<div dir="ltr">Dear pyMVPA group,<div><br></div><div>So I succeeded finally with the Searchlight.</div><div><br></div><div>Now I have some questions regarding RSA:</div><div><br></div><div>- As I can see here: <a href="http://www.pymvpa.org/examples/rsa_fmri.html" target="_blank">http://www.pymvpa.org/<wbr>examples/rsa_fmri.html</a></div><div>in the first step 'ROI pattern correlation distances' are computed and plotted. I would like to have something similar, where I get for starters just a (dis-)similarity analysis with no searchlight involved, however I would like to get for instance for my binary problem just a 2 x 2 RSA matrix, i.e. not for each voxel as is now the case, but a whole brain result comparing the two conditions. How would that be conventionally done?</div><div><br></div><div>- Also, is there an alternative to z-scoring to rest when I have not modelled rest explicitly (just z-scoring with mean and stddev of both conditions?)?</div><div><br></div><div>Many thanks,</div><div>Pegah</div></div>