<div dir="ltr"><div>Well, you may not have assumed so... I run this command in another tab of my console (echo of the variable returned nothing, I was kind of suspicion there).<br><br></div><div>Now I have done it correctly (echo returns no), but it doesn't change the result : I still have the warnings and the empty result file.<br><br></div><div>If it can help, when I run formatter with net on, it seem to be downloading something (about 500 Ko-2Mo, looking to traffic curve).<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2015-07-15 17:42 GMT+02:00 Aaron M. Ucko <span dir="ltr"><<a href="mailto:ucko@debian.org" target="_blank">ucko@debian.org</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Yes, that's what I meant, assuming you proceeded to run blast_formatter<br>
from the same shell session.  I'll take a closer look when I get a chance.<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
-- Aaron<br>
</font></span><div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
Yann Dumont <<a href="mailto:yann.dumont0@gmail.com">yann.dumont0@gmail.com</a>> writes:<br>
<br>
> I am not sure I have done what you asked correctly. I am not very familiar<br>
> with environnement variables. I just run<br>
><br>
> $ export NCBI_CONFIG__GENBANK__PREOPEN=no<br>
><br>
> without rebooting, and it did not change anything.<br>
><br>
> 2015-07-15 16:57 GMT+02:00 Aaron M. Ucko <<a href="mailto:amu@alum.mit.edu">amu@alum.mit.edu</a>>:<br>
><br>
>> Yann Dumont <<a href="mailto:yann.dumont0@gmail.com">yann.dumont0@gmail.com</a>> writes:<br>
>><br>
>> > I am currently have some connection issues, so I realized that<br>
>> blast_formatter<br>
>> > failled when internet connection is off.<br>
>><br>
>> I'm sorry to hear that.  Does the environment setting<br>
>><br>
>> NCBI_CONFIG__GENBANK__PREOPEN=no<br>
>><br>
>> help?<br>
>><br>
>> --<br>
>> Aaron M. Ucko, KB1CJC (amu at <a href="http://alum.mit.edu" rel="noreferrer" target="_blank">alum.mit.edu</a>, ucko at <a href="http://debian.org" rel="noreferrer" target="_blank">debian.org</a>)<br>
>> <a href="http://www.mit.edu/~amu/" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mit.edu/~amu/</a> |<br>
>> <a href="http://stuff.mit.edu/cgi/finger/?amu@monk.mit.edu" rel="noreferrer" target="_blank">http://stuff.mit.edu/cgi/finger/?amu@monk.mit.edu</a><br>
</div></div></blockquote></div><br></div>