[Qa-jenkins-scm] Build failed in Jenkins: reproducible_builder_amd64_1 #2580

Sun Sep 20 16:22:37 UTC 2015

See <https://jenkins.debian.net/job/reproducible_builder_amd64_1/2580/>

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[...truncated 3887 lines...]
+Sélection du paquet python-sphinx précédemment désélectionné.
+Préparation du dépaquetage de .../python-sphinx_1.3.1-6_all.deb ...
+Dépaquetage de python-sphinx (1.3.1-6) ...
+Traitement des actions différées (« triggers ») pour man-db (2.7.3-1) ...
+Paramétrage de mime-support (3.59) ...
+Paramétrage de libpython2.7-stdlib:amd64 (2.7.10-4) ...
+Paramétrage de python2.7 (2.7.10-4) ...
+Paramétrage de libpython-stdlib:amd64 (2.7.9-1) ...
+Paramétrage de python (2.7.9-1) ...
+Paramétrage de fonts-lato (2.0-1) ...
+Paramétrage de libgfortran3:amd64 (5.2.1-17) ...
+Paramétrage de libmpdec2:amd64 (2.4.1-1) ...
+Paramétrage de libpython3.4-stdlib:amd64 (3.4.3-8) ...
+Paramétrage de python3.4 (3.4.3-8) ...
+Paramétrage de libpython3-stdlib:amd64 (3.4.3-4) ...
+Paramétrage de sgml-base (1.26+nmu4) ...
+Paramétrage de xml-core (0.13+nmu2) ...
+Paramétrage de fonts-font-awesome (4.3.0~dfsg-2) ...
+Paramétrage de libblas-common (1.2.20110419-10) ...
+Paramétrage de libblas3 (1.2.20110419-10) ...
+update-alternatives: utilisation de « /usr/lib/libblas/libblas.so.3 » pour fournir « /usr/lib/libblas.so.3 » (libblas.so.3) en mode automatique
+Paramétrage de libhdf5-8:amd64 (1.8.13+docs-15.1) ...
+Paramétrage de libhts1:amd64 (1.2.1-1) ...
+Paramétrage de libjs-jquery (1.11.3+dfsg-3) ...
+Paramétrage de libjs-underscore (1.7.0~dfsg-1) ...
+Paramétrage de libjs-sphinxdoc (1.3.1-6) ...
+Paramétrage de liblapack3 (3.5.0-4) ...
+update-alternatives: utilisation de « /usr/lib/lapack/liblapack.so.3 » pour fournir « /usr/lib/liblapack.so.3 » (liblapack.so.3) en mode automatique
+Paramétrage de python-all (2.7.9-1) ...
+Paramétrage de python-babel-localedata (1.3+dfsg.1-6) ...
+Paramétrage de python-pkg-resources (18.3.1-2) ...
+Paramétrage de python-six (1.9.0-5) ...
+Paramétrage de python-tz (2012c+dfsg-0.1) ...
+Paramétrage de python-babel (1.3+dfsg.1-6) ...
+update-alternatives: utilisation de « /usr/bin/pybabel-python2 » pour fournir « /usr/bin/pybabel » (pybabel) en mode automatique
+Paramétrage de python-roman (2.0.0-1) ...
+Paramétrage de python-numpy (1:1.9.2-2) ...
+Paramétrage de python-h5py (2.5.0-1) ...
+Paramétrage de python-markupsafe (0.23-2) ...
+Paramétrage de python-jinja2 (2.8-1) ...
+Paramétrage de python-nose (1.3.6-1) ...
+Paramétrage de python-pygments (2.0.1+dfsg-1.1) ...
+Paramétrage de python-pysam (0.8.3+ds1-2) ...
+Paramétrage de python-setuptools (18.3.1-2) ...
+Paramétrage de libjs-modernizr (2.6.2+ds1-1) ...
+Paramétrage de sphinx-rtd-theme-common (0.1.8-2) ...
+Paramétrage de python-sphinx-rtd-theme (0.1.8-2) ...
+Paramétrage de sphinx-common (1.3.1-6) ...
+Traitement des actions différées (« triggers ») pour sgml-base (1.26+nmu4) ...
+Paramétrage de docutils-common (0.12+dfsg-1) ...
+Traitement des actions différées (« triggers ») pour sgml-base (1.26+nmu4) ...
+Paramétrage de python-docutils (0.12+dfsg-1) ...
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst-buildhtml » pour fournir « /usr/bin/rst-buildhtml » (rst-buildhtml) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2html » pour fournir « /usr/bin/rst2html » (rst2html) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2latex » pour fournir « /usr/bin/rst2latex » (rst2latex) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2man » pour fournir « /usr/bin/rst2man » (rst2man) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2odt » pour fournir « /usr/bin/rst2odt » (rst2odt) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2odt_prepstyles » pour fournir « /usr/bin/rst2odt_prepstyles » (rst2odt_prepstyles) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2pseudoxml » pour fournir « /usr/bin/rst2pseudoxml » (rst2pseudoxml) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2s5 » pour fournir « /usr/bin/rst2s5 » (rst2s5) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2xetex » pour fournir « /usr/bin/rst2xetex » (rst2xetex) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rst2xml » pour fournir « /usr/bin/rst2xml » (rst2xml) en mode automatique
