<html><head></head><body><div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial, helvetica, sans-serif;font-size:16px"><div id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7215">Dears</div><div id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7215" dir="ltr">The structure of my dataset has 2 Modalities BY 2 Actions design (2 Modalities "Motor Imagery (MI) and Action Observation (AO)") (2 Actions lift and knock).<br></div><div id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7215" dir="ltr">I am trying to run a Searchlight to identify the common informative voxels (similar patterns) across different modalities, in another word, training the classifier on data of one modality (MI of Lift vs Knock) and tested on the other modality (AO of Lift vs Knock) and vice versa.</div><div id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7215" dir="ltr">Here is my code:</div><div id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7215" dir="ltr"> </div><div id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7215" dir="ltr">clf=LinearCSVMC()<br></div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7635">cv = CrossValidation(clf, HalfPartitioner(attr='modality'))</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7636">sl = sphere_searchlight(cv, radius=3, postproc=mean_sample())</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">res = sl(ds) <br></div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637"><br></div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">Where ds has a dimension of (32, 106720)</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">(ds.sa.modality) return an array            = ['MI'        'AO'        'MI'          'AO'.............................]</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">which corresponding to (ds.sa.targets) = ['lift_nv' 'lift_v' 'knock_nv' 'knock_v'...........................]</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637"><br></div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">However (res.samples) returns only 1s. Means nothing is common at all!!!</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">Is there anything wrong with my code above?</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637"><br></div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">Your comments are highly appreciated.</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637"><br></div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">Sincerely</div><div dir="ltr" id="yui_3_16_0_ym19_1_1485297743529_7637">Salim</div></div></body></html>