[Debian-pan-maintainers] État des lieux mi-juin 2023: ufo-tofu

[Emmanuel FARHI]

Petite précision pour ufo-tofu. J'ai essayé sur une bullseye et sur une 
bookworm.

*Installation*:

wget 
http://ftp.ch.debian.org/debian/pool/main/p/python-qtpynodeeditor/python3-qtpynodeeditor_0.2.0-2_all.deb
wget 
http://ftp.bg.debian.org/debian/pool/main/u/ufo-tofu/python3-ufo-tofu_0.12.0-2_all.deb

sudo apt install ./python3-ufo-tofu_0.12.0-2_all.deb 
./python3-qtpynodeeditor_0.2.0-2_all.deb
Lecture des listes de paquets... Fait
Construction de l'arbre des dépendances... Fait
Lecture des informations d'état... Fait
Note : sélection de « python3-ufo-tofu » au lieu de 
« ./python3-ufo-tofu_0.12.0-2_all.deb »
Note : sélection de « python3-qtpynodeeditor » au lieu de 
« ./python3-qtpynodeeditor_0.2.0-2_all.deb »
Les paquets supplémentaires suivants seront installés :
   python3-pyqtconsole python3-versioneer
Paquets suggérés :
   python-python-versioneer-doc
Les NOUVEAUX paquets suivants seront installés :
   python3-pyqtconsole python3-qtpynodeeditor python3-ufo-tofu
   python3-versioneer
0 mis à jour, 4 nouvellement installés, 0 à enlever et 2 non mis à jour.
Il est nécessaire de prendre 0 o/234 ko dans les archives.
Après cette opération, 1 419 ko d'espace disque supplémentaires seront 
utilisés.
Souhaitez-vous continuer ? [O/n]
Réception de :1 
/home/experiences/grades/farhie/python3-qtpynodeeditor_0.2.0-2_all.deb 
python3-qtpynodeeditor all 0.2.0-2 [35,6 kB]
Réception de :2 
/home/experiences/grades/farhie/python3-ufo-tofu_0.12.0-2_all.deb 
python3-ufo-tofu all 0.12.0-2 [137 kB]
Sélection du paquet python3-pyqtconsole précédemment désélectionné.
(Lecture de la base de données... 1549507 fichiers et répertoires déjà 
installés
.)
Préparation du dépaquetage de .../python3-pyqtconsole_1.2.2-1_all.deb ...
Dépaquetage de python3-pyqtconsole (1.2.2-1) ...
Sélection du paquet python3-versioneer précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../python3-versioneer_0.28-1_all.deb ...
Dépaquetage de python3-versioneer (0.28-1) ...
Sélection du paquet python3-qtpynodeeditor précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../python3-qtpynodeeditor_0.2.0-2_all.deb ...
Dépaquetage de python3-qtpynodeeditor (0.2.0-2) ...
Sélection du paquet python3-ufo-tofu précédemment désélectionné.
Préparation du dépaquetage de .../python3-ufo-tofu_0.12.0-2_all.deb ...
Dépaquetage de python3-ufo-tofu (0.12.0-2) ...
Paramétrage de python3-pyqtconsole (1.2.2-1) ...
Paramétrage de python3-versioneer (0.28-1) ...
Paramétrage de python3-qtpynodeeditor (0.2.0-2) ...
Paramétrage de python3-ufo-tofu (0.12.0-2) ...
Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.11.2-2) ...

*Utilisation*:

farhie at re-grades-02:~$ tofu gui
ERROR: Cannot import modules for GUI, please install PyQt4 and pyqtgraph


*Installation dans un venv pip*:

J'ai ensuite tenté une installation locale dans un venv.

