<div dir="ltr"><div><div><div><div>When I construct a dataset using Dataset.from_wizard() and supply a brain mask all I get in return is a dataset that's all 0. <br><br></div>I show the code below:<br><br>#get image data reshape and flatten<br>rotatedImageData = rotateShape(getImageData(DATA_LOCATION))<br><br>#Get mask data<br>mask = getImageData(MASK)#.nonzero()[0]<br><br>#Load dataset<br>ds = Dataset.from_wizard(rotatedImageData, targets=metaData['diagnosesT1'], mask=mask)<br><br><br></div>The datasets that I'm loading definitely match, having checked in fslview, and were generated by fslvbm scripts.<br><br></div>Is this something I'm doing wrong? I can't work it out.<br><br></div>Thanks.<br></div>