<div dir="ltr">Hey,<div><br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">On Mon, Jan 13, 2014 at 3:02 PM, Arman Eshaghi <span dir="ltr"><<a href="mailto:arman.eshaghi@gmail.com" target="_blank">arman.eshaghi@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Specifically my problem is with buildtemplateparallel in ANTs that benefits from a couple of grid engines including SGE, Apple XGrid, PBS but not condor. For some reason the above trick (qsub symbolic link to condor_qsub) does not work here, and I receive “condor_qsub ‘-n’ option not recognized’. From the error message it clearly appears something is passed to condor_qsub that it can not handle, even when imitating SGE qsub.<br>

<br>
Here is what I have done:<br>
<br>
1. Checking buildtemplateparallel.sh script to figure out the problem. So far no success, it sounds non-trivial (to me).<br>
2. Asking from ANTs mailing list, they suggested I make the script to work with condor on myself (see no. 1).<br>
3. Getting back to SGE: not an option, I bragged about  condor a few weeks ago to IT admin, I’ll lose credibility.<br></blockquote><div> </div><div>4. Figure out what qsub -n does and try supporting it in condor_qsub</div>
<div><br></div><div>However, I have trouble figuring out what -n is supposed to do. Any hint?</div><div><br></div><div>Michael</div></div>
</div></div>