<div dir="ltr"><br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Le jeu. 14 janv. 2016 à 12:14, Andreas Tille <<a href="mailto:tille@debian.org">tille@debian.org</a>> a écrit :<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">On Thu, Jan 14, 2016 at 09:42:01AM +0000, olivier sallou wrote:<br>
> Le mar. 12 janv. 2016 à 22:23, Andreas Tille <<a href="mailto:tille@debian.org" target="_blank">tille@debian.org</a>> a écrit :<br>
><br>
> > Hi,<br>
> ><br>
> > is it libhtsjdk-java which provides the relevant classes now or what<br>
> > needs to be changed?  (Same for fastqc.)<br>
> ><br>
> replacing lib/htsjdk-xx by libhtsjdk-java and adding htsjdk.jar file in<br>
>  build.xml makes compilation fine<br>
<br>
Cool.  Thanks for checking.  Would you do the upload yourself (preferably<br>
by also upgrading to the latest version)?  If you have time constraints<br>
feel free to commit your test to Git and I'll take over.<br></blockquote><div>I have no time right now, but I can do it quite soon if it is fine for you.</div><div>I have not pulled code, so I cannot push it, I simply added htsjdk.jar in build.xml and remove hstjdklib from lib/ dir. But I can do this soon before uploading. </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
Did you also tested fastqc?<br></blockquote><div>nope </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
Kind regards<br>
<br>
        Andreas.<br>
<br>
--<br>
<a href="http://fam-tille.de" rel="noreferrer" target="_blank">http://fam-tille.de</a><br>
</blockquote></div></div>