Bug#860675: jlapack: FTBFS on i386: segfault

[Lucas Nussbaum]

Source: jlapack
Version: 0.8~dfsg-3
Severity: serious
Tags: stretch sid
User: debian-qa at lists.debian.org
Usertags: qa-ftbfs-20170418-i386 qa-ftbfs
Justification: FTBFS in stretch on i386

Hi,

During a rebuild of all packages in stretch (in a stretch chroot, not a
sid chroot), your package failed to build on i386.

Relevant part (hopefully):
> make[4]: Entering directory '/<<PKGBUILDDIR>>/jlapack-3.1.1/src/lapack'
> f2java -c .:obj:../../src/error_reporting/obj:../../src/blas/obj -p org.netlib.lapack -o obj -s -d  lapack.f > /dev/null
> lapack.f:
> 	dbdsdc:
> 	dbdsqr:
> 	ddisna:
> 	dgbbrd:
> 	dgbcon:
> 	dgbequ:
> 	dgbrfs:
> 	dgbsv:
> 	dgbsvx:
> 	dgbtf2:
> 	dgbtrf:
> 	dgbtrs:
> 	dgebak:
> 	dgebal:
> 	dgebd2:
> 	dgebrd:
> 	dgecon:
> 	dgeequ:
> 	dgees:
> 	dgeesx:
> 	dgeev:
> 	dgeevx:
> 	dgegs:
> 	dgegv:
> 	dgehd2:
> 	dgehrd:
> 	dgelq2:
> 	dgelqf:
> 	dgels:
> 	dgelsd:
> 	dgelss:
> 	dgelsx:
> 	dgelsy:
> 	dgeql2:
> 	dgeqlf:
> 	dgeqp3:
> 	dgeqpf:
> 	dgeqr2:
> 	dgeqrf:
> 	dgerfs:
> 	dgerq2:
> 	dgerqf:
> 	dgesc2:
> 	dgesdd:
> 	dgesv:
> 	dgesvd:
> 	dgesvx:
> 	dgetc2:
> 	dgetf2:
> 	dgetrf:
> 	dgetri:
> 	dgetrs:
> 	dggbak:
> 	dggbal:
> 	dgges:
> 	dggesx:
> 	dggev:
> 	dggevx:
> 	dggglm:
> 	dgghrd:
> 	dgglse:
> 	dggqrf:
> 	dggrqf:
> 	dggsvd:
> 	dggsvp:
> 	dgtcon:
> 	dgtrfs:
> 	dgtsv:
> 	dgtsvx:
> 	dgttrf:
> 	dgttrs:
> 	dgtts2:
> 	dhgeqz:
> 	dhsein:
> 	dhseqr:
> 	disnan:
> 	dlabad:
> 	dlabrd:
> 	dlacn2:
> 	dlacon:
> 	dlacpy:
> 	dladiv:
> 	dlae2:
> 	dlaebz:
> 	dlaed0:
> 	dlaed1:
> 	dlaed2:
> 	dlaed3:
> 	dlaed4:
> 	dlaed5:
> 	dlaed6:
> 	dlaed7:
> 	dlaed8:
> 	dlaed9:
> 	dlaeda:
> 	dlaein:
> 	dlaev2:
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> 	dlag2:
> 	dlag2s:
> 	dlags2:
> 	dlagtf:
> 	dlagtm:
> 	dlagts:
> 	dlagv2:
> 	dlahqr:
> 	dlahr2:
> 	dlahrd:
> 	dlaic1:
> 	dlaisnan:
> 	dlaln2:
> 	dlals0:
> 	dlalsa:
> 	dlalsd:
> 	dlamrg:
> 	dlaneg:
> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	dlangb:
> 	dlange:
> 	dlangt:
> 	dlanhs:
> 	dlansb:
> 	dlansp:
> 	dlanst:
> 	dlansy:
> 	dlantb:
> 	dlantp:
> 	dlantr:
> 	dlanv2:
> 	dlapll:
> 	dlapmt:
> 	dlapy2:
> 	dlapy3:
> 	dlaqgb:
> 	dlaqge:
> 	dlaqp2:
> 	dlaqps:
> 	dlaqr0:
> 	dlaqr1:
> 	dlaqr2:
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> 	dlaqr5:
> 	dlaqsb:
> 	dlaqsp:
> 	dlaqsy:
> 	dlaqtr:
> 	dlar1v:
> 	dlar2v:
> 	dlarf:
> 	dlarfb:
> 	dlarfg:
> 	dlarft:
> 	dlarfx:
> 	dlargv:
> 	dlarnv:
> 	dlarra:
> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	dlarrb:
> 	dlarrc:
> 	dlarrd:
> 	dlarre:
> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	dlarrf:
> 	dlarrj:
> 	dlarrk:
> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	dlarrr:
> 	dlarrv:
> 	dlartg:
> 	dlartv:
> 	dlaruv:
> 	dlarz:
> 	dlarzb:
> 	dlarzt:
> 	dlas2:
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> 	dlasda:
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> 	dopgtr:
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> 	dorg2l:
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> 	dorgl2:
> 	dorglq:
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> 	dorgr2:
> 	dorgrq:
> 	dorgtr:
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> 	dormtr:
> 	dpbcon:
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> 	dpbrfs:
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> 	dpbtf2:
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> 	dpocon:
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> 	dppcon:
> 	dppequ:
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> 	dpttrf:
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> 	dsbevx:
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> 	dsbgvd:
> 	dsbgvx:
> 	dsbtrd:
> 	dsgesv:
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> 	dspev:
> 	dspevd:
> 	dspevx:
> 	dspgst:
> 	dspgv:
> 	dspgvd:
> 	dspgvx:
> 	dsprfs:
> 	dspsv:
> 	dspsvx:
> 	dsptrd:
> 	dsptrf:
> 	dsptri:
> 	dsptrs:
> 	dstebz:
> 	dstedc:
> 	dstegr:
> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	dstein:
> 	dstemr:
> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	dsteqr:
> 	dsterf:
> 	dstev:
> 	dstevd:
> 	dstevr:
> 	dstevx:
> 	dsycon:
> 	dsyev:
> 	dsyevd:
> 	dsyevr:
> 	dsyevx:
> 	dsygs2:
> 	dsygst:
> 	dsygv:
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> 	dsygvx:
> 	dsyrfs:
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> 	dsytrd:
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> 	sormr3:
> 	sormrq:
> 	sormrz:
> 	sormtr:
> 	spbcon:
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> 	spbrfs:
> 	spbstf:
> 	spbsv:
> 	spbsvx:
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> 	sposv:
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> 	spotrs:
> 	sppcon:
> 	sppequ:
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> 	sppsvx:
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> 	spptri:
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> 	sptrfs:
> 	sptsv:
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> 	spttrf:
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> 	ssbgv:
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> Warning: IMPLICIT NONE ignored.
> 	sstein:
> 	sstemr:
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> 	ssysvx:
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> 	ssytrd:
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> 	ssytrs:
> 	stbcon:
> 	stbrfs:
> 	stbtrs:
> 	stgevc:
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> 	strsna:
> 	strsyl:
> 	strti2:
> 	strtri:
> 	strtrs:
> 	stzrqf:
> 	stzrzf:
> 	dlamch:
> 	dlamc1:
> 	dlamc2:
> 	dlamc3:
> 	dlamc4:
> 	dlamc5:
> 	dsecnd:
> 	lsame:
> 	second:
> 	slamch:
> 	slamc1:
> 	slamc2:
> 	slamc3:
> 	slamc4:
> 	slamc5:
> Segmentation fault
> Makefile:10: recipe for target '../../src/lapack/obj/Lapack.f2j' failed
> make[4]: *** [../../src/lapack/obj/Lapack.f2j] Error 139

The full build log is available from:
   http://aws-logs.debian.net/2017/04/18/jlapack_0.8~dfsg-3_testing-i386.log

A list of current common problems and possible solutions is available at
http://wiki.debian.org/qa.debian.org/FTBFS . You're welcome to contribute!

About the archive rebuild: The rebuild was done on EC2 VM instances from
Amazon Web Services, using a clean, minimal and up-to-date chroot. Every
failed build was retried once to eliminate random failures.