+update-alternatives: utilisation de « /usr/share/docutils/scripts/python2/rstpep2html » pour fournir « /usr/bin/rstpep2html » (rstpep2html) en mode automatique
+Paramétrage de python-alabaster (0.7.6-1) ...
+Paramétrage de python-sphinx (1.3.1-6) ...
+Paramétrage de dh-python (2.20150826) ...
+Paramétrage de python3 (3.4.3-4) ...
+Traitement des actions différées (« triggers ») pour libc-bin (2.19-20) ...
+Lecture des listes de paquets...
+Construction de l'arbre des dépendances...
+Lecture des informations d'état...
+Lecture de l'information d'état étendu...
+Initialisation de l'état des paquets...
+Écriture de l'information d'état étendu...
+Construction de la base de données des étiquettes...
  -> Finished parsing the build-deps
-Reading package lists...
-Building dependency tree...
-Reading state information...
-fakeroot is already the newest version.
-0 upgraded, 0 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
+Lecture des listes de paquets…
+Construction de l'arbre des dépendances…
+Lecture des informations d'état…
+fakeroot est déjà la plus récente version disponible.
+0 mis à jour, 0 nouvellement installés, 0 à enlever et 0 non mis à jour.
 I: Copying source file
 I: copying [python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.dsc]
 I: copying [./python-pbcore_1.2.2+dfsg1.orig.tar.xz]
 I: copying [./python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.debian.tar.xz]
 I: Extracting source
 gpgv: keyblock resource `/tmp/buildd/.gnupg/trustedkeys.gpg': file open error
-gpgv: Signature made Tue Aug 11 20:21:38 2015 GMT+12 using RSA key ID D1C646D1
+gpgv: Signature made mer 12 aoû 2015 22:21:38 GMT-14 using RSA key ID D1C646D1
 gpgv: Can't check signature: public key not found
-dpkg-source: warning: failed to verify signature on ./python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.dsc
-dpkg-source: info: extracting python-pbcore in python-pbcore-1.2.2+dfsg1
-dpkg-source: info: unpacking python-pbcore_1.2.2+dfsg1.orig.tar.xz
-dpkg-source: info: unpacking python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.debian.tar.xz
-dpkg-source: info: applying doc-theme.patch
-dpkg-source: info: applying enable-build-time-testing.patch
+dpkg-source: avertissement: impossible de vérifier la signature sur ./python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.dsc
+dpkg-source: info: extraction de python-pbcore dans python-pbcore-1.2.2+dfsg1
+dpkg-source: info: extraction de python-pbcore_1.2.2+dfsg1.orig.tar.xz
+dpkg-source: info: extraction de python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.debian.tar.xz
+dpkg-source: info: mise en place de doc-theme.patch
+dpkg-source: info: mise en place de enable-build-time-testing.patch
 I: Building the package
-I: Running cd tmp/buildd/*/ && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games" dpkg-buildpackage -us -uc  -b -rfakeroot
-dpkg-buildpackage: source package python-pbcore
-dpkg-buildpackage: source version 1.2.2+dfsg1-1
-dpkg-buildpackage: source distribution unstable
-dpkg-buildpackage: source changed by Afif Elghraoui <afif at ghraoui.name>
+W: no hooks of type A found -- ignoring
+I: Running cd tmp/buildd/*/ && env PATH="/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/i/capture/the/path" dpkg-buildpackage -us -uc  -b -rfakeroot
+dpkg-buildpackage: paquet source python-pbcore
+dpkg-buildpackage: version source 1.2.2+dfsg1-1
+dpkg-buildpackage: distribution source unstable
+dpkg-buildpackage: source changé par Afif Elghraoui <afif at ghraoui.name>
  dpkg-source --before-build python-pbcore-1.2.2+dfsg1
-dpkg-buildpackage: host architecture amd64
+dpkg-buildpackage: architecture hôte amd64
  fakeroot debian/rules clean
 LC_ALL=C.UTF-8 dh clean --with python2 --buildsystem=pybuild
    dh_testdir -O--buildsystem=pybuild
@@ -580,7 +591,7 @@
 creating build
 creating build/scripts-2.7
 copying and adjusting bin/dataset.py -> build/scripts-2.7
-changing mode of build/scripts-2.7/dataset.py from 644 to 755
+changing mode of build/scripts-2.7/dataset.py from 664 to 775
 /usr/bin/make doc
 make[2]: Entering directory '/tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1'
 sphinx-apidoc -o doc/ pbcore/ && cd doc/ && make html
@@ -1097,7 +1108,7 @@
 test_valid_referencesets (test_pbdataset_subtypes.TestDataSet) ... SKIP: XSD can't handle multiple contigs?
 
