<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Hi all,<br><br></div>Thanks Jo and Taku for the responses. I will try using either the sub-sampling or over-sampling methods instead then. I thought that weighting the classes would do functionally the same thing -- why isn't it common practice?<br><br></div>Taku, or anyone else, do you have any references for the bootstrapping method you mentioned? Neither I nor my collaborators have heard of that method for fMRI, but it would be nice to be able to use most or all of our data from the larger class. <br><br></div>Jo, we are changing the cross-validation partition to leave-one-subject-out, but it still ends up pretty imbalanced. So we're still going to have to use a method to correct the imbalance...<br><br></div>Thanks,<br></div>William<br></div>