<div dir="ltr">Dear Andreas,<br><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">пн, 19 мар. 2018 г. в 14:14, Andreas Tille <<a href="mailto:andreas@an3as.eu">andreas@an3as.eu</a>>:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear Liubov,<br>
<br>
On Mon, Mar 19, 2018 at 12:47:38PM +0000, Liubov Chuprikova wrote:<br><br>
> I have tried to find the information that should be placed in d/copyright,<br>
> but unfortunately, I don't have any experience with this kind of stuff. So<br>
> this is what I have found so far:<br>
><br>
>    - I downloaded the test sequence from the Ensemble Bacteria, which is an<br>
>    online database of EMBL-EBI. At the bottom of the sequence page<br>
>    <<a href="http://bacteria.ensembl.org/Candidatus_carsonella_ruddii_dc/Info/Index" rel="noreferrer" target="_blank">http://bacteria.ensembl.org/Candidatus_carsonella_ruddii_dc/Info/Index</a>>,<br>
>    it is indicated "Ensembl Bacteria release 38 - January 2018 © EMBL-EBI". I<br>
>    couldn't find any license they may have for the data, except that Terms<br>
>    of Use <<a href="https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use</a>> states: "EMBL-EBI<br>
>    itself places no additional restrictions on the use or redistribution of<br>
>    the data available via its online services other than those provided by the<br>
>    original data owners."<br>
>    - At first, the sequence was deposited in the GenBank database (as said<br>
>    in this paper<br>
>    <<a href="http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(13)00752-5" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.cell.com/current-biology/fulltext/S0960-9822(13)00752-5</a>>). I<br>
>    didn't find if the GenBank has copyright, but they say here<br>
>    <<a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/</a>>: "NCBI places no restrictions on<br>
>    the use or distribution of the GenBank data. However, some submitters<br>
>    may claim patent, copyright, or other intellectual property rights in all<br>
>    or a portion of the data they have submitted."<br>
>    - Finally, I have found that the sequence itself has no patent (this had<br>
>    to be indicated in the field LOCUS of the GenBank file<br>
>    <<a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP003467?report=genbank" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/CP003467?report=genbank</a>> as PAT).<br>
>    I suspect the sequence has no copyright as well, although I can't find a<br>
>    confirmation.<br>
><br>
> Could you, please, point me in the right direction. I feel like I'm getting<br>
> stuck.<br>
<br>
Thanks for this elaborate information.  I tried my best to condensate it<br>
into d/copyright.  The rule should be that we provide information to the<br>
best of our knowledge (but not more ;-) ).  Please review and add at<br>
least a line<br>
<br>
   wget ...</blockquote><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"> <br></blockquote><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
(see FIXME) and may be other information you (as a scientist) might<br>
consider helpful which I might have missed.<br>
<br></blockquote><div><br></div><div>Thank you for help! I have added wget link, but it is quite long. Is it ok or it would be better to split it into several lines? Plus, I have replaced the link to the journal article by the one containing DOI (which is more stable).</div><div><br></div><div>If there is nothing additional to change, could you please check and upload the package?</div><div><br></div><div>Regards,</div><div>Liubov</div></div></div>