 ----------------------------------------------------------------------
-Ran 218 tests in 72.627s
+Ran 218 tests in 34.739s
 
 OK (skipped=1)
 make[1]: Leaving directory '/tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1'
@@ -1304,7 +1315,7 @@
 running install_scripts
 creating /tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1/debian/python-pbcore/usr/bin
 copying build/scripts-2.7/dataset.py -> /tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1/debian/python-pbcore/usr/bin
-changing mode of /tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1/debian/python-pbcore/usr/bin/dataset.py to 755
+changing mode of /tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1/debian/python-pbcore/usr/bin/dataset.py to 775
 Installing .open script to /tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1/debian/python-pbcore/usr/bin
    debian/rules override_dh_install
 make[1]: Entering directory '/tmp/buildd/python-pbcore-1.2.2+dfsg1'
@@ -1334,21 +1345,34 @@
 dpkg-gencontrol: warning: File::FcntlLock not available; using flock which is not NFS-safe
    dh_md5sums -O--buildsystem=pybuild
    dh_builddeb -O--buildsystem=pybuild
-dpkg-deb: building package 'python-pbcore' in '../python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1_all.deb'.
 dpkg-deb: building package 'python-pbcore-doc' in '../python-pbcore-doc_1.2.2+dfsg1-1_all.deb'.
+dpkg-deb: building package 'python-pbcore' in '../python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1_all.deb'.
  dpkg-genbuildinfo  >../python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1_amd64.buildinfo
  dpkg-distaddfile python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1_amd64.buildinfo python optional
-dpkg-distaddfile: warning: File::FcntlLock not available; using flock which is not NFS-safe
+dpkg-distaddfile: avertissement: Fichier::FcntlLock non disponible; utilisation de « flock » qui n'est pas sécurisé pour NFS
  dpkg-genchanges -b >../python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1_amd64.changes
-dpkg-genchanges: binary-only upload (no source code included)
+dpkg-genchanges: envoi des binaires seulement (le code source n'est pas inclus)
  dpkg-source --after-build python-pbcore-1.2.2+dfsg1
-dpkg-buildpackage: binary-only upload (no source included)
+dpkg-buildpackage: envoi d'un binaire seulement (aucune inclusion de code source)
+W: no hooks of type B found -- ignoring
+perl: warning: Setting locale failed.
+perl: warning: Please check that your locale settings:
+	LANGUAGE = (unset),
+	LC_ALL = "fr_CH.UTF-8",
+	LANG = "fr_CH.UTF-8"
+    are supported and installed on your system.
+perl: warning: Falling back to the standard locale ("C").
 I: unmounting /sys filesystem
+/usr/lib/pbuilder/pbuilder-modules: line 163: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (fr_CH.UTF-8)
 I: unmounting /dev/shm filesystem
+/usr/lib/pbuilder/pbuilder-modules: line 163: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (fr_CH.UTF-8)
 I: unmounting dev/pts filesystem
+/usr/lib/pbuilder/pbuilder-modules: line 163: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (fr_CH.UTF-8)
 I: unmounting run/shm filesystem
+/usr/lib/pbuilder/pbuilder-modules: line 163: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (fr_CH.UTF-8)
 I: unmounting proc filesystem
+/usr/lib/pbuilder/pbuilder-modules: line 163: warning: setlocale: LC_ALL: cannot change locale (fr_CH.UTF-8)
 I: cleaning the build env 
-I: removing directory /var/cache/pbuilder/build//31805 and its subdirectories
-I: Current time: Sun Sep 20 04:20:53 GMT+12 2015
-I: pbuilder-time-stamp: 1442766053
+I: removing directory /var/cache/pbuilder/build//40991 and its subdirectories
+I: Current time: Mon Sep 21 06:22:28 GMT-14 2015
+I: pbuilder-time-stamp: 1442766148

