So the zscoring/averaging order mixup is absolutely what caused these strange distributions… swapping the order or removing zscoring returns them to normal-ish (with the zscored results having a much narrower distribution). That being said, I can't get my mind around why inverting the zscore/averaging would lead to this particular strange result: not only were accuracies increased high the board, but my observed searchlight accuracy peaks were right around the hypothesized region of interest. In take 2 of the analysis, at least initially, zscoring (at the correct time) seems to obliterate any effect.. although it appears to return a bit if I leave out the zscoring completely. I'm also wondering if there's relatively simple way to compromise between raw 4D files and standard scores by just going for effect sizes. <div>
<br></div><div>Thanks again,</div><div>Mike<br><div><br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 20, 2011 at 4:10 PM, Yaroslav Halchenko <span dir="ltr"><<a href="mailto:debian@onerussian.com">debian@onerussian.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div class="im"><br>
On Thu, 20 Oct 2011, Mike E. Klein wrote:<br>
</div><div class="im">> I wasn't getting that error… at the time of zscoring I hadn't yet<br>
> removed category #3, so it was seeing -exactly- 3 samples per chunk.<br>
<br>
</div>aha... indeed... may be we should warn if number of samples per chunk <<br>
some reasonable number, e.g. at least 5<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
--<br>
=------------------------------------------------------------------=<br>
Keep in touch                                     <a href="http://www.onerussian.com" target="_blank">www.onerussian.com</a><br>
Yaroslav Halchenko                 <a href="http://www.ohloh.net/accounts/yarikoptic" target="_blank">www.ohloh.net/accounts/yarikoptic</a><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a></div></div></blockquote></div><br></div></div>