Installing collected packages: pyxdg, PyQt5-Qt5, versioneer, PyQt5-sip, 
pycairo, pillow, parso, packaging, numpy, networkx, coverage, qtpy, 
PyQt5, PyGObject, jedi, imageio, qtpynodeeditor, pyqtconsol

Installing collected packages: PyOpenGL, pyqtgraph

Il semble ensuite qu'il y ait une dépendance sur

  * sudo apt install libgirepository1.0-dev

en creusant un peu plus loin on tombe sur le célèbre

  * ValueError: Namespace Ufo not available for version 0.0


Emmanuel.


Le 15/06/2023 à 17:29, Emmanuel FARHI a écrit :
>
> Bonjour Roland,
>
> merci pour les nouvelles et le travail fourni.
>
>   * Croisons les doigts pour Jupyterlab. Ca va bien marcher à un moment !
>   * Pour PySAXS, il ne faut pas hésiter à secouer le cocotier. Je
>     viens d'envoyer un email en ce sens.
>   * Pour eman2, ca a l'air en effet du pur cmake dans un conda
>     (CONDA_PREFIX not found). Je ne suis pas expert non plus la
>     dedans. Peut etre faut-il définir CONDA_PREFIX a la mano ?
>   * Merci pour Demeter. Je ne vois pas pas très bien si les GUI
>     arthemis et athena (https://salsa.debian.org/science-team/horae)
>     sont alors disponibles avec la nouvelle librairie
>     https://salsa.debian.org/perl-team/modules/packages/libdemeter-perl
>   * Pour RefNX, je l'ai migré vers DONE dans la liste PaN.
>
> Pour la suite:
>
>   * ufo-tofu: j'ai l'impression que le GUI ne se lance pas.
>   * nabu me semble un bon choix, et connaissant les développeurs, ca
>     doit être relativement propre.
>   * codra est fait par l'auteur de Spyder il me semble
>   * orange/quasar, peut etre plus simple maintenant car des
>     dépendances ont été ajoutées à debian depuis.
>   * napari est assez touffu en dépendances, mais a garder en stock car
>     c'est un excellent outil
>   * mpes nécessite bokeh
>     (https://salsa.debian.org/python-team/packages/python-bokeh), mais
>     les autres dependances sont peut être accessibles. Plus facile que
>     'arpys'.
>
> Merci d'avance, Emmanuel.
>
>
> Le 14/06/2023 à 16:26, Roland Mas a écrit :
>> Bonjour,
>>
>> Un rapide état des lieux mi-juin, parce que je réalise que je n'ai 
>> pas donné de nouvelles depuis un certain temps.
>>
>> - pour la galaxie Jupyterlab/ipywidgets : je suis dans le packaging 
>> de jupyter-ydoc, qui a besoin de ypy, qui a besoin de maturin (un 
>> système de build). Maturin est en cours de packaging par Jelmer 
>> Vernooij, avec quelques dépendances en Rust. J'ai essayé de 
>> construire tout ça avant que ça atteigne unstable/NEW mais ce n'est 
>> pas encore réussi. Comme je vois passer des commits réguliers, je 
>> suppose que Jelmer est sur le coup et que ça va se résorber d'ici peu.
>>
>> - pour pysaxs2, je suis toujours en attente de la publication des 
>> sources par Olivier Tache du CEA. Je l'ai relancé fin mai, j'hésite à 
>> insister… peut-être que vous pourriez tâter le terrain de votre côté ?
>>
>> - pour eman2, je bute sur le système de construction. Apparemment il 
>> est considéré comme acquis que eman2 ne sera jamais installé que via 
>> Conda, et aucune instruction ne semble présente pour la construction 
>> directe (via CMake). Je progresse doucement sur la 
>> résolution/détection des dépendances par CMake.
>>
>> - demeter (le remplaçant de horae) est dans NEW.
>>
>> - refnx est dans testing.
>>
>> Voilà de quoi mettre un peu à jour la TODO-list sur 
>> pan-team/soleil-packaging-overview :-)
>>
>> Roland.
>>
>>
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>  ___) /_  _| |___| |___ | || |___   Tel : +33 (1) 69 35 96 04 
> <callto:+33%20%281%29%2069%2035%2096%2004>
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