Compressing the 2nd log...
/var/lib/jenkins/userContent/reproducible/logdiffs/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.diff:	 85.2% -- replaced with /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/logdiffs/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.diff.gz
b2/build.log:	 89.0%
+ echo 'Compressing the 1st log...'
Compressing the 1st log...
+ gzip -9cvn b1/build.log
b1/build.log:	 89.2%
+ chmod 644 /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/logs/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.build1.log.gz
+ update_rbuildlog
+ chmod 644 /srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf/tmp.p0qO5gXmct
+ mv /srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf/tmp.p0qO5gXmct /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/rbuild/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.rbuild.log
+ RBUILDLOG=/var/lib/jenkins/userContent/reproducible/rbuild/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.rbuild.log
+ '[' 0 -eq 1 ']'
+ '[' 0 -eq 0 ']'
+ call_diffoscope_on_changes_files
++ mktemp --tmpdir=/srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf
+ local TMPLOG=/srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf/tmp.lvnyxQgOx3
+ echo
+ tee -a /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/rbuild/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.rbuild.log

+ local TIMEOUT=30m
+ DBDSUITE=unstable
+ '[' unstable = experimental ']'
+ set -x
++ mktemp --tmpdir=/srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf -d dbd-tmp-XXXXXXX
+ local TEMP=/srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf/dbd-tmp-SjuBa54
++ schroot --directory /srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf -c source:jenkins-reproducible-unstable-diffoscope diffoscope -- --version
+ DIFFOSCOPE='diffoscope 34'
++ echo diffoscope 34
++ grep '^E: 15binfmt: update-binfmts: unable to open'
+ LOG_RESULT=
+ cleanup_all
+ '[' 0 -eq 1 ']'
+ '[' '' = failure ']'
+ '[' '!' -z '' ']'
+ gzip -9fvn /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/rbuild/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.rbuild.log
/var/lib/jenkins/userContent/reproducible/rbuild/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.rbuild.log:	 87.8% -- replaced with /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/rbuild/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1.rbuild.log.gz
+ '[' ng = legacy ']'
+ '[' ng = ng ']'
+ gen_package_html python-pbcore
+ cd /srv/jenkins/bin
+ python3 -c 'import reproducible_html_packages as rep
pkg = rep.Package('\''python-pbcore'\'', no_notes=True)
rep.gen_packages_html([pkg], no_clean=True)'
INFO: Starting at 2015-09-20 16:22:37.363014
CRITICAL: buildinfo not detected at /var/lib/jenkins/userContent/reproducible/buildinfo/unstable/amd64/python-pbcore_1.2.2+dfsg1-1_amd64.buildinfo
INFO: Finished at 2015-09-20 16:22:37.371680, took: 0:00:00.008678
+ cd -
+ cd
+ rm -r /srv/reproducible-results/tmp.C522JHktBf
+ false
+ rm -f /tmp/reproducible-lockfile-unstable-amd64-python-pbcore
Sun 20 Sep 16:22:37 UTC 2015 - /srv/jenkins/bin/reproducible_build.sh stopped running as /tmp/jenkins-script-EhecjHbR, which will now be removed.
Build step 'Execute shell' marked build as failure

