<div dir="ltr">Thank you Brian, very helpful!<div>Obviously, if I run ANOVA for each voxel separately, I treat the trials as "subject" *(based on my analogy). </div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">

On Tue, May 6, 2014 at 3:21 PM, Brian Murphy <span dir="ltr"><<a href="mailto:brian.murphy@qub.ac.uk" target="_blank">brian.murphy@qub.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Hello Vadim,<br>
<br>
you're right that the Anova feature selection is univariate. And also<br>
for a two-class problem it gives an identical result to that you would<br>
get with a t-test (F statistic is different from t-statistic, but what<br>
matters is the ranking, which will be identical). I suppose the reason<br>
PyMVPA uses Anova rather than t or z statistics, is so that it also<br>
works for more than two classes.<br>
<div class=""><br>
> In one-way ANOVA with data analysis we might have subjects as<br>
> between-group factor and treatment as within-group factor. But<br>
> treating voxels as "subjects" does not help me because there is no<br>
> grouping for voxels (grouping is for condition).<br>
><br>
</div>Hmmm, not sure, but if I read your analogy correctly, I think you should<br>
be thinking of *trials* as being equivalent to subjects.<br>
<br>
best,<br>
<br>
Brian<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">><br>
> Any ideas? Any links for explanation would be also appreciated!<br>
><br>
><br>
> Thanks,<br>
> Vadim<br>
><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
><br>
<br>
</div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">--<br>
Dr. Brian Murphy<br>
Lecturer (Assistant Professor)<br>
Knowledge & Data Engineering (EEECS)<br>
Queen's University Belfast<br>
<a href="mailto:brian.murphy@qub.ac.uk">brian.murphy@qub.ac.uk</a><br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Pkg-ExpPsy-PyMVPA mailing list<br>
<a href="mailto:Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org">Pkg-ExpPsy-PyMVPA@lists.alioth.debian.org</a><br>
<a href="http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa" target="_blank">http://lists.alioth.debian.org/cgi-bin/mailman/listinfo/pkg-exppsy-pymvpa</a><br>
</font></span></blockquote></div><br></div>