data/*
\ No newline at end of file


=====================================
debian/tests/control
=====================================
@@ -1,3 +1,3 @@
 Tests: run-unit-test
-Depends: @
+Depends: @, filtlong-data
 Restrictions: allow-stderr


=====================================
debian/tests/data/sample_R1.fastq deleted
=====================================
@@ -1,652 +0,0 @@
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-GTCATATTTCGATCTTTTCCCAAACTCACCTTTCCATAGTAGAACTGCGGTACTTCTGGTTTCCGAGTTGTGAGGACCGAGGTCCTGACGGGGAGTGAGTGACTTTGGTCGAGGCGCAATGTTGGGTGGTAGCATCCTTCTGTCTCTTATA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-ATGAATGGTTCATTACGGACCAGAGCTAGCTGGAATTGCCTCCAATTCTCAGTGGGTCCATTACCCCCGACTTTCTACGCCTATACTCAAAGGATCTAAAGAAACTCTGACAACTTGCGCTCCCCCGATACTGCGNAAGCAGGATCTGTTC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-GAGCATCTCTTTTTAGATGCGGCGCCTAGATCTTTGGTTCCTTCGATTTCTTGTTGACTCCTCCTTGGAAGACAGCACGCGCCTGTATCCCGGATGTGGGAAGCCCTCTTATTGCTCCTAATAACCAGGAAAGAGGCACTGTCTCTTATAC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TCAGGGCGCGTTAAAAGAAACGGCTGGCGTCGGGGACTAACCAAAGGCCGGTAAGAGGTCACTTCACCGGATTGCATTATGGGTCGTAGGTCGCACACTGTGGAAAGTCATTAGCCCAAGGAGGACCAACGGAGGAGAGCATCACGGCGAA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-ACGACTGTATGAGATGTTCCCGGTACGATTATCTATCGGGGATTCCGCAACGGGGCTCCGCGACTTTCCTTTGCGATGTAATCTTGTCCACAGGGGGTTCTGTACTCAACATGATATTTATTTCACGCAGTCGCCGCCTGTCTCTTATACA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-ACAGATACCACTTTTATGTCTCTGGGTTGGGAATCTCGAGGCTGTCCATCCGCCCATAGTCGTGCCGCACGTCGCCTACCGTAGTAGTGCTACTCCAGTCCTTAACTCCTTACTATATGCCCCGGTCTTCGCAGAGGGATGACGTTATGTC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TTTGCTTACTCGAGCATACTATGGTAGGTCCTCCTGCGGTCTTTATCGCCGAGAATTTGACTGAAGAGTCTAATCGTTTTAGAATAGAATGCCTGCAACGAGTCACATCTGTGTCGGGCATGATGTTCGCACTACGCTGTCTCTTATACAC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-AAGTACCTTGCGGGGTGTTGGCTTTCATTCGCTGACCGGCCACTTCTTCTTTCGAGGACACGTTGGCGCTACAAACATATAATTTTCATGAACCACTAGGATCACCCCTTCTCTGTCTCGATTGAGCGGTCAATTCTTAACTTGATGCCGT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-GTCCGTGGGGTTCAGGGAGTGGCCCGCTAGACATAGTAATTTTCCATTGTACCCGGTAACGTGGTGACGGATGTCACGCTAATGATGATCCTGCCTTTGTGGACCTGTACACAATGTTCCCGCGCGAAAGTCGCCCTGTCTCTTATACACA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TCCGTTCGGCTTCGGAGAGGCACATGCTCCCCGATCTCTGGCTTAACGGGATCCCCCTGATTGCTCAACAGGAGCTGGCCACGGGTTACTTGGCGTAATATCGACCGTGATAACTTCAGAAACCGGGAAGCCGCCCACAATCCGACGCTGA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-CTCGCAGCACTTTGGGTAAGTCTCAAAACCCAGCGTTCAATCATAGAGCATCCATACAAGCCTAGCGAATAACCAAAGCTCCTAGCGGAGGATGCACTGTGTTTGGTGAGCTGGAAATAACGATTTAAAGTGGTCTGTCTCTTATACACAT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-GCTACTTTCCGGGGTCCCCTTTCACCTGCGAACGCGAAGACCTGAACGTGACCAATAATGCATATGGAAGAGATTCACAGTTTCCGCGAGTCCCAGGGGCTAATATCAAGTCAGGGGGAGTAGATCACATCGAACGAGTCGTATTCCCATA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TGGGCGGTGGCGTGCGTCACCGCGGTAACAGACGGACCGGACCGAAGGGATTTGAGTACTGATGTTGACAGTGTAACTCCCTCCAATGACCTTCAGAAAGCGGCCATAGACAGTCCACCTGCCTAGGGTGCGACTGTCTCTTATACACATC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CCCGCTATATATACCTGCATACACTGTGCGTACTGGAGACGTGCTGGGAATACCATTACGTGACGCCATGTAGGCGATTCGGCAGAGGTACTGAGTATTTACAAGACCAACCTTCGAACGCCCCCTCCACAAGGCTATTAATAGCATAAAC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TTACCCATACACTGTACGGTAATGCGACGCGCCTTCACATCTACAGCGCCAGGAAGGAGTAATTAGTGCAGTTTCGACATGGCCAGGACAAATTAGTGGTAGTAAAGGCTAACGATTATAGAATAGCCNGGTCTGTCTCTTATACACATCT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CCCATCAGGTGTTGCACTTTGCTTTAAGAGGGCTAGTGGGGCCAGGTATACGTTTTGCCATCGCTCGGCCGAATTCCTTGTCTCAATAGTGTGGAAGACTGCTAGCATGAGTCTACACCGAAACAAGGACTGGACGCGGCGAAACTATCTG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-ATTCAACATTGCGGGTAATCACGAGGGAGGGAATAAGTTCTAGCGACACCGGTTTCAGCAATCGCCTGAACCGTCTTTCCTTGCTAAACGGGAAGATTTGTTCCCGCGTGGAGTGGGATACGACCGATACTCTGTCTCTTATACACATCTA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-GCGTTGAACGTGCTTCGGACGTTGTTACTAATGCGGTGAAGACGGGTATAGAATGACACTAATCAGTCCAATACGTTAGGCTATGCGAGTGAGAACTGGTCATTGAACCTCATATGCTCGGAGGGAAGTTCGTGGTTCAACCGGGGGGCGG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CAGGGCGAGGAGGCGCAATACACAGTAGGCCCGAGAACCGCGGGCAATGAGTGTCCAGTCTGGAATATGCTTACTACCAACGCCAGACCACCGTGCTATGGCAGTGGAAGGACAGGGTACTCGTAACTTGCTGTCTCTTATACACATCTAG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TAATAAGATGTTTTTGGTACGGGGTCGCCCATGTGTTGGCGTAGGTTCCTCGACATACTTCGGGCGTCTCCGCAATGAGACACCACTACTGCCGGTAGTAGGCAAGGAGCAATCTGAACGTTTGCCCTAAAAGTTTGAGTAGAGAAATACA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-AGGACCGACGACCGGGTTCCGTATCCTGACTGCCAAGCTTCCGCCCCTAGCGACTGCACGTGAAGACGGCACAATATCTTTGCGTGAAGTGAGGCCCTTTACCAAGCGGCTTCGGCATCGCTAAACCATCTGTCTCTTATACACATCTAGA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CTACCTAATGCTCCATTTTAATGGGCTCCAGTGTTCTAACGGCAAATCTACAAAGAGTATCGGACTTGCCGTCAAAAAAGGTTCGATAATACATAAGGAACGAAAGCAGCTTTGCAACCACTAACTGCTGTATCTTACGTCTTGTCTTGTC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CAGATGCACGGCCCGTCTCTATATGGTGTACCATCGCGTTTCAAATATATGACCACTTCCACCCAGCATATACTGTAGGTGATGTCGTGTCGAAAACTAGGCGTTTGGGGAACCGTACTGGATGCTAGCTGTCTCTTATACACATCTAGAT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TCGACCGCCTCGCGCTCAGCTCATCAAGGTTGGGACCTTCAAAAAGCCAGAGACTGGCGTCGCGTCTGGACCGAGACCAGATTGCGAGGCGCCGGTTAATACTCTGGAAACGCCCCTAAAGTCCAGCATTTGATATAAGAAACGGATCAAG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-AGNTAACTGTACGGAATTCACGATACACTGCTGACCATAGCAGCCTTGTGTTTAGTTACGGAATATAGCACAACCACCACTCACCGNTATGAAGCTGTTGTTACAGACGGCCGCAGCTTGTGTCGTGCTGTCTCTTATACACATCTAGATG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TGGACGCATTTTTTCTTCTGGCGGGGCCCAGGTTAATGTTCATCAGCTACTAGCACGCAAGTCCCACGGAAGTTGGTGCTCCCCTGTTGTTTCCGCGCCTGGCACCAGCGGCCATGTTTGATGGGTCGAGTACATCGTCGCAAAAAGCATT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CGCTGGACTCGATAAATCAGTCCTATTCACCGAGGGTGTCGAGTTTCAGAACCTAGGCACAGCTCAGAGCTTGGCGTGAATGGCGATTTGGCAACTGAATATCCGCAGGAGCAAACTTCTTCCGTGCTGTCTCTTATACACATCTAGATGT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-