Thank you for the response,<div><br></div><div>I'm always lazy to improve problem description (and my english doesn't help me!!!)</div><div><br></div><div>Theoretically for every fold I have to select important features, so I perform ANOVA, the algorithm ranks my feature, but I want to drop the first 1% and use the 5% (or X%) of the new rank after 1% dropping.  I found on my analysis that most important feature are, in the 90% of cases, on the brain edge (probably motion artefacts voxels that still affect the dataset also after preprocessing). </div>
<div>For this reason I would like to extract ANOVA ranking stack or to find a method to use voxels from 1.01% to 5.01%!</div><div><br></div><div>So I want to perform ANOVA on data, drop the first 1%, select the new ranking stack (5% of residual voxels)  and train the classifier!</div>
<div><br></div><div>Thank you</div><div>RG</div><div><br><div class="gmail_quote">On 3 October 2011 18:14, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:debian@onerussian.com">debian@onerussian.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">I might be missing the problem since you seem to have to know the blocks<br>
you need ;)  so following the example from the clfs warehouse:<br>
<br>
    FeatureSelectionClassifier(<br>
        kNN(),<br>
        SensitivityBasedFeatureSelection(<br>
           OneWayAnova(),<br>
           FractionTailSelector(0.05, mode='select', tail='upper')),<br>
        descr="kNN on 5%(ANOVA)")<br>
<br>
logical change would be to use 0.99 instead of 0.05 to select 99% top voxels<br>
(or in other words to dump 1%)... or just change mode to 'discard' and specify<br>
0.01 as the fraction<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
On Mon, 03 Oct 2011, Roberto Guidotti wrote:<br>
<br>
>    Hi all,<br>
<br>
>    I would like to know if there is a method to extract the feature<br>
>    ranking from ANOVA feature selection or if there is a method to drop<br>
>    first 1% of voxel included in the ranking and select other voxel as<br>
>    usual (with FractionTailSelection()).<br>
<br>
>    Thank you<br>
<br>
>    Roberto<br>
<br>
</div></div>> _______________________________________________<br>
> Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
> <a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
> <a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
<font color="#888888"><br>
<br>
--<br>
=------------------------------------------------------------------=<br>
Keep in touch                                     <a href="http://www.onerussian.com" target="_blank">www.onerussian.com</a><br>
Yaroslav Halchenko                 <a href="http://www.ohloh.net/accounts/yarikoptic" target="_blank">www.ohloh.net/accounts/yarikoptic</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
</font></blockquote></div><br></div>