<div dir="ltr">Hello,<div>Same error: </div><div><br></div><div>" PyMOL(TM) Molecular Graphics System, Version 1.7.2.1.</div><div> Copyright (c) Schrodinger, LLC.</div><div> All Rights Reserved.</div><div> </div><div>    Created by Warren L. DeLano, Ph.D. </div><div> </div><div>    PyMOL is user-supported open-source software.  Although some versions</div><div>    are freely available, PyMOL is not in the public domain.</div><div> </div><div>    If PyMOL is helpful in your work or study, then please volunteer </div><div>    support for our ongoing efforts to create open and affordable scientific</div><div>    software by purchasing a PyMOL Maintenance and/or Support subscription.</div><div><br></div><div>    More information can be found at "<a href="http://www.pymol.org">http://www.pymol.org</a>".</div><div> </div><div>    Enter "help" for a list of commands.</div><div>    Enter "help <command-name>" for information on a specific command.</div><div><br></div><div> Hit ESC anytime to toggle between text and graphics.</div><div><br></div><div> Detected OpenGL version 2.0 or greater. Shaders available.</div><div> Detected GLSL version 1.30.</div><div> OpenGL graphics engine:</div><div>  GL_VENDOR:   VMware, Inc.</div><div>  GL_RENDERER: Gallium 0.4 on llvmpipe (LLVM 3.5, 256 bits)</div><div>  GL_VERSION:  3.0 Mesa 10.3.2</div><div> Detected 2 CPU cores.  Enabled multithreaded rendering.</div><div> ExecutiveLoad: "h2co.xyz" loaded as "h2co", through state 1.</div><div>Segmentation fault</div><div>"</div><div><br></div><div>I agree, looking at it now this could be due to running it in VMWare fusion. Perhaps I should look elsewhere for a fix. </div><div><br></div><div>Sincerely,</div><div>Michael </div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 30, 2015 at 2:21 PM, Michael Banck <span dir="ltr"><<a href="mailto:mbanck@debian.org" target="_blank">mbanck@debian.org</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<span class=""><br>
On Thu, Apr 30, 2015 at 01:22:28PM -0400, Michael Beck wrote:<br>
>  Detected OpenGL version 2.0 or greater. Shaders available.<br>
>  Detected GLSL version 1.30.<br>
>  OpenGL graphics engine:<br>
>   GL_VENDOR:   VMware, Inc.<br>
>   GL_RENDERER: Gallium 0.4 on llvmpipe (LLVM 3.5, 256 bits)<br>
>   GL_VERSION:  3.0 Mesa 10.3.2<br>
<br>
</span>My bet would be that this is an issue with your graphics driver.  Can<br>
you display any kind of graphics, e.g. the formaldehyde molecule I've<br>
attaced in XYZ format? Just running "pymol h2co.xyz" works here.<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br>
<br>
Michael<br>
</font></span></blockquote></div><br></div>