GCCCAATACGGTCGGTCCATCCGTTATAATTAGGGTCCTGTATCAATCCAGATAAAATGAGGCCAGGCCCCTGCGTATCCGATCGCTTGANAAAATCCTTGCAGGCACTTGCCGGTTTGACCGCAAACGCCTGGCCAGCGAACGTAGTCTA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-CGTACTTCAACACTTATCTAGAGGATCCGTGCTTCTGCGTATGGGAGATAGTCAGACCATCTTCGGCCGGTTACGAGACCATATACGAACCCCCCCAAGAGACGAAGTGTTTGTGACCTGGCAGACTGTCTCTTATACACATCTAGATGTG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-GACTTCATACTTCTAAGCGTCCCTGCATGCAGCTGCCTATTTGAGTCCTAGAAATTACCTCACAAGAGTCCGACCACTGTCAGATGTCAGTCCGGAGCTAGTCCACGNAACAGTTAAAGAAAGTCGGAATGTTGCCAAGCCTGGAAGACAA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-GACGCCCAGATGACTTACGGTGACAATACCCATAACCACTAAGGGCGTTTCCCTCTGAATTACAATGAAAGGTGAATGCGGATGCCTTGAACGGGATAGCACGATTTGATAGCTGGGATCCGAGCTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-ATCACATAAACTTCCTACGACACAACAGGGGACGGTTGTGGTAGGAGCCGGCGGATAATAACCTAAACATATTGTTAACGGAAGGAATCCAAGGGCACAGTTTGAGGGCTCCGCCTTACTCGTATCTCCGCGACCGCCCAGTGTGCGCGTG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-TTGCCATGATTTCTTTGCTCCTAATCATACCCCGCAGTCCAGGGCGGCGCTCAGTTGCTACCATGGGAGGAATCTGTGGGAGATATACTAGATCATTAAGATTCATGGAATATTGGGTGCGTGCTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-CATGATCAATAAGCGTGCTCCCACAATGATCACGTCTTAGAAATTGAACCGGGACTGGATTGCGGATACGACGAATGCAGGAGAATGACGTGTAAGCGTCTATCCTGAATTACAATAGAGCCATAACCTCCACGGTCTACTTTAGAACTGG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TAAGCTTTGAAGTACATGAAGCACCAGGAGTTCGTGTGGGAAATGCCGTGGTAACGAGAGGCGTGTGTGGCCACCACCCTCTTTTACGATTCCACATTAGTGAACGTCTTTTAGAGTGGCAACTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTAT
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-ACCCTTAGTTTGCTCACATACCTCCGTCAGGAGAATGCTGTCTCGCCCACGGGGAAAAATGAAGGTTTGGCATTCCTCTCCCTGGACTCCCGCAGCCGCGATATACATGATCGGGATCACGGGTTGGGTAGAACAAAGACTTCCGCTATTC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-CTAAAGAGCTAGTCTTGATGACTACTTTAAGATAACCACCGGCATCGGTGCGACAAGTAACTAGTGCGACATTTGTGCTACTTCTTGCCTCTAGTAAATAAGGGGGAAGTATGGTCTAGAACTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTATA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-GTGTACCCGTGCAGCGCTGAATCCTGCTATCGTAGAACTTTTGTCTTCCAAGGACTTATCTTGCCATTTGCGGAATAGGCGTAACTTGAGGATTTTGCCAGGCCTCATACGCCATGGAGATGGTTAGCTTGCTAACTGCATCGATACAAAC
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
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-TAGGTAACGCGTGTCGGCTGGTAGGCGCACCATTCCCGCCAATTTACGATGTGTAACGTCAGGGAATTGCTTCGTACCCCCCCATAAGATTGCGTTTATGAGCGTACTGGCTACGACAGGCTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTATAA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-ACCTCACTGGACGCTACAAATTACCATCCTGTTTTAAACTTTGTACGCGCGACTGAGGAACGGTCTGCGACGAAGCAAATAGCGTTTTCGGCGTCGAAGATTCCGTCGCCCGAGGCCAAGTGTTGAAAATATAGTAATGTAAAAAGAAGGG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CGCAATACAAGTGTTTCACTGGTGGTAAATCATATCTTTTGCGAGGTATTGTGCATGAGAATCATACTGNTACCAGCGCTCCGTCAATCAGAGGCATGGGCGCGGCCCCACTCAATAGACTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTATAAG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-ACTTCTCTCCTGAGGGAACACCGTGGGGTACCATCCTCATGTCCTCGAACCATACCGCTTACCACGTCCTAAGCTCTTCAAATGCTAGAGCTGCTCTCTCGAATGCGAAGGTCGTGCTCATGGTNAATCCATGCAGGAAAAGCATACGAGG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-CACTTTAACCGTCATTTGAGTCAACGTGACTCCACCTCTGCGGCGGCTCACCCTAATGTTCTCGGGTGTTAGTCCATCACGGATTGCAGCTTTTGTGATCAAGTTGGTGCACCTGGAACTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTATAAGA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TCGTACTCAAGATTCTAGCCGGCCCTGTTGTTGAGAAGAAACATTAGGGCACAGTATTCAACGTTGGTGATTTGGATGCCCACGGACTCTAATTCCCGGTAACCGTGATTGATTACATCTTATGCAATGTAAGACTCATGGACATAGTATA
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
- at M903:194:000000000-A5FBD:1:1108:18012:8206 1:N:0:CGATGT
-TAGCCGCCTGTGTTGACCATTGGGAGCAGGCTTCCAGTTCGAATCTGCCAGACATCAGATATCATTAGTCAATACGTGAAGGGGTGAAGCTCGTAGGGGACGAGGACAGAAGATAACCTGTCTCTTATACACATCTAGATGTGTATAAGAG
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-+
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-+
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-+
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-+
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-+
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-TCTCATCTTCCTGACAGTAGAGTGCGGTGAGGGCTTAGATAACCGGTTAAGTGCTGAGGTTCCCGGAAAAGGGTTCTTCCGACGGTGTCCTCGATGAACTCCGGATTACGATAATGGCTGAAATCTGGACGTCCTTTCCATAGCACTTTAC
-+
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-ATTTTCATATTGGTCAAAATTACGGGGAGCCGATCCAGGNCGATTGACGCATATTTTCTTAAATTTCCACACCCGCCGAGACACGAAGAGGGGTACGCCCATCTGCCCGATCAAGTTGTAGACCTTATCTGTTGCGTACCGCTAGCGGCGG
-+
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-ATTTTCATATTGGTCAAAATTACGGGGAGCCGATCCAGGNCGATTGACGCATATTTTCTTAAATTTCCACACCCGCCGAGACACGAAGAGGGGTACGCCCATCTGCCCGATCAAGTTGTAGACCTTATCTGTTGCGTACCGCTAGCGGCGG
-+
-CCCDBFFFFFFFGGGGGGGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGGHHHGGGGHHGGGGGGGHGGGGGGGHHHHHHHHHGGGGGGHGEGGGHGGGGGGGGHGHGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGHHHHHHHHHHHHHHHH
\ No newline at end of file


=====================================
debian/tests/run-unit-test
=====================================
@@ -9,17 +9,13 @@ if [ "${AUTOPKGTEST_TMP}" = "" ] ; then
   trap "rm -rf ${AUTOPKGTEST_TMP}" 0 INT QUIT ABRT PIPE TERM
 fi
 
-cp -a /usr/share/doc/${pkg}/examples/* "${AUTOPKGTEST_TMP}"
+cp  /usr/share/doc/filtlong/test/* "${AUTOPKGTEST_TMP}"
 
 cd "${AUTOPKGTEST_TMP}"
 
-quorum -s 50M sample_R1.fastq sample_R2.fastq > output
-if [ $(dpkg-architecture -qDEB_BUILD_ARCH) = "amd64" ]
-then
-	echo "d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e  output" > checksums
-    md5sum --check checksums
-	echo "Expected output and generated output are same: PASS Test"
-else
-	[ -s "output" ] || exit 1
-	echo "PASS Test"
-fi
+gunzip -r *
+
+quorum -s 50M test_reference_1.fastq test_reference_2.fastq -q 30
+[ -s "quorum_corrected.fa" ] && [ -s "quorum_corrected.log" ] || exit 1
+echo "PASS Test